EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-15181 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr3:46970930-46977980 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOSL2MA0478.1chr3:46977131-46977142ATGAGTCATCC-6.62
FOXC1MA0032.2chr3:46975395-46975406TATGTAAATAT+6.62
HNF4GMA0484.1chr3:46975115-46975130TGAACTTTGCACCCA-6.6
Hnf4aMA0114.3chr3:46975113-46975129TTTGAACTTTGCACCC-6.21
JUNBMA0490.1chr3:46977131-46977142ATGAGTCATCC-6.62
KLF4MA0039.3chr3:46974450-46974461CCACACCCTGC+6.62
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr3:46972492-46972503AGGCACTCAAG+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:46971300-46971315GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
SOX10MA0442.2chr3:46973700-46973711AAAACAAAGCA+6.02
ZfxMA0146.2chr3:46971276-46971290GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Znf423MA0116.1chr3:46972788-46972803TCACCCCTAGGGTGC-6.46
Number of super-enhancer constituents: 56             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00943chr3:46971562-46975179Adrenal_Gland
SE_00943chr3:46975428-46979987Adrenal_Gland
SE_02008chr3:46971380-46975339Aorta
SE_02008chr3:46975431-46979976Aorta
SE_10127chr3:46964000-46982704CD14
SE_11155chr3:46963907-46992913CD20
SE_13638chr3:46971550-46974655CD34_Primary_RO01536
SE_13638chr3:46976258-46977215CD34_Primary_RO01536
SE_14564chr3:46971566-46975300CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14564chr3:46975429-46976256CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18708chr3:46972575-46975234CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20061chr3:46970016-46975395CD56
SE_22640chr3:46971928-46975052CD8_primiary
SE_23114chr3:46971617-46975208Colon_Crypt_1
SE_23114chr3:46975502-46977081Colon_Crypt_1
SE_23749chr3:46971711-46973448Colon_Crypt_2
SE_23749chr3:46973449-46975042Colon_Crypt_2
SE_26114chr3:46971685-46975312Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26114chr3:46975509-46978450Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27403chr3:46970664-46979932Esophagus
SE_28630chr3:46971492-46975383Fetal_Intestine_Large
SE_28630chr3:46975414-46978592Fetal_Intestine_Large
SE_30558chr3:46971654-46978550Fetal_Muscle
SE_31407chr3:46970646-46975250Gastric
SE_31407chr3:46975429-46987226Gastric
SE_32585chr3:46966448-46975230GM12878
SE_38780chr3:46970749-46974865HUVEC
SE_38780chr3:46975376-46979404HUVEC
SE_40617chr3:46970726-46975377Left_Ventricle
SE_40617chr3:46975387-46993135Left_Ventricle
SE_41619chr3:46971597-46975216LNCaP
SE_41619chr3:46975596-46977166LNCaP
SE_42118chr3:46970032-46992962Lung
SE_47478chr3:46971661-46973453Pancreas
SE_47478chr3:46973781-46974777Pancreas
SE_47478chr3:46975612-46979175Pancreas
SE_48306chr3:46971528-46975218Psoas_Muscle
SE_48306chr3:46975337-46979878Psoas_Muscle
SE_48684chr3:46971559-46975364Right_Atrium
SE_48684chr3:46975375-46980001Right_Atrium
SE_49453chr3:46971538-46972807Right_Ventricle
SE_49453chr3:46972817-46973621Right_Ventricle
SE_49453chr3:46973793-46975177Right_Ventricle
SE_49453chr3:46975521-46977057Right_Ventricle
SE_50160chr3:46971539-46975248Sigmoid_Colon
SE_50160chr3:46975499-46978664Sigmoid_Colon
SE_52388chr3:46971545-46975260Small_Intestine
SE_52388chr3:46975498-46978637Small_Intestine
SE_53507chr3:46970696-46975269Spleen
SE_53507chr3:46975569-46979136Spleen
SE_58746chr3:46966845-47032612Ly1
SE_59412chr3:46966960-46998383Ly3
SE_59747chr3:46966600-47033537Ly4
SE_60850chr3:46965041-47030117DHL6
SE_62445chr3:46966331-47033109Tonsil
SE_64772chr3:46975095-46977995NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr34697492946975057
chr34697150846974600
chr34697151946971826
chr34697321646973514
chr34697154846973919
chr34697394846974481
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I046924chr34696632946982223
Enhancer Sequence
ACTGGGCAGG GTGTGACGAG ATGGTGCCAG CCAGAGCAGT AGGGCAGGCC AACACCTAAC 60
ACCTTGTCAG CTGGCCAGGA AATACTGAAG CAGCCTGCAC TCACCAGCAG TCACTGGCAT 120
CTGGAAGCCA CCTTTCTGAG GACAACTGGA GCCAAACAAT GGTTCTGCCA CCCCCATTTT 180
AGAATGAGGA AGTTGCTAAG GGGAGAAGGT ACTAGCTCTA GCTAAAAGAA AAGAAATAAA 240
AACAACAAAA ATGTTGACAG TGGTTATCTC TAGGACTGAC TTTTTTTCAA GAGATGGGGG 300
TCTTGGCTGG GCATGGTGGC TCACACCTGT AATTCCAACA CTTTGGGAGG CCGAGGCGGG 360
TGGATCACCT GAGGTCAGGA GTTCAAGAAC AGTCTGGCCA ACCAACATGG TGAAACCCCA 420
TCTCTACTAA AAAAACAAAA ATTAGCCAGA TGTGGTGGCG GGTGCCTGTA ATCCCAGCTA 480
CTCAGGAGGC TGAGGCAGGA GAATCACTTG AACCTGGGAG GCAGAGGTTG CAGTGAGCCG 540
AGATGGTGCC ACTGCACTCC AGCCTGGGCG AGAACAGCAA GACCCCATCT CAAAAAAAAA 600
AAAAAAAAAA AAAAAAAGAG ATGGGGGTCT CCCTATGTTG CTCAGGCTGG ACTTGATCTC 660
CTGGGCTTAA GCAATCCTCC TGTCTCAGCC TCