EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-03535 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:223910300-223916100 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr1:223910663-223910674ATGACCTTGAC-6.32
EsrrgMA0643.1chr1:223910663-223910673ATGACCTTGA-6.02
FOSL1MA0477.1chr1:223914582-223914593GGTGACTCATC+6.32
FOSL2MA0478.1chr1:223914581-223914592GGGTGACTCAT+6.14
JUNBMA0490.1chr1:223914581-223914592GGGTGACTCAT+6.32
JUNDMA0491.1chr1:223914582-223914593GGTGACTCATC+6.62
KLF13MA0657.1chr1:223911722-223911740AGACCACGCCCCTATACG+6.08
Klf12MA0742.1chr1:223911723-223911738GACCACGCCCCTATA+6.57
MecomMA0029.1chr1:223911750-223911764TCTTATCTTGTCTC-7.06
NKX2-5MA0063.2chr1:223915940-223915950CTCAAGTGGT-6.02
SP1MA0079.4chr1:223911721-223911736CAGACCACGCCCCTA+6.23
SP4MA0685.1chr1:223911721-223911738CAGACCACGCCCCTATA+6.26
TBX20MA0689.1chr1:223912814-223912825CTTCACACCTC-6.02
Number of super-enhancer constituents: 50             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00224chr1:223891886-223912166Adipose_Nuclei
SE_00224chr1:223912311-223916909Adipose_Nuclei
SE_01908chr1:223913738-223914955Aorta
SE_02306chr1:223913344-223915961Astrocytes
SE_04026chr1:223913451-223915326Brain_Anterior_Caudate
SE_05036chr1:223913560-223915403Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05972chr1:223913207-223916372Brain_Hippocampus_Middle
SE_07996chr1:223913125-223915466Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09681chr1:223908083-223912580CD14
SE_09681chr1:223912826-223918041CD14
SE_19702chr1:223910355-223912486CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19702chr1:223913106-223916325CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_24051chr1:223913880-223914466Colon_Crypt_2
SE_26209chr1:223912988-223915695Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26925chr1:223913192-223915372Esophagus
SE_31491chr1:223911144-223912177Gastric
SE_31491chr1:223913141-223916265Gastric
SE_34545chr1:223913070-223916058HCT-116
SE_34979chr1:223912930-223916086HeLa
SE_36294chr1:223910018-223911044HMEC
SE_36294chr1:223913510-223915892HMEC
SE_37129chr1:223899390-223911201HSMMtube
SE_37129chr1:223913319-223916436HSMMtube
SE_38254chr1:223913007-223915923HUVEC
SE_38957chr1:223913198-223916265IMR90
SE_41495chr1:223912854-223916323Left_Ventricle
SE_42269chr1:223910669-223912331Lung
SE_42269chr1:223912507-223916406Lung
SE_44530chr1:223913197-223916987NHDF-Ad
SE_44904chr1:223911568-223912149NHLF
SE_44904chr1:223913680-223916262NHLF
SE_45872chr1:223913083-223917105Osteoblasts
SE_49408chr1:223912976-223915760Right_Atrium
