EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-08673 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr12:46940220-46945680 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr12:46944937-46944949AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:46944941-46944953AAACAAACAAAC-6.32
MNX1MA0707.1chr12:46941770-46941780TTTAATTACC-6.02
NFAT5MA0606.1chr12:46943846-46943856ATTTTCCATT+6.02
NFATC1MA0624.1chr12:46943846-46943856ATTTTCCATT+6.02
NFATC3MA0625.1chr12:46943846-46943856ATTTTCCATT+6.02
NFYAMA0060.3chr12:46942059-46942070AGCCAATCAGA+6.32
NFYBMA0502.1chr12:46942054-46942069AAATGAGCCAATCAG+8.42
SOX10MA0442.2chr12:46945538-46945549TGCTTTGTTTT-6.02
ZNF263MA0528.1chr12:46943457-46943478CTTTCCTCTCAACCATCCTCC-6.01
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_34940chr12:46940255-46945995HeLa
SE_35912chr12:46940092-46945994HMEC
SE_37842chr12:46940248-46944565HSMMtube
SE_39344chr12:46940196-46944534IMR90
SE_43715chr12:46940055-46945614MM1S
SE_45259chr12:46940146-46941584NHLF
SE_45259chr12:46941787-46944755NHLF
SE_46224chr12:46940207-46945157Osteoblasts
SE_56537chr12:46940240-46952971u87
SE_64227chr12:46940192-46955318NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr124694355846944140
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I046546chr124694028946957960
Enhancer Sequence
TGCATTATTT TATTTCATCC TCATATCAAT CTGCAAAATA GTTATTTTCT CCATTTTATA 60
GATGAAGAAG GTGAAGCTCA GAGCAATTAG GAAGTCTGCC TAGTGTCTCA GATGGAGTAA 120
GTGGTGGTGT TGAGATTTGT ACCCAGGTAG GCTCCCAAGC CCATGTCAAC AATTACTGTG 180
ACACACACAG GCTCTTCCTG TGTTGAGCAC CACAGGAAGA GAAGGTTTGG AGAGGGAAAG 240
GAGGAGATGG TGATCACATA GTATTATGTG TTCTACTATC CAACTATTTT GGGTTTTGCT 300
TGCATGAAAA TGCATGGGAG CAGCAGTGCT TCCTTCTTAT CTGGAGGAAT TGGCAGGGTG 360
GGAGGTGGAA GAGGGAGCCT AGAAGGTACC CTTTACAAGC ATCCTGTTGA CCTCATGGTG 420
TTTCTCTCCT GCCCCCTCCA GAGTAGTTGC TGATAAAGGA GATATAAAGG AGCAGGGTTC 480
TTCAGGTCAG AGTTTCTAGC TTTAGTGGGA ATGCCAACAG AGAAAGGGAC CCAGTGTCTG 540
AAGCCACAGG CAAGGAAGCT CAGGGCTCCA TAGAGGTGGA CAGGCAGCTT ACATCTCATC 600
TCATGGCTAA GCACATTAAC CACATAAGCT TCCTCTAACT GCTGAACTCA CAGCAAATAA 660
ACACACGCCC ACACAACCAG TAAGTAAGTA TCAGTGGAGC AGATGCAAAT GAAATACAAG 720
TGATGAACTG CTGTCAGTTC TTGGGGTATT TGGCACCTGC GTCAACTCCA GAAGGAATGT 780
GACCTCTTGG GTAAGGAGGG CATGATTTCA GAGGCACCAA GAGGACCTTT CCACCAAATT 840
CAGCTTTTTA ATTTTTTTTT TAAATCTGAA ATTCTACAAT TATAAATTCA TTCCTCCCCT 900
TTCAAAATGA AGCACTTTAT ACTAAAGAAG AACCCACTTA AAGCTTCATT AATTATTTCT 960
TCCCTGAAGA AGAATCAGTC TTTTGGGTTC TATCTTGAGA ACACATTTTG AGAGTAGGGC 1020
AGGGAAGGAA TGAAATTTCT GTCAGCAGAG AGATGAAGAA GGCTGGCCTG AGAAGGCAGG 1080
