EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-01771 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:120562900-120565630 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:120563572-120563593CTTTATTTTCACTTTTCTTTC+6.66
LMX1BMA0703.2chr1:120564122-120564133AATTTAATTAA+6.32
Number of super-enhancer constituents: 18             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00001chr1:120545720-120570355Adipose_Nuclei
SE_03434chr1:120554599-120564678Brain_Angular_Gyrus
SE_03980chr1:120549079-120570221Brain_Anterior_Caudate
SE_07385chr1:120548934-120569847Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08816chr1:120560737-120563322Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09137chr1:120545789-120570232CD14
SE_12867chr1:120560851-120563850CD34_Primary_RO01480
SE_13322chr1:120545914-120570095CD34_Primary_RO01536
SE_14057chr1:120546042-120569730CD34_Primary_RO01549
SE_18945chr1:120550673-120570213CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_36951chr1:120560204-120563380HSMMtube
SE_41312chr1:120555136-120563468Left_Ventricle
SE_42341chr1:120556611-120563456Lung
SE_43397chr1:120554561-120565886MCF-7
SE_45586chr1:120545832-120570231Osteoblasts
SE_46953chr1:120561329-120563259Ovary
SE_49875chr1:120554642-120565868RPMI-8402
SE_53396chr1:120556680-120563463Spleen
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I120018chr1120560624120563022
Enhancer Sequence
TTCTAAGGCA CCACTAATAT TCAAAGATTT AGGATCTAAG CAGTGCACCA AAAGTCCTCT 60
GATTTTACTC TTTTGTCCCA CAGTACTTGT TCCTTTGTCT GAGTGTCCAT AGTTATTATC 120
TGTGCCCCTA CACTGGGATA TTACAAACTG TTTTATTTTA CACATCTCTG TATGCTTCAT 180
CTCCCCAGCA AGACTTCAGA AGACTGCCAC CATGTCTTAT GCAGGAGAAA CTGCATTCAC 240
TGTCAGACAG TCTCTGGGTA CGTATACTTG TGAATAAGGA AGTCAGGTAA CACAGGCCTC 300
TTGGGCTTTT CTGGGTATTC ACAATACCCA GTACAGTGAT CAGTTATAGT AGCCTGCTCA 360
ATAAATACTA GTGTGATAAA AATTAAACTT TTGTTTGAAA AGTGAGGATT CTATAGTGCT 420
TCAGAGTCCA TCTAACTTTC AGTGTTCAGC ACACAGGATT ATAGACAGTG ACTGCAGGAA 480
AATGACCTGA ATCTATACAG ATTTAATAGT CTAAATGCTA CCATTCTACA TAAATCCTAA 540
TCAGATTATT TTCTTATTAA CACCTACCTT TCTCCTCATA TTTACGTGAA GGCAAAAAAC 600
TGGATAGAAT GCTCTAGTTG AATGTGTTCG CTGAATAATA TCACCCATCA CTTAAATAAT 660
GCCTTTCTTA GTCTTTATTT TCACTTTTCT TTCATAAAAC TCTTTTCATA AAGATCAAGT 720
AGAAGACTGT TTAGGAGAAG AGCATTTCGA GCAGAAATTA ACTGCATTAC TTTTTCATAG 780