SE_50365chr1:223911011-223912456Sigmoid_Colon
SE_50365chr1:223913039-223916033Sigmoid_Colon
SE_51879chr1:223913896-223915223Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53249chr1:223913106-223915207Small_Intestine
SE_55958chr1:223910205-223910981u87
SE_55958chr1:223911472-223912472u87
SE_55958chr1:223913015-223914574u87
SE_55958chr1:223914578-223916004u87
SE_63671chr1:223913673-223915261HSMM
SE_64794chr1:223908347-223911615NHEK
SE_64794chr1:223913313-223915321NHEK
SE_65644chr1:223913370-223915937Pancreatic_islets
SE_67677chr1:223910205-223910981u87
SE_67677chr1:223911472-223912472u87
SE_67677chr1:223913015-223914574u87
SE_67677chr1:223914578-223916004u87
SE_68376chr1:223892363-223922876TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1223914239223914747
chr1223913851223914937
chr1223913235223915200
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I223722chr1223910120223916233
Enhancer Sequence
TAAATTATAA ATTTAAAAAT GCATTTTTAT AATAGGTACC TTTAAAAATG TTAATAGACT 60
TTTTTTTAAG AACAGTGTTA GGTTTATAGA AAAGCTGAGA TGATAATACA GGAAGTTCCA 120
GATACCTCAT ACCCAGTTTC CCCTATTATT AACATGTTAC ATCAGTGTGG TACACGTGTT 180
ATAATGAATC AGCATTGATG CAGTATTATT AAAGTCCATG CTTTATGCAG ATTCTCTTAG 240
TTTTCCCCTA AGGTTCTTTC TCTATTCCGG GATCCCATCC AGGACCCCAC GTTTCATTTA 300
GTTGCCAAGT CTCCTTCGGC TCCTCTGGGC TGTGACAGTC TCTCAAGTCT TTCCTTAATT 360
TTGATGACCT TGACAGTTTT GGGGAATATT GATCAGAGAT TTTGTAAGAT GCCTGTCTAT 420
TGGAATTTGT GGTGCCTTTT TAATAAGTAT GCAGTGGCTC ACACCTGTAA TCCCAGCACT 480
TTGGGAGGCT GGGGCAAGAG GATCGCTTGA ACCCGAGTTT GGGACCAGCT TGGGCAACAT 540
AGCAAAACTC TGTCTCTACA AAAAAATTAC CTGGGCTTGG TGGCACATGC CTGTCGTCCC 600
AGCTACTCGG GAGGCTGAAG CAGGAGGATC ACTTGAGCCC AGGAGGTAGA AGCTGCTGTG 660
AGCCGTGCAC TCCAGCCTGG TTCTGGAGCC ACTGCACTCC AGCCTGGGCA ACAGAGGGAA 720
AACTTATCTC AAAAAGTAAA TAAATAAGTA CCCATGTAGT TAAAATGTTT AAAGACTAGC 780
AAATAGATGT TGGCTGGTTT GATGGAGAAA GTAAATCCAT TCTTTTTCTT AAAAATGATC 840
TCTTCACCAC CAGTCCCAGC ACCCCCCTTA CCAGCCTCCC AGGGCACTGT CCATGGCTAC 900
ATTGTCCATG GGCCATCATG TCCCCTCGGC TTCTCTTCTG GTTGTAAATG CTCTTGCACT 960
TTTCTCCCTT GTGGCTGCCG TCCACACTCC CAGCTGCCTT CCCTCTGCAC TTAAGATCTA 1020
AGATCTTAGA GACGAGATGA GACATCTCTT GCCTTCGTGC ATCTAAGACA GCTCATCAAC 1080
AGGTCCAGGT GAACTGCTAA CACTGCTGTG TTGCTTGGAG GCCCCTGTCC CACCCTGGCT 1140
GCCTCAGCTT TGGCCATGGT ACCCACGGTC TCCAGCTACA TCAGATGCCT GAAGAACAAA 1200
TCTCTCCTTA GCTCTCCCTG CCCCCTCTCC AGGAATAGGA GCAGTGGGAC CCCCTTCAAG 1260
AATCCCCCAT TTCCCATATA CTTTCCTGCA AAGCCACAGG GCGTGCAAAG TGGGATTCCA 1320
GGGCTCCAGC CTGCTCCCCA TGGGCCTCTG GATCCAGGGG TGACTCTTTG CCTGTTTGGG 1380
TGCCTCTTTA GATTTTCCAC CAGCTTCCTG TGGCCAGGAG CCAGACCACG CCCCTATACG 1440