AATATACAAA CTAACTGATG AGGGTTAACC AGTATGCCAT TTTTATGCAA GTCAGTACAG 1140
GTTTCTCAGT AAAGTACGGG CAAATAGAAA TGTAATTTAT GAATATTTCA TCATTCTTTG 1200
TCATATAGGC CAGCCAGAAA GGGCAAAAAG AAAAAGATAT TCAGAGATGT GACTTCTTGG 1260
TGTCCTTCTG CACTTGACAG AAGCTACCCC TTTGGGAAAA ACTGGATAGT TTGTAGATCT 1320
GCCACAGAAA ATTCAACATC TCTAAAGGCA TACTAGTGCT AAATGGACAT ATTATTACTT 1380
TTGCTATCTC ACCTATTGGC ATGTGCTTGT GTGTGAGGAG GGATTATGGA CAGGATGGGG 1440
AATAGGAGAG TGTCAAGAAT GAATGGGCAT TGCCCAAGAA GGTGAATCAG CTGACTGTTC 1500
AATCTACCTG GAAGTAAAAA TAACTGGGGA GCAGAAAATC TTATGCATAT TTTAATTACC 1560
TTGTCTAGAA CATGAAATGA CAAGAATGTG TACTATATTT ATTGGGCTAC TGAATTCTCT 1620
ATTTCATGCC CCTAGGCACT CCCAGAAGTC TGATTCTATT TCCTTGAAAA AATACCAAGC 1680
ATTTCTCCTT CAAGAATGAT TGAGGGGTTG CCTTCTGTTG TTGCTTTACT AACCACCTCC 1740
CTCAACCAAA CACCCACAGG CAAGTTGCCT CTCATTCTCC AATCTAGGCA AAGAGTGAAT 1800
CTTTTGTTGT TATTTGCAGG AAATGGGACA CAGGAAATGA GCCAATCAGA ATCAGCATTA 1860
GGCCATTTTT TTTCCCTTGT CCCTCTTTCT CAATCTTTTT AATTGGGAAA AGTACTTGTT 1920
TTAAAATCTA GTAAATATGA TACAAATTGA ACATCCAACT ATAAGAAGAA TCATCAGAAA 1980
AAAAATCAGG ATTTCTCTTC AAAGTTTACA GAGACTTAAT ATAACTCCTT TTCTTAATAG 2040
TTATTTTTCT TTGAATTAGG CAGTGGTAAC TAAAGCTAAA ACAACCACCA CCACAGTGGT 2100
AATAAAGGCT AAACGACCTT CCACTGCCCT TGTTTATGCT TTTCTCATCA GTTGAGCTTT 2160
CCGTTTCTTC AAAGTCCCAC AGAAATGGCT GGCAATTTTC AATCATCAAA TCAAAGCCCT 2220
TTGTTGGAAT TGTTTCTTTG GTGTAACGCA GGATATGCTG CCAGTAATTT GATCAGTTCA 2280
GTCATTTCCA TAATTAGAAC AAGAGCACGT CTTCCTAAAG TATGTGCTTA TTCCATGGTC 2340
TGAAGTCACA CAAAAGGGAA TGTGCAAAGC CCTTATGTTG TGTGGTTCTA AAATAGCAGC 2400
TGTTTTTTAT ATATTTACCT CTTAACAATT TGCCCACCAT CCTAGGTAGA CAAACTTATA 2460
GCTCTGCTCT ATCTGCTGAT GACTGATGAA ATGCAAGTCA GAGCATTTCA CTTTAACTAT 2520
ATTGTTTGTC TGTTTAATAG GTGTGGCATG CATACCCACT CATATAAGAC TCATTCAAAA 2580
TCTTCCTGGG TTCCTCAAGA GCAGAGGGAA GGCAACACTT AAATACTTTG AGTATTCTCT 2640
CTTCATATTA TTTGTGTACC TGTAGAGCTT TATGCCTATG ACAACCTTGG TGTAATGTGG 2700
TAACAGTCTC ATGGGATTAC CAAGGTTGTA GGTTCCCTAC CCTCACTTTA AAGAAGGGGA 2760
ATTTTGGCCG GGTACGGTGG CTCACGCCTG TAATCCCAGC ACTTAGGGAG CCCAAGCTGG 2820
GCAGATCACG AGGTCAGGAG TTCGAGACCA GTCTGGCCAA CATAGTGAAA ACCCATCTCT 2880
ACTAAAAATA CACAAAATTA GCCGGGTGTT GTGGTGTGTG CCTGTAATCC CAGTTACTTG 2940
GGAGGCTGAG GCAGGAGAAT CGCTTGAACC CAGGAGGCAG AGGTTGCGGT GAGCCGAGAT 3000
CGCACCATTG CACTCCAGCC CGGGTGACAG TGTGAGGCTC TATCTCGAAA AAAAAAAAAG 3060
AAGAAGAAAA AAAAAAGGAG GTGGGGGGTG GGAATTTTGA GCAGTGGGTG CATTTATCTG 3120
AGACTATTTG TGGGGTAGTT GAGATAGCTG TGCTCCAATG CTCAGCTCAC ACCACATCCA 3180
AATGTCTTTC TCATTGTCAT TTCACTGTCT TCTTGTGGTC TCCCTGTTCT GTTCTCTCTT 3240
TCCTCTCAAC CATCCTCCAC ACAGCAGTTA GAATAAACTT TCTCACATCC TTTCATCATG 3300
