EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-02134 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:152000600-152004980 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:152001637-152001655GCTTCCTTCCATTCCTCC-6.09
FOSMA0476.1chr1:152002983-152002994TGTGACTCATT+6.62
FOXA1MA0148.4chr1:152004669-152004685CTTTGTTTATTTAGTC-6.02
GATA2MA0036.3chr1:152004470-152004481TTCTTATCTTT+6.62
LHX6MA0658.1chr1:152004164-152004174GCTAATTAGT-6.02
LMX1BMA0703.2chr1:152003874-152003885AATTTAATTAA+6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:152000759-152000774GAGGTCAAGAGTTCG+6.24
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:152003776-152003791CGATCTCTTGACCTC-6
PHOX2AMA0713.1chr1:152003873-152003884TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr1:152003873-152003884TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:152003873-152003884TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:152003873-152003884TAATTTAATTA+6.62
ZNF263MA0528.1chr1:152002735-152002756TGAGGAAGAAGGGGAGATGGA+6.18
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09446chr1:152001463-152003803CD14
SE_09446chr1:152003989-152005156CD14
SE_14980chr1:152004117-152010156CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19080chr1:152003527-152010096CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19875chr1:152003864-152009996CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_26843chr1:152001042-152002228Esophagus
SE_26843chr1:152002262-152002886Esophagus
SE_33944chr1:152001602-152002872HCC1954
SE_34680chr1:152001289-152002829HeLa
SE_35894chr1:152000890-152002901HMEC
SE_64304chr1:152001376-152002942NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1152001678152001977
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I152028chr1152000990152002822
GH01I152031chr1152003990152005156
Enhancer Sequence
AAAGTGTCAC TATCCCCAAA AAACAGTGAG CTAGGGAAGA GATGGAAAAA TATCAGGCAC 60
CCTACTGGTC TATTTGCTAC TTTACCAAGA AATCGGGCCG GGCACGGTGG CTCATGCCTG 120
TAATTCCAGA ACTTTGGGAG GCCAAGAAGG GCGGATCACG AGGTCAAGAG TTCGAGACCA 180
GCCTGGGCAA CAAGGTGAAA CCCCGTCTCT ATTAAGAATA CAAAAATTAG TCGGGCATGG 240
TGGCGCATGC CTGTAATCCC AGCTACTCGG GAGGCTGAGG CAGGAGAAAT GCTTGAATCC 300
GGGAGGCAGA GGTTGCAGTG ACCTGAGATT ATACCACTGC ACTCCAGCCT GGGTGACAGA 360
GCGAGACTCC ATCTCGGAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA GAAAGAAATC ACTGGCCATG 420
