EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-01457 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:90371820-90375130 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs78359677chr190372770hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
JUNMA0488.1chr1:90373674-90373687ATGATGATGTCAT+7.52
JUND(var.2)MA0492.1chr1:90373673-90373688GATGATGATGTCATT+6.69
NFE2L1MA0089.2chr1:90372371-90372386CCTGCTGAGTCATCT-6.66
Nfe2l2MA0150.2chr1:90372373-90372388TGCTGAGTCATCTCA-6.27
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:90372968-90372983TGAACTCCTGACCTC-6.22
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04567chr1:90370890-90372578Brain_Anterior_Caudate
SE_09368chr1:90368169-90379815CD14
SE_13550chr1:90365423-90375292CD34_Primary_RO01536
SE_14642chr1:90358807-90375291CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20971chr1:90359113-90374716CD8_Memory_7pool
SE_33324chr1:90371516-90373292H1
SE_37826chr1:90371209-90378770HSMMtube
SE_38798chr1:90368819-90375491HUVEC
SE_40012chr1:90370943-90375012K562
SE_46203chr1:90370371-90375296Osteoblasts
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr19037232190372729
chr19037431790375036
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I089900chr19036570290378845
Enhancer Sequence
GTACACACTG TAGCCCAAAG GTGAATTTTA CCCTCAATAT AAGCAGAGTA TGCTGTATGT 60
CAACAGTCAG CTCAAACAGA AGCTCGAGCA TCGCTGTAGA GCCGCTATCA TCACTGAAGG 120
GAATTCATCA TTATCCCTGT TAGTAATTTC ATAGCTTTGG AAACTGGTTT ATAGTACTTA 180
ACTGAAACAA CCCCAAAATC CCACCCCTGA CTCTGCCTTT TCTATTTTCC CCAACTTCTG 240
TTCCCTTTCT AAAGAACAAG ATTTTGTGGA ATTTAAAGTA GACTGTGACT GGCCAGGTTG 300
CTGCTTGCTC ACAATGCCTG TCCTGTGTGT TGGCTTTCTC AGCCAAACTT TTGGGAGCCA 360
GTTGTCACCC AGGACCCAAG GCTGGCATTC TTTGGAAAAA CCTGCCTGTG TGTTGTGCCA 420
AGTTGTGTTA GCCACTCCAT GTTATTCTTA GATGGGCTCT GGAGTATGAC CAGCCTGTGT 480
GCATGCATTT GTAGTAGGCA CTGGATAAGA ACTGGAGTAA TGACTACAGA AGTGAACGGT 540
CACAGCTCTA ACCTGCTGAG TCATCTCAGC TCAGCCTTGC TAGCAAGGCC TCCCAGGCTG 600
CATATAGTTT GCTTTTCCTG TTCGTTGCAT TCCAACCTGT CAACGGCTAT TTTCTGAAGG 660
TCTGTGGGGG CTCATGTAGA AAAGGAATAG GTCTGGGTGG AGGCCAAGAA TCTGAATTTG 720
TATCATGTAC CCTAGCTCAT CTTAATTCAA GTGTTAGTCT GTAAGAAACA GAAGAATGGG 780
TAACTCAACT CCTCCAAACA AATCTGTCAG CATTTACTCA TGCAGGAAGG CTATTTTCAT 840
GTATCACGTT CAGAACACAA AGGGTCCCAA AGGGCTTCCC ATCTATCTTT CAGGTGTTGG 900
GCTTCCTGTC TTCCACTGTG TCTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTGA TACTGAGTCT 960
CACTCAGTTG CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG TGTGATCTTG GCTCACTGCA ACCTCCGCCT 1020
CCCGGGTTCA GGCGATTCTC CTGCCTAGCC TCCTGAGTAG CTGGGATTAC AGGCACAGAC 1080
