EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-03963 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:234658130-234661070 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
Number of super-enhancer constituents: 40             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00256chr1:234657922-234660554Adipose_Nuclei
SE_02030chr1:234658240-234659366Aorta
SE_03087chr1:234658349-234659400Bladder
SE_03277chr1:234658115-234659704Brain_Angular_Gyrus
SE_03881chr1:234658002-234659912Brain_Anterior_Caudate
SE_04834chr1:234657859-234660473Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06031chr1:234654506-234660488Brain_Hippocampus_Middle
SE_06706chr1:234656883-234661332Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07941chr1:234656052-234660102Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08855chr1:234658356-234659378Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_25723chr1:234655759-234660382DND41
SE_25723chr1:234660620-234661698DND41
SE_25924chr1:234657982-234660127Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26846chr1:234658264-234659486Esophagus
SE_27803chr1:234658261-234660379Fetal_Intestine
SE_28730chr1:234658169-234660481Fetal_Intestine_Large
SE_29594chr1:234656189-234660440Fetal_Muscle
SE_32368chr1:234658208-234659696Gastric
SE_33599chr1:234658052-234661616H2171
SE_33857chr1:234658262-234660015HCC1954
SE_36308chr1:234658046-234660473HMEC
SE_37893chr1:234657436-234660325HSMMtube
SE_39731chr1:234658084-234659646Jurkat
SE_39731chr1:234659796-234661757Jurkat
SE_40608chr1:234658060-234659500Left_Ventricle
SE_42030chr1:234658283-234659257LNCaP
SE_42375chr1:234658067-234659689Lung
SE_42375chr1:234660648-234661732Lung
SE_45860chr1:234658048-234660595Osteoblasts
SE_47805chr1:234658360-234659326Pancreas
SE_48212chr1:234655856-234659626Psoas_Muscle
SE_48672chr1:234658073-234659556Right_Atrium
SE_51126chr1:234652894-234661725Skeletal_Muscle
SE_54537chr1:234657117-234661453Stomach_Smooth_Muscle
SE_61054chr1:234622432-234680799HBL1
SE_61473chr1:234622384-234680928Toledo
SE_64732chr1:234658798-234660226NHEK
SE_66634chr1:234658084-234659646Jurkat
SE_66634chr1:234659796-234661757Jurkat
SE_68387chr1:234634206-234681763TC32
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I234520chr1234656067234660375
GH01I234525chr1234660948234661546
Enhancer Sequence
TCGAACTCCT GACCTTAGGT GATCTGCCCA CCTCGGCCTC CCAAAGTGCT GGGATTACAG 60
GCGTTTGCCA TCGGCCTGGT CCAGATTTTT ATTTTTCAAA TGAAATGAGA AGCTTGGGTT 120
TCACTCTAAA CGTTCTTTTC AACTCTGAAA CCCAGCAATT CTGAATCTCT CTACTTCTGG 180
GCAACTCTGT TTCCATTCTT CCGGGGTTCA TGGGAGAGAA CCTTCTTCAG AGAGGCTGAT 240
GCAAGAGCTC CAGGGGAGGG GCACTGAGGG CACATGAATT GTGGAACAGA AACAGCGATG 300
GTTACAGCAG CTGGCAGAGT GAGGAAGCAG CGGTCTCGGG AGTCCCAGCC CGAAGGCAGA 360
TTTCCTGGCC ACAAAAGCAC CAACGGACAA GACTCCACCA ACGGTGCCCC TTGGATGGTG 420
GAGTCCAGCT GCCAAGCTCA CTCAGGGGAC AGTGGCTCTT TTCTCAGTCA CTCATCATGG 480
