EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-01915 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:145113440-145115730 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LHX2MA0700.1chr1:145115574-145115584GTTAATTAGT-6.02
mix-aMA0621.1chr1:145115573-145115584AGTTAATTAGT+6.14
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00110chr1:145109341-145120995Adipose_Nuclei
SE_02370chr1:145113433-145116175Astrocytes
SE_09153chr1:145108944-145121268CD14
SE_36703chr1:145112883-145116455HMEC
SE_37044chr1:145112592-145117027HSMMtube
SE_39012chr1:145112193-145116292IMR90
SE_44224chr1:145112208-145121153NHDF-Ad
SE_44968chr1:145112756-145115992NHLF
SE_45537chr1:145109103-145121359Osteoblasts
SE_51844chr1:145113549-145115880Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_55651chr1:145112164-145123546u87
SE_63643chr1:145113469-145116071HSMM
SE_67559chr1:145112164-145123546u87
SE_68407chr1:145053820-145118488TC71
SE_68408chr1:145053820-145118488TC71
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1145113904145114998
Number: 4             
IDChromosomeStartEnd
GH01I120157chr1145113319145115924
GH01I148771chr1145112227145116926
GH01I146321chr1145112942145116344
GH01I149354chr1145113079145116277
Enhancer Sequence
AACATATTTG GATAATTAAA TATTTTTATA TAATTTCATA TATTTTTTTG AGACAGAGTC 60
TTGTTCTGTT GCCCAGGCTG GAGTGCAATG GCACGATCTT GGCTCACTGC AACCTCCATC 120
TCCTGGGTTC AAGCGATCTT CCCACCTTAT CCTCCTGAGT AGCTGGGGCT ACAGGCATGT 180
GCCACCACGC CTGGCTAATT TTTGTATTTT CTTAGTAGAG ATGGGGTTTT GCCATGTTGT 240
TCCGGCTGGT CACAAACTCC AGGGCTCAAG CAATCCACTC ACTTCAGCTT CCCAAAGTGC 300
TGGGATTACA GGCATGAGCC ACAACACCCA GCCCTTTATA TAATTTTAAA AGTGTAGGTA 360
ATTAGGTAAA ATTAGGTTAA AAGTATATGT ATATTTACCT GATATTTAAA TATTACCTAA 420
GTGTTTAATG TGGACATGTA AGCTCTTTAA AGATAGTGCT TATGTATTTT ATATCTGTTT 480
CACATACTCC TTATATATCC CCCACAGAAA TGGTCACAAA TAGGTTCCTT AATAAGTATT 540
TTTGAATTCA GCCATGCTAT ATATTCATTA GTAAGTGAGT TTTCTTTTAT TATGAACTAC 600
AAACTTTAAC CTTTTTTTGA GTAGTGAGCA GTTATTCATT TACCTTCACA CTCTTTAAAT 660
ACCAAATTTT GAGTGAGTGA GTGTGTAAGG TTTTGTCATA CAGACTTGCA ATTCCTATAT 720
GGGATAAAGT AGACTAGCAC AGGAATTTTT CTTGTATCAC TCATGCAAGA CTCTAAATTC 780
CTTAAAGGCA GGGATCATGT ATATTTTGAT CACTGTTGTA TCCTCAGCAC TTCACATGGT 840
GCCTGTCACA TAAATATTTG TTAAATGACT TCTCCAAGCA ATAGCTTTGT CTTTATGTTA 900
TCCTGTATTT CAAAACGTTC ATATATAAAT TCTCTCAACT ATGACTTGTT TCATAGGGTC 960
TAATAATTGT TCCTCTGCTG AGTTATTCTC AGCAGATTTA GATTCATTTA GCAAATGTTT 1020
ATTGAGCACT AACTATATAC CAGGCCCTGT TCTGGGCATT CAGGATATAG CAGCAAACAC 1080
AATAATTTAA AATCCCTGTC CAGTGAAGTG TATATTCTTG TAGGCTCTGT AAAAAGATGC 1140
CCTGTGCATT GTCATGGTTA TTTCTCAGTC CCTGACTCTT CTTCCGTCAC TAGATGTTTT 1200
TCTTACTCAT GTGATCAGTT GCTAATTCAG ACGTGGCTGT CATGCCTGTG TTATTAAGTA 1260
ACGCCATGTT TCCCAATCAA AACCAGTCTC TATTAAGCAA CTCCAAATAT TCCAAAAGCA 1320
TTCTTTAAGG AAGAAACAGC CGGATTGCAA AATAGTTTTT TCTGAAATTT CAAGAAGTGA 1380
AAAGTTTGAT CAGAATTTAT TATGTCAAAT GGAGAGTTTG TGTTTATTAT TAAAATATGC 1440
CCTATATTTT AATATGGTCT AGCTTGTGTC TATCTGGCTA TTTCTCTAAG TGTTTAGTTA 1500
ACTGTTATAA GAAGATAACA ACATTACAAA TGTCCTTGGG GGTGAAAAAA CTTGCCAGAA 1560
AATACTAAAA AGCTTAATTT ACTTGCGTTT TTTTTTGTAG TACTTATTGT ATTTTAGTTA 1620
CAACTTTCCT ATGTCTATTG AAATATAAAT CCTGATAGCT TTAACTTCAT AGTAGTCTCT 1680
ACTATGTGGA GAATCTTAGA AATGTTAGCA GTCATCATTG AAGTATAGCT TAAGACTGTG 1740
TTTGGTTAAT TGAATTTTCT GGTTATCTGA GTTTGTTTTA CATGGATTAT CATTATCGTT 1800
TTTCAAAATA TAAGAGAATA TGATTCAGAC CATTAGAAGA TTATGAAGAT AATAATTATT 1860
AACATGTAAT AATTATTATA ATTTATCATG TGCAGGCATT GTTGCTCACT TTACAGGCAA 1920
TCTCATGTAC ATACAACTTT ATGACATAGT TACTGTTATT ATCCCCAATT ATAGATGAAG 1980
AAACTAGGTT TTAAATAGGT TACATGACTT GACCAATGTC ACATAACTTG TACAGGTGAT 2040
ATCTGAACCA AAGAGTCTGA GGCCAGAACC TGCACTTCTA ACCACCTTAC TATATAGCCT 2100
CAAAAATTCA GACATAATCT GATCAGCATC ATCAGTTAAT TAGTATATGC AATGTTAGCC 2160
TCAAAATAAA AATGATGATT TAAGATTCAT GGTTGTTGCA GTGCTGCTCA TTTTGGTTAT 2220
TTTTAATGCC TTAATACTTT CGGTAAAATA CTTCCAGGGA CTAATTAATG TTTTCCTTTT 2280
TTCCTCTTTG 2290