CACCACACCT GGCTAATTTT TGTATATTTA GTAGAGACGG GGTTTTGCCA TGTTGGCCAG 1140
GCTGGTCTTG AACTCCTGAC CTCAGATGAT CCACCCACCT AACCTCACAA AGTGCTGGGA 1200
TTACAAGTGC GAGCCACCAT GTCCGGCCAG TCAGTTGTTT TAAATCGTGT ATTGCCTATG 1260
AGCAGATGAG GAAGAGGAAT CACACTGTCT ATTGAGATTA CTGACAACCT TTCTAAGCCT 1320
CATTTTCTCA GAGTTTTAGC CTCAAAAGGG ACATTGATCA ATTTGTAGTC TGATTTCCTT 1380
CTTTTCTCAG TTTACAAAGA ACTTAGAGGA ATTATTTCAT GAGTCCCCCA AAATTAGTCA 1440
TTTCCTACTT TGTGACCCCA CAGCATTTTG TTCATACTCC ATATTTTAAG TAAACACTGT 1500
TTTGTAATTA ATGTGTTTAT ATGTCACTTC TTTCCACCAT CACCACCAGC CCCCTTGCGC 1560
CAACTGATTT CTTCAAGAGA TTGAACCAGG TCTAATTTAT GTTTGTCTCC CACCAACCCA 1620
GTGACAGATA GATGAATCAT GTTGCCTGGA GAGGTTAAGG GATTTGCCTA GAGTAGCAGC 1680
CCTGAAATGT GAGTGGCTTT CATAACTCCC AGCCATGTAC TTACCACTCG TATGTTGCCA 1740
GAAATGTTTT TAAATGATGT GAATTCATGC AAATGAGTTA GGACACAACT TTCCCATTAT 1800
GTTCCTCTAC ACTAGCTCAT TTATAAAACA TTCATAATAG TGATGATGAT GATGATGATG 1860
ATGTCATTAC CACCCACCCA ACTGTATCAT TTTAAGGATC AACCTAAATA ATATTTGTGA 1920
AAGCTTTGAA ACTGGCAAAG CCACCTTATG CAGGTATATA GATTGCTATT ACTCTAGTCT 1980
GTTGTTATTT CTGTGTAATT TACAAAGTAT TTCATATTCA TCATCTCACT TCTCGTTACA 2040
CCTCTGTGAA ATAGGTGGTC TCATTGTCAT TTCATAGACA CAAGAACTGA GGCTGAGCGA 2100
GACTAAGTAT TTCAACCATA ATCACAAATG GATGAAAGAA GACTAGAACC CAGCCAGCCC 2160
TCTTGCTTTC TTCCAGTACA GCCACTAGAT CAAGGCTGCA GAGTCCCTCA GGGGTGTTGT 2220
TATCATCATC ATCTGTTGAA TCTGTTGCAT CTTCTGTTGT GTGTTTAGGT CCTCAGGTCC 2280
CTAAAGCCCT CCTGGGTGAG CCCAGGAAAG AGACAACTTC ATGAGAAATG AGAGTGAGGC 2340
CCTTCTAAGA CCAGTTATGT ATGTGTGTTG AAATGCTAGT CAGGTTTTTC ATTTTATCAA 2400
AATGCAGGGC TTAGACACAG AATGCTTTAT AAGACAAAGC AAGTTTGATT TTGAATTGGC 2460
CGACCATTGA CCATGTTGGA CCAGCAGCAG CAGCATGTGG ATATGTGGGT CCAGGCAGGA 2520
GGGGCTAACC TCTCCATGGC TTCTGTCTCA ATGGGGAGTT CCTTACTGTG ACTCTCAGAG 2580
GAAATGAAGG ATGATAAATC CAGCTGCTGC TTCCTGTTTC TATAATTTGG GGATTTATTT 2640
TTTTAAAGGG TAGAATGCTT TATTTTTAAA CCAGTGGAAA ATACCCTCAA CGTGTTCCTT 2700
GTTAGTATTT CCTTGAAATC TAGATGCACT CATTTGAGCT TTAAAGGAGT GGGTGTGTTT 2760
GCGTGTGTGT GTGTGTCTGT GTGTCTGTGT GTGTGTCTGA AATTCCCATG ATGCTGCCTG 2820
AGATGGCTCG CTCTCTTTCA GTTTTTCAAC AACAATAACA ACAGAATGAA AACCAATTAA 2880
GGCAGATTTC ACTGGGCAGG AAGCTCTATG TGAGATTGAT GACAGTATCT GATTTAGAGG 2940
AGGCCTGTAA TTTATATCTG TGGTATTACT ATCTCTCTGG GTATGCTTGT GCAATTCAGG 3000
TCTGGTTTTT CTTCTGCTTG TGATTGTGTC ATTAGTAATA AAGTCCCGAG GCATTTAGGA 3060
AACACACTGC CTTCTCACAT ATCATTGTTT ACAGACAGTA GCTGTTTGGT ATAGATGATT 3120
AGGATGCCAT TTTTGGAGTT TGATTATGTA GCCCCTGACT CCATAACTAA AACCAATAGG 3180
TAGAAATATA TTTTACCAGT GCCATTTTTT TTTTCATTTC CTAATTTAAG AGACAGAGGA 3240
TGTATATGGG GTTCCAATGG TACATCGTTC AGGAGCAGCA TAGGAAATTT ATCTGGCAAA 3300
ATAGAATTAT 3310