EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-01929 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:145255700-145260190 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:145257810-145257831GAAAGAAAAGTGAAAATAAAG-6.66
JUN(var.2)MA0489.1chr1:145259619-145259633GTGACTCATTTTCT-6.06
JUN(var.2)MA0489.1chr1:145259614-145259628AAAAAGTGACTCAT+6.86
LMX1BMA0703.2chr1:145257272-145257283TTAATTAAATT-6.32
Nkx3-2MA0122.3chr1:145259835-145259848TTTAAGTGGTTGA-6.24
Nr5a2MA0505.1chr1:145259557-145259572CATGGCCTTGAATTT-6.18
ZNF263MA0528.1chr1:145258515-145258536GGAGAAGGGTGAGAGGAAGGG+6.39
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00003chr1:145251059-145275952Adipose_Nuclei
SE_03069chr1:145258633-145260535Bladder
SE_03463chr1:145255907-145266810Brain_Angular_Gyrus
SE_03978chr1:145251140-145275413Brain_Anterior_Caudate
SE_07422chr1:145257772-145272464Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08814chr1:145258081-145260666Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09140chr1:145251182-145275606CD14
SE_12866chr1:145251628-145256255CD34_Primary_RO01480
SE_12866chr1:145257553-145260552CD34_Primary_RO01480
SE_13318chr1:145251319-145275481CD34_Primary_RO01536
SE_14056chr1:145251680-145275353CD34_Primary_RO01549
SE_36948chr1:145258023-145265701HSMMtube
SE_41324chr1:145257935-145266273Left_Ventricle
SE_42337chr1:145257947-145266278Lung
SE_43396chr1:145255520-145266848MCF-7
SE_45621chr1:145255468-145275585Osteoblasts
SE_46950chr1:145258144-145260074Ovary
SE_49874chr1:145255538-145266765RPMI-8402
SE_53593chr1:145257940-145264728Spleen
Number: 4             
IDChromosomeStartEnd
GH01I146178chr1145258592145260391
GH01I148628chr1145258728145260327
GH01I149440chr1145258464145260864
GH01I120773chr1145258558145260557
Enhancer Sequence
GCAAGTTAAA GTCTATAATG CTAGCTAACA TTATTGCGTA TTAGGGTCTG TTCTCAAGTA 60
GTTTACATGT ATTTACTTTA GTCCTCATGT GAGAGAGAGA CTATATGGAA GCTAAGAGAA 120
GTTAAATAAT TCACTCAAGA TCCCATCACT CTGTAGCTAA CCTGAGATAT ACTCGTGGAA 180
AATGTACTGT CACGTTGAGT CTCAGTTTGC CTGTCAATAA AATGGGACAG AATTACCTGT 240
TTTAAGTTGG TAGTTCAAAT GGAACCTTCT GAAAAGGAAG TGTGGAACAT TTGAAAGTAT 300
ACAAAAAGGG GACTTTTCAG ATCAGGAATA TGATTAAAAC ACTGCTTTAT GTAATTTCTA 360
AATTTAAAGA CAGTAGCATT AGGTAGGCCT GAGTACCTCA TATCATTCTA GAACACTAAA 420
TCTGCATATA GTTACATGAG TGTACATGGG CCAGGTTTGG TGAATACTGC ATTTCTGAGA 480
