EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

HS129-09896

Organism

Homo sapiens

Tissue/cell

MCF10A

Coordinate

chr12:123993240-123998140

Target genes

Number: 20
Name	Ensembl ID

RP11	ENSG00000256152
VPS37B	ENSG00000139722
ARL6IP4	ENSG00000182196
PITPNM2	ENSG00000090975
C12orf65	ENSG00000130921
MPHOSPH9	ENSG00000051825
CDK2AP1	ENSG00000111328
SBNO1	ENSG00000139697
RP13	ENSG00000256092
SETD8	ENSG00000183955
RILPL2	ENSG00000150977
SNRNP35	ENSG00000184209
RILPL1	ENSG00000188026
DDX55	ENSG00000111364
SNORA9	ENSG00000206897
EIF2B1	ENSG00000111361
GTF2H3	ENSG00000111358
TCTN2	ENSG00000168778
ATP6V0A2	ENSG00000185344
ZNF664	ENSG00000179195

TF binding sites/motifs

Number: 18

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

Foxd3	MA0041.1	chr12:123993691-123993703	AAACAAACAAAC	-	6.32
Foxd3	MA0041.1	chr12:123993695-123993707	AAACAAACAAAC	-	6.32
Foxd3	MA0041.1	chr12:123993699-123993711	AAACAAACAAAC	-	6.32
GATA2	MA0036.3	chr12:123994414-123994425	AAAGATAAGAA	-	6.62
RREB1	MA0073.1	chr12:123996119-123996139	GGTCTGTGGGTGGTGTGAGG	-	6.13
RREB1	MA0073.1	chr12:123995464-123995484	TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr12:123995514-123995534	TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr12:123995677-123995697	TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr12:123996316-123996336	TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr12:123996620-123996640	TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr12:123996666-123996686	TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr12:123996213-123996233	TCTGTGTGTGTGGTGTGTGG	-	6.24
RREB1	MA0073.1	chr12:123996815-123996835	TGTGTGTGGGTGGTGTGTGA	-	6.32
RREB1	MA0073.1	chr12:123995588-123995608	TGTGTGTGTGTGGTGTGTGG	-	6.68
STAT3	MA0144.2	chr12:123994873-123994884	CTTCCCAGAAA	-	6.02
TP63	MA0525.2	chr12:123997858-123997876	CACTTGTCCCGACATGCC	-	6.25
ZNF740	MA0753.2	chr12:123994900-123994913	GTGGGGGGTGTGG	-	6.03
Zfx	MA0146.2	chr12:123994503-123994517	GGAGCCGAGGCCTG	+	6.61

dbSUPER

Number of super-enhancer constituents: 3
ID	Coordinate	Tissue/cell

SE_41489	chr12:123996593-123999071	Left_Ventricle
SE_49060	chr12:123994038-123995094	Right_Atrium
SE_49060	chr12:123995289-123999069	Right_Atrium

HEDD

Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6
Chromosome	Start	End

chr12	123994131	123994400
chr12	123993756	123993862
chr12	123996116	123996243
chr12	123997731	123997985
chr12	123994116	123994289
chr12	123997475	123997717

GeneHancer

Number: 2
ID	Chromosome	Start	End

GH12I123512	chr12	123997481	123997630
GH12I123509	chr12	123994039	123995094

Enhancer Sequence

TAAGTTATAC CTCAATTTAA AATGTTAAGG CCGGGCACAG TGGCTCGTGC CTGTAATCCC 60
AGCACTTTGG GAGGACAAGG TAGGAGAATT GCTTGAGCCC AGGAATTACA GGCTGCAGCG 120
AGCTATGATC GCATCATTGC ACTCCACCTG GGTGACAAAG TGAGCCCTCA TCTCCAAAAA 180
AAAAAAGTTG CTAAAAAAAA CAATAGCCAA GGCTGGGCGC GGTGACTCAC ACCTGTAATC 240
CCAGCACTTT GGGAAGCTGA GGAGGGCGGA TCACTTGAGG TCAGGAGTTG GAGACCAACC 300
TGGTCAACAT GGTGAAACCT CTCGTCTCTA CTAATAATAC AAAAATGAGC TGGAAATCGC 360
TTCAACTCAG GAGGCAGAGG TTGCAGTGAG CCAAGATCAC ACCACTGCAC TCCAGCCTGG 420
GCAGGAGAGT GAGACTCCGT CTCAAAACAA CAAACAAACA AACAAACAAA CAAAAATAGC 480
CAAGAAGTGG AAGCAAGCTA AATGTCCATC AACGGAAGAA TGGAATAAAG AAAATGTGGT 540
CTGTCCATAC AACGGAATGT TACTCAGCCT TAAAAAAGGA AGGAAATCGG CTGGGCATGG 600
TGGCTCACGC CTACAACGCC TGCACTTTGG GAGGCTGAGG CAGGTGGATC ACCTGAAGTT 660
GGGAGTTCGA GACCAGCCTG ACCAACACGG AGAAACCCCA TCTCTACTAA AAATACAAAA 720
TTAGCCAGGC ATGGTGGCGC ATGCCTGTAA TCCCAGCTAC TTGGGAGGCT GAGGCTGGAG 780
AATTGCTTGA ACCTGAAAGG TGGAGGTTGC AGTGAGCTGA GATCGTGCCA CTGCACTCCA 840
GCCCGAGTAA CAAGAGCAAA ACTCCGTCTC AAAAAAAAAA AAAAAAAGAA GGAAATCCTG 900
TCACATGCTG CCACGTGGAT GAACCCTGAA GACCTTATGC TTAGTGAAAA AGCCAGGCAC 960
AAGGGACAAA CGCCGTATGA TTCCACTTCC AGGAGGAGCT CCCTAGAGAA GTCAGACCAC 1020
AGACGTGGAC GTCGTTTTCG TCAGCAAGAT GAAAGGGGTC CAGCGCCCTG CTGCCCACCC 1080
TCATGCACAC AGTAAACACC GCTGCCCTGT GCACTCACAC AGGTTACAGA GGGGCAATTC 1140
TGCGACATGT TTTCCACCAG AATGTTTAAA AGGAAAAGAT AAGAAACACT AGCTGGCCAA 1200
GGGCCCTACT GGTACAATTC ATCTCCGCCT GCTGATGGGG GAAGATGAGG ACAGCCAGTC 1260
CCTGGAGCCG AGGCCTGGCA TGTGTGGGGC AGGGGCTCCC GATGAGGAAG GTGGGAAAGA 1320
CAGGGGAAGG CCCCCCTGGA CCCTTGGGGA GCCCAGCGGC AGGGCAGGGT GTCAGCAGGT 1380
GGCCGCAGGA GTTGCTCTGC GTCCACTTTC TCTAAGCACA GAACCGGCAA CCAAGCCGGG 1440
CCCCCCGCTT GCAGTTGTGA AGTGGACCCT CTCCCCGTCA GCTCTGCTCT CCTGCCTCCG 1500
GCTGTGGGTC CTGTGAGGGA TTCCCGGGCC ATGTGGGGGG CCCGCCTGTG CCCTCTCTCC 1560
TCTCTATGCC CCAGGGACAC TGCTGCAGAG CAGTGCTGGG TTTAGCTGGT GGGACCCGGG 1620
GACACGGCTA ACGCTTCCCA GAAAGGCGAC CCTTGGGCAT GTGGGGGGTG TGGTGTGTGT 1680
GTGTGTGTGT GGTGTGTGAG GTCTGTGTGT GGTGTCAATG TGAGGTCTGT GTCTGGTGTG 1740
TGTGTGAGGT CTGTGTGTGT GAATGTGGGG TCTGTGTGTG TGGGGTATAT GTGTGTGATG 1800
TGTGTGTGTA GTGTGTGAGG TCTGTGTATG GTGTGTGTGA GGTCTGTGTG TGGTGTCAAT 1860
GTGAGGTCTG TGTCTGGTGT GTGTGTGAGG TCTGTGTGTG TGAATGTGGG GTCTGTGTGT 1920
GTGTGGTATA TGTGTGTGAT GTGTGTGTGT AGTGTGTGAG GTCTGTGTAT GGTGTGTGTG 1980
AGGTCTGTGT GTGTGTGGTG TGTGAGGTCT GTGTGTGGTG TCAATGTGAG GTCTGTGTCT 2040
GGTGTGTGTG TGAGGTCTGT GTGTGTGAAT GTGGGGTCTG TGTGTGTGTG GTATATGTGT 2100
GTGATGTGTG TGTGTAGTGT GTGAGGTCTG TGTATGGTGT GTGTGAGGTC TGTGTGTGTG 2160
TGGTGTGTGA GGTCTGTGTG CAGTGTGTGT GTGAGGTCTG TGTGTGTGTG TATTGTGTGA 2220
GGTCTGTGTG TGTGTGGTGT GTGTAAGGTT TGTGTGTATG TGATGTGTGA GGTCTGTGTG 2280
TGTGTGGTGT GTGTGAGGTC TGTGTGTGTG GTGTGTGCAG TGTGAGTGTA TGTCTGTGTG 2340
GTGGCATCTG TGTGTGTGTG GTGTGTGGGG TCTGTGTGTG TGTGAGGTCT GTGTGTGGTG 2400
TGTGTGTTAG GTCTGTGTGT GTGGTGTGTG AGGTCTATGT GTGTGTGTGG TGTGTGTGAG 2460
GTCTGTGTGT GGTGTTTGTG TGAGGTCTGT GTGTGTGTGG TGTGTGAGGT CTGTATGTGT 2520
GTGTGTGGTG TGTCTGAGGT CTGTGTGTGG TGTGTGTGTG AGGTCTGTGT GTGTGTGGTG 2580
TGTGCAGTGT GAGTGTATGT CTGTGCGGTG GCATCTGTGT GTGTGGTGTG TGAGGTCTGT 2640
GTGTAGTGTC AATGTGAGGT CTGTGTGTGG TGTCTGTGTG AGGTCTGTGT GTGTGGTGTG 2700
TGAGGTCTGT GTGTGTGAGG TCTGTGTGTG AGGTCTCTGT GTGTGTGGTC TCTGTGTGGT 2760
GTGTGTGTGA GGTCTGTGTG TGTGGTGTGT GAGGTCTGTA TGTGTGTATG TGGTGTGTCT 2820
GAGGTCTGTG TGTGGTGTGT GTGAGGTCTG TGTGAGGTCT GTGTGTGTGG TATGTGTGAG 2880
GTCTGTGGGT GGTGTGAGGT CTGTGTGTGT GGTGTGTGTG AGGTCTGTGT GTGGTGTGTG 2940
AGGTCTGTGT GTGTGAGATC TGTATGTGTG AGGTCTGTGT GTGTGGTGTG TGGTGTGTGT 3000
GTGTGGTGTG AGATCTGTGT GTGTGTGAGG TTTGTGTGTG TGGTGTGTGT GAGGTCTGTG 3060
TGTGGTGTGT GAGGTTTGTG TGTGTGTGGT GTGTGTGAGG TCTGTGTGTG GTGTGTGAGG 3120
TCTGTGTGTG TGTGTGAGAT CTGTATGTGT GAGGTCTGTG TCTGTGTGTG GTGTGTGAGG 3180
TTTGTGTGTG TGTGTGGTGT GAGATCTGTA TGTGTGAGGT CTGTGTCTGT GTGTGGTGTG 3240
TGAGGTTTGT GTGTGTGTGT GGTGTGAGAT CTGTGTGTGT GTGAGGTCTG TGTGTGGTGT 3300
GTGAGATCTG TATGTGTGAG GTCTGTGTGT GTAGTGTGTG AGGTTTGTGT GTGTGAGGTC 3360
TGTGTGTGGT GTGTGAGGTC TGTGTGTGTG TGGTGTGTGT GAGGTCTGTG TGTGGTGTGT 3420
GAGGTTTGTG TGTGTGTGGT GTGTGTGAGG TCTGTGTGTG TGGTGTGTGA GGTCTGTGTG 3480
TGTGTGGTGT GTGAGGTCTG TGTGTGTGGT GTGTCTGAGG TCTGTGTGTG GTGTGTGTGT 3540
GGTGTGTGCA GTGTGTGTGT ATCTGCGGTG GCATCTGTGT GTGGGTGGTG TGTGAGGTCT 3600
GTGTGGAGGT CTGTGTGTGG TGTCAATGTG AGGTCTCTGT GTGGTGTGTG AGGTCTGTAT 3660
GTGTGTGTGT GTGTGTGGTG TGTCTGAGGT CTGTGTGTGT GGTGTGTGAG GTCTGTGTGT 3720
GTGTGGTGTG TCTGAGGTCT GTGTGTGTGG TGTGTGAGGT CTGTATGTGT GTGTGAGGGC 3780
TGTGTGTGAG GTCTGTGTGT GTGTGGTGTG AGATCTGTGT GTGTGTGAGG TCTGTGTGTG 3840
TGTGGTCTGT GTGTGGTGTG TGTGTGAGGT CTGTATGTGT GTGAGGTCTG TGTGTGGTGT 3900
GTGAGATCTG TATGTGTGAG GTCTGTGTCT GTGTGTCGTG TGTGAGGTCT GTGTGTGGTG 3960
TGAGAGCTGT GTGTGTGTGA GGTCTGTGTG TGGTGTGTGA GGTTTGTATG TGTGTGGTGT 4020
GTGTGAGGTC TGTGTGTGGT GTGTGAAGTT TGTGTGTGTG TGTGGTATGT GTGAGGTCTG 4080
TGTGTGGTGT GTGAGGTTTG TGTGTGTGTG TGGTGTGAGA TCTGTGTATG TGTGAGGTCT 4140
GTGTGTGCTG TGTGAGGTTT GTGTGTGTGT GGTGTGTGAG GTCTGTGTGT GTGTGGTGTG 4200
TGCAGTGTGA GTGCGTGTAT GTGTGTGGTG ACATCTGTGT GTGTGTGGTG TGTGAGGTCC 4260
GTGTGTGTGT GGTGTGTGTG AGGTCTGTGT GTGGTATGTG AGGTTTGTGT GTGGTGTGAG 4320
ATCTGTGTGT ATGAGGTCTG TGTGGTGTGT GAGGTTTGTG TGTGAGGTCT GCGTGTGTGC 4380
TGTGTGCAGT GTGAGTGCGT GTATGTCTGT GTGGTGGCGT CTGTGTGTGT GTGGTGTGTG 4440
AGGTCCGTGT GTGTGTGGTG TGAGGTCTGT GTGTGTGGCG TGTGTGAGTG GGTGTATGTG 4500
TGTGTCTGTG TGGGTGTTGT ATGTGTGTGT CGTGTGTGTT TGGGGGCTGA GGTCCCATGT 4560
AGACAGAAGT CAGTGCCAAA GCCACAAACT CCTCCCGACC CCCCGCCTGC CATTTGAACA 4620
CTTGTCCCGA CATGCCCTGT CCTGGGGCGC CAGGACCCAC TCACTCATTT ACTCCTTGCT 4680
GGGGCTGCCT TGGCTCCCCG AGAGGTGGGC GGGAGGCGAG CATGAGGAGA GAGGGGCGGC 4740
TGGGTCTATG TGGAAGCCCA GCAGCCTCAT CACCTTCCTG GGCGGCAGCC GTAGGAGCTA 4800
TGAGACCGAG GCAGAAGCCT GGCGCCTGAC TCCTATCCCA GCTTCGGCCT CTTAGTTGCT 4860
TTCCCTTCAG GCCTCGGTGC TCTCGAGAGG CCTGTGCACG 4900