EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-00559 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr1:23910800-23917710 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:23916037-23916049GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:23916041-23916053GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:23916045-23916057GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:23917378-23917390GTTTGTTTGTTT+6.32
MEF2AMA0052.3chr1:23913349-23913361TCTATTTTTAGT-6.27
MEF2BMA0660.1chr1:23913349-23913361TCTATTTTTAGT-6.32
MEF2CMA0497.1chr1:23913348-23913363TTCTATTTTTAGTAG-6.57
MyogMA0500.1chr1:23915330-23915341GACAGCTGCAG+6.62
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:23911735-23911750CGATCTCTTGACCTC-6
Nr5a2MA0505.1chr1:23915436-23915451GAGGTCAAGGCCATT+6.21
POU4F2MA0683.1chr1:23915257-23915273ATGAATAAATAATTAG+6.95
Tcf12MA0521.1chr1:23915330-23915341GACAGCTGCAG+6.14
ZNF263MA0528.1chr1:23917037-23917058GGAGAAGCAGGGAGGAGGAGG+6.09
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02313chr1:23911680-23912727Astrocytes
SE_10300chr1:23916267-23922628CD19_Primary
SE_11050chr1:23915810-23926228CD20
SE_29676chr1:23915477-23917404Fetal_Muscle
SE_34689chr1:23911473-23914834HeLa
SE_34689chr1:23916785-23920997HeLa
SE_37153chr1:23911208-23916370HSMMtube
SE_38999chr1:23911711-23912765IMR90
SE_44435chr1:23911510-23913354NHDF-Ad
SE_45797chr1:23911487-23913505Osteoblasts
SE_50077chr1:23911695-23912795Sigmoid_Colon
SE_51741chr1:23911497-23914033Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_56054chr1:23911487-23913322u87
SE_56054chr1:23913497-23914218u87
SE_58372chr1:23873313-23964782Ly1
SE_63528chr1:23911497-23914047HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr12391417723914400
chr12391440023914668
chr12391691823917225
chr12391203723912393
chr12391643323916712
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I023584chr12391143023914610
GH01I023589chr12391549223930119
Enhancer Sequence
TTTTTTGCAC ACTGGTAATA TGCAGTGTCC TCTTCTAGGC ATTTCGATGT TTTGCTTCAT 60
TTAATTCTCA CAGCAATCTT GTAAGGTAGG CACTGATATT TTTCAATTTT ACGATTTTTT 120
TTCTTTTGAG ACAGGGTCTT ACTCTGTTAC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC ACCATCTTGG 180
CTCACTGTAA CCTCTGGCTC TCAGGCTCAA GTGATCCTCC CACCTCAGCC TCCGAGTAGC 240
TGGGACTACA GGCGTGTGCC ACCATGCCTG GCTAATTTTT TTGTATTTTT GGTAGAGATG 300
GGGTTTTGCC ATGTTGCCTA GACTGGTCTT GAACTCCTGA GCTCAAATGA CCCATCCACC 360
TTGGCCTCTC AAAGTGCTGG GATTACAGGC ATGAGCCACT GTGCCCAGCC TCAATTTTAC 420
AATTTTTTTT TTTTTTTGAG ACGGAGTCTC ACTCTGTCAC CCAGGCTGGA GTCCAGTGGC 480