AATGGCCTTT AACATGAAAG CTCAATGTAA TAACTGTGGA TGAAATAGAA GAAGAGGGCA 540
GTGAAGGTGG GGATAGAGGA TATTGTCTAT TAAAGTGTGC TTCAGTAGAG AGAACTAATT 600
TGAAACTTCT CCTTTCTTTT TACTAATGGA ACAGGAGCAA GTCCAGACAG ATTTATGCAG 660
TTGTGAAATT GAGACAGGTT AAATTCAGTG ATTTTTGATA AATGTTGTTG CCAGCACAAA 720
AGTCACAAGT TGTTGAATAT GGCACCTTAC ATTTGCATAG TGAGTTACAG ATGCATAGGA 780
GTATGTCCTG TGAGGCTTTT CCTTGTATTA GGACTTGAGA TCTGGACCCT TTAACAGTAC 840
CTTTCCTAAG TGATTCTTAT TAATACTTAT GTCCTATTAA AATCCTTTAT CAAATATGAT 900
GTTTCCCTAA GGGGTCTTTT GTAAAGGAAG TCTTGGTTAC TAGCATCTCC ATCTGTGGCC 960
CAGGCTTGAG TGCAGTAGAG CAATCATGGA TCACTGCAGC CTCCACCTCC TAGGCTCAAG 1020
CCATCCATCC TCCTGCCTCA GTCTCCCATT TTTAAAACTT TTTATAGAGA CACGGTCTCA 1080
CATGTTGCTC AGGCTGGTCT CGAATTCCTG GGCTCAAGTG ATCCTCCCAC TTCTGCCTCC 1140
CAAAGGGCTG GAATTACAGG CCTGAACCAC TGTGCCTGGC CAGTTAGTAG CTTCTTAACA 1200
CATAGCAACA TAATTTCCAT ACTATTTTCA ACTAATTTTT ATTCTTTCAG TTGGGACCTT 1260
TATATATTTC AGTGTTCAGT GAAGAAGTAG GAGAATCTGG TTCTTAGGCT CTGCCTATAT 1320
CCTTTTACCT GTCTTGGGTA ACTGCCAAGA AATTAAATCA ACAAATTTTG GCCTGCAGTC 1380
TGGCATTAAT AGATGTGAAT TTAGCTAGGT TTCTTTCAAC ACAGTCTCCA GGTCAATCGT 1440
AATCTTATGT GAAGTTTCTT ATTCAGGCAT GTCTCGTTAG CACCATTAAT TTCACACAGG 1500
AATTCTTTTT TTCTCCCTTT TTTTGTGACT AAGCAAAATG AGAAATATTT CTCTTTCAGG 1560
ATATGGAGAG GCTTAATTAA ATTCTTTAAT TTTGTCTACA TCTGCCCTTA TGAATGATAG 1620
CAAAGGAATG GGGGATATCA GAATATGAGA AAAAGTAATC ATCTAAAAAT TTCCAAGCAC 1680
TTTAAAATTT ATTAAGCTAG CATAAATATG TGGGTGTGAT AGAGGTTTTC ATTAAGCCTC 1740
CTCTCAACAT ACAGTAGTTA GGAATGAAGT TTAGTGTCTC TCCGTCCTCC TGTCATATGT 1800
GTGTATGCAC ACGTGTGCAC ATGCGACTGT GTTATGCATT TTGTTTTCAT ATTTCTTTTA 1860
GTTGGGTTTT ACCTTACAAC CCAACGTAAG GTAAATTAAA ATTTCTATTG GATTTCCGCA 1920
CATTTTCTAG ATCCTATTTA TTCACTGTCA GTGACCTTCA CTAGCACTTA GTCCTCTGAG 1980
TCCAAAAATG TATTGCCAAT TCTTAGACTC CATCAGCCTT CTCCTATGAA AAAGTAATGC 2040
AGTTAATTTC TGCTCAAAAT GCTCTTCTCC TAAACAGTCT TCTACTTGAT CTTTATGAAA 2100
AGAGTTTTAT GAAAGAAAAG TGAAAATAAA GACTAAGAAA GACATTATTT AAGTGATGGG 2160
TGATATTATT CAGTGAACAC ATTCAACTAT AGCATTCTAT CCAGTTTTTT GCCTTCACGT 2220
AAATATGAGG AGAAAGGTAG GTGTTAATAA GAAAATAATC TGATTAGGAT TTATGTAGAA 2280
TGGTAGCATT TAGGGTATTA AATCTGTATA GATTCAGGTC ATTTTCCTGC AGTCACTGTC 2340
TATAATCCTG TGTGCTGAAC ACTGAAAGTT AGATGGACTC TGAAGCGCTA TAGAATCCTC 2400
ACTTTTCAAA CAAAAGTTTA ATTTTTATCA CACTAGTATT TATTGAGCAG GCTACTATAA 2460
CTGATCACTG TACTGGGTAT TGTGAATAGA CAGAAAAGCC CAAGAGGCCT GTGTTACCTG 2520
