EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-01023 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:44377700-44381520 
Target genes
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6674176chr144379957hg19
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr1:44380214-44380225TTGACCTTGAA-6.14
FOXH1MA0479.1chr1:44378648-44378659TGTGGATTGGG-6.14
KLF4MA0039.3chr1:44378885-44378896CCACACCCTCC+6.32
NFKB1MA0105.4chr1:44380557-44380570AGGGGCTTCCCCT-6.02
NR3C2MA0727.1chr1:44379080-44379097GAGGACACAATGTGCCC+6.15
Nr5a2MA0505.1chr1:44380213-44380228CTTGACCTTGAACGT-6
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
SE_36897chr1:44377427-44381593HMEC
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 7             
ChromosomeStartEnd
chr14437947444379939
chr14438085744381052
chr14437822644379291
chr14438089344381202
chr14437840544378587
chr14437950044379600
chr14437960044379695
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I043912chr14437773144381511
Enhancer Sequence
ATATGTGTGT AATACGTCCA TTTGTAATTT TGTCCTTGGC CCAACAATGT TAGGGGTTGA 60
ACCTACATGG ATATGGTGGC AGTGGCTGGA GATGAGGCTA GGTGAGCAGG GGACAGATGG 120
TGAAGGGTCT TAAAAGCCAA AGTCTCATCA AGGAGCCTGG ACCTTATCCT GAGGACCAAT 180
AATAGCAGAA GCTAACAAGA GCTGACTTTG TGCCAAACAT ATTATATGCA TGACTTCAAA 240
CTGTCATAAC ACAAAAACAC TATAAAGGAG AGCTAGTATT ACTGCCCTTA TTTTATAGGA 300
GAGGATGATG AGACTTAGAA GAGTAAAGAA CTTGCTTAGG GGTACAGAGT TAGAGTAGTT 360
GGGGGTGTGA GGGTTCACAA TCAGACCTGC ACTCTTAATT GTCAACACAA GCTGTTGCAG 420
TGGGCAGTGG AAAGCCACTG AAGATTTTAA GCCTGAGAAT GTCGAGATCA GATTTGTGCA 480
GGGATGTGAA TAAACTGAAG GGAAAGCAAG AGGGAGTCAG AGAGAGCTGA TGGCTGTTAG 540
AGTCACCCCA GGAGAGTTGG TGGTCCGTCC TAAGGCAGTA GCAGCAGGGA GCATAGGCGT 600
GGACACATCT GCCTACTCTT GCTGTGAAAG CCTACCATGG TTAATCTCTA TTCCCAGACC 660
TGTGAGCACA CCAGGAAACA TTCTCTCAGG AGCCTGGTGG GGAAAGTGCT TTCTTCCCAG 720
ATGTTTTCCC CATTGCTCCT GGATGTTCTG ACAAGAGCAG AACAGGTTGC ATCAGCAGGA 780
GTCTGGCAGC TTCACACAGG GGAGCTGGGT CCAGACTTGA CTGAGGCAGG GACATTCCTG 840
AAGGAGGAGG GATTTGACAA GGAATGCAGC CCACAGCTGG CCTTGAGGAG AAGCTGGACC 900
ATGCCGGGCC AGCAGCACTG GCTGGCTTTG TAGGCCTCTG TTGTGTCCTG TGGATTGGGG 960
AAATGAGATG TGAGAAGCCT TGGGCCAGAT GTGGACACTT GCAGGCAGAG GCCTTGTGGA 1020
ATAGGACTGT GTGCTGGCAG CAGGGCTGGC AGTGTCTCCA GCAGCAGGCA GACCTCCCCA 1080
CCGGGAGCCA GGGGGAAAGG CTGGCTCTCC CATTCAAATG CATGTACGTG TGCAGGTATG 1140
GATATGTGAA TGTGTTCCGG CCTCTCCGGT GGCTGATGTT GCTGACCACA CCCTCCGCTT 1200
CACTCTCCTG GCCTCTGTGA CACTCACTAT AATCATAATA AGTAAGATTT ATTGAGCTTG 1260
CTGTATACCA GACCCCGTGC CAGATGCTGT AAAACGCACA GCATCTCTAA TCCTTACAGC 1320
TATCTGGGAA GTAGGTCTTC TCAGCCCTAT TGTATGCACA AGGAACTTGA GGCTTAAAGA 1380
GAGGACACAA TGTGCCCCTG GTCACAGAGA TGTGGAGCTG GGATTAAGCC TCTGTTTTTC 1440
ACACTCCCAA AGCTGCAGTG GTACACAGAT GTTCTGTGTA TGTGCCTGTG GACGTTTTTC 1500