GCGATCTCAG CTCACTGCAA GCTCTGCCTC CGGGGTTCAC GCCATTCTCC TGCCTCAGCC 540
TCCCGAGTAG CTGGAACTAC AGGTGCCCGC CACCATGCCC GGCTAATTTT TTTGTATTTT 600
TTTGGTAGAG ACAGGGTTTC ACCGTGTTAG CCGGGATGGT CTCAACCTCC TGACCTCGTG 660
ATCCACCTAC CTCGGCCTCC CAAAGTGCTG GGATTACAGG CGTGAGCCAC CACACACACC 720
CCCCTTTTTT TTTTTGAGAC AGAGTCTCCC TGTTTCACCA GGCTGGAGTG CAGTGGTGTG 780
ATCTCGGCTC ACTGCAACCT CTGCCTCCCG GGTTCAAGCA ATTCTCCTGC TTCAGCCTCC 840
CGAGTAGCTG GGACTACCAG TGGGCACCAC CACGCCCAGC TAATTTTTGT ATTTTTAGTA 900
GAGAGGGGGT TTTACCATGT TGGCCAGGAA GGTCTCGATC TCTTGACCTC GTGATCCATC 960
TGCCTCAGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGCATAAGC CACCGCGCCT GGACAATTTT 1020
ACAATTTTTT TAACCACGAT TTATTGTTTT ACAAATAAGG AAATTGAGAT GCAGAGAGGT 1080
GAATTGACTT GCCTGAGGTC ACACAGCTAG AAAGTGGCAG AGCTCCACCT TGAATTCAGT 1140
CAATCTGGGA CCCATGGTTT TAGCCATTGC GCAGCTTTGC CTGGTCCTCT AGACAGTCTG 1200
CCCATAGTAG GTGCACAATG AAGAGGATGT CTGCTTCTGT TTGGAGAGAG GGAGCTCTGA 1260
CCAGGTTATT TAGGGTGTTC AAGACCCTTG ACATGACTGC CCTTTGAGTG GCACATGAAG 1320
TCTTGTGCTT TCCCTGCCTT GCTCTCTCCA ACCTTCCAAA ATAAATCCTT GACGGCCCAG 1380
GGGCTGGGGG AAGGTGGATA ATGACTTGAA AATATGCTGG CATGACACAC GATAGCATCT 1440
GCAATCATGG ATTGTGAAAT CTAGACAAGT TCTGAGACTG TGACTCACAA ATTTTACGTC 1500
AAAAAGGAAA TTACAAAGGA ATAACTAGGA GCATCTTTTA CAGAGCGTCC TTCTCTGGCT 1560
GTGTCACCCT GAGCCCTTGA TCCTACATTT TAGTCATGGC AGGCGTCTGG AATACAGATG 1620
CGAACCTTGC ACCACCATCC CTGGCTCAAA GCACCCGGCT CTCAGGTTCT CTCTCTCTTG 1680
AGGATTGGCT CTGGCTCTTC CCGAGCTACC TCCTGATCCT CCTGTAGTTC CTCTAAGGTG 1740
ATGGCTCCAG CTGAGAAGCC TGGCAGGTCT GGGTTCAAAT CCTGACTCAG TCACTTACCG 1800
GCTGGTACCC TTGGCCACTT TCTGGATCTC CATATTAAAT CCATATTCAA GGATTAATTA 1860
GGGCTGCAGA TGCTCACCTT CTAGGGCTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTG AGACGGAGTC 1920
TCACCCTGTC AGCCAGGCTG GAGTCCAATG GTGTGATCTC AGCTCACTGC AACCTCCGCC 1980
TCCCGGGTTC AAACGATTCT CCTGCCTCAG CCTCCCGAGT AGCTGGGATT ACAGGCGCCC 2040
GCCACCATGC CCAGATAATT TTTGTATTTT TACAAATAGA GACAGGGTTT CACCATGTTG 2100
GCCAGGCTGG TCTCGAACAC CTGACCTCGT GATCCACCCA CCTTGGCCTC CCAAAGTGCG 2160
AGATTACAGG TGTGATCCAC GGCACCCAGC CCTTCTAGGG CTCTTGCACA GGATGACAGC 2220
TCCAATATCC TCCAAGAAGG AATTGTCTAT TGTGTTCATT GCTATATCCC AGGGCCTGCC 2280
TAGAATGGTA CTTGGCAAAT AGTAGACCCT TAATAAATAA CTGCCAAGCA AATGAATAAA 2340
AGTCCTAGTA CAGTGTCTGG CACATAGTAG ATACTCAGTA TCTGATCACT TTTTTTTTTT 2400
TTTGAGACAG GGTCTCACTC TGTCGCCCAG ACTGGAGTGC ATTGGTGCAA TCTCAGCTCA 2460
CTACAACCTC CGCCTCCCAG GCTCAAGCAA TTCCCCTGCT TCAGCCTCCC AAGTAGCTGG 2520
GATTAGAGGT GCATGCCATC ACTAATTTTT CTATTTTTAG TAGAGACAGG GTTTCATCAT 2580
GTTGGCCAGG CTGGTCTCTA AGTCCTGACC TCAGATGATC CACCCGCCTT GGACTTTTTT 2640
