EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-19989 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr2:87782020-87784550 
Target genes
Number: 9             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chr2:87782490-87782501TATGTAAACAT+6.32
TFAP4MA0691.1chr2:87783828-87783838ATCAGCTGTT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 36             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00171chr2:87782441-87787468Adipose_Nuclei
SE_09258chr2:87781785-87789398CD14
SE_10897chr2:87783391-87788228CD20
SE_11820chr2:87782712-87787455CD3
SE_13331chr2:87783012-87784144CD34_Primary_RO01536
SE_13331chr2:87784209-87787379CD34_Primary_RO01536
SE_14374chr2:87781552-87789332CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15394chr2:87781561-87786992CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16280chr2:87781716-87787166CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16916chr2:87783059-87787393CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17780chr2:87780642-87788510CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18237chr2:87780761-87789545CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19109chr2:87782076-87788063CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19984chr2:87782411-87788140CD56
SE_20733chr2:87781737-87788157CD8_Memory_7pool
SE_22088chr2:87783676-87787006CD8_Naive_8pool
SE_22297chr2:87781983-87788189CD8_primiary
SE_25383chr2:87782022-87788216DND41
SE_25814chr2:87782661-87788244Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27265chr2:87782541-87784498Esophagus
SE_31331chr2:87782587-87788068Fetal_Thymus
SE_33985chr2:87782030-87786733HCC1954
SE_34720chr2:87780604-87788196HeLa
SE_36601chr2:87781797-87788112HMEC
SE_36950chr2:87781718-87790578HSMMtube
SE_37980chr2:87781739-87788162HUVEC
SE_38853chr2:87782079-87788103IMR90
SE_39844chr2:87782529-87784543K562
SE_43612chr2:87782015-87788156MM1S
SE_45567chr2:87781624-87790926Osteoblasts
SE_47155chr2:87781870-87791006Panc1
SE_50093chr2:87781661-87788151Sigmoid_Colon
SE_51383chr2:87783269-87787191Skeletal_Muscle
SE_52358chr2:87781927-87788160Small_Intestine
SE_53335chr2:87781890-87788138Spleen
SE_56508chr2:87783387-87787740u87
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I087482chr28778212087787918
Enhancer Sequence
TCTTTGGAGA ACTCTGACTA ACACAGTCTC CTTCTCAGTA TTAATGTTTT TTTCTTGGAC 60
AGAAAATATA GATAAAATAG AAGTCTAGAA GTTCTGTTTT CTCTCACGAC CAAATTCTTC 120
TATTTCTCTT TTAACCCATT CAGATTTGTG AGTCCCGGAG CGTGCTTTGC CAGGGCTCTG 180
TTGAGTTCCA CAGTGCATTG AGCACCACTA TGTGGGAGGC ACTGGCTCTC AACAGGCAGC 240
AGGCACCTTT TCCCTAATGA ACTGTCTTTC CAGGTTTCAC TCAAGCCCTT TCTATCAGAC 300