CACTAGGGAT TAAGTGCATT TAATAACACC CCCACTCTGC ATTTAATAAC CCTCCAAAAC 540
CCAAATGACT CTCCTGCACA TTGAAGCTGC TTAAACCATT GACTGTGATC AACTGCTATA 600
GCAACTGCCT AACAGTCTGG AGGGGTGTGC ACAGGGAAAA CACCTCAACT ACCACACATT 660
ACGTGTTCTT GCTGAGAGAG AGAAGGAAGG GACGTGAGTT CAAGGCTCCC TTTGCTCCTC 720
GCAGATGGTA CTTTTCAATG TAAAATATGC CAAGACGAAT GTGGAGCTCA AGCTACTGGG 780
ACAGCGAATA AAGATGCCGG GAAAAGGAGG AAAGAGATTT CACATGGGCA ACGGTTGACA 840
AGTCTTTCTT GTTTGTGGCT TGCAGTGAGC AGTGGACAGG CATTCTCAGA TCAGGTCAGA 900
GAGCAAGTCA TCAATGGGGG CAAATTCCAG TCGGGTCTTT CAACTGACCG TTTTGTTCAA 960
TGAATGTCAC ACTGTAACAG GATAATTGGA GGGTTTGGGT AAGCTGGTGA GGGAATAAGG 1020
GCTTTTCCTA AGAATGATAA AAGCAGAGAG GCAGCTCTCA GCTCTAAGCT GGCTGCCCTG 1080
TTTCTGCAAA AATAGGTCCT TTAACATGGA GAAGCAGAAA TCTAAACCTT CTTAAATCCC 1140
CTCGAATGTT TTGAATAGAA CAAACACCTA TTTAATGAAA GAAATACATT TTCAAAGATC 1200
ATAGCAACAG GACACACGAG CTGCTTGGTC ACCTAAGTGT TTTTGGAAAA GGAAAAGAGC 1260
TATTCAGCAT TAAAGATTCA GGAATGTCTG TTGACATATT AAGGAAACAA CCTCAGGGGA 1320
CAGCTGACAA GGCTCCAAGA AGCATCACCA AGGGAACAGT GACGCAAACG CATTCCGTTT 1380
TTACAGGCTG GCAGGCTGCC AGGTTCCCTC GCCTGACGGC TGATGTAATG CTAATCCCTA 1440
TCTGGGTGAG CGTTGCTTAG ATATCAACTC AAGCAGCTCA GTCAGTTGCA ATCAATAGCA 1500
GGATCCTTTT ATAGAAGATA GTAAAGGGAA AAAATACATG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTA 1560
TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA 1620
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAAAACCC CAGATTCTGG TGTTCTGCAA ACCTATACAT 1680
CGTACAAAAA AAAAAAAACA TTATGCACTC AGGTGTCTCC ATATGGAGTA TAGCCAGTTG 1740
TCTAGGAAAG ATATTGCTAT TTCATAAGAC CAGTTCTTTT TTTAAAGCAT AACTAAAGAA 1800
TATGCCTAAT TCCCAGCTGA GCTAAATAAT GATGGAAGAA AACAGAAGAC ATTAGGTGGG 1860
AATGTGAAAA TAATGATCTT TTTCATTATT GAATAAATGG GCTGATTCCT TTTAAACCTA 1920
TGCATAAAAT ATTACTTTTT AAAAACTTCT TTCTTCAAGA CCACTGCTTT TCAGTTATTT 1980
TAGAATAAAT AATAAGAATA GTAATTATGC ACATTTTAAT CAGTCGTGGA TTGAAGGCTT 2040
ATGTTAAGTG TCTCCTGTAA TGTGTTGGCG GGGCCACTTT TCATTTTTTC TCTCAGGCAT 2100
AGCAATTTTA ACTGTCCAAG AGCAATAAAG AACTCATTCT AAAAACTCAA TTCAATTATG 2160
TATATTCTTA CTTATTTACA AGATTATACC TAGATGGAAG GAATCTATGT TGTCCTACAC 2220
AAAAGACCAA TAGCAAATAC ATCCTTGGTT CCAAAGCCTT CAGAGTAGAA AATATTCAAA 2280
CATTCCCCTT GCAACCCACC AAAAAGGTGG TGTGGGGGTG GAATGAGCAC CAACAAAGAT 2340
AACCAAGCTA TTTTTAATAA TAATAAAATG AGCATAACTA TGATAACATA GGGCAATAGA 2400
CTTGTCAATC AAGCCCACAA GGATGGTAGT TACAGGGTAG AAATGACACA TTATTAATAT 2460
TTTATATGTT TATTGCACCT TTCTTTTAAG GTAGGTTTTA TTTTGCTTTC AGCCTATAAG 2520
AAGTTTACAG ATAAGCTTTA TAAACCTTGT AAATTACATG AAAAGCTGAT GGGTATGTAC 2580
ATATTTTTCT GGGAGAAGGG CTCATAGATA TCATTAGATT CTCAAAGGGA TCCAGGGGCC 2640
CCCACCCCAA GGTTAAAACT GGTGAATTCT AAGGAGTTAA AAATCCTTTA GAAATTTGAT 2700
TTCAATTATC CCCCACCTCC CAGTAAGATA ATTTATTTAC AGGTAGAGAA AGTGGGAAAC 2760
TGAGAGGCCA AGTTGCTCGC CCAAGTTCAA GGAAGCAGGC CGTCTATGAT TATCTAGGCT 2820
GCTAGATGAG AAGGCCTCCT TGCTTAAGTT TCTATGGCAT GCCCATTAGT CAGGAGCATC 2880
CCATTGGAGC AGAGCTCATA AGGGAAGGGC CAGGGAAAGC TTAGGATGCC TGCTGATTAG 2940