EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-08437 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr12:27706920-27709600 
Target genes
Number: 10             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFICMA0161.2chr12:27708477-27708488TTCTTGGCAGA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03790chr12:27703945-27709987Brain_Angular_Gyrus
SE_07252chr12:27701414-27711689Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08320chr12:27700805-27710329Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_35853chr12:27705685-27710031HMEC
SE_41040chr12:27703940-27708673Left_Ventricle
SE_41040chr12:27708843-27709964Left_Ventricle
SE_43068chr12:27704961-27708517Lung
SE_43068chr12:27708921-27710005Lung
SE_44212chr12:27703934-27710227NHDF-Ad
SE_45579chr12:27698172-27710328Osteoblasts
SE_47027chr12:27706850-27707241Ovary
SE_47027chr12:27707264-27708168Ovary
SE_47349chr12:27700501-27711498Panc1
SE_55934chr12:27699789-27710279u87
SE_64268chr12:27706949-27710131NHEK
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I027547chr122770008327711987
Enhancer Sequence
CAGAAAAAGG CATCTTTTGG AATGCCAGTG TTTCATCTAA GTTTAATTTG ATACCAAGGG 60
CTGCTTGACA GCACCCATCT GGTTAACACT GAGTGCTTAG ATGTATATTA CGGTAAATGG 120
CTTAAAACTG GCAACTTCTA GACATTAGCT CACAATCCCG TTAAGATTCC TGTTAAGCCC 180
TGGGGATAAT GCACAGCCTG GTGTAATCAA GAAAACTGTA GCAGTTACAC TCATCCCAAC 240
ATCCCAATTA TTCCTAACTT AAATGTTGCC ATCCGCCAGA TTTCTCAGCC TAGTGAAGCT 300
GTTCCCTCCA TTTAAAACAA TTGCTTTCTG AAAATTTGTG TTTCTTTGGT AAAAAGATAT 360
ACACTAGGAG GAAATGATTT GGAATTTAGA AGTGCTCACT ACAGGGTTCT TATTCAGTAT 420
TTTTATCAGT GATTGGGAGT TGCGGTTGAA ACCAGGCTGG GAGAGACAGC TGATGACAGT 480
CAGAATCCAG AAAATAATCC GTACAAACGA TGACAATGGT AAAGTGAAGT TGATAATGCT 540
TTAAATAACA AAGCTGTATG TCACGCTGTG AATATACTTG AAAAAAAATC AACTGAAAAC 600
TGACATGACT TGGTTTGGTA AAAACTCCCT GGAGGTTTGT AGTTCAGCAG AAGCCAAATC 660
TGTGATATTG CTGTGAATGG AAAGTTCATC TAACCGTGTT TAGCAAATTT AATGCAAGTT 720
AGTGTCCAGT TTCTGGAGAT AATGGTTCCT TTGTGCACGT TGTCGGAGAT CCTACATCTG 780
GAGTCTTGTG CTTGACTCCA TACACTTTAA GAGGAATGTT GCCAAATTGG AATGTTCCCA 840
GTGTTGGGGT GTGGAGATCG TGCTGACACC AGAGGTCTGG AAATTGTGTC CCCTTCGGAG 900
TGGTTTGAAG AACTGGGGCT GTGATGTCCT AGGAAGTTAA GGGAGACAGG GCTGCTATTA 960
TAAAACATTT GCCTGCTTGC CAAGCAGAAG AAGGAATAGG CTTGTATTTT TTGATCCCTG 1020
AGGACGGACC TCAAATGGCA ACAGAGGCTG GGGTGGGGCG TGCATTCTTG TTCGTTCATG 1080
GAAGGCAGGC CCTTCCAGTA AGCAAACGAG CCAAGCTGTT GACAGGAGGT GGCAAGATTT 1140
ATGGAGATGC CTCAGAAAAT ATTCGGGCTT TCAGCCTAGA TGTTGGCTCA GGTCCCCTTC 1200
GACAATAAGG TTCTATGGTT TTGTAAAATA GCTAGCACCC CTGGTTCTTT TCAAAAATTA 1260
TTTTCTTCAG AGAGATAGAA TGGTGGAAGA AAGGCACTCT TTGCTGTGGC ATAGATCATA 1320
GAAAGCACAA TAACTGCTTG TTTCTCATGA GAGCTGAAAA TGCTCTGGAG ATTTCTCTAA 1380
ATGTGGCTTT TCTTGTTCTT TATTTTCTGC AGATCCTGTC AGGACTATAG ATTCCTTATT 1440
CCTTTATTTG ATTTGGTGTT TCACTCGAGC GGGCTAAATA ACAGTGATTA TTATATGCAA 1500
AAAAGGTTGC TACAGTTATT TTTCCCCCTG ATATGAAAGC TAAGCCTTGT TTTCCTCTTC 1560
TTGGCAGAAA TTGTGCTTTT CTTTGGAGGA AATCATAAAT CATGATTGAA AGCAAAAGCT 1620
GTTTTGACCC AACTCTTCCC CTTTTCTCTA TGGAGAAACA ATCACTTGGC GATGATATAG 1680
CACGTACGAG ACAGATGATC AGAATTAAAT TCTTTTATCT GTTAACAAGC TCATCTTTTC 1740
ATTGACTCAA ATCCTTTTAA GAAATATTAT TTTGGGGGAA AAAGCCCCCA TTTTGTGTTA 1800
ATTTTTCTGA TCCTTTGACA AATATGTTTA TTATTCTTTT AAGCAAGTTG GGCACCATTT 1860
TACATAAAAT TATAGCTTAA ATCAGAGCCT TATGATTGAA AGAGACTTTG CATAAAAAAA 1920
GCAATTACTT ATTTGTCCAT GTTAAACTTA GATGCAGTGT TTAGAACTTA AACTGTGAAG 1980
TTTAAGTTGA ATTATGAGTA ATGAATACAG AATATTTTGG AATTAACAAT TAGCCTACTG 2040
AATAAAGCTG CTTCCTGAAT ACATCTATTG CTTTTGAAGT CAAGTATTTT CTTGGCATCA 2100
CAACAGGCCA GTTTTGAGTA ACCTTGTTGT GGTTGATATG CTAGTTTCAA AATCTGCTGG 2160
AGAAATCAAA GCTCGGTGTG GTTTTCTGAC TTCCCACATG ATTAACTGTA AGATCCCTGC 2220
CATATAGATG GCTAATAATA TTTTCCATAG CCACCTGGGA GTAACAAAGA GCATTAACAT 2280
TCATTACTGC ATGTTAATGA AACACATAAA TATTGAAAAT AAATATTGTA TGACTTGAAT 2340
CTTTAGCAAG GTTTCTATTC TTTGCCAGTG ATAACGTTTG TTATCATAGA GTGAAAAACC 2400
AGTTTCAGGC GTCACACCAA ACAGGAGCTA TCATGGTAAT ACCCAGAAAA TGTGACAAAA 2460
GGCTAACTGT TGTGGACTTA GCTTGCGTTG TTAGTTATAC AGATTTTTTG CAGAGATTTG 2520
ATATGAAGTT GGGTTTATAG GAATTAGGAA TTCATGATGG AGTCTCATGT TTATTGCTTC 2580
TTGGTCCGCA TTGGGAAAGT TGTCAGTTAC TGAGGGAACA GGAAATTTCC ATTGTGCTTT 2640
GCTGCTGGCA GTCTGGATTT GTGTTGTTTT AGAAGTTTTC 2680