TTACTCCTCA TTTTCTAACT TGTAAAATTC AGACATCTCA GCTTACCCTT CCTGACAACT 3360
ATCTTTGTGT TATGGCAGAC TTGTTTAACA TGAATTTCTC TGGTACCATG AAGATATGTT 3420
CCAAGGCCCC CAGTGGATGC CCGAAACTGC AGTTAGTACC GAACCCTATA TATGCTATGC 3480
TTTTTCCTGT ACATACGTAC CGTACAGCAC CAGCGTACTG GACAAAGGGA TGATTCATTT 3540
CCTGGGAGGG GTGGAATGGG ATGACACAAG ATTTCATCAC ACTACTCAGA ATGGCGTGCA 3600
ATTTAAAACT TATGAATTGT TTATACATTT TCCATTTACT ATTTTCACAC TGCAGTTGAT 3660
CCTGGGTAAC TGAAACTGAG AATAAGGAGG TGACTATTGT GCATACTTTG AAATGCTGAA 3720
TTAACTGTCT TGTCACTGCT CTGATGACTT CTTTCTCCTC AAGGCCAGCA TGAAACCCTC 3780
CTTCCTTCTG AAACGGTGAT GAAAAGTGCC TTTATCCAGG AAGTCTTCCC TGATGGATTT 3840
CAACACCTTT CTATCTAATT TAAATACACT TTACCTAATT TTGCAACAAG ATAAAAGAAC 3900
TTTCTAAGTG TCCTCCATAA TCCTACCACC CTAACACAAC TTCTTGAACT TCTCTGTTTC 3960
CTTCCAAGTC TCTCCTACCT GCATATAAAC TTTTCATGGT TGTGATGTAT ACAACTTGTA 4020
TGATTTTTGT CATTTAACAA TATTTTGTAA CTTTCCACAC CACTATACTA CCTTCATTTT 4080
TAGTAATGAT AGTACATTTT TTATGGGTAG TGAGTGATAG TAGAGAGAGG GAGAGAGTAG 4140
AATTTGTAGC CAGCATATGT GTAACCTTGG GCAAGGTACA TAAGCCCCTT GGAGCATCAA 4200
TTTGTTCACC CGTGAAACGG GGATGAAATG TATGTAAAGC ACATCATACA GTACCTGACA 4260
TTTGACAAAT ACTGGCTGTG ATTCGTTACC AAGTTTAATT AAGCCATATG CACTTGTTTT 4320
TTATGGTTTA CTGCTTTGAA AATTTTTGTG ACGATTTCAT GGGCAGTTCC CAGACAATTG 4380
ATAAGCTCCT CTAAAGATGG GAACTTTTTT TAAATTTTGT ATCACTTCCT AGGTCTTCTG 4440
TTAAAAGATG GAGGTCTCCC TCAGTGGACT GTCAATCGTT CAATGCAGTG GCTGACTGCA 4500
TTTCATTCTA AATAATTTTT CTCTTCAAAT TGAAACCTAG TCACTAGGTT TCTGTGCTCT 4560
AAGCCCTTTA AACCTAGTTA TACGTTGACA AAATAGAAGT AGCTTTGGTA TCCTTTTAAT 4620
TCCTACATCA TCCCTATCCC CTTTTCAGCT GAGTAAAGCT GAGTCTTTTG CTCTAACCTC 4680
AGTACCTTAA CTCTAAAAAG AAACCAACCA ACCAACCAAA CAAACAAACA AACACTTGGA 4740
CAAACAGCTT CGCCTTCATC AAAAGGAGTG TGTCAGGCTG GGCGTGGTGG CTCACGCCTG 4800
TAATCCCAGC ACTTTGGGAT CAAAAAGAAT CTCACTACTG TTAAAAAAGT CAAAAGGCAT 4860
TCTTCAGACT AAATTGGTGT CTCTTTTGCT TTGTTGCTTT TTCTTCCTTT CTTGAAATCT 4920
TCTGGAATGA TTGAAACCTA GGAAGCAGCA TGATTTGAGA TGACAAGGGT TTAGTCATCA 4980
ACACACCTTC TGTAGATGCA TTTCTAGCTC CAAAATGACA TGGAGATAGA GCAGGGCCAG 5040
TTCAGGTCTG ATTTTTCCAC ATTAATTTAT ATCCTAAACT TTAGACTAAG GGCACCATTT 5100
CACATAGTGC TGTACCAAAT TTTAGGAGAA TCATTTCCTT CACAGTAGAA TGTCTATCAA 5160
ACCTATGTGC AATGTACTCT GCAATAATAA AGAAGCATTT TGCTAAAGCA TGAGGAACTG 5220
AGCCTCTTGT TTTTGAAAAG TAGTTATGAA ATCATCTCTT TTTGTTTTAA ATCCAAGTAG 5280
ACTAAATTTC TGATTGAAAA GAATTGAAGG TTTTGTTTTG CTTTGTTTTG AATATCACTC 5340
CCACCAGGAA TTATCAAGTA GAATTTATTC TTAGAATATG AAAAGGGGTA GAGATATATT 5400
TTCAACATGC TCTCTAGATC ATTGAACCAA AAAACCATAA TTTTTGACAT GTTTCAGCAG 5460