EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-03215 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:208344890-208349700 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GCM1MA0646.1chr1:208347268-208347279CATGCGGGTAC+6.62
ZNF263MA0528.1chr1:208348552-208348573AAGGGAGGATGAGAAAGAAGG+6.13
ZNF263MA0528.1chr1:208345783-208345804CCCTCCTCTTCCATCTCCTCT-6.5
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
SE_54968chr1:208345176-208346405Stomach_Smooth_Muscle
SE_54968chr1:208346743-208347599Stomach_Smooth_Muscle
SE_58948chr1:208347899-208379506Ly3
SE_63272chr1:208323592-208353812GLC16
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1208346199208346291
chr1208348000208348800
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I208171chr1208345177208346405
GH01I208173chr1208346744208347599
GH01I208176chr1208349541208359979
Enhancer Sequence
TAGGCCTAGC AAGATGGCTC ATGCCTCATC CCAACACCTT CATGCCTCAT CCCAGTGCTT 60
TGGGAGGCCA AGGCGGGAGG ATGGCTTGAG GCCAGGAGTT TGACACCAGT CTGGGTAACA 120
GAGTGAGACC CTGTTTCTGC GATAAATAAA TTTTTAAAAT TAGCCAGGCA TGATGTGGCA 180
TGCGCCTGTA GTCCCAGCTA CTTGGGAAGC TGAGGTGAGA GGATCGCTTG AGCCCACGAG 240
ATCCAGGCTG CAGTGAGCCA TGATTGCATC ACTGCATGCC AGCCTGAGTG ACAGTGAGAC 300
CCTGTATAAA AAGGAAGTTT TTTTTAAGAT GATAATAATA GCTCTTACCC TAATAGGATT 360
ATGTGGTGAG AATTAATTTA AGAAAATGCA TATGATGCAT AGTGCCTGGG GCACATAGTA 420
GGTGCTCAGT ACATCTTAGC AGTTATTACA TTGGTGCAGA AGTAATTGTG GGTTTTGCCA 480
TAAAAAAAAA AAAGGCAAAA CCCGCAATTA CTTCTGCACC AATGTTGTGC AGTGAGATAA 540
GCACAAAGCA GTGTCAAAAT AGAGAGCTGG GGGGAAAACA GGCAAAAACC ACAAAGACTT 600
TTGCACCAAC GTAACAGCAG CCTGAAGAGT GGCTCCAAAG GAAAGATGCA CATATTGTTT 660
GCAGACCTAT GTGAAAACCA CTGTTTGGGG CTCTGTTATT TGCAGAGGTA ATGTTTTGGG 720
TTGGAGGAAG TACTGTGGAA TTGGAAAGGT TGGTGGGGTC ATATTGTGAA AGACCAGGGA 780
TCCCTGGACT TTGCTTTGTA AAAAGTGTGT TCTGTTCTTC CTTCAATTTC TAGCTCTCTA 840
CTTTGACATT GCTTTTAAAA ACAACTCCTA AGTACTTCCA AGTTACCGCT GCCCCCTCCT 900
CTTCCATCTC CTCTGCCTGC TAGTTGTGCC CACAGCACTG CCCCCATCCG CAGATGACAC 960
CTGGGGGTCA CAAGGGTCTG ACCTCAGCTC TGGGCAGGCT GAGCCGAGCA CATGCCCTGA 1020
CACTTATCTC ACCGCTGGAA AGCTTGGCTT CTGAGTTCTT GGGTGGCAAC TATCCCAAGG 1080
AAGCTGCTTT CTCTTTATAA CAGATTCTGG AGGGCTGAGG GAGCTGATCT CATCATGTCC 1140
