EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-03384 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:214627420-214630950 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs12757404chr1214629616hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:214627727-214627738TTTTATTGCTT-6.32
GATA2MA0036.3chr1:214630484-214630495TTCTTATCTTT+6.62
RUNX1MA0002.2chr1:214630420-214630431AAACCACAGAA-6.32
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02460chr1:214627589-214629357Astrocytes
SE_35815chr1:214623977-214630686HMEC
SE_45575chr1:214623678-214630769Osteoblasts
SE_47135chr1:214616324-214632731Panc1
SE_56089chr1:214624407-214629986u87
SE_64230chr1:214627538-214630573NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1214628051214628766
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I214457chr1214630938214632656
GH01I214450chr1214623923214630702
Enhancer Sequence
GTATTTTGGA TGCCTAGGAG TGAGTCTCCA TATAATAAAT TATGTAATAT ATGTAATTAA 60
CATGCTATGC AGCAATTATT AAAGTTGGAA AAGAGCCCTT TTATAAGCAT TAGTGGAGAA 120
ACAGAGGGCA ACTTCACAAT TGCTTAACAG GCTAACCATG ATTTATCATC TTTCACTAAA 180
AGTAGTTTTG ACATTTGGGA GATATTTTTA TGGTCCACAC TTCATTCAAA TTAGTAATAT 240
TCAAATTATA GAGGGCCACA GTAACTGCAT AAATGTTCTA CAATCGATTT TAAAAAACGG 300
TTAAAATTTT TATTGCTTCT GTGTCTTGAA AGCTATTTTA AATTTCCTTT TCTCATTCCC 360
ATCCATCCAG ATCATTAAAC CAGACCTGAC CTCCACCCCA GAAATCCCTC AGAGAAAGAA 420
TATTCCATGG AATATATACA CACGAACATG TATGTGCACA CATACAACAC ACACAAAATG 480
CACACTACAG CTGCACATAC ACACACTCCT GTGCATACAC ACATATGGAT ATGTTGAGGA 540
GGATGATGAG GTACAAGAGA AATGATAGTA AGGCAATAAT CTTGAGCCAG AGCTCTAAAT 600
AACAAAGTAA ACCACTTCTA ATAGAAAAAC CTAATTCATG GCATAAATTT ATCACTGCTG 660
TTGTACAGCA CCTTCCAGAG GACACAGAAT ATTTCAGGGT GACTCACCAG GTAATTATCC 720
AGTGAAATAA TTACATAACT ATGGAAGAAA CGGGGTGTCC AGTGCAGGGC AGAATTGGGG 780
GAGGCAGGTA ATCTGGAGGA CAGAGTTTGT ATCTACTCAC AGCCAGAACA TCCTAACTTT 840
AGAACTGTCA AATTCAGTTC TCTAGCAGGA AGAAAAGTCC ATCCCCACCC TGATTTTTGA 900
AGCTATGCCC AAAGTAACCT TTTCCATTCC CACCCTACTC CTCCCGTTCT TCCTCTAGCT 960
ATTTTCCTAC TCTGGAGTAG AAAGACCCTG CCTTGAAAGT CCAATACAGC ACATGTTTAT 1020
TCTCCCACGT CTACACAGTG CCTCACAGGA AATGGAATCA GAGCCTAGGC TCTCATTTCA 1080
ACTAGCATGT GCACCAATCA ACTTCCTGTG TATTATCCAA GGAACTACTA ATCCTGTCAA 1140
GCCCAGCTGA GACCCCACCA GGCTGGTTTG TGGTTAACTT GCCAATTTAA ACTCTAGCTC 1200
AATTTTGAAA GCTGAGCTTA GCTGCTAAAC ATTGCCACAT GGTTGAAGAA AGCATGGTGG 1260
ATGATTGCAA ATAGAAACCA CCTTCTCCAT GACACCAAGA GGATCCCATC ATATTACCTG 1320
AGTAAATGCC TGAAATATCT GTTCTGTTTA TATCTCAGGC ACCAAAAGTA AGCCAGACTC 1380