TTCTACCATG CAGCTCTGCC AATTTCTTTA AGCATCTCTC CCTTCTTCCT GACTGTCCTG 360
ACCAGGAAAC TCCCTAATCT CTAATATCTA AAGTCATGAA GCCAATTGCA TCATTAGATG 420
CGCAGTATAT ATAAATAACA TTTACTTACA AGAATATTTT TATAGAAATG TATGTAAACA 480
TACTTACATA CATTTCTATA AATACATTTA AATTCCTAAA GACTTGTTTG AGCAATTTAA 540
AAAAAAAATG CTCCAGTTTA ACTTCCTACT ACAATTAGGA ATTTGGGGCA GGGTGCATAA 600
TTGCCAGTGT ACTCACAGTG ACTGCAATTA GAATGTGCTG TGGAGTCAGA GGAACTGCCT 660
GACAGTGCCG GGCAGTTGAC CCTGGGCTGG GTTCAGAGCT CTCCAGTGGC CACTGAGAAG 720
TAGGAGAGTG TTTCCTGCAC AATCCTGATT TCTTGGGGGA GGAGGTACTA CTGCACGCTG 780
CTGGGAGGAG CCTCTGAAAC TCTCCTGGGC CAGGTCTCCT CCCGTGCTTC CTCTCCCTGA 840
GGCAGCCTCA CCTCTTGACG CCTGTCCCCA GCACACCCTT CTGTAGCTTT CCTCTGACTC 900
ACCCCTCTGT GTGTCTTTCT CTCCAACTCG GGGTCCTGTC ACCTAGGCCT CTCTCCTTTT 960
TCCTAGGTGG CTGGCAGTTG CTCTTCCCTT GGTTTTCTCT AATTTGATCT CTTTCCCACC 1020
CTTCCAGTCT GCCACAGTCA CCCTTGATAT CCGCAGAATC CACCCTCCTT GGAAGGGATG 1080
AGGAAGGGGG TTTATATAAC TCAATTTCAT TTGTAATGTT TCAAATGGTA TTTTTTTTCT 1140
GGGAATAATT GGCGCTGGAT TCTGAACTAT CTTTCCTGTT GCAAAGAATG AAATCCCTTC 1200
TAGGTGATGG GGCTTGATCT TTCTCTGTTG CAATAGCAGC GATGTCCAAA ACAATCAATC 1260
AGAGGCATTT TCTACCGTAC CTGAGCCATT CAGTGGTTTC GACCTCTGCT CCAGATTACC 1320
CAGGGTTATC CAGATGGGTT AATGCGAGTC CTTAGAATGG TGTTTCCCAC CTTGAGAGTG 1380
GGTTGTTGGC TAGGTGTGTG GGGGAGCTGT TTGTCTACAC CTCAGAAACG CTCACAACAG 1440
CAGGTTCCAG GGAAAGTCCC TGGGTGTCCA GTAAAAGCTG GGTCGCCCTC CCTAGGGGGC 1500
TCTGAGACTA GCAGAACTGA TGGCCCCATA ATTTGAGCAC AGGTATGCAT ATTTCTTAGG 1560
GGTTGGTGGG CAGACTCATT CATGTTCCCA TCCCAGGGGT GCAGGGGACC CTTCTCCCTT 1620
CCCCACATCA GCCCAGGGCC ACAGAAGCTC CTCAGGAGGC AAGGAAGGGA ATGGAGAGGA 1680
CAAGAGTGCC TACAGAGTGG GAAGGAGACA AGCATTCTCA GGTATTTATC CAGGGTAAGG 1740
GCAAGGGCTT TTCTGCAGTC CAGGACATTA GAAGAGTCCT GAACCAAGAA CTCCACCCCT 1800
GCCCCGATAT CAGCTGTTTT TATTGACTGA GCTGTTGGAG AACAGTTTTG GTGTGCGGAA 1860
ACAGTGAGAT CCCTAACCCT ACACCCCTGA ACCCAGCAGA TATATCCACA CTGACCAGAA 1920
AGGACTGGCT AACCACAAGC CTGCCTGTGC ATGGCAGGGA AAGGAAAGCC ATTCTTGAGT 1980
AAATGGTGTT CAAAGGTTGG GCAATATATG TATATGGTGT TCTCCTGTGG ACATAATTGT 2040
GCACAAGGGT CAGAAGAAAT TGCTTTCATT GGGCAAGCTA CTTAACCTGT CTAAAGCTTT 2100
GTTTTTTTAT GATCTGTAAA TGAAGACAGA TCCTATCTCA TGGCTCTGCA CGTCACACAG 2160
CGATAGCAGA CAGGTAATTA GGATGCAGGT AGTTAGCAGA CAGCCTGGGT GTACTTTAGC 2220
TGTTCAAGTT TCCTCAACCT GGCCTCCTAG CCATGACCTT TCACAGAGGT GCAAATCATC 2280
TATGAGTTTG CACAGAATCC CCTGCAAGGA AATATGTTCT TGTTCTTGAC TTACATTTGA 2340
GTTGGTTGGT CTTACAGTTA AGGCGGAGGT CATCACTCTT AATAAAGGCC ATTTTAAGTG 2400
GAGTGACAAG TCACTAAGGG ACTTGTTGGC ATTGTTTACT TCTTATCCAG GGCTTTCCAA 2460
GAAGGGACAG TGTGTCTGAG TTTTTATCTT ATGAAGGTTT CCCACCTGCA GTTTAGTTTA 2520
CTATTATTCT 2530