EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-17212 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr4:185249640-185255010 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs57214277chr4185254772hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr4:185254421-185254432TTTTATGGCTT-6.62
HOXC11MA0651.1chr4:185250354-185250365GGTCGTAAAAC+6.14
IRF1MA0050.2chr4:185252052-185252073TTAAAGAAAGCGAAAGAACAA-6.05
Lhx3MA0135.1chr4:185250046-185250059ATATAATTAATTT-6
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09158chr4:185248725-185255795CD14
SE_11655chr4:185247069-185253721CD20
SE_27359chr4:185248979-185251889Esophagus
SE_27359chr4:185251893-185253833Esophagus
SE_30320chr4:185252180-185253061Fetal_Muscle
SE_31870chr4:185250061-185254375Gastric
SE_32479chr4:185248153-185253126GM12878
SE_43500chr4:185248236-185254171MM1S
SE_52652chr4:185250098-185251717Small_Intestine
SE_52652chr4:185251983-185253197Small_Intestine
SE_52652chr4:185253298-185254377Small_Intestine
SE_53345chr4:185250685-185251485Spleen
SE_53345chr4:185251975-185253792Spleen
SE_59479chr4:185230901-185269523Ly3
SE_60970chr4:185171463-185270371HBL1
SE_67351chr4:185248236-185254171MM1S
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr4185250931185251612
chr4185252918185253136
chr4185254652185254822
chr4185249670185249928
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH04I184334chr4185254652185254822
GH04I184326chr4185247911185254342
Enhancer Sequence
CCTGATGGCT GACGAGCTGA TGAACAAGAG CAGCAGGTGT GTCCCCGCTG TTCCTAGAGA 60
ACAGTATGGA GAGTGGATCT CTCCATCACC CCCTCAATTC CCAATTACAT CCCAGTTGTC 120
CCATCCTCAG TCCTGAGGGG CTTTCTTAGT TGAGTCATAA GGGTAACCTC CAGGATGTCT 180
CCAGAGCTAG GAGGAAGTTG CATAATATCA GTGTTTTTTA AGTACTTTTA GAAAGCAGTG 240
ACATTCATTT GACAAAAAAA TTTAATGTAC AGTGATTTCT TTCACTTACT GCTGTTGACT 300
TTTCATAAAA AGATAATCTA AGGTCCCTTC CCTCTAGGAT GTATTTACAA CCTCCTTGGG 360
GAGTCAAACA TAAAAATTAA ATAAGAGCTA TGGAAGGATT ACACCGATAT AATTAATTTT 420
AAAATTAGAT TGAGAGCAAA AACATTTATT GAGCATGTAC TATGCTCCAG GTACCTGCAT 480
AGGCACTTTT ATTTATTCCT CTGATTGAAC TGTCCTGTAA GGCGTGGGAT ATTATCTGCA 540
TTTTACAAAA GACAGCTCTA GGCTCAGAAT GGTTAAGTAA TGACAGGGTT CAGGACATGC 600
TACCCCAAAC TGTGGTACCT TGACACACTG AATATCTTAA GCTGAAGGAA TCTGAGAGAT 660
GGCACGTGCA AGAAGCTCCC TCTCACCTTT CCCCTCACCT TGCCTGCTGA ATCAGGTCGT 720
AAAACCTAAG AAGGATTTTC TGACCTTCTC CTGAAGCAGG TCATCGTAAG ACCCTCCTGT 780
GAGCGGTGCC CTCCCTAGAC CCGGAGAAAG GGAACATCCT TATTTCTGAA GACAAAGAAG 840
AAGCTGAACA AACAGGCCTT GCTCAGTTTC CCCCAGTTTA TTCCCATCAG ACCACACTCT 900
TTCCCCAATC ACGTTTCCGC ACACCTGGCC ACTTCTCGTC AAACCTGTTG TACAAAAGAA 960
