EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-00825 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:33456120-33460410 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr1:33458749-33458760ATGACCTTGAA-6.62
EsrrgMA0643.1chr1:33458749-33458759ATGACCTTGA-6.02
Foxd3MA0041.1chr1:33456993-33457005AAACAAACAAAC-6.32
Lhx3MA0135.1chr1:33456834-33456847AAATTAATTAGCT+6.15
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:33460203-33460218AAGGTCAGGAGTTCA+6.04
Nr5a2MA0505.1chr1:33458748-33458763CATGACCTTGAACCC-6.59
SREBF2MA0596.1chr1:33459454-33459464ATGGGGTGAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00738chr1:33456598-33459517Adipose_Nuclei
SE_09317chr1:33456097-33460488CD14
SE_19095chr1:33457487-33458537CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19886chr1:33456854-33459244CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_23323chr1:33457107-33459100Colon_Crypt_1
SE_32111chr1:33457084-33460030Gastric
SE_35956chr1:33456184-33460071HMEC
SE_37722chr1:33456073-33460522HSMMtube
SE_38650chr1:33457471-33459120HUVEC
SE_42882chr1:33456220-33456794Lung
SE_42882chr1:33456978-33459866Lung
SE_46598chr1:33457047-33459318Osteoblasts
SE_53906chr1:33456346-33460129Spleen
SE_64575chr1:33456194-33459320NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr13345934133459527
chr13345740633457727
chr13345791433458607
chr13345880033459074
chr13345701033459012
chr13345686433460248
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I032988chr13345360333460156
Enhancer Sequence
CAGTGAAACC CCATCTCTAT TAAAAATACA AAAAAATTAG CCGGGCGTGG TGGTGGGCGC 60
CTATAGTCCC AGCTACTCGG GAGGCTGAGG CAGGAGAACG GCGTGAACCT GGGAGGCGGA 120
GCTTGCAATG AGCGGAGATT GTGCCACTGC ATTCCAGCCT GGACAACAGA GTGAGATTCC 180
GTCTCAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAGAAAT TAATGAGAAT AAAGCTTCTG GCACACAGTA 240
AATGCCTTCG GAGTTTGTAT TGGGCTTGTT ACCGTTAACT CTTCATCTGG CCAACTACTG 300
CTCCCTTCTT CCTCCAAGGC AGATGCTGTC CCCCTTTGTA TCTTTCCCCA CCTTGCTGCT 360
CTCACACATC ACATTCCCTC TCTGTCTTGC TGCTGTCCCA TGTCTATCTT TGTGTTATAG 420
CATCAGACAC GACACAGTGC CCCTCTACCC TATAAGCTCC TCCAGGGCAG GGCCATGTCC 480
ACTTTATTCT TTTCTGTGTC CCCAGGGTCC AGCAGAAGGC ATGACCCAGT GTGGCTGTCA 540
GGTTAGAAGG GGTTGGATAA GAATTTGTGA TGGAGGCCGG GTGTTGTGAC TCATGCCTGT 600
