EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-01505 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:94157550-94161250 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr1:94159308-94159319TGCTGTGATTT-6.62
IRF1MA0050.2chr1:94159117-94159138TTCTGGTTTCTGTTTCTTATT+6.35
IRF1MA0050.2chr1:94158160-94158181GACGAGAAAATGAAAGCACAA-6.54
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02579chr1:94157835-94160151Astrocytes
SE_34666chr1:94156170-94161986HeLa
SE_35914chr1:94156301-94161880HMEC
SE_37201chr1:94157138-94160168HSMMtube
SE_38161chr1:94157782-94160479HUVEC
SE_51729chr1:94156945-94160739Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_57679chr1:94157517-94158002VACO_503
SE_57679chr1:94158132-94159107VACO_503
SE_57679chr1:94159110-94160716VACO_503
SE_59776chr1:94145101-94182733Ly4
SE_63513chr1:94156834-94160739HSMM
SE_64440chr1:94157271-94160872NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr19415860194159338
chr19415812794158185
chr19415922994160171
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I093691chr19415658794162086
Enhancer Sequence
GCCATGATGA AAAGTTAAAT AATGTTTCTA AAATTCCTTT GGAATGCAAG TGAGTGAAAG 60
TGGTGCTATG ATAAAGACAA TCTAGGGTTG GCCAGTTTGA TTTTTAAATA AGTGATTTAT 120
AACTGACACT GCATCATTAG GAATGAAGTG CTCGCCGCAC AGCTCGGCAT CCAGTGCAAG 180
AGCAGCTGGC ACAGCAAGCT GGAGGGCTGC AAGAGGCTGT CAGTTTGGCC CTTTCCTCTC 240
TGGTTCCTTC CTCACAGGAA CCCCCCTCCC CAGTGCACAC ACAGCTGCTG TGGGGCACTG 300
CTTTTGCCTC CTCTTGTGTG GTAACCATTT GGAACTGCTT TTAATGGTGC TGTCGACAGT 360
ACTGAGGTTT CCAAATGGTA AGAATAATTT CCAGATAGTA ACACAGTCAA GCATAAGGAG 420
ACACACAAGA ATTGGCCTAG GTGTCTGCAA AGAGGGAGAG AGCACCAAAG GTTCTGATGG 480
GGGAAACACA AACTAAATAT GAATCATAAA AGCTATGCTT ACCAGCCCAG GGCTAAGAAC 540
TTTGTGTGCA TCATCTGAGT TAATCCTTTC AGCAACCTAG AGAGGTGGGG GTTATTAAGC 600
CCTTTTTATA GACGAGAAAA TGAAAGCACA AAAAGGCAGA GTAACCAGCC AAGTTCACAG 660
AGCTGGGATG TGGAGCTCCC TAAACTGGCC TCCCTGACTC CACTGCCCAC TTCATCTCCC 720
AGTGTGAACC CTTGTTCCTC AGAGTGAGTG GGAGAGTTTG GGGTTGATTG CTTGAGCGTG 780
GTGTGGAATG GCACAGTGAA TCTTAAGAGA AGCAAGCAAG CTGGGTTAGG TAAACTTAGC 840
CCAGTGCCTG GCACTTGCTA GGCATTCCAT AGATATTTGA GATTTGGACT TTTGAACAGA 900
GTTTCAGACA TAGGGTCAGA GTGTGTGGGG GTCTCAAGCA GGTCAGGAAC CACAGTCAAG 960
CCTCTACATA CACTTGAATT TTCCCCATGG CAGGAACCCA CATTGAAGGT TCACAGGTGT 1020
GTCCTAGCGC CGTCCTGGGG CTGTGGAGCA GCTGCCTCTC CAGTGCCCGG GGTTTGCCAT 1080
AAATGCCGAA TCTCAGCCCC ACCCTAAGGC ACTGACTCAG AACCCACATT TTAACAAGCC 1140
TCCCAGTGAC CTGTGTGAGA GGCACTGCTC CAACTCAACA ACCCTCCTGC AAGGGAGCAA 1200
GCCAGCAGTC ATCCTTCTAC CCAGTACAGG GGAAATTTCT TTTTCCTGTA CTAGGCTTAG 1260
GGAATAGCAC TTTGGGGGGC TAACCCCTGG TGCTGCCCTA ACCTCTTCCT CACAAAACCT 1320
TTCATACAGC TGTGAGAGGC AAACTTCTCA GTTGTCAGCA TTTCCAGGAA GAAAGAACCC 1380