GCTTTAAGAC ACCAGGCTAA AGGGAACTAA CCAGAAAGCC TTTGCTTGCT TGGGCCCTTA 480
GGTTTTGATA AGTAAGATCT AATTGGTACC AAGCTTCTAA CTCAAGATTC AGATCAACAA 540
ACCCCTATGG AGTACTTCCT ATAAGCAAAG TGAGTGGTAG AGAGAGACAC TAGCAGGAAG 600
GGTTGGTTTG GGGAGGAGAT AATGAGCCCA GTGAGGGCAT TTTGTATTGG TCTTGTTGGT 660
AATGCCCAGT GGGCATTCAC AATTTGAGTT TGGAGAGAAG ATCTAGCTTG AGAAGTAGAG 720
AGAGAGAGAG AAAGAGAGAG ATGAGGGCCG GGGAATGTGC CCACATTAGG GAGATGGGGT 780
GGTGTGACGG TTAATATTAG GTGTCAACTT GATTGGATTG AAGGATGCCG AGATAGCTGG 840
TAAAGTATTG TTTCTGGATG TGACCATGAG GGTGTTGCCA GAGGACATTC ACATTTGAGT 900
CAGTAGACTG GGAGAGGAAG ACCCACCCTC AGTGTTGGTT GGCATCATCC AATCGGCTGC 960
CAGCGTGGCT AGAACAAAGC AGGCCGAAGA AGCTGGCTTG CTGAGTCTTC TGGCTTTCAT 1020
CTTTCTCCAT GCTGGATGCT TCCTTCCATT CCTCCTGCCT TTGGGCATCA GACTTTTTTC 1080
TCTCATGACT CATATCCAAC CAAATCCCCA AGCCCATTTG ATGCTCCACC CAAATATCCC 1140
TTGAATCCAT CCCCAACCAC CCACTGTCCA GGCCACCACC TCCTCTGATC TGGATACTGC 1200
GGCAGTTTCC TGATGTTCGT ATTCTTTTCG CTTTGCCCCC CCGGCACAGT GTCTGGAACA 1260
TTATAGAGAC TCAAATATGC ATTGCATGAT GCAATCGTCA GGAAGGATGA ACAAAGCCTG 1320
CTGGGCCAGT GACTAGTAGG GGAGAAGTTT CAGTAGAATG CTGAGGGCAA GTGTTAGAAC 1380
TCAAGGGGTT CAGGATTGAG TGGTAATAAA GGAAATAGAA GCCTTTGGTG TAGACACATA 1440
CAAAAAAGCA ATAATTCTGA CCAAAGGGAA ATATCTAAGG CAGCAACTCG AGGGTGTGGA 1500
AGTGTTGAGG AGTCTTTTGT TTCACTTTTT TGGTAGCAGA GAGCAGATAA TCCTTTAAGG 1560
AAGAGTATAA ATTTAAGACG ATTAAAAATG TAAAGGAATA TAACATTCAT ACACGAATTG 1620
TTAGGGAATC AGTGGGAATG TATTTTAAGA ATTACAACTG TGTGTTAGCT ATCTATTATT 1680
GTGTAACAAA TTACCACAAA CTTAATTACT CAACACAATT TCACTGTCTC ACAGTTTCTG 1740
TGGGTCAAGG GTCTTAGCAT AGCACTAGGA GCTGGTATCT TTTTAAAATT TCTTGGCTCT 1800
GTTTCTCCAA CATTGGCTCC ACTCTCAGAT CCCTTCCCTG TTGTCTTGAG ATGGCTATTG 1860
GCCTGTCTAA GGCTACAAAC TCTCAGGTTA GAATCCACCG AGAAGGAGGA ATAAGCAATT 1920
GCCTTTATCC CAGAATTTTC AGCAAAGGTA CTGAGATTCC CTTTATTTTG AACAGCTTAG 1980
ATCACGTTGA CCACCCTAGG CCAATCACTG TGTCCAAAGG AATGCGGGGC ACTCATTAGC 2040
TTCGGCACAG GTGTGTCCTT GAATCTTGGA ACTGGGGAAG AACCCTACCT AAACTAAGAA 2100
CACCAAGAGA TGGGGAGTGC AGAGCAGGGC TTGATTGAGG AAGAAGGGGA GATGGATGCT 2160
GCAAAAACAA GGAATAGGCA CACACAAGGA ACACATCTCA AATACAACAT GGTTGGTTTA 2220
TTTATTTATT TATTTATTTA TTTGAGACAG AGTCTCATTG CGATGCCCAG GCTGGAGTGC 2280
AATGGCATGA TCTTGGCTCA CTGCAACCTC TGATTCCTGG GTTCAAGCGA TTCTCCTGCC 2340
TCAGCCTCCC AAGTAGCTGG GATTACAGAC ATGCGCCACC ACGTGTGACT CATTTTTGTA 2400
