EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-02175 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:153611570-153614710 
Target genes
Number: 44             
NameEnsembl ID
SPRR1AENSG00000169474
SPRR1BENSG00000169469
SPRR2DENSG00000163216
SPRR2AENSG00000241794
SPRR2EENSG00000203785
SPRR2FENSG00000244094
SPRR2CENSG00000229035
SPRR2BENSG00000196805
RP1ENSG00000230779
PGLYRP3ENSG00000159527
PGLYRP4ENSG00000163218
S100A9ENSG00000163220
S100A12ENSG00000163221
AL591704.5ENSG00000237008
S100A8ENSG00000143546
S100A7AENSG00000184330
AL591704.9ENSG00000203781
S100A7ENSG00000143556
BX470102.3ENSG00000238279
S100A6ENSG00000197956
S100A5ENSG00000196420
S100A3ENSG00000188015
S100A4ENSG00000196154
S100A2ENSG00000196754
S100A16ENSG00000188643
S100A14ENSG00000189334
S100A1ENSG00000160678
CHTOPENSG00000160679
S100A13ENSG00000189171
SNAPINENSG00000143553
ILF2ENSG00000143621
NPR1ENSG00000169418
AL713889.1ENSG00000242565
RP11ENSG00000235015
INTS3ENSG00000143624
SLC27A3ENSG00000143554
GATAD2BENSG00000143614
DENND4BENSG00000198837
CRTC2ENSG00000160741
CREB3L4ENSG00000143578
SLC39A1ENSG00000143570
JTBENSG00000143543
RAB13ENSG00000143545
RPS27ENSG00000177954
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:153613039-153613054GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:153612468-153612483TGAACTCCTGACCTC-6.22
ZfxMA0146.2chr1:153611600-153611614CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1153613486153613555
chr1153611892153612209
Enhancer Sequence
ATGGTCTCGA TCTCCTGACC TCGTGATCCA CCCGCCTCGG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT 60
ACAGGCTTGA GCCACCGCGC CCAGCAGTCA AAGGTTTTCA ATGCTAAAAT ATACAGAGTA 120
GAGTGACCCT CATTTCCACA GCACCTAAAG TTTTACCAGT AAAGTGGAGC AAGAATACTG 180
AGTAATTTGA GTTAGGGGTT CTCTTTTTCA AATTTACAGT GAGAGATAAT CCTATTCAGA 240
CCTGAAATAA AACCTGCTCT TTATTATTCA TAGAATTTAT ATGCAAGTCC GGACAGTGGC 300
TGTGGAAGGA TATGTCCAAG CTGTGGCTGG GCGTCTGGAG GGCAGTGCCA TGCAACTGTA 360
AGGGCTTTGG TAGCATTGCA TGGCTATGCA TAAATTCAGC AGTTAAATAT AACACCCTTA 420
CACCCCCACC CTGAACCATT GGGCTCACTG ACCAAAAATA AACAAGGGTG TCTGCTTCGG 480
CTACCTTAAG CCTTGGAGTG ACTGGATTCC TCCCTGACTC AGGAAAGCAG CAAAAGGCAC 540
CATTTTCCAA GAGTAAATGG AAGTTGCTGA AGATGAATCT CTGACAGATC ATTCCAAAGG 600
ACCTTTCAAC AAGAAGCTTT AAGTATAGGC TCTGCAGGAA GTAGTCCCTA TCCAGAGTAG 660
TACTATTAAA TAGAATTTTT TTATGTTTTT GGTTTGGTTT GGTTTGGTTT GTTTTGAGAC 720
GGAGTCTTGC TCTGTCACCC AGGCTGTAGT GCAGTGGTGC AATCTCAACT CACTGCAGCC 780
TCCGCCTCCC GGGTTCAAGC GATTCTCCTG TCTCAGCTAC AGGCGCCCGC CACCACACCC 840
GGCTAATTTT TGTATTTTTA GTAGAGACGG AGTTTTGTCA TGTTGGCCAG ACTGGTCTTG 900
AACTCCTGAC CTCAAGTGAT CTGCCTGCCT CAGTATCCCA AAGTGTTCAG ATTACAGGCA 960