GCCATAGTTG TCTTATCTTG TCTCTGAGAT TAGAAGGTTG GAACAGATTT TCCTGATGCC 1500
CCACTACTTC TGACATTCTG TGACTTTAGA ATGTTACCTT CCTCGACAGC CCCCTGCACC 1560
CTCACACATC TGGCTTTAGC TGGACTGGTG TTTGTGAGGA ATTATATCTC CACCTTGTTC 1620
AGCACCAGTC CCCAAGAAGA CCAGCCAAGG GACACTCATC TGGGGATTTG AGAAATGAAG 1680
GACCGTGGGT TCCATGAGGT CTGTTGGGGT CCTGGCTAGC AACACTGTCT GGATGATTGA 1740
GCCCCAGGAG GAGGTGGCCT GGCCAGCAGG TGTGCAGTGA GGCCACTTCT AGACCACCCC 1800
TGTCCCATAG AGCTTCTAGT GATGATGGAA ACCGTGTATA TCTGCACTGC TCCAAACAGC 1860
AGCACTAGCC CTGTGTGGCT GTGGAGCACT TGAAATATGA CTCATGCAAC TGAGAAACTG 1920
AATTTGTAAT TTTATTTAAT TTAAATGTAA ATAGCCACAT GTTCCTTGTG GCTGCTGCAC 1980
TGCACAGCAG CAGACTGTTG CGCTCTGGAA TCCAGCCTCT CAGCCTTTAC TCTCCAAAGC 2040
GGGATAGTAT TCACATCAGA GCCAAACAAT GCACAGACGT CAATAAACAG GCAGGGCATG 2100
GTGGCCCATG CCTGTAATCC CAACACTTTG GGAGGCTGAG GTGGGAGGGT CCCTTCAGCC 2160
CAGGAGTTCA AGACCAGCCA AGCAACATAA TGAGAACCCA TTTCCACAAA AAAAAATTTT 2220
TTTAATTAGC TGGGCATGGT GGTGTGCACC TGTAGTTCCA GCTACTTGGG AGGCTGAGGT 2280
GGGAGGATCA CTTTGAGCCC AGGAGGTCAA GGCTGCAGTG AGTCGTGATT GCACCATGAC 2340
ATTCTAGCCT GGGTGATGGA GTGAGACCTT GTCTCAAAAC AAACAGCTAA ACCTACATCA 2400
ATAAACATCT GTAAATATCA GGGTAGCGAA TGAGGACTTG GTGTCTGGCA GTTAGGGACT 2460
GGCCTCTTAT TCTGCCACAT ACTGGCTCTG TCATTTTGAG TGGATCACTA TCCTCTTCAC 2520
ACCTCAGTTT CCTCATCCGT GAAATGAAGA TAATAATAGT GCCTACTATC AAGACCATCC 2580
TGGCTAACAC GGTGAAAACC CATCTCTACA AAACTACAAT ATGAAATACA AACAATTAGC 2640
CGGGCGTGGT GGCATGCACT TGTAGTCCCA GCTACTCAGG AGGCTGAGGC AGGAGAATCG 2700
CTTGAACCTG AGAGGTGGAG GTTGCAGTGA GCCATGATCG CACCACTGCA CTCCATCCTG 2760
GGCAATAGAG CGAGACTTCA TCTCAAAAAA AAAAAAATTG TGTCTACCTC AGAGGACTGT 2820
AAAGATGAAA TGAAATAATA GACATATAAA GCTCAGAGCT CCAGAGGCTG GTACATAGTA 2880
AAGGTTTAAT CCATGCAGAT TGCACGTTCT CTTTGGGGAC AGTACAGCTG GAGGGGAGTA 2940
CTGTCAAATG AGGTCGCGTC GCTGAGGTGG AGACACATTG TGGCACATCT TGAATACCCG 3000
ACTGGGTCCC AGCTTTAGCA CTTGACATTG GCGGCCACCT AAGTTTTGGA GAGGGGTATG 3060
ACAGAGGAGG TGGTGTCCCA GGGGGAAGGT CCGGAAACTC AGAGGAGTTT CCTGCTGTAA 3120
TTTTCTTTGG TCACACAATG GTCATGGCCT CCTGATGTTT CCCACAAAGG GCCAGAGGCC 3180
CTTCAGTGCC AAGGAACGTG GACTCTCTCC TATCCCAGCA CATACACGTG CTTCCAGTAC 3240
CTTGTGATCT CTAGCCATAA GTTTCCACTC ACCCATCTGC GAAATGGGAA CAATGACGAT 3300
GTTTGCGTCC TTTCTTTTTC TTTTCCTACA ATGCAGGGAA CTTTAAGACT ATGTGACAGA 3360
AAGGTGCCAC TGGAACCCAG GGCCTCGTGG GTTTCCTCCG TCTCTCGGGA GACCAGGATC 3420
CGAGTGAGAA AGTTTCCCAC GTTCATTCTT GTTGGGCCCA TTCTCAGGAT GATGTTTCTC 3480
CTGTATTTTG CTACCCCAGC CCAAGCAAGA CTAGTAGTTC AGCTTTGTGA ATCCCCTCAG 3540
GAAGTCAGGA AAATAGATAC TGTCTTTGGG CTTCCTCCAG GAGCTAAGAA AGGAGAGTTC 3600