TGAGAAGAGG AGTTACAGCT TTTTTTTTTA GGAAACAGGC TGAGGTTTTG TTGGTACTTG 1560
ATATTTTTGT GGCTGGGGAA ACACGGAAAT GCCCAAACCA TATCTTGGTC TTACTGTTTC 1620
TCCTTTCCCT GAAATCTCTG AGGAAACTAC ACCAGGACAG TGGCAGACAA GAAAGAATAA 1680
AAGGAGCGCT GGACTGTCGC TGTGTCGGGC TCCCAGTTCT CCAGTGCAGG GCTCCCTGGG 1740
ATCGTGACCT AAAACAGGGC TCCTTCCCCA GGGTCCCAAC ATGACTCTCA GCCGCTGCTG 1800
GCCGAGTAAG AACCGAGGGC AGTAAGACCT CAGCGCAGTG AGCCACGAAG GGCAGAGGCA 1860
GAGGTGGCCT GCTCCAAGGA GGAGGCCCTG CCCAGCTCAC CCACCGCCAT GCAGAGGCAG 1920
CAACTCAGGA AGGGCTGCCT TTGTGGGAGA GAATTTTCAC CTCACACCAG TAATCGTGAC 1980
ACACTCAGTA TCCTCAAATC TAAGCAGTCC CATCAGGCAT TTCTCCTCCC AGGAAAGAGT 2040
AAAGATGAGA AGAGACGTGG CAGCTTTCCC CTCCCCATCA GATCGCCAAG GGGGTTGAGT 2100
TAATAAGCGA ATTTCCTGCC ATTTGAGATG GTGATTAAAT CCGGGACTTT TAGCATATGG 2160
AACAGACCAA GAGGGATTGT TTCAGAGAGG GCATCTCATG TGCAGAAAAA CAGGTTGTGA 2220
AGTCAAACGC AGCTCAGATT CTCACCAGCT GTGCGTGTAC CCTGACGAGT CCCCTCACCA 2280
TTCTGGGCCT TAGTCCCCTC TGAAAAATGG GACATGGGCA CCAGAGAGAC TCCTGAGAGC 2340
TCCCTTAGTG CTCTTAGAGG AGACAGGGGA GGTCTCCTTT ATCTTTGACC CCTAACCCCT 2400
CAGACTTCCA GAGGCGGGAA CTGCAGCGAT GATACAAATG GTGTGGTGGA AAGAATGCCG 2460
TTTTGGAGTC AGGACACCTG GGTTTGAATC CACTTGCAGC CACTTGCAGG CTGCTTGACC 2520
TTGAACGTAT CGTGTCGTAT CGTTTCACCT TGGGATCTGT ACCTGTGAAG TGGGTGAAAG 2580
TTAAAGAGAT AATAAAGTAA CAGTCGTGAA ACCAGCCTGG AGCCTCCTCA CACAGGCCCC 2640
CAGCTGTGCC CAATCCTGGT TCTCCCTGTT CCTCCCGAGC AGCCCCTGTG CTTTCTCCCT 2700
CCTCTTTGGT GTGTGCAGGG CAGGCACAGG CAGGAACCCC AGGTGGGAAG CTGTTGGGGC 2760
CTGCTGGGCC TGGAGAAGGG ACAGGGGCTG TGCTGTGCTG TGCTTGGCAC AGGCTGGCAC 2820
CTGCTGTTCC TGTCAGTCCA CATCTGGCCC ACCCAAGAGG GGCTTCCCCT CAGCTATGCC 2880
TAAGGTCTTG GCCATTTCTC CACCCGTCCG TTTCCTACTG TCTCCCACCA TCCCTCCCTT 2940
TACCTCCCTT ACGCACACCC CACTTCTGGA GACAGGAGCA GGAAAAACTG GGGTCGGCTT 3000
GCTCAGCCTG ACTGGGGCTG AAACAGAAGT TTGCCACAAG GTTCCAATGT TTGAACTGAC 3060
CTTTGGAGGA CAGACAGTTT GCCAGAGAAA GAGATGTTGC CACAGAGTTG GGAGCCATGA 3120
GGAGGGAGTG GCTGGAACAG AGACAATCCA CCAAAGGAGC AGCAGCGGAA GACGCTGAAG 3180
AGCTGCTGGT CACTGGGCGC CCTGGGTGGA GGTCAGGTCT CCTTTAGTAA CCGTCACTGA 3240
TGCCTCTTTG CTGTCTGTGC TGTGCCACGC CCTGGGCTAC AGAGGTGAAT CAGATGTGAG 3300
TCCCTGCCCT ATGGGGCTAG TGTGCACTCA GCCTGGATTG GCTCATTTAA TTCTTACAAT 3360
AGCTTGTAAG CTAAATACGC GTGATGTCCC TGGTTTATCC ATAAGGAAAT GGTACATTCC 3420
TTGCCCAGGA TCTGCACATG GTGAGTGAGC AGATCTGAAG TTAAATCCTA GGACCAAGGA 3480
TCTGAACTCC ATATTTTACC ACCTCTTGAA GGTCAGATGT CAGTTCTGCC TTGGGGTGGA 3540
GGGGGCGAGG AAAGACATGA AGGAGAGGCA GCTGCTGAGT CTTAGAAAAT GGATGGGTCA 3600
TGTGGATAGA GGTGGGAAGG ATGTTAGAGA CAAGGAGCAG CATCAGCAAA AGTGTGGGGC 3660
ATGAATTAGC AAGTGGGGAC TTCAGATGGA CTGAGACTGA AATGAGAGAC AGATGGGTTA 3720
CTGGCTAAAA GGCTCAGCTC TTCTTTAGGC AGTGGTGATC TGATTTGTAC ATGGAAAATC 3780
ATTCTGGCAG AGAGAAAGTG GTTTGAGAGG CTGGGCGCAG 3820