TGAGCTACCG TGCCCAGCCA GAACTTTCTA CAATGATGGA AATGTTCTGT ATTTGCTCTC 1020
CGGTACAGTA GCCACTAGTC ACATGTGGCT ATTGAAAACT TTAAATGTGA CTAGTGCAAT 1080
TAAGGAGCTT AATTTTTTTT AATTTAATTT TAGGCCAGGC CTGTAATCCC AGCACTCTGG 1140
GAGGCCAAGG CAGGCGGATC ACTTGAGGTC AGGAGTTTGA GACTAGCCTG GCCAATGTGG 1200
CAAAACCCCA TCTCTACTAA AAAAAAAAAA AAGCCGGGCA TGGTGGCGCA TACCTGTAAT 1260
CCCAGCTACT CAAGAGGCTA AGGAGAATCT CTTGAACCCA GGAAGTGGAG GTTGCGGTGA 1320
GTGGAGTTGG CACCACTGCA TTCCAGCTTG GGTGACAGTG AGACTCTGTC TCAAGAAAAT 1380
AAGTAAAATT TGCTTTTAAT TTAGGCTGGG TATGGTGGCT CACACTTGTA ATCCCAGCAC 1440
TTTGGGAGGC CTGGGCAGGT GGATCACCTG AGGTCAGGAG TTCAAGACCA GCCTGGCCAA 1500
CATGACAAGA CCCCGTCTCC ACCAAAAATA AGCCAGGCGT GATGACAGCT CCTGTAATCC 1560
CAGCTACTCG GGAGGCTGAG GCAGGAGAAT TGTTTGAACC TGGGAGACGA AGGTTGCAGT 1620
GAGCCAAGAT CGTGTCACTG CACTTCAGCC TGGGCAACAG AGCGAGACTG TATCTCAAAA 1680
TAAAAATAAT TGAAATAGCC ACATGTAGCT ATAGAGGCTG CCTTACACAG CACACCTCTA 1740
GAAGGGAAAC TAAGTGGTAT AGTTGACATC CTTAACTTCC CTGTTAATAT TAAAGGCCGG 1800
TATTGGTGGC ACTTAAGGAT TGGAATGGGT AAAGAACTTC CCAGCACTGT ACAGTTCTTT 1860
TAAAGCACAA AGCTTGGGAG AATTAATATA TGCAGGATAA CTGAACGCAA GAGACTTGTG 1920
GAATGCAGTT CTAACCTGAT AATTGTGTGT TAATCGGGAG TAACAGGACA GGCCGTTACG 1980
GTTGGTTACA CCTACTTATG CTAGATGCAT AATGTTTGGA GCCTTCCCCA CTGATGAGAA 2040
GCAATTTATG ATCTTGTGCT AGAAAGTTAA TAATGCTTCA CAGCATCTTT TTGAGAGGTT 2100
GATTAGAAAA CACACACATA CACGTTGGTA GTCACTTGTG GGTGAAGCCT GAAGGGGCTA 2160
TACAATTTAT TTTCTTTCAG ATTGACTGAT GGCTTTATGG ACAGCCAGGC TTACTAGGAG 2220
CTTGGTTGTG TTCAGGGCTA TTGCTGTCCC TTTTTCCTTT GAAGGAATTT AATTCTCTGA 2280
GATGTAGTCT TAATGGTTTT CTTTTGAGAA CAGATTCTTA AAAATACCCT ATCTCTGTAG 2340
TGTGTCCTTG TTCTTATATA TGGCCCTGAG TTTTGTGATC ACCTGAATAA TTCTAACATA 2400
CGTTTGGCTG GCTGACTGTG GAGATACATT TGAGTTACAT GTTTATTTTT AATTTAAGGT 2460
CATCATTGTT TTAAAGGAGC TGTTTGCAAG TGCAGGCATG GAATTAGGGA TTTTTAAGAA 2520
ATGTAAGGAA AGGAGATTTG ACTTTCTTGT GTTTATTTAC ATCTTAAGGT AAAAAGTGGA 2580
CCGTCTGGAA ATAGATTCTC AGAGGAAAAA TGGAGCACAC GGGCCTTTTT GAGAAATCAA 2640
TCTTGTTCTT AAGTCACAAG AACTCAAGTG AACTTGTAAT TTAAGTTTTG CCCAGAGTGT 2700
GATGAACTTC CTATGGTGTT TGAGTAAGCC TTTGAAGACA GTGGTAGTCC ATGGGCAGGT 2760
ATGAATCAAG TCATATAATT GTCAACCTGT AGTTCAAAAG CAGTACAATC CAGGATTGAA 2820
CTATAGAATG TTCTTACGAA AACTTAAGTT TCAACTGGCA GTGTATGACT TCTGTAGCCA 2880
AACTAGTGAG GTAATTTGTG GAGATGCCCA TTTCATGGGA CCACACTTGA GCTTCTTGGA 2940
GTTTCTGCTC TGGATCAAAA TTCTGCTGCT TGTATAACAT GTTCTGAGGC AAAGGCTTGC 3000
TTCTGGTTTG GGATCCTTTT GACACCCACA ACAGGTTTAT CTCCCTTCAC ACCAGCATCT 3060
CACTTGCTTC TTTTTCTCTG CACTTTGAGT TGCCAAATCC TGTTGGATTG CTTTTTTGAT 3120
CTCAATCCCC TAACACCTTT 3140