EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-01359 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:78440960-78444560 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:78442885-78442897AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:78443027-78443039AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:78443031-78443043AAACAAACAAAC-6.32
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
SE_13760chr1:78440981-78442052CD34_Primary_RO01536
SE_13760chr1:78442270-78446554CD34_Primary_RO01536
SE_14888chr1:78440854-78446748CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18555chr1:78439946-78447087CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19704chr1:78440503-78446337CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21141chr1:78441202-78446868CD8_Memory_7pool
SE_21684chr1:78442308-78446105CD8_Naive_7pool
SE_22645chr1:78440827-78446362CD8_primiary
SE_35273chr1:78442114-78446661HeLa
SE_36446chr1:78440990-78441890HMEC
SE_36446chr1:78442383-78446764HMEC
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr17844113578441494
Enhancer Sequence
GACATGTGAA GAAACGTGGA CACTAGAAAT ATTACCATAC CATAACTTGC TTATCACAAG 60
CCTTGCTAAA CTGTCACAAA ATGATTTAAA AAAAGAATCA TGCTCAAATG TTAGTTTTCA 120
CTGAAGAGAC TGATGGAAAT AAAAAAAAAA ACAGCTCTAG TCTATATTTT CATTTCATTC 180
AAACAACATT ATGCAGCCTA AATCACTTTT ATAACTGTCA GAGAAGAGAC TGCAAGAAGG 240
ATCGAATACA TAATGACTAA TTTCATAGTT GTCTAGAGGG GAAGGGATGA GGGTTAATAG 300
TCTCGCTTAG CTAATCATCT AGTCTGATTC ATTTCTACCT TCATATAACC TCGAGGAAAA 360
AAACGGTAGA TAAACACATT TTAATTTTCC AATGTTCTAG AGACAGAAGT TGCTATTAGT 420
ACCACTGCTA AAGACCCAAT CAAACAATCC CAATCTCTGG AGTTACAGCT TGATATACAC 480
AAAAATAAAT TTCTTAAGTG CACAGGCTGG AAACCCTGAA CTAAAGCAGC AATCTGGTGT 540
CCCTGTGTTG AATTTAGCTC AGGATATTAT AAAAATCTAA AAATTTCACA TAAAAGCCAG 600
AAAAAAAAAA AGAAGATTGG CAACTAAATG ACCAGATGTC AACAACCAGC TAGAGTTAAC 660
ATTACTGGCA TTACCAGGTA CGGACCAGGA ATCATAATTA CTTGTCCTGC TTTTCTGAAT 720
AACAACTATC CAGCTAAAAA TACCAATGGC ATCCCCACTG GTACAGCCTT TGAAGCTCCT 780
TGAGAGCAGG AAACTATGCC TATATCTCTT CCTTCCAAAA ACAAAAACAG CATAGTATTC 840
TAGACAAAGA AAATAAACTT AGGATTAGTT GAGGATTCTA GAAACTTAAG TCAATATTCT 900
CTTAAATACA CAAGGAGGAA GTAGTTCAGA TATTAACCTA ACTTTTGTCT AAGTACGCTT 960
CTGTATATTC CACTTATATC ATCAGAGTAA CAGCTACAAC TGACATTTAG AGATATCATC 1020
AAATGTAATG GGTAATTCCA GGCAAAAACT AAAGTTAGGG AGCTCAGATT TAAGATCATT 1080
TTTATAAAGA AATCATTACA GCAAAGACAT CAGGACAACT GATCTATTAG CATTATACAA 1140
CAATAAATTT CACAATTTGC CAACAATTTC TATATTTTAA GAAGTATAAA GAAATTATGG 1200
CTTAGCCTAA TAATAAAATC CAATTTTTTT TTTTTTGAGA CAGGGTCTCG CTCTATGACC 1260
AGGCTGGAGT GCAGCAGCGT GATCTCCACT CACTGCAACC TCCACTTCCC AGGTTGAAGC 1320