CTGAAGAGCA GGAATTTAAG ACAGGAATTG GCAGCCGAGG GCAAGGTTCC ACCTCCTCCT 3660
CCCTTCTTCT GTGGGGTCTG TGATGAGAGC AGGGATGGGG AGGAAGAGGG TGGGTTTGCC 3720
TGCGCCTGGG GGGAGGGCAG CCATCAGGAA GGAGCAGCCA CCTCTGCTGG GGTACTGGAG 3780
ATAAAAACTC TGATATTGAC TAGTGACCGT GGGGGCGATG GCCCAGGAGG GTCAGGGCTG 3840
CAGGGAACAG GGACACAAAA ACGACAAAAC ATGCAACAGG TTATGTCCTT CTGGTCCAGG 3900
GCACGGCTGA GACAGGCAAG GGACTAGAGA GAGGAAGAGT GAATGTCAAG CCCCAGCACC 3960
CTCGCCTCCC TCCCATCCTC CCTTTTAGGG CCTCCCTTCT GGCAGATAGG GCAGGGAGAA 4020
GGGAAAGGAA AGGCCTGGGA CACGTGGTTT GGATCACTGG CTGTGGCTCA CAGTTCTGAT 4080
GTGTGTGCAG TTTAGGGAAG GAGGCTGAAG ACTTCTTGTT AATAAGGGTG GGGCATGAGT 4140
AAAATGGAGG ATCTGCCCCC TCCCCTCCCA GCCCCTGATA CAAATGAAGG ATGATTGTAC 4200
ATGCATGGGG AATTCCACTT TGGGGGTATC CTTTTCTGGG CTGCTGCCAG ACTCTGAAAT 4260
GAGTAACAAA GGGATGGCCC AGGGTGACTC ATCAGCTACC CTCTCGCAGG CCTAGCACGC 4320
TGGCGGGGTG TGCATTTCCT CTAGAGAAGC CCCTCCCTGC CAGTTTCAGA GGGATGGCCC 4380
TGAATTGGCT TTTCAGAGGT TCCTTCTCCT CCCTTCCAAA GCGAAGACCC ACAGCTGCCT 4440
GAAAATGTGG CTCTCCGCCT TCTTGGGCTG CCTAGGACCT TGAGAGATGT GTCTCTCTGG 4500
GACAGGGTGT CAGGTCTGCT GGAGATTGTT AAAATGCTGT TGTCTCAGGA AGGGTGAAAT 4560
TTAGCCAGGA GCAGTCTTCA GTAGCTTGGT CTGTTTATCG TGTATCTAGC TGTCAGCATG 4620
CAAAACAAAA GAACAAAAGG TCTAAAGAAA TATAACGCAA AACAGGTACG ATTTGAGATC 4680
CATCAGGGTT TCTCAACCTT GGCACAACTG ACTGGATAAT TGTTCATTGT AGGGGGCTGT 4740
CCTGTGAATT ATAGGATGTT TAGCTGCATC CTTGGCCTCT ACCCACACAC CCCCGTGTGC 4800
CACTCAAAAA TGTCTGCAGA CCTTGCCAAA TGTCCCCTGG GGGCTTGGCG GAGTTGGGGG 4860
GTGCATGGAA TGCCCCCAGT TGAGAACCAC TGGCAGAGCA GGAGTGAAGG GGGAGGTACT 4920
GTGGGGGTCA CTGGGCACAC AGAATGCCAT TTGGGGAGCC TGGTGCAAGG GAGTGGCCGG 4980
ATGGGAGGTA GGAATAGCAG TGGTAATCAG TAGGTGAGTT GCTGAAGACA AACTAAATAT 5040
TCTTTCCAGC ATTGCTTCAA TCTAATCCAG CCGCAAGTAT GAGTAAATAC TGTAGGAAAG 5100
GAGAAAACAT TGCATGTACG GGGTCAGGGC AGCATTGCTG GGATATTTGA GCCTGTGGGA 5160
GGGGAGCTTC AAGCTTCCCA CTAGCATTGG GAGGAACACA GCAAAGGAGG AGAAGGGCCC 5220
TCCCTGCTTC TTGGAGAATG GTTCCACTGG CAGGCCATTC CGTCTGCTCA GCTTCCTAGC 5280
TCAGGTGCCT TTCCAAACCA CACATCAGCA GGGAGACAGT GGGAACATCT CAGGTCCAGG 5340
GTACCTTGGG AACTGCAGAG CAGCTGGGTG GCCTGACACT GGCATTTCTC AGTGTTGGCT 5400
CCATTCTCTT GCTGGCACCC CCAGGTGGGA GACTCTGTTA GCAGGTGTAT CTTACTATCC 5460
CTGGCTCCCT GGTATGCGTT ACAGTTCAGA CTCCCAAGCA CAAGCTCCCT GTTTTGTCAC 5520
ACCTGTATCT AGTGTGTAAC AATCCACCCC AAAACAAATG GCTTGAAACA CAAGGCATTT 5580
TGTTCTCTCT CATGGTTCTG AAGGATGACG GGGCTGAGCT GGGCAACTCT CTCCCGCTCT 5640
CTCAAGTGGT TGCAATCAGA TGGGGATGGG GACAGAGTCA TCTGTAGGCC CCCTCAACCA 5700
CATGTCTGGT GCCCGGGCTG AAGGGTGGAT CAGCAGGGGT CCAGGGATCT CTGTCTCTTT 5760
TGTGGTCTCC CCATCACAGG GACTTGAAGG TAGCTGAACA 5800