GCCAGGCTGA ACTGTTTCTC TGGGTCATTT CCTTATGAAG GTTCCCGTGT CAAGTAAAAC 1020
TTAGATTAAC TAAATGTGTA TACTTTTCTC TTCTTAATCT GTCTTTTCTT ATATGGGCCT 1080
CAGCCCTGAA CCTGAGATGG GCAAGGAAGA TACATTTCCT CCCGTACCGT GACAAAATAA 1140
GTGTCTTCTC GTTCAGAGTT TCCGATTCCA AATCCAGGAG TCTTTCCACT ACATCAAACC 1200
TAATGGTAAA TATTCAAGCA TGTACAAAAG AAAGATCCCT GTAGTTGAGT GCATCCAGAG 1260
AAGCGCCTTG GCTCTCCCAG TAGTACTGCT CTGACCTGAG GAAGAATAAG GCCTTTATAA 1320
GCACAACTTG GCTGCATTCC ACTGGCATAA ATCCCAATCA GACAGTCAAC CCCCTTCCGC 1380
ATCCCCATCC TCTGGCCTTT TGAGAAAAGG GATCTGCCCT CCTAAGGGAA TGTTCATTTT 1440
GCCACTAACA GGGAGCTCTC TGAAAAACGC TGTTTGCTGT CCAGTCACAC CTCTGTGGAA 1500
TCTTTTAACA CATGGCGATT CTGTGGCAGG ATACCTGTGT TGGTTTTGTT TTCACAGAGT 1560
GGTCACAAAG CTGAGTTCAA GGTGAGAAGT GAAAACAATT AAATGAATGG TAGCTTTTTC 1620
CACATGACTT TTCACTGCAG TGACCCAGCC CGGTCAGCCC CCGCGCCCGC TCGGTGGCGT 1680
GCACTTCCCA TGACACACAC ACTCGTGGTA TCCATGAGTG CGTGTCAGGA AAGCAGAAGT 1740
GTCACATGGA CAAGCGAGTG TCAACAAGAG ATGTGCCTCC TCTACACATC ATGTGGTTAA 1800
TGTCCAAACT CACTCATCCC ACAGTCACGT TTGACTCTCA GTTGATCACT CTTTGTTCAT 1860
GTTGAGATTC AACAGGAAAT ATTGTTTTTA CAGGGTCTGG AATTTTAATG AGTCTAAGGA 1920
TTCCTGATGG TTGTATTGAC TTTATTTGTG GGGTTCTCAA AAGGAATCTC ACAGTGTAGT 1980
CAACAGCAAG GAGTAAGCAT TTTCTTACTT ACAAAACCAA AGTTATATGT GTGGTACAAA 2040
GATGAGAGAC TGGGGCCAGG CGAGGTGGCT CACGCCCATA ATCCCAACAC TTTGGGAGGC 2100
TGAGGCAGGC AGATCACCTG AAGTCAGGAG TTTGAGGCCA GCTTGACCAA CATGGTGAAA 2160
CCTCATCTCT ACAAAAAATG CAAAAATTAG CTGGGTGTGG TGGTGCACAC CTGTAATCCC 2220
TGCTACTCAG GAGGCTGAGG CAGGAGAATC ACTTGAACCC AGGAGGTGGA GGCTGCAGTG 2280
AGCCAAGATC ACACCACTGC ACTCTAGCCT GGGTGACAAA GCAAAACTCT GTCTCAAAAA 2340
AAAAAAAAAA AAAAAGTGAG ACTGGGAGCA GAAAGCAAGC AGTACTCACG CCACACTGCT 2400
GGGCAGTGGT GCTTAAAGAA AGCGAAAGAA CAAACAAATG AAATACCAGC CTCAATGCAA 2460
AAATAAGCTG GAATGGAGGA GGTTTTCCAT GCTTTTTGAA AGAGGCTGGG TAGAAATTGT 2520
AGTCTTGGGG GTTTTGTTGA CAGCAAGAAT TTCAGCTTTG CCTTAAGTGT TACTCAGAAG 2580
GTGAAATGGA TTCAGCCAAA CGTTACCATA TAAACACAAA CAGGCACATT TTGAAAACAG 2640
TTCCTGGAGT TCCAGGGAGC TCCCCTTTAA TTCATCCCTA GCTCAATGCC GTATAGTTAG 2700
TGTTCAACGT CCTTCTAAGA AAAGAACTGA GGCGGTTTAT TATTAGTGGT GAAGAACCAA 2760
TACACAGAAA TACAAAGGGT CATAGAAAGA CAGTAAGCAA CATTTCTGCT ACAACAAGAG 2820
TCCGTAACCA TGCTTTACTC CAGCCTCGGG GCTTCTGAAA CCTCCCTAAG CTAAGAAACA 2880
CAAACACATG TATGTGGGCC CATAATAGAT GTAGGTGAGG GCTATAGGTC TCCTCAGCTT 2940
CATACCAGGT GGTATGTTAC AATGAAAGCA AGTCTCAGAC GGAATTCGGC CATAAAATAA 3000
ACATTTAGAA GCCAGCAGGC TCAAAAACGT GGTACAACCA GTTCTGTAAA CTCAACCAAG 3060
TACTGGTGCT TTGTTCTGCT GGCACACTGA CAGGTGCCTT ACATAACAGA TTCACTTAAG 3120
GCAGATGTGA CAGTACTCGA ACAGCATGAT TTAGCTTCAT GTCTAGTCAG GGTCAGGTGC 3180
