EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-10802 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr13:99931230-99934450 
Target genes
Number: 12             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr13:99933047-99933065TCTTCCTTCCCTCCCTTC-6.39
EWSR1-FLI1MA0149.1chr13:99933055-99933073CCCTCCCTTCTTCCTTCC-6.64
EWSR1-FLI1MA0149.1chr13:99933059-99933077CCCTTCTTCCTTCCTTCT-6.64
EWSR1-FLI1MA0149.1chr13:99933051-99933069CCTTCCCTCCCTTCTTCC-7.12
EWSR1-FLI1MA0149.1chr13:99933039-99933057TTTTCCTTTCTTCCTTCC-7.54
EWSR1-FLI1MA0149.1chr13:99933043-99933061CCTTTCTTCCTTCCCTCC-7.88
ZNF263MA0528.1chr13:99933035-99933056TCCTTTTTCCTTTCTTCCTTC-6.36
ZNF263MA0528.1chr13:99933055-99933076CCCTCCCTTCTTCCTTCCTTC-6.56
ZNF263MA0528.1chr13:99933047-99933068TCTTCCTTCCCTCCCTTCTTC-7.36
ZNF263MA0528.1chr13:99933051-99933072CCTTCCCTCCCTTCTTCCTTC-7.51
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09586chr13:99927015-99938758CD14
SE_10324chr13:99932550-99933297CD19_Primary
SE_10324chr13:99933325-99937392CD19_Primary
SE_11877chr13:99933419-99936730CD3
SE_16332chr13:99933482-99936233CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16931chr13:99933508-99936093CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_19205chr13:99931242-99933317CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19205chr13:99933357-99935885CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20352chr13:99932458-99936110CD56
SE_20920chr13:99933519-99936152CD8_Memory_7pool
SE_26111chr13:99931499-99936078Duodenum_Smooth_Muscle
SE_32560chr13:99932546-99936087GM12878
SE_45967chr13:99931249-99933299Osteoblasts
SE_45967chr13:99933314-99936049Osteoblasts
SE_62226chr13:99907599-99977172Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr139993181299933023
chr139993314199933542
chr139993364399933940
chr139993247699932579
chr139993279999932938
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH13I099278chr139993105599931454
GH13I099279chr139993169699937287
Enhancer Sequence
TGTGTGAATG TTGACTTTCC TTCATGAGTT ACTCAGTATT TATACTGAGA AAAGTAGACT 60
TTAGTCTGCT GTTGTGTAGC CAAAGCCTTT GGATTTTAAG CTGTTCCCTT TCTCCTTCCT 120
TTTCCCACCT CCCTCTCGGC TTGCCACCTC TTTTCTCCTT TTCCCCCTTT TCTTACCCCT 180
TTATCTCCCC TGCTTTTGCA CTGATCCCCA CTCCTCTTCC CCTCCCAACA GTACCTACTG 240
GTTTGGTTAG CCCTACCGGG GATTTTAGTA AATAAATACT TAAATGCTTG AATGTGATTG 300
CACAGAGCAA AGTTGACTAA TAAAAAGTTG ATCAAAATTT GTATCTAGAA TGAAGGATGT 360
GAGAGAATAA ACTGCCACCA TTCAAGTGTT TCAAGAGAAG CTTAAAGGTA ATTTTTTGCA 420
GAAGCTGTCT TTGACTACCC CCACCCTCAG ACTAGGTCAC AGTCTCTTGT GATATGCTTT 480
CTTAGAACAT TTTTCTTTCT TATAGCACTC ATCACTATAG ATAGTAAATA AGATGTAACA 540
AATGATTTGA TACCTGCCAC CTCCACTAGA ATACAGACTT TGTGCCAGGA GGAGACTGTG 600
TTAGTTTGTC TCACTAATGA TGCCTCACTG CCTTAGCCTG TTCAGGCTCC TCTAACAAAA 660
TGCCCTAGAC TGTGTGACTT ATAAACAACC GAAATTTATT TCTCACAGTT CTGGAGGCTG 720
AGAAGTCCAG GATCAAGGCA CTGGCAGATT TGGTGTTTGG GGCTGTCTTT TCGTGGTGTC 780