TTTGAGACAG GATCTCGCTC TGTCAGCCAG GCTGGAATAC AGTGGTGTGA TCATGGCTCA 2700
CTATAGCCTC AACCTCTCAG GTTCAAGCGA TCCTCCTGCC TCAGCCTCTT GAGTAGCTAG 2760
GACTACAGGA GTGCACCATC ATGTCCGGCT AATTTTTGTA TTTTTTGTAG AGACAGGGTT 2820
TTACCATGTT TCCCAGGCTG GGCTCAAACT CTTGGACACA AGCAACTCAT TCATCTTGGC 2880
CTCTCAGTGT TGAGATTCCA GGTGTGAGCC ACCGCACCCG GCCATCACAT CACTGTTATT 2940
ATTACTACTA ATTCCTGAAA GAGACCCCCC TGATCAGCTG ACCTCAGAAT TCCTGTTGCT 3000
CAGCCTCTAA CTCTCTCAGG ATCCATTAAT GTACCAGTTT CTTGTATATT GGTTGGTCTC 3060
GGATGGGTTA ACTTGTGTGA GTTGGTGTCC CAGAGTCAGG ACACCTGGGC TGTTGGAAGC 3120
AGGTTGGGCA AAAAAGACTT TGATCTTGCA AAGTTCAGGA GGAGGATTGG GGCATCAGGG 3180
CCTTGCTGAG GGCTGCTGCT TGTGGGGCTC AGCTGGTACA GGCAGCTCTT CAAAGACTCT 3240
TCTCTCAGGC CTCTCCTTCC AATTTCATAC CTCTGGAGAT GGTCTCCATG AGTGATCTAG 3300
CCTTTGGAGT ATAGGAACCT TCCTTTTGCA GCTGCGGTGA GGGACAGAGA AAGCACTTTG 3360
ATAAAAATAG GAAAACCGGT GCTGGGCGTG GTGTCTCACA CCTGTAATCC CAGCACTTTG 3420
GGAGGCTGAG GCCTCACTTG AGCCCAGGAG TTCAAGACCC AGCCAGGTAA CATGGTGACA 3480
TGGTGAAATC CCATCTCTAC CCCAAAAAAA GGGAAATTGG CTACTGGCTC CTTGTATCAG 3540
TCAAGGTTCC AGCCATCCAA TAGGTGGCTC ACTCAAAGGA GCCTCCGGAG AGAGCTGAAT 3600
GAAGGGACTT ATCTATAAAG GGAGGAGTAA GGGGGCACCC AGGGACTAGT AGCAGCAGGA 3660
AGTCCTGGCA CCATTATCCT GAAGGCAGGA AGGGAAGGGG TGGTGAAGGC TGTAGCTGCA 3720
AGATAGGAGC TGTGGAGAGG GACTCAACAC AGCCAACCAG CCCAGCAGGA AAGAAGGAGC 3780
CAGGACAATC CACTCCCCCA ACACTTGCTC TTCCTTGAGA CCCCAGTTTT TTGCCATTGC 3840
TTCCATTGGC CAAACCCAAG TGCAAGCCAG ACCCAAGTGA AAGCCAGAGG CCAGGGAAGC 3900
CCAGATGCTT CCCCAGGTAG AGAAGAAGGG GCTGCTCTGG AGGGGCAAAG GCAGAATACA 3960
CGGCATGCCT TGTTTCTGTT TTGTTTTGTT TTGTGCCTTG GGAGGATTTA CATATATTAT 4020
TGTTATATGT ATTACATATA TTCTGACAGT CCCTCTGGGA GGTGAGGAAA CCAGAGAGGT 4080
GAAGTCACTT GCCCCAGGTC ACACAGAAAC CAGAGAGGTG AAGTCACCTG CCCCAGGTCT 4140
TTTGATCCCC AAATCCATGT TTTTTCTATG CAGTATCCCC CTGATGGAGC TCACACTGAC 4200
TTTCTGGCTG ATATGTTCTA CTTTCCAATG GAAATCTCTC TTGACCAGGT GATGCTAAGA 4260
CTCAAATGGG AGGAAACTGG GGGAACAGGG TTGACTGATG ATGGGGAAGG TGTTTTGCTG 4320
TGGAGTGTCT GTCGTGCTTA TCAGAGCAGA GGCCAGCCCT GTGGCTGGCT CCATCATTCT 4380
GTGATTCAAT GGCCGTGAAA CCGACAGGGC AGGGGGAGCA GAGGCTGGGC TTGGGAGGGG 4440
GCATTGCACT CATAGAGATG AATAAATAAT TAGGTAATTA CCACCTTACA GTTCCTCTCC 4500
TAGGGAAATA CGCATACGCA TTACCAAGAT GACAGCTGCA GCTTTTCTAT AACAGAAAAG 4560
TTCAGACCCT CTACATGCCC ATCATTCAGG GTTCTAATGG TGGCTAGGAT TTAATTTAGA 4620
GAGATGATGA TGCAACGAGG TCAAGGCCAT TGAAAAAGTT TTACTCCTTA CAGTTCCCAA 4680
GCGGGGGCGA GGCAGGCACA CTGTGTCACG CAGGGCCACA TGGGGAATCT CTGGGGTCGG 4740
TCAGAAGGCA GGGATGCAAA GAGAGCATGG CCCAGAGCCT TTAGTGCGGT TTTTGCGGAA 4800