AATCCCAGCA CTTTAGGAGG CTGAAGTGGG TGGATCACCT GAGGTCAGGT ATTTGAGACC 660
AGCCTGGCCA ACATAGCGAA ACCCTGTCTC TACTAAAAAT ACAAAAAAAA AAAAAAATTA 720
ATTAGCTGGG CATGGTGGTG CGTGTCAGTA ATCCCAGCTA CTCGGGAGGC TGAGGCAGGA 780
GAATTGCTTG AACCCAGGAG GTGGAGGCTG CAGTGAGCCG AGATCATGCC ACTGCACTCC 840
AGCCTGGGCA ACAGAGTGAG ACTGCATCTC AAAAAACAAA CAAACAAAAA TAACATGTTG 900
ATGGAATGAA TAAACTTAGA AGAGATTGAA TGCATGAATG GACGAATGCA TGAATGAGTC 960
AGTAATAGCA GGTATCCACC AGCGGAATCC TCTTTCCCCT AGGGATAGAA TCCTCCACCT 1020
CCCAGACTCC ATCTCAAAAA ACAAACAAAA AGAATGTGTT GATGGAATGA ACAAACTTAG 1080
AAGAGACTGA ATGCATGAAT GAGTCAGTAG TAGCAGGTGT CATCCACCAG CAGAATCCTC 1140
TTTCTCCTAG GGAGAGAATC CTCCACCTCC CAAGGTGGGC CCTGCCACGT ATGGGAGCAG 1200
GGCTCCTGCC TGGCACAGGC TGGGATGAGA GGCTCTGCCC CTCATAGCGA GAGTGTCGCT 1260
AGGGGCAGAG CCATCACGGG TCAGGGGTAA AGGGAGGGGG ACACGGTGGG GCTGGAGTGG 1320
TGGGAGATTT GTAGCCCAGG TAGGGGGGTG CCCTTGCCTA ACTTGGTGGG GCTAGAACCC 1380
GAGTACTGAT GCAACCAAGC TGGTTTCCTA CTGCAGCTGC ACTCTGGCTC CCACAGTTTC 1440
TGTCACCCCA TCACTGATGA CTGAGGCGTG ACCTACAGGA GGGCCTGGCC TACATAGCAG 1500
AGAAACAGAG GCCTTAGGGA TAAGGGGCGG CAGCCTGGCT GGCTGGCCAA TGAATCCAGG 1560
TCCAAGCTTA GCGGGTACTT CCTGCCGCCG GGTCCAGCGC CAGCCAGTTC ACCTGCTGTG 1620
CAACCCTAGC TAAGACATGT CTCCTCCCCC CTGCCTCAGT TTCACCATCC TGGGGGACTC 1680
TTCCTGCTTT GGCATCATTA GAAGTCCTAC CTCTCTCCCA GGCAATCTTC AAAAAATTTT 1740
CTGATAGCAG AACAAAAACC AAAACCTGAT ACTCGATACC TCTTTTGAGT CCACTAAGCA 1800
GCCCCTTAAG AGAAGCAGAG AGCTCAGAGT CAGGCTGAAA AGCTGTGTTA CCCTAAGTTA 1860
CTTCCCTCTC TTCAGTTTCC TTTCCTGTAA AATGGCCATT GATAATGACT ATTTCCATCC 1920
CCACAGGATA GCTGTGAGGA TTAAGTGAGC TGTTGGGTGT AAACTGCTTT GCAGGGGTTA 1980
GGAGCATTAC TCTTACTCAG AGAGGCAGTA GCTTCAGGCC CAACCTTTCC TGAGGCCAGC 2040
CCCTGACACG CCCTCAGCTT GTGGCAGCAA CAGAGATGGG AGGGCCTCCT GGGACATTCC 2100
TGAGCCTGGT GTGGCCACAG CTGAAGAAGC AAGTCTGCAT ATACTCTGTG GTGAGAGCCT 2160
GGCTGGTCTC AGGGCTTGCA GGGAAGGGAG TTTTTAGAGA AGGAAATGGT TGTGGTGAGA 2220
CAGAATGATG GAGCAACTTC TTGGGGATCT GGGTGGAAAG CCCCCACTCC TGGTATGTTC 2280
TCATGGTGGG ATGTGGAGCA GATAATGCAG CCCTGCACCA ACCTCATTCA CCATCAGAAA 2340
GTACCTGGTG TTCACCGACT GCTGGGCTAG AGCAGAAACA GGTTTTAACA TGAAACCTCA 2400
GACCACTTGC CATTTCTGGG CCTCAGAACC TCCCTCCCCC CAAGCAATTA CTAGGGTCAT 2460