TTTTTAGTAG AGACAGGGTT TCACCATATT GGCTAGGCTG GTTTCAAACT CCTGACTTCA 2460
AGTGATCCTC CCACCTCGGC CTCCCAAAGT GCTGGGATTA CAGATGTGAG CCACCGCGCC 2520
TGGCCAAATA TAATGTGTTT TAAACCAGAC TCTATATTTT GCTCCTAAAG CTTAACCCCC 2580
TTGCTTCATT CCTGATTTCA GTGAATTGTA TCATCATCCA ACCAATTGTC CATGCTGGGA 2640
AGCTGGGAAT AATCCTAGGC TTCTCTTTCT CACCACTACA TTCAGATAAT CATCATCTCT 2700
TGGGTTTTAC CTCTTACATA CTCTTCCCCT CCCTTCCCGC TTCATTGCCT TATTTCAGAT 2760
TCTTAACTGA CCCATTTTAC CATCTCTCCA TTCTCTCTCT CTTAAAAAAA AATGTTGACT 2820
TGTGGCCGTA GAACGATGAA TGTCCAAGGC CTATGGATAA TTCTAATAGC CCACACACTT 2880
GGGCACCAAC CCAACAGTGG GATCATGTGT TCACTAAGAG TGTATTTGTG ATCGGTCCCA 2940
AACCTGTTTA TATTCTTTTT TTTCTTTCTT TTTTTTTGAG ACGGAGCTTG CTCTGTTGCT 3000
AGGCTGGAGT GCAGTGGTGT GATCTGAGCT CACCGCAACC TCCACCTCCC GCGTTCAAGT 3060
GATTCTCCTG CTTCAGCCTC CCAAGTAGCC GGGATTACAG GCGCCCGCCA CCACACCCGG 3120
CTAATTTTTG TATTTTTAGT AGAGACAGGG TTTCACCAAG TTGGCCAGGA TGGTCTCGAT 3180
CTCTTGACCT CGTGATCTGC CTGCCTCAGC CTCCCAAAGT GCTTGGATTA CAGGCGTGAG 3240
CTACCGCGCC TGGCCCGTTT TTCTTGTAAG GTATAATTTA ATTAAATATC CCATAAACCA 3300
ATAAAATATG TATGTGAAGA GATAGTTTTT ATCTTTATGA AAGTCAAATT GAATTCTTTT 3360
CAAAGACTGG ATGATTCAAA TGTACTGAAG ATAATTGCAG TTGCTACAGG TATAGCTGAG 3420
ACAACTGTAA ACGGCTGAGG CAGTGGCTCA CCCTAAGGTG CTGGCCTTCA TTTTGGAATG 3480
TCAGAGCCAA AAATGACCTC AGATATGGTC TAATCCATCT CACTGAATTT ATGAAGGAAT 3540
AAACCATAAT CTAGAGAGAT TTTTGCTAAT TAGTTAAAAC TCACATAAAT GGATAAGGAA 3600
TCAGAGGTTT TCTGGATACA CATCACTTTT TCGCTGTGCT TCTTAGGAAT AATTGCACAT 3660
TGCGGAAACC TGCCCCTCTT TCTCTCTCTC TCCTCTAATC TGTCATCTTT AACCCTGGAT 3720
CAGTCTTCTT ACCTTCTTTC TAGGCTCTCT TTCCCTGCTG CTTTATCAGA GGGCTTAGAA 3780
AATTAAAACT AGTGTTAACA CTAGCTTAAG CCAAACATGA AGACCTTGGC AACACGAGCC 3840
TCCTTTCTAT TCCACAAACA TCCTAGATCC TTCTTATCTT TGGAGGACCT CTGCCCTTCC 3900
CATTTCTTCT CTTGAAATGC CCTCTTCTTC TTTTCAAATG TTTGCTCTTT CTAGTTCTTC 3960
ATATCTCAGC ACAAATGTCA TGTCCTCAGA ATAGTGCCCT CTTAGTCCCC ATGAATCTGT 4020
AACATAATTG TAATCTGTCC TTCCTAGGAT TTATCATACT CTGATAGTCC TTTGTTTATT 4080
TAGTCATTGT TCTCTCCCCC AACGAGAAGT TATACTCAGT GAAGGCATGA CCTTGTCTGT 4140
CTTGCTGGTT GTATTCTCAG GATCTATGAC AGTGCCAACG GGTAGCAGTG AGTAAACAAT 4200
AACAATAAGT GACAACTCTC CATCAGTCAA TAATTTAGAG ATGAATCTGG TTGTACTATT 4260
AGTCATGATT ATGTGTACAC CCAAGATGCA TTTTTTCTTA TTTACTATGC AGCTTCTATC 4320
AATCTAATTT ATATTCCTCC CACTTTCCAC CCTCCCATGC ACAAATTCAC CAACTCTCTA 4380