CTCACATGGC AGAAAGCAGA GAGTTCAATG GGTTCCCTTT TATAAGGGCA CTAATCCTAT 840
TTGTGAAGAC TCTACCCTCA TGACCTAATC ACCACTCAAA AGCCCCACCT CCTAAGAGCA 900
TCACACTGGG GGTTAGGATT TTAACATGTG AATTTGGAGA GGACAGAAAC ATTCAGTTGA 960
TAGCACTTGG TTAGCATAGT GGCTCCCACA TAGTGGACAC AACTGTGAGA TGGATGGATT 1020
GATAGAGCAA ATAGATTAAT GAAAAGTATT TGATCTTTTG ATTTCATCTC CTTTGGTTTG 1080
GACTATTGCT GTAGCCTCCT AACTGTTCTC CCTGTCACCA TCTCAATGCC ATCATCTGCA 1140
CTGCCCCACT CCCCTAATTT TATCTACAAA GGAGATCTGG TCTTATTCCT TTACACCTTG 1200
AGAAATCTCC TATGGCTTCC TCCTGCTGTT TTATAAAGTT TAACTTGCTT GTGACACACC 1260
TCAGAGCTCC AGCCAATCTT CCCAGCCTCA TTTTCTGTCA TTCCTTCCTT GTACTCTGCA 1320
TGTCAGCTAA ATTGCATTAC TCACTACTGC CTGTCACGCA TACATCATTA CAGATTTCTC 1380
TGGATTCATT TATTACGACA ATTGTGGTTA CAACATCCCT TCTCCCCTTT GCTTGACAAA 1440
CTTCTACCAA GAAAACAAGG AGAACTTCAA GTGTCCCCTT GGGTAGCTCT GCTCCACGAA 1500
ACCCTGCTCC AGCCAGAGTT GGAATTAACC TCTCCTTCCT TCTTGCTCCC AGTTAACTTT 1560
GTGCTTGTAA GTTATGTGAA ACATTCATTA CTTGAGATGG TAATTATTTA CCTAATTGAC 1620
CACTCTCTCA ACTGGATGCT TTTGAAAGAG CAGGATCTTA CTCTCTCTTA CAGCTCCCTC 1680
AGCATGGAGT AGTGAAGAGT GTTCTTTAAT ACCAAAGGGA CAAAGAAAGC TGACTGGGAT 1740
CGGTCTGCCA CATGCTAGTT GCTTCAGTTA TTTTTTTGCA CTAAATTATT GTGTCTCTGC 1800
TAATGTCCTT TTTCCTTTCT TCCTTCCCTC CCTTCTTCCT TCCTTCTTCT TTCCCTCTCT 1860
CTCTCTCTCT CTCTCTCTTT CTCACTCAGT AAGCTACCTC AAATCTGTTA CTTAAGAGAA 1920
AAATGTAGGC TGGGCGTGGT GGCTCACGCC TGTAATCCCA TCACTTTGGG AGGCCGAGGC 1980
AGGCAGATCA CTTGAGGTCA GGAGTTTGAG ACCAGCGTGG CCAACATAGT GAAACTCCAT 2040
CTCTGCTAAA AATACAAAAA TAAGCCAGGT GTGTTGGCGG GCACCTGTAA TCCCAGCTAC 2100
TTGGGAGGCT GAGGCAGGAG AATAGCTTGA ACCCAGGAGG CAGAGGAGGT TGCAGTGAGA 2160
TGAGATCACA CCATGGTACT CCAGCCTGGG TGACAGAGCG AGACTCCATC TCAAAAAAAA 2220
CAAAACAAAA CAAAACAAAA AAAAACAACA GCAACAACAA AAAAGTATAA AAGTTGAATT 2280
TCACATTTGG GTTCAGTGAT TTTTTTTTTT AAGGATTGAA ATGTGGACTT ATAAAATCAT 2340
TTCCAGCATC TTACCTAAGA GAGAAGCATA TAATCCATTC ATTCTTATAT TCACAAGATA 2400
TCTCCTTTCT CAACCAAAAA GTTCTCACAC TTTGGGCTCA GTTCAGTATT TGGGTGTTGG 2460
ATACCATGTG TCCGGCATTG TACTTGGTAC TATGTCACCT TGGTAGTCAG CAAGCACACG 2520
CCAGGCTCAT CCCAGACACT CTGCAGGTGT GCCACTTTCT CTCCTTAGAA CAGCCCTGGA 2580
AGGTGAGAAC TCGCATCTAC TTTGAGGAAA CAGGCTCAGA AACCTTCAGC GCTATTTTCT 2640
ATAAATTGAT AAAAGAAAAA TCATGATGTT AGAAGATACA TAACAAGAGG AAGAGGCTTT 2700
TCTTGTCTCA CTTATGTCTT GACATTGCCT GAGGACTGAT TAGGAACTGA GATTGCCAAT 2760
CATTTTAACA AGATTTTAGT AATGTTTGAA GATCTGTGCC TTCTGAATCA AAGTGGCGTG 2820
CAGAGGTACT TACCTTATGG ATTGCTGGCT AATTGTGAAA GGAGACTCAG GCTTTTAACA 2880
CTGCAGGAAT TTCAAACTGC GGTCTCAGTG GCCAGAGTGT CTTACCAGGG AGCAGACCTA 2940
ATGTATCCAG TTTAAAAGGG CGTGTAAGCT GTTGCCAGAA GTCTACATGA AGCCACATGA 3000
TAAGTGATTT TGTATTTGAA CATGAAGGGC AGTGGCATCA TTGACCTAAG CTAGAGTTTC 3060
CTCACCCTCA GCACTTTTGA CATTTTAGTT GCATAACCCT TTGCGGTGGG GGCGGTCCCG 3120
TGCACTGCAG GGTGGCTGGC AGCATCACTG GCCTCCACCC AGTGTATGCT GTTAGCAAAA 3180
CCTCCTTTCC CCAGTCTTAC CCCAGTCATG ACAACTAAAA 3220