AGGAATGGGC GAGGTAGGGT AGGCAAGTTT GAGCAAGTTT AGGACTGGAC AGTTTGAGTA 4860
CTGTTAGCAG GCTCTAGGCT CTAGGTATGG TCTCTAGTTG TCTAGTACCT GACCCTGGGG 4920
TGATGTAGGG CAGGGGAGAT ATTGGCTTGG TGTGTGAGAG TGGTTAGTTA GTATATGAAA 4980
GGCATGTTCA CAGGCAAGTT GTTTACCATC TCTAGGAATT AGCTAGCCTG GGAGAGGCCA 5040
TCTCTCCAGG ATTAGCAAGG CCCCAGATGT CAAAGCATTG TAAAATACAG AAAATAAAAA 5100
ACATGATTCA TACATTCAGG GAATGATTGG AAAACGACAT TATGTTCATA CTTTGGAATA 5160
CTATGAGGTA GGTAAAAATA GTAAGGTAGG TCTACTTACT TACACAGATG ACCTCCAAGA 5220
CATTAAGGCT TTTTGTTGTT TGTTTGTTTG TTTGTTTCTG AGAGGGGGTC TTGCTCTGTT 5280
ACACAGGCTG GAGTGCAGCA GTGCAATCAC AGCTCACTGC AGGCTTGACT GCCCAGGCTC 5340
AAGCAATCCT CCTGCTTCAG CTACCACGCC TGGCTAATTT TCTTTTTTTG TAGAGACAAG 5400
ATCTCGCTAT TTGGCCAGGC TGATCTCAAA CTCCTGGGCT CGAGTGATCT GCCTGTCTCG 5460
GCCTCTCAAA GTGCTGGGAT TATAGGCGTG AGCCACTGTG CCTGGCCAAG ACATTAAGTA 5520
GAAAAAAGAA GTTGTGGAAC AATACTTACC CATATGATTC CATTTACAAG TGGAAAAAAT 5580
GAACAAATAA ACCTTAAATT TCTATGTATT TCTGTATATG TGTGCAATGC CCCAAAGAAT 5640
GTGTAAGTGG ATAGACACCA AACTAGCATC AATGGTTATT CTTGGAAAGC GGGAGAGTGG 5700
AATTGGAAAA GGATCAGAAG GAGGTCTTTT ACTACATCTG TATGTTTGAA GTTTTTACAA 5760
TAAATACATG TTCATGTATT ATCTGTGTAA TTTAATATAA AGTAAGTAAA TCCTCCCTTT 5820
TCCTCTAGAT AATGTTAAAC CCATTTGATG AACACTGTGA TGGGGAAGTA CAGGGGCTGA 5880
CTGGTGTGTA AGCAGAGAGG CAGGGTCCCT TACCCTGATT AGGCAACCAG GGAGGACTTC 5940
CTGAAGGAGG TGAGTCCTGG GTTATGTTTT GAAGGATGGA TTAAAATTAG CCAGATGAAG 6000
AAGTAGAGAA AGAGTATTCT AGATAAAGGG GACGGTGTGT CTGGAGAAGT GATGGAGCAG 6060
CTATATTTAG GAGTATAAGA TTGTGAGAAA GAGGAGGGCC AGGGATGAAG TGGGAGATGT 6120
GAATGGAAGC AGATCTTGAG GAGCCTCATA AGCCCAGCTG AGAGGTTCCA ATTTCACCCA 6180
GAAGGCAATG GGGAGGCCTC AGAAGGGCTT TAAGGTTTGC CATGAGTGGG CCAGGATGGA 6240
GAAGCAGGGA GGAGGAGGCG GGGCTGTGAA TGAACAGACT GGAGTGACGC TAAGATCAGC 6300
TGCCATCAAC CTCACCCTCC CACACTCCAG CCACATGGCT TGCTTTCTGA GCTCTAACTC 6360
ACTGACCCTA AACTTTCAGG TGCATCAGAA CCGCCTGGAG GGTTTGTTAA AAACTCAGCT 6420
TGCTGGGTCT CACCCTCAGA GTTTTAGCAA GTCTAGGGTG TATCCCAAAA GTGGACATTT 6480
CTAGCAAGGT CCCAGTGATG CTGATGCTGC TGGCTGGGGG ACCCTACTAT GAGAACCACT 6540
GCTCTAACAT ACCTTTCCCT TCCCACCTCA ATGCCTTTGT TTGTTTGTTT TGTTTTGTTT 6600
GTTTTTGAGA TGGAGTTTCA CTCTTGTCGC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGG GAGGTCTCAC 6660
CTCACTGCAA CCTCCGCCTC CCGGGTTCAA GCAATTCTCC TGCCTCAGCC TCCTGAGTAG 6720
CTGGGATTAC AGGCATGTGC CACCACACCC GGCTAAGTTT TGTATTTTTA GTAGAGATGG 6780
GGTTTCACCA CGTTGGCCAG GCTGGTCTCG AACTCCTGAC TTCAGGTGAT CCGCCCGTCT 6840
CGGCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGCG TGAGCCACTG CGCCCGGCCA ACCTCAACGC 6900
CTTTGCACTT 6910