CTGGAGGCTG GTCCTGCCAG CCAAGCCTCT ATTCCGCCAC TCCAAGGGAT GGGCCAGGAA 2520
AATAGCCTTT GGAGTTAGCT CCTGATTTGC TGGTGACATG GGATGTCCTT TCCCCTCTTT 2580
GGACCTCGGT ACTGGGTGAG AGTGAAGTTG TATCTGGTTT GGCCGTGGCA TGACCTTGAA 2640
CCCAAGATAC TGTGGCCATG CCAAGTATTT TGTAAAGTTT GGACTGTTGG ACAGTGGAAA 2700
GGCCAAGTGC TGTGGAGGAA TGAAGAAAAC GCCCAGGACA GTTGAGGGCT TCGTCACTTT 2760
TCACTGAGCA GCTTGAAGGA GACCCAACCT TCTGTGTTTC CACTTCCTCA TCAGCGGAAT 2820
GGGGACATTT CTTTTTTTGT GGTTGTTATT TGTTTGAGAC AAGGTCTCGC TCTGTCATCC 2880
AGGCTGGAGT ACAGTGGCAT GATCATGGCT CACTACAGCC TCCATCTCCT GGGCTCAAGC 2940
GAGCCTCCAA CCTGTGCCTC CTGAGTAGCT GGGACCACAC GCATGCGCCA CCACGTCCAG 3000
CTAATTTTTG TTTTTGTAGA GATGGAGTTT CGCCCTATTG CCCAGACTGG TCTTGAACTC 3060
CTGGACTCAA GCGATCTGCC CACCTCAACC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGCATGAGC 3120
CACTGTGCCT GGCTGGGACA TTCCTCTTTA GGCCTCTCCT TCCTTCTCTG TAAAACAGGA 3180
GGCAGGTGAG CTTCCAGGGT CCTGGGCCCT GTGATTCTGC TTCTCAGCTG TGACCTTGGG 3240
CAAGTCAGTT CATCTTCACC TCTCCGCATC TTGGTTTCTC CATCTGTCCA ATGGGTATTT 3300
TCCCCCTCCC CATTCTCAGA GTTGCTGAGC TCAAATGGGG TGATGAGCAC TAAGGTGTTT 3360
TGAACAGGAA AAGTGAAAAG GGCTTCTGCA GGGCAGCTCC TTTGAAGCCC CAATCTCCTT 3420
GCCCTCACCT GTCCTCCCAA GAAGGTGTAA AGCCTTTTGT GGAGTTCCAC CTAAAACAGA 3480
GGCCTCCGGT TAGCTCCTTC CTCAGACCCT GCTGGGTTAT CTGACAGGCC CATAGCCTAA 3540
CCTGGCTGGT GACTGGCTGC TTCTCTCTAG CTGGCACAGC CCTGGTGTCC AGGCTACGAG 3600
AGAAGAGGCC TGGGTCTCTG CCCAGTGGCT TCTGCAGCAA AGGGTTTTCT AGTCAGATAG 3660
AACAGGGTTT GAGCCCCAGC TCTGCCACAT TTTAGCTGTG AGCTGTGATG GTTAGTTTTA 3720
GCCATTTTAC AATTTGATGG TGTCAGTCCG ACTGCACCAT GGGATACCCA GATAACTTTG 3780
GACTTGGACT GGAACTAAAC CACTCTCCTG GGTCTCCAGC TTGCCGACTC ACTCTGCAGA 3840
TCTTGGGACT TGCTGGCCTA GCGTGATATA TATAGATCCT ATTGGCTCTG TTTCCCTGAC 3900
TGGTACAGAG GCCTTGGGCA ATTTGCTGCT TCTTCTGAGT CTGTTTTGAA ATCTGTAAAA 3960
AATGGAAATA ATAATTCCTA GCACAAGGAC CACTTTCCTG CTTTAGAATT CCCATTATTG 4020
GCTGGGTGCC GTGGCTCACG CCTGTAATCC CAGCCCTTTG GGAGGCCAAG GTGGGCGGAT 4080
CACAAGGTCA GGAGTTCAAG ACCAGCCTGA CCAACAAGGT GAAACCCCGT CTCTACTAAA 4140
AATACAAAAA TTAGCTGGGT GTGCTGGCAC CTGCATGTAA TCCCAGCTAC TCAGGAGGCT 4200
GAGGCAGGAG AATTGCTTGA ACCTGGGAGG CAGAGGTTGC AGTGAGCCGA GATCGGGTCA 4260
CTGCACTTCA GTCTGGGCAA CAGAGCAAGA 4290