CTTGAGTGAT CTCCATGTGA CCTCGTCTGT CTCAGGTTCA TGAACATGAA GGTGAGAGCA 1440
GCTCTTCCTC ACAGCATGAC CAGGCAGTGA CAAACACGCC ACATGGAAGG AAATGAGTGA 1500
ACAATCCTCG CATATTCTGA AGTGAGTCAT TGGCCTTTCT TGTGGACTGG GTACTGGATG 1560
ATTAAATTTC TGGTTTCTGT TTCTTATTTC AGAATATATT GATGATGAAC ACATAGCGTC 1620
CCCCAAAGTG CAAGGTGCTG GGGACAACAG ATCAGGTGGT CCTTTAAAAC ACTTTATACA 1680
AAAATAATAT TATACTGTTA CCACCTTGGT AACACAGTAA AAATAGAGGA CAGGTAAGAT 1740
GCCTCTGTAA ACACGGACTG CTGTGATTTT GGTGACTAGT AGGGGGCAGA AACTCGAAAG 1800
TAGCTCCAGG GACGCTCACC TCTTGTGCTC CTATCCCACT GTCCATCTCC CATCTGCTCT 1860
GGGCTCTCAG TGTGGAGTGG AGCTGATAGT GGTCTCCACC ACCAAGGCTC TGCCTCTTGC 1920
TTGAGCCCCT GAGCACCTAC TCTTGGCACT CTGTGTGCTT TGCCCACTTA ATCCTCACGA 1980
CAGCTCTTTG AGGCAGGTAT TATTATCCCT ATTTTATAGA TGAGGAGATT GAGGTGCAAA 2040
GAGAGGCTAA GTTGCCCAAG GTTGCATGTC TAAAAAGTAT CAGAGGATGA GAATACAGAT 2100
CTGACCAGGA TTCTAAAGCC CACGTCATTC CCTCCACACC TGGTAGCTTC AGCCTTGCCC 2160
AGCTCCTGGT GGAACTTCCG GTAAGGGATG CTCACAGAGC ACAGGGTGGG GAGCTCCCCT 2220
GGCACGTGGA AATCACATCA CACTGTTGGC TGGCAACTCC ACTTCCATGT CAATCTGGTG 2280
CCAGCTCCGG GATCCTGAAA TGCCCTGCAT GAATCATCAA GGGACAAAAA GAGGAGACTT 2340
TCCAGGGACT GACGCCCTCC CAGCCACCGT GGGATCCCGG CTACTGTGAC TGAGCCCAGT 2400
CATGACTCCA GAGTGCTTCA CATCACATCA TTCTTTCTCA GCATCCAAAA TGTGAGTCCT 2460
CTGGGCATGA ATTCTCTCCT CCACTCCACT CTCCATGGCT CTCCTGGTCC CTTCCTCTTT 2520
CTTCTCCCTA CCCCTTTCTT TTCCAAACCT CTCATCCATT CTTCTCTATA GTCCCCTTCT 2580
CCATACTTGG AGGCCTATGC CTTCTTAATA TCAACCTTCT CCAACTTTCC TGATCATTAA 2640
AGTCACCTGA TCATCAGAAT CATGCACATC CCCTGGCTCC TGTCCCAGAG GTCTGAATTG 2700
GAGAGATCCA AGTGAGACCT GGCAGCCAAT GTTTAACAAG AGCCCATGTG TCCTTATGAT 2760
CAAACACATT TGGGAGACCC CAAACCACAC TCCTCCTGTT GTAATCCACC AAACACTGTT 2820
CCTAATTCAC CCTGGAAATG GCTGGGGTCC TCAAAGCCAC CCACTCCTGT CCTGTGACAG 2880
CACCTCCAAT GCTCCAGCCT CAAAGTAAAA TGACCTCCCA ACTCTGATCA CCTTCACCTG 2940
TGCTCCACCT CAGCCTACAC TCTGGCCCAC CTGGGCCTTG TTATTCCCTG GGACTGCTCC 3000
TCCCCTGACA TCGTCAGGCC AATAGCCTCT TTCTGCCCAC ATTCCCCTCG CCCTCCCACA 3060
TTCCTGTTCC CTGGCACCTG GCCCTTGAGC ATAATCCTGT CATGCATCGA CATCATTCTG 3120
GTCTATCAGG CCCCTCCTGG GCTTCCTTCT TCCTTCCCTG CCCACCCATG GTTAATCACA 3180
TGAGCCAGTT TGTTGTCAGT CTGGACCCAT ATCCTTCTGT TGTACTTACT CAGGAACGCT 3240
CAGATTAATT CATTCCATCT TCTCTGAAAT CTTCAGAGAA ACCCCACAAC CCTGCAGGCC 3300
CACCCCATCA CAAATCTAGG GTAAGCTCAA CTTCATCTAG AATTAGAGCC CATGAGGCCA 3360
TCAGGCTCCA ACTCCCACTC CTTTTCCCCC TACAATGGAA CTGACATCAC TGTCAACCTC 3420
TCCACCTGTC TCTTCACTGT CTCACTCCTG TGGTTCAGTA GAAACCCACC CAGTATGTTC 3480
TTGCTGCCAT CCATCCCATT CCCATCCCAC TCTATCATCA CCCTCTTTCT CTCTATCTTT 3540
AATGCCTCCC TCTCAGCTGG CTGTTCCAGC TCAGCCAGTT AAGCTGCTCA AGTTTCCCTT 3600
GCCCTGAACA GCTTGCTCAA TTTTATGCCC CTATCTACCA TCTTTATCCA ATCTCCTGTC 3660
TTCCTTTCAC TGAAGGCTCT GTAATTCTCT GCAGTCAGGC 3700