ATTTAATCCT CATGATACCT CCTCTGGGTG AGGTATGAAT CCCATTTTAT TGCTCCAGTT 1440
TTCTTAAGAA AACTAGAACA CACAGCTCTG GTGCCATGAG TTCTGCAATA AGTTTACTGC 1500
AATGATGAGA AAAGAAGACA GAAGAGCCAG TCCTCAGACA CAAGAACCAC ATCCCTGAAC 1560
CACTTACAAA AAATGCACTA CGATGAAACC AAGTAGGGAA AGCCACACTA AAATGTCATT 1620
TTTATGTGAG CAGCTTCCTC ATTTATTTGG TTTGGTGTAC TGCATTTTAA CACAGGAAAC 1680
ATACATTTAA GCATATACTA AAAAATCGGC TAGTTTCTTC AGTGGCAGGT TGGTGTGTGG 1740
ATACTACAGC GTCAAAATGT CCATCTTTTG GTATTATGGA AAGATTCTAG AGAATAAGGG 1800
CCCTTAAAAG TAGTTTTGAG GGCAGGGGAC ATTATGGGAA CTCTCCGTAC CTTTTGCTCA 1860
ATCTTGCTGT GAAACTAAAA CTGCTCTAAA GAAATAAAAT CTATTAAAAA GTAGTTTGGG 1920
GTGGTTTTTA TTTGTTTGTT CATTTATTTG TAAAGAGATG GTATAATCCC CCACCTTAGC 1980
TATTAAAAGG GAAATATTTT TTGAGGGTTT TGTTTTTCCA GTTTTGTGAC AATGGCACAG 2040
ACTAATGCTA TTTGTAAGAG GTTTAGATGC AGTCTTGGCA ATTACCAAGG ATTAAAGCCA 2100
TGATCTTATC TCAAGCATTT TGAAGAGTTA CTCATCCAGA AGCAAAAGTT TAAAATATCT 2160
TGCATTAAGT TGTAATAGGT TGCCTATCTT ACCCAATATT TCAGCTGTAA ATTAAGAAAT 2220
GGTGTGCTTC CACATAAAAT ATATGAATTA CATATTATAC AAGCACGAAC AGTTTCACTG 2280
AGGCATGGAA AATACTTCAA AAGATGACTA TAAGCAGACT CTGAAATAGC ACTTCATGCA 2340
ATTACATTCC AATGGCTTTG GAAAATAAGC CACTGTACAT CAGTTGGATA ACGGTAGAAA 2400
AGAACTTGTG TGTAATCAAC CTCTACTCTG GGTAGGTCTG AGATTTCTAT AACTGACACA 2460
TCTATAATTA ACAACTGCAC CCTCTTCATT TTCCTAGCCA ATCTCTTTAT AAAAGTACAT 2520
GAAAAGAAAA TGCAGAGTAA CACAGACCCA AGAAGCAAGT CCCATAGCCA AGAAAAACCA 2580
CTCTTCTGAG ACTGTACGAC TCACCTAGAA TACACAGAAA GATGAAGACG TACAAGTTAA 2640
GACTGGCGAA TAGTTCACCC ACAATCTCTA TACCTAGAAA ATGGAGATGC CGGTGCCATT 2700
ACATTCTAGG ATTGACATTA AGCTAATAAT GTTTCACACT GTCATTTTTA CAAAGACAAA 2760
AAGCAACACA AAACTTAAAG ATGAGAAATC TCCCCCAGCA GTCTACTCTT CAGTCGATTC 2820
TTAATCAGCA TTGATTATTT TAATCCTTTG CAAATACACA TATATACTGA CGTGATTAAA 2880
CAAGCTATAA AATACAGCAG AATTCCACTA TTATCTGCCA GGGCATGAGG TGTTGCATTT 2940
AATTGAGTAC CCCCCAAATC CCACATAAAT TATTAATTGC CAAAAGATTA GCATGAAATC 3000
AAACCACAGA AATATTCTTC ATGTAAGTTA ACTTTTATGT GATAATAGGA AATGCATGTT 3060
AAGTTTCTTA TCTTTATAAT CTCTAGTCAT TATGAAAATA GCAAAATGTG GAAAATTTCT 3120
ACTGTAGTGA TAGCTTTGGG TAAAACAGCT TTTAGTAAAG ATCAAAATAT AAATTTGCAA 3180
AAGAAAAAGG GGATAAATTA GAGGATAAGG ACTTACTCTT TGAAATGATT ATAGTTTGGT 3240
TTTTAAAAGC TTTTTTACAC TCTTTTAAAA ACCAAGGCTC TTAGGCTTAG CCTTAGGAGA 3300
GAGCCGAGAG TTATGAAAGT CACCATTCTC CAGAGCGCTG GATTTCCTCA CAGCAGTTCT 3360
CTACCTCAAA TAGGGTTTAC CAATGAACTG AAGGGTATCT CAGGTGCCTT TGTTATATCA 3420
TTTATCCTTC TTCCACTTGT TAAGTTAAAA GTAGAGCCAA GGTTATTCTA GCATATTTTT 3480
ACATTTTATT AGGATGCTTA TACTCACTAT TACCATTAAA TGCCCCCTTT 3530