EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-03162 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:206887630-206890000 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:206888182-206888198TTTTGTTTACATATTG-6.2
FOXP2MA0593.1chr1:206888183-206888194TTTGTTTACAT-6.14
IRF1MA0050.2chr1:206888964-206888985TCTTTCTTTCTTTTTTTTTTT+6.25
ZNF143MA0088.2chr1:206888259-206888275TGGAGCATTGTGGGTA-6.51
Number of super-enhancer constituents: 24             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00569chr1:206889296-206891921Adipose_Nuclei
SE_18978chr1:206886129-206891443CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_26063chr1:206886354-206889074Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26063chr1:206889295-206890836Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27575chr1:206887443-206888941Esophagus
SE_27575chr1:206889463-206890165Esophagus
SE_31968chr1:206887150-206889403Gastric
SE_31968chr1:206889495-206890586Gastric
SE_40628chr1:206886209-206888054Left_Ventricle
SE_40628chr1:206888111-206891316Left_Ventricle
SE_42239chr1:206886370-206889066Lung
SE_42239chr1:206889407-206891229Lung
SE_45992chr1:206886188-206891212Osteoblasts
SE_48186chr1:206886265-206888115Psoas_Muscle
SE_48186chr1:206888149-206888979Psoas_Muscle
SE_48619chr1:206887101-206888007Right_Atrium
SE_48619chr1:206889007-206891195Right_Atrium
SE_50514chr1:206886245-206889409Sigmoid_Colon
SE_50514chr1:206889441-206891186Sigmoid_Colon
SE_51178chr1:206886185-206891206Skeletal_Muscle
SE_52589chr1:206885539-206891265Small_Intestine
SE_54245chr1:206887278-206888715Spleen
SE_54245chr1:206888868-206891242Spleen
SE_59174chr1:206876376-206918919Ly3
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I206712chr1206885617206891363
Enhancer Sequence
CGTCTGGCAT TCCTTTGGTC TATAATTCAG TAAACTCTGC TAAAAAGGAA ACGAGACTAG 60
CTTGCTGTGG CCTCTTAAGC GACCCAGGGT AGCTTGTGAT GGTTCAGATT ATGATTTGTT 120
CTAGAGCTTT TCCAGAGGCA GATGTTGAGG AGTTTATCCT ATTTGTCCCC TTCCCTTTAA 180
ACAAACAAAA GTGCCGGCTG GACGCAGTGG CTCATGCTGG TAATCCCAGC ATTTTGAGAG 240
GCTGAGGCAG GCGGATCACC TGAGGTCAGG AGTTCGAAAC TAAGCCTGGC CAGCATGGTG 300
AAACCCTGTC TCTACTTAAA AAAAAAAAAA TTAGTTGGGT GTGGTGGTGG GAGCCTATAA 360
TCCCAGCCAC TCGGGAGGCT GAGGTGGGAG AATTGCTTGA ATCTGGGAGG TGGAGGTTGC 420