AGGAACCTTT CTATGAGCTG TGGATACAAG TCCTGATTCA AATCCCAAAC CAGAGACAGC 3240
ATTTGGAAGG GCATACATTA TCCACTAGGC TTTCTAGGTC ATAATACCCT GTTTATGCAA 3300
GGAGATGCAA TCTGATACAG TGCTTCCAGT CAGCCCATAA TATTTTGAAC AACTCTTACT 3360
TCACCAATGA AAATGACTCC TAAAATCCAT TATGCCAGAT AGCAAAGCTG TTGGTGTTCA 3420
TTGAGGATAG AGGAAGTTCT TATAGCTGAC TCTCTAGAGC AGGAGCTGCT TCTTCTTTTT 3480
TTTTTTTTTT TTTTGAGACC GAGTCCAGCT CTGTCGCCCA GGCTGGAGTG CAGTGATATG 3540
ATCTCGGCTC ACTGCAACCT CCACCTCCCA GGTTCAAGCG ATTCTCCTGC CTCAGTCTCC 3600
CGAGTAGCTG GGAATACAGG CGTGTGCCAC CACACCAAGC TAATTCTTTG TATTTTTAGT 3660
AGAGATGGGT TTTCACCATG TTAGCCAGGA TGGTCTCGAT CTCCTGACCT CCTGATCTGC 3720
CTGCCTCGGC CTCCCAAAGG AGGAGCCTCT TAATAGTCTT TCAAATTCCA ACAGACCACC 3780
CCTGGAGTGT GTATATTCAT TCCTGAATAG GGCTCTTCAA TATTAACTCG CTGCTCCTGG 3840
TTGTCAATTA AAAACCCAGA GATAAATACC ACTACCTATG CCAACATTTT TAACCATGAA 3900
TTGGAACAGT GTAATATTTT TGCTGGGATC TTTGATTGTC TCTTGCCAGA GCCCAGACTG 3960
GGGATCCAGG CATACACCTG GGCTCAAGAC TTAGGAAAGC CCTCTCTCTT TCCTGGCCTT 4020
ACAGTCTGGA GTCTTGGTCA GAATCTGCCC ATCTTCAAAC AGTTATGGCT TTCTCTTCTT 4080
ACCTGTGCCT TCCATCAACC TTGTGAAGTA GGTGACGGTT ACCAGGGTTA GAGTTCAGTT 4140
ATTTCAAGAG CTTATCAGAG GAATTAAGCA GCAATTTTTT TATTTTTTTG CTTCAAGCTA 4200
TCAGTTCCAA GGTCAACATG ATATCTTGAT ACTCTTAAAT GCTCTGATAT TTTTTGATTT 4260
GCTGTGAAAG GCACACAATA TTAACTCTAT TAATGCCAGA CAAAATACCG TCATAAATAC 4320
TACATAGGAA GGGCCCTTGA CAAAGACAGT CTCAGTGACC AAACTTTAGA AGGCCCCTCT 4380
CAGCCCTCTT TTTAACAGGA CTCATCCCTG GACCCAGGCT TCAGCCTGCC TAGTCCAGTT 4440
TTAGCAGGGA TCCTGCTAAG CCAATTTAGT GAGAGTCCCT CAACCTTGAC CTCTGACCAC 4500
ACTGGTCTGC CTTCAGCAAG AATCCTGTTA AAGTCAGTTT AGCAAGAATT CCCCTCCCCT 4560
TGATATTTTT CTTGGTAATT ACTTCTCTTA ATAATTTTCT ACCCATCAAC CTCCCCAGCC 4620
CCCATCTGAT ACTGACATGG CCTAAAAAAC TTGAATATCA TACTGCTGGA CTGAGTGAGG 4680
GTTTTCGAAA CTCTAGTTGA GTTCATGAAA CTGCTAACCC ATGATCAAGC AAAACAAGAA 4740
TTAATTACAT AGGACTGAAT CAACTAAAGA AGGAGTATAA TTTTTATGGC TTTTTGTTTG 4800
GAACATTGCT TGTTCTTAAT GTTCTATTTT CTGGACATAA GGAACCCCTT TTCTTTTTCT 4860
CTTAAGTTAG CTATAATATG TAACAATTTA GTAGATACAT TTCTATAACA AAAATGGAAC 4920
ATTTATCTTT TTTCCTAATC CTTCCATAAT TCAGAAACTA TTACTGAGTA TTTTTATGTT 4980
CATGGTTGTA TTAGTCTGTT CACACTTTGC CATAAAGAAA TACCTGAGAC TGGGTAATTT 5040
ATAAAGAAAA GAGGTTTAAT TGGCTCACGG CTCTGCAGGC TGCACAGGAA GCGTGGCAGC 5100
TTCTGCTTCT CCGGAGACCT CAGGAAACTT CCGGTCATGT GGAAGGCAAA AGGAGAGTGA 5160
GGCGCATCAC ATACTCAGAG CAGAAGGAAG AAAGAGAGAG TGGGAAGGTG CTACACACTT 5220
TCTTTTTTTT TTTTTGAGAC GGAGTTTCAC TCTTGTTACC CAGGCTGGAA TGCAGTGGCA 5280
CGATCTCGGC TCACGGCAAC CTCGGCCTCC CGGGTTCAAG CGATTCTCCG GCCTCAGCCT 5340
CCCGAGTAAC TGGGACTACA GGCGCCCGCC 5370