GAGAAGGCTG ATGGAGTCTA AGAATTGGCA ATACATTTTT GGACACAGAG GACTAAGTGC 840
TAGTGAAGGT CACTGACAGT GAATAAATAG GATCTAGAAA ATGTGCGGAA ATCCAATAGA 900
AAGTTTAATT TACCTTACGT TGGGTTGTAA GGTAAAACTC AACTAAAAGA AATATGAAAA 960
CAAAATGCAT AACACAGTCG CATGTGCACA CATGTGTGCA TACACACATA TGACAGGAGG 1020
ACGGAGAGAC ACTAAACTTC ATTCCTAACT ACTGTATGTT GAGAGGAGGC CTAATGAAAA 1080
CCTCTATCAC ACCCACATAT TTATGCTAGC TTAACAAATT TTAAAGTGCT TGGAAATTTT 1140
TAGATGATTA CTTTTTCTCA TATTCTGATA TCCCCCATTC CTTTGCTATC ATTCATAAGG 1200
GCAGATGTAG ACAAAATTAA AGAATTTAAT TAAGCCTCTC CATATCCTGA AAGAGAAATA 1260
TTTCTCATTT TGCTTAGTCA CAAAAAAAGG GAGAAAAAAA GAATTCCTGT GTGAAATTAA 1320
TGGTGCTAAT GAGACATGCC TGAATAAGAA ACTTCACATA AGATTACGAT TGACCTGGAG 1380
ACTGTGTTGA AAGAAACCTA GCTAAATTCA CATCTATTAA TGCCAGACTG CAGGCCAAAA 1440
TTTGTTGATT TAATTTCTTG GCAGTTACCC AAGACAGGTA AAAGGATATA GGCAGAGCCT 1500
AAGAACCAGA TTCTCCTACT TCTTCACTGA ACACTGAAAT ATATAAAGGT CCCAACTGAA 1560
AGAATAAAAA TTAGTTGAAA ATAGTATGGA AATTATGTTG CTATGTGTTA AGAAGCTACT 1620
AACTGGCCAG GCACAGTGGT TCAGGCCTGT AATTCCAGCC CTTTGGGAGG CAGAAGTGGG 1680
AGGATCACTT GAGCCCAGGA ATTCGAGACC AGCCTGAGCA ACATGTGAGA CCGTGTCTCT 1740
ATAAAAAGTT TTAAAAATGG GAGACTGAGG CAGGAGGATG GATGGCTTGA GCCTAGGAGG 1800
TGGAGGCTGC AGTGATCCAT GATTGCTCTA CTGCACTCAA GCCTGGGCCA CAGATGGAGA 1860
TGCTAGTAAC CAAGACTTCC TTTACAAAAG ACCCCTTAGG GAAACATCAT ATTTGATAAA 1920
GGATTTTAAT AGGACATAAG TATTAATAAG AATCACTTAG GAATGGTACT GTTAAAGGGT 1980
CCAGATCTCA AGTCCTAATA CAAGGAAAAG CCTCACAGGA CATACTCATA TGCATCTGTA 2040
ACTCACTATG CAAATGTAAG GTGCCATATT CAACAACTTG TGACTTTTGT GCTGGCAACA 2100
ACATTTATCA AAAATCACTG AATTTAACCT GTCTCAATTT CACAACTGCA TAAATCTGTC 2160
TGGACTTGCT CCTGTTCCAT TAGTAAAAAG AAAGGAGAAG TTTCAAATTA GTTCTCTCTA 2220
CTGAAGCACA CTTTAATAGA CAATATCCTC TATCCCCACC TTCACTGCCC TCTTCTTCTA 2280
TTTCATCCAC AGTTATTACA TTGAGCTTTC ATGTTAAAGG CCATTTCTCA GAAATGCAGT 2340
ATTCACCAAA CCTGGCCCAT GTACACTCAT GTAACTATAT GCAGATTTAG TGTTCTAGAA 2400
TGATATGAGG TACTCAGGCC TACCTAATGC TACTGTCTTT AAATTTAGAA ATTACATAAA 2460
GCAGTGTTTT AATCATATTC CTGATCTGAA AAGTCCCCTT TTTGTATACT TTCAAATGTT 2520
CCACACTTCC TTTTCAGAAG GTTCCATTTG AACTACAAAC TTAAAACAGG TAATTCTGTC 2580
CCATTTTATT GACAGGCAAA CTGAGACTCA AGGTGACAGT ACATTTTCCA CGAGTATATC 2640
TCAGGTTAGC TACAGAGTGA TGGGATCTTG AGTGAATTAT TTAACTTCTC TTAGCTTCCA 2700
TATAGTCTCT CTCTCACATG GGGACTAAAG 2730