GGTTCTTGTG CCTCAGCCTC CCAAGTAGCT AGGACTACAG GCACAGGCCA CCAAGCCCGG 1380
CTACTTTTTG TATTTTTTGT AAAGATGGGG TTTCACCATG TTGGCCAGGC TGGTCTTAAA 1440
CTCCGACTTC AAGTGATCTG CCTGCCTCAG CCTCCCAAAG TGCTGGGACT ACAGGCGTGA 1500
GCCACCGTAC CCGGCCTGAA ATCCAATTTT TAATTAAAGC ATTGCAACAC AAGGTCTTCC 1560
AGTATCTGGA TCCGCTTGTA CCTTTCCTTG CCTCGTTTCA CGTCCTCCCA CCCCCATCTT 1620
CTAGCGACTT CACTTCTGGG TCCTTGCCAT TCCCTCAAGT CCCCACACCT CTGCGCATGC 1680
TGCTTCTTTT CTTCACTGGC CAAACTCTCT TTCATTTTAT AATGTCTTGC TCATATATCA 1740
CCTTTACTTA GGAAATTGGG CATCCCCTCC TAACAAACTC TATAAACACT TATAAAGCAA 1800
GTGGATGAAT TAAATATCCA TATTTTGTCT GCTCTCGTTA AAGTATTAAT CAGATAATCC 1860
TGTTCATCTG CATTTGGTCA AGGAACTATA TCATAGCTTC TTAGTAGGAA ACAATTCATG 1920
CATTAAAACA AACAAACGAA AAAAAACAAG GCCGGGCGCA GCGGCTCACG CCTGTAATCC 1980
CAGCTTTGGG AGGCCAAGAC GGGCGGATCA CGAGGTCAGG AGTTCGAGAC CAGCCTGGCC 2040
AGCATGGTGA AACCCTGTCT CTACTGAAAA CAAACAAACA AACAAAAAAA ACACAAAAAA 2100
TTAGCCGGGC ATGGTGGCGG GCGCCTGTAA TCCCAGCTAC TCGGGAGGCT GAGGCAGGAG 2160
AATTGCTTGA AGCCGGGAGG CAGAGGTTGC AGTGGGACGA GATCGCACCA CTGCACTCCA 2220
GTCTGGGCGA CAGAGGGAGA CTCCGTCTCA AACAAAACAA AACAAAACTC CAGTATCTAC 2280
CTACAGTGTG CGATACCAAT TAATCCAATG TGCTGGTTCT GGTAAAATAA AATAGTTGGT 2340
TCCAGTAAAT AAAATAGTTC CCTTAAGTTT TACAAATCAA TCTAATAAAA CACGCTAAGA 2400
GTGTTTGTCA TAGTTATATG CTTGTTGCTA AACATGTTCA GAATTTCTTA AATTACGTGG 2460
AAAAAACCGC AGAACTAATA TTAATGATGA CCTTTTGTTG ACTACTCCTA GTATTTCTGG 2520
TTATAAAAAA GTACAGGTAC ATGTTTATAA TGCGTTCACA TTAGATGTGT TACAACGGAT 2580
TTTATGAATT CTAATTTTGA CTCAATGTTC CTTCAACTGT CCCGGTAAAA AGTTAACTAA 2640
GTGAACTCCT AATGCAACGA AAACACAGCA CAACACTGGT TTCTAATTAT CATTAGCTTA 2700
AAACTAGTAA AAAATGCCCA GCACCTAGTA CAATATGCAT AGTGTCACAG AGAATAGGAT 2760
TCTTTTGCTT ACATGCAAAT CTATACCAAC ACCATACATT TTGAAATGTT AAATATATTA 2820
GGGGACTATC TAAGAATGTA AAGTTCAAAT TAAGGTATCT TTTATTTTCC TGGAATACAC 2880
GCACTATTTT AACAGCTTTC GTCTGGGAAA GTGGTGCCTT CAGGGCAAAT GCACGCACTA 2940
CGTAATACAA AGAGGTCTGG TCAGTTTACG ACTCTGAACT GAGAGGCAGA TTCAAATTGA 3000
AACCTCTGGT ATAATGGGCC TGAGGCCATT TTGAGAAATA AGGGGGGCGG ACTGGTGGAA 3060
CAGACTGACA CGTAAATCCC GCCCAGAAAA AGGCTGCTTT CAAGTCCCTT CCTTGTAGAG 3120
GTGTGACGGT GAATGGTACT GAAAGCGGTT TTAATTGCGA GAGAGAACGG AAATGAGCTG 3180
TAAAGGCTAC TTTAATGATA AATCCCTTCC CTTGCTATGG CTCCAGGACA GACCCTAGTT 3240
CTTTCCCAAA CTCATTACCA GAACCTTCCA TTAAATTGTG TGAAACTAAC TGCGCTTTAT 3300
CCCCTGGAAG AGGATCTTTA TCTAAACTAG CTCACTGGAG ACACGCGAGT GCCGCAGAAG 3360
CGGGAGAAAG ACTTCAGGCC TTCTTTGCGT AGCACGCGTC GGGGTTCTAA GTGGATTAGG 3420
CACCAAGAAC ACAAAACTGG GTTCTGGTCT CTAATCGTTA TTACCAACAT GGGGAAACGT 3480
GTCTCTTCAC ATTTCAGCCC GGAAGAACAC CTCTTTCCTC TTCCTCATGC GCTTAAGGGT 3540
AGCGGCCTAC TCAGTCAGCG GCCAATTACC GTGAGCTTTC GGGATTCCGC CGCGCGGTCC 3600