AGTGAGCTGA GATCACACCA TTGCACTCCA GCCTGGGTAG CAGAGTGAAA CTCGGTCACA 480
AAAAAAAAAA AAAAAAGAAG TCCCAACCCC CCAGTTTTTT ATATCCTCTT AGTCATCATA 540
GTTTATTAAC AGTTTTGTTT ACATATTGCT TCTTTTTCCC TCTTGGCTAG ACTGTGAACC 600
TTGAAGCCCT GTGAGCTTGG TCTAGTGCCT GGAGCATTGT GGGTACCAGG TTTCGAGAGA 660
ATGTGTGCTG CCAGAAAGCA GATCTTTGCC ACCTCCTCTC CCCTCAGCTC CTGAACCACT 720
GCCAGCAGTG GTTCTGGAAT CAACCTGTAC TTTCCTTCTG CATCCTGGGA TGTAATTCTG 780
GGTGATTGTA AGTTGGTTTA TGGTCTAGCT TAGAATTGAG GCTTCTCTTG AGAGAGAGCA 840
TGTGTGTAAA TGTTTAGCTT GTTCTAGTCT GTGGAGCATT CTCCTTCATA GAAAAGATGG 900
GAAATACTGG AGATGAAAAT TCTCCATTCT CTGTCATTTT GTGTGTTAGA GTCTCTGTCC 960
CCATCCCAGG GCCACTTCCT CCCTGGTTCT TCTTATGGCT TTGGATGTAG CTTGAAGACA 1020
TGCTCCTAGC ATTTTCACAA GCTCTGCTTG TTGTGTTTAG TGAGCGCAGA CTACTCCCTT 1080
CGGGCCTGTC CTGGCTCATG GGCAGTTGCT CGTGTCTTTG CACACATCCT TTACTGTCTC 1140
AGCTCTTCAC TTCTCCCTGA CATTTGTGGC TGCCTCCTCC TGGTTTCTTC TTTAAGCGAT 1200
TATTGTGTTT TAGATGATCA GAATTCACTT TTTAGAGACT TGGACCTTGT CTTTCAAAAT 1260
GCATTCCCTT TTGGGATCTC TGCCCATCAT ACTCCTTGGT CTCAACATCT AAATATTGGT 1320
TTTTTTTTTC TTTTTCTTTC TTTCTTTTTT TTTTTTTTTG AGATAGGGTC TCACTCTGTT 1380
GCCCAGGCTG AAGTGCAGTG GTACGATCAT TGGCTCACTG CAGCCTTGAC CTCCTGGGCT 1440
CAGTGATCTT CCTGCCTCAG CCTCCTGAGT AGCTGGGGCC ACAGGCTAGT GCCACCATGC 1500
CCTGCTAATT TTTTAAATTA TTCATAGAGA CGGGGTCTCC CTGTGTTGCC CAGGCTGGTC 1560
TTGAACTCCT CCTTCTCCTT TTTGTATCCT CTTAGTCATC AAGCCATCCT CCTGCCTCAG 1620
CCTCCCAAAG TGCTGGGATT TCAGTGTGAT CCACTGCGCC TGACCTGAAT ATTGGTTTTT 1680
TTGAAGTCTA GGCTAAACAA CTGTTTTTGT CTCAGTTTTT TTTTTTTTAA TTTCCCTCCT 1740
TTGAACTCTG AATTGACAAG CTTACTTCCT CCCAATGTGG TGTTCTTGTT ATTATTGTTT 1800
TTGCTAGCTG AAGTATTTTT TTTTTTTTTA AACATAATTT ACTAGGTTTT TCTTCCTGGC 1860
CAGAAGTAAG TTCAGGGTAA TAGTTCCCTT CCTTGTATCT TCAGCTGTGT GAGAGGTAAT 1920
GTAGAGTGAG AATTTATTTA TCAGGTGCCC TGCTCGTAGC AGAAGGCATG ACCTCGACTT 1980
CTCTCTCACA GTGACCTTGT GTTTGTGTTG GTGGCTTGAA CTCACTCTTG TGTCTGGGCC 2040
ATTTCTCTCA CTGTGTAGGA AAGAGTGGTT CCTGTCTTCT CCCTGGCCAT GTAGTCTGCT 2100
GTGTGTCACC ATAACAATCA TCTATCTTCC GGTTCTTTTT CCTTCTCTCC TCACCCAGTT 2160
GTCTCCAGTC TTAGGCGTGT GGAATTGTGT ACTGGGTGGG GGATGTGTGT GTGTGGGCCG 2220
CCCTCTTGAT TTGTAGGATC CTTCTCTTCC TCCACATTCT CTGTCAACTC TCCTCCACCC 2280
CCTGTGAGAT CTGTGGACTC AGGTATACGT TGCTGTGAGT CTCATTCTGC TCAGCTGGGG 2340
TGATGAAGGT GAGATTGCTT TTGTCGCTTC 2370