ACTTCTTTAT TCACAAGTAT ACGTACCCAG AGACTGTCTG ACAGTGAATG CAGTTTCTCC 2580
TGCATAAGAC ATGGTGGCAG TCTTCTGAAG TCTTGCTGGG GAGATGAAGC ATACAGAGAT 2640
GTGTAAAATA AAACAGTTTG TAATATCCCA GTGTAGGGGC ACAGATAATA ACTATGGACA 2700
CTCAGACAAA GGAACAAGTA CTGTGGGACA AAAGAGTAAA ATCAGAGGAC TTTTGGTGCA 2760
CTGCTTAGAT CCTAAATCTT TGAATATTAG TGGTGCCTTA GAAGATGGAT AGGTAGGAGA 2820
AGGGTGAGAG GAAGGGAGCT GAGGAGACTA GAAGGGACTG TTATTTCCTG GAATAATCAT 2880
TACCAATTTC TTCATCACGT TTTCTTAATG ACACGGTTTC AAACGTTTTC TTCATCTTGA 2940
TTGCTGTCTT CTGTGTATAT GCTGGTTTGT GTGAGGTTTT ACTAAACCAG TATGTGGATT 3000
AATCTAGTTT CACAGTGACA GGTAAGTGAT TTAGAAAATC ATTCCTTTAG CACATGTTAA 3060
CTTGAACGTT TGGAGGTAGA ATGCCTAGAG TGAGGGTGAA GGAGAGGACC TGGGGACAGG 3120
AAGAGAGGGC AGCTGGGAGC AATTATGCTC CTTCCCTCAG ACCTTTTTGG CCTTGACTCT 3180
TGATTCTTGT ACTTCTACCA GACAGAGAGG CGGTAGGCTT GTGGCCATGT TTTGCGAGGA 3240
AAATCAGAAT CTAAGAATCT CTAAGGCAAG AGCAAGAATG GATTGGGATA GGGGAAGTGA 3300
TAGGAAAACA GAGGCACTAA GAAGAGGGTT GGTTTTCATG TACTGCATAG TTCATTCCCT 3360
TAGTTGAGAA ATCAGGTATC TCAACCTCAG ATATCTTCTG TCCAGCATAT CGCTGGCCAG 3420
ATCTGATTCA TATGAGGGAT CCAGAGTAAG GAAGCATCTG TTAGCCAAGT CTTTGGTTAC 3480
CCCAAATTAG CTCAGGTCCT TTACTGCTTG TTTCCTCTGA TTATATAGTA CATATCCAAA 3540
CCCTCAATTT TCCAGAATAA ACTAGGTCTG CCTATTCTGT GTGGAAAACA TTTGATGGTG 3600
GTTAAGATTC TCTTGCCTAG ACGATGGTAG TGCCTTAGTC GTTTAACTGC CTGTCACTTT 3660
AAGATTTTGA AATACTGATT CTTGTTGTGT AAGCCAGACA CATCTTGAGA ATATTTTACG 3720
GGGCAACTTG CCCTTTCTGA AACCTCAGTC ATCCTGAAAA GTAACTCTGT ACCTCCTTGA 3780
CTTTAATTTT TCTGTCTTAA TTCTATTTGT ATACAATGTT TGTGGTGTCT GATTCTCTGT 3840
CTCGTATTGC TGAAACTCAT GGCCTTGAAT TTCTGGGTCA CTCTTAAAAA ATAGACATAA 3900
CTTGATTACT AATGAAAAAG TGACTCATTT TCTTCCAGGC AAAGGCTGAC ACTGACTGTC 3960
ACAGTTTGTG ACAGAAGCAG ACTCTCTAAT TAGGAGACAT CACCTATTCT TTTCTAAATT 4020
TTATAAGAAT TGATGATAGC ATCATGAGAT GGGAAGTGAG TAAGATAAGC GTTTATGCTT 4080
GTAGAGAGGA TGCATAAAAA TGAAATCTGG ATAAAGTTCT ATCTGAATTT ACCTTTTTAA 4140
GTGGTTGATT CCCTGTGAGC TTAAATTTAG TGCTTCTCTT CCCAGACCGT TGTCTTACAT 4200
ACACACTTCA GTCAGTTTTA GCCTTGTATA ACTAATCAGC AGGTCAGATT CCATCGAGGC 4260
TGAAATACCT ACCACCATTC TATGCTCAAG AAAACAGGCT CTCATGTTGG CCAGTTGTTT 4320
GGGATAGAAG ATGGTTAGAC CTTTCTATCC TTTTTAAACA CAAGATTCTT TTTCATTCCC 4380
CTTATCTTGT TTAAATATAT TGTTCCTTCT CTTTGGTTGT TCTTTGCTTT CTTATGCATC 4440
TGTGAGGGGC TAGCTGAAAG TGTGAGTTGT GGAACAATTC ATTTACATAA 4490