TTGGATGGTA CTATCCATCT TGGCAGAAGG GAGGGCTGAG AGTGCTCAGG CCTTACCTGG 1200
GAGTCCCTGC AGGAGCCTGC ACAAAGCTGT TTTTTTGTGT TCAGGGGACA CTTTTGGGCA 1260
GCATTAGAGA AGAAAGGAGT AACTGGGATA CTCTGGGGAC GGCTGGCTGG CTGCAGAAGA 1320
TGGGTCCTTC TAGCAGCTCC CAGTGAATAT GACTAATCAG TTCAACATCA CAGAAAGAGC 1380
CCAGGCCTGA GAGGGAGAAG ATTAACAGCG AGGTGACTGT GAGCAAGTTA CTGCCCTCTA 1440
GGCTGGAGCT GCCTCACTGG CATATCTGAG AGGCAGTGTT GGGTAGTGAT TAAGAGCAAA 1500
ATCTACAACC AGTATTGCTA GATTGGACTC CTGGCTTTAC CACTAACAAG AGCAGGGCTC 1560
TCAGCCTCTA TAAGCCAAAT GCCCTCATTT GTAAAATTTC CTTATTTCAA ATCCTGTCGG 1620
TGCAAGATTA AGAGTTAATA TATACAAATA AAGTACTTGG AACAGTAGAT GGCACAGAAA 1680
ACATTATGTG TGTTTACTAG TATTACGGCC ACTAGTATTA ATGCCTTTAC TGCCATATCG 1740
AGGATGTTGG ATTAGTGAGC CTTTGAAGGT CTCTTAAAAA GTCTGCAGTT CTATTTCCCT 1800
GCACTATGAG CCCCGTTTAG ATTTCAGACT TAATCTAGCA TTTGCTGAGT GCTTACTATA 1860
TATGAATATA TTATCTTATT TAATCCTTGC AACAAGCCCT GTGCATCCCA TGTTATTATG 1920
TTCATTAAGA ACTGAGAAAA TCGGAGCTCA GAGAATCTAA GTGAAGTTCT CAGAATCACA 1980
CAGCTAGCAC ACGGCCAAGC AGGATTCACC TGCAGTCCAG CCCAGCGTTC TTTCCAGTCT 2040
ACCAGCAAGG GGACAAAGGA TCAGTTCTTT GCTACCAAGC TGTCATATCT GTCCAAGAAT 2100
AAGGGCCAAG GCTTCTGTTC CCAGCAGATC TCGTTCTGGG GCTGTGCATG CTGAGCCTGT 2160
CTCAAGGGTG AGTGGAGGAT TTGCCAATGA AAATGTTACC AGCTGAACTA GCATTGGCCA 2220
GCCATATTGG GGCCAAGAAG GAGGAGAACT AAAATTAATC CTCTCATTAC CAGTCTGACC 2280
TGCAGAAGGA TGAGCAGCAC CAAGCCAGGA AGAAGAACTC CAGCAACATC TGCTGCTGCT 2340
TGCTCGACTT TCATTTCCTC TGCCCCTCCT GGGAATGCCA TGCGGGTACC AGGATGCTGA 2400
GATGTGGTGC ATGTGCGCAC CCCCACTCAC ACAGAAGCAC ATATGCTGGA GACAGAATTA 2460
GGAGCCCGCT GAGATAGCGC TTTGAAAAGA AGAGAAGTTG GTGGAATATG TGGGTTTTCT 2520
CCCTTGTGCC AAGTCCCCTC TGAGAAGGGT ATTTGGATCA GAGGTAGAAT CTCTGAGTCA 2580
TGACGTGACT GGTTTTTGCA AATGTGTCTA GGCCACTTGC CTGGTCATGG AGGGGTCCTG 2640
CCCACTGGCA GACCTCAGCT CCTGTCGGTG AGGGGCTTTG AGTATGGAAA AGAGAGGAGT 2700
GGGGACTTGC TATGGCCTGG CAGCCAATGG TTGTGTGTGG GGTTGGGGGC TGGAGAGAGA 2760
AGGGCTAACT CTTTGGAAAG CCTGCCTGCT TGTTCTATTC TTGCAGAGGC GCCTGGGGGA 2820
GGGAAGGAGG AACACAGAAG GCAGAGTCAT AAGGAGACGC CGCGGGTGGG GGTGGGAGGA 2880
GGTAAGGGCT GTGGAGGGAG GGAAGAAGGC ATTGTCAAAC TCTCTGGATG GTCATCAGCC 2940
AGATGTGGAG ACCATATGGA GGAGGCAGGC TGGAGGTGTG CAGGGAGGGG AAGAAGACAA 3000
ACTGAGGGGA GGAGACTGGG AAGGGCAGAA GAGGCAGGTG AAGGCTGCTG ACCTAAGCCA 3060
TCAGAGTGGG AAGCCGGAGG AGCTCCCATG CCCCCAATAG GCTGGTCCAT GCACCAGGGC 3120
CACAGGGGTC ACCAGGCACT TCTGCTCAAG GCTCAGCCCA GTTTCTCTGC TTTCAGTTCT 3180
GAAACTCAAA CCCCACAATG CACTCCCTGC TCCACACTAG CCCTTAGGCC TTCTCTCCTC 3240
CTCATGTGTT CCCCCCACCT GTATATCCTC AAGTTCACGA CTGCAAAGTG ACAACAGTGG 3300
TGGATACAAG AGAAATTCCC CGAGGAAATG AGCTGGTGTT TCCTGGTCTC CCTCAATGCC 3360
TCTGGAATGC AAGGGAAATC GGATTTGGCC CCTGCTGATC TGATACCTCC CTGGTGCTGG 3420
GAACTCTGTC CAGCCCTGGC CATTTGCTGC CTCTGGGGGA GCTGGGACAG GTGGGAGCCA 3480
GCTGTTGTTA GGACTTTGCA CACTAGTGGC TCGTGGGAGC TCCTGTACCC CTTAGAAAAC 3540
AGAACTCAAC AGCAGTGAGC AGACTGGCTG ATCCTGCAGG AATCTTTGGG GGAGAAGGTA 3600
TATGATGAGT GAACCGGAAC ACCTGGAGAC CCTGTACCTG AAGAGCACTC AGGAGCTCCA 3660
CTAAGGGAGG ATGAGAAAGA AGGCTAAAGG GTGGAGGGGG AGAGGGCAGG GATGTGATAA 3720
GAACAAAGCG TGAGTCTTCC TACATTCCAA CTGGGTCCAC TCATCCCAGC TGAGCACCAG 3780
ACAGTGAACT GTGGACTCCA GTATGGAATA CAGCCAGTCA CTGGGCAAGA GTCCTTCCTT 3840
TCCAGGGGAG GTCTCTTCTT GTTCCCCCAC TGTATCCCTC CAGGGCTGGC ACATCCTCTG 3900
AACATGGACA CAAAGGCTCC AGCATTAAAG TAAGAAGAGA TAGAGGCTAC CTGGCCTGGA 3960
GGAAGAGGAA GAATGTAAAA TGGCCTCCAA AGGATTCTCT TAGGGTAAAG GAGACCAAAC 4020
TTTGCCTGTG TCCTGGACAG TCTAGGCAGT CTGATTGGAA CTATGTTCTT CTTCTTGGAC 4080
CAGTCCTTTG TTGAGAAGTC TGAGCTGGAG TCCTGGGGCC AGCTGTCTCC ACAACAGGAA 4140
TCACTGCTCC CCAGGGGAAT GGGCTGGAAA TCTGGAAAGG TCATCCATAG CCCCAGGGAG 4200
CAACAACCTG AGGCCCTGGT TGGCAGAGGT CAGGCTGGAG AATGGCAGTC TTCCTAAGAG 4260
AGTGCCTCAG AAAACCTGAT AGCCAGAGAA AGAAGACAGG CTGGTTCAAA CCATAGTTAA 4320
AAGATGCCTA GGGACTCACT AGGATGGTTA TAGGGTTGGA CACGGGCCGG CTTCCCATTG 4380
TGTGGTATCT TGGGGTTTTG TCTGAAGTGA ATTGATGGAT GGCTCAATTC TGTTTCTGTT 4440
GGAACCAACC AGCCTTACGT ACCCTCCTTC TCTCTCATAG TTGTCTGGTG CTTTACAGTT 4500
TATAATAGGC TTTCAAAGTC AGGTTTGAGT TAAGGTCACA ATAACTGTGA AATAAACAAG 4560
TAAGGAATTG TTGCCACTTC ACAGATGAAA AAATAAAGGT CCCAGGATGG TGCTTCTAGC 4620
ACTGGTTCCC ATCAGCCTTT CCAGTGAGAT GACAAGAGCT GGGTTAGACA GGTAAGCCCT 4680
GCAGAGGGGT CCCAGTGGCC TGCAACTAAC TCTAGACTCA TTCATTTCAT TTCCACGGGC 4740
ATGGGTAAGA AGAGGCTGTC ACCCCTTCTT TACTCCTCAA ATTATGCCTG TATCCACATC 4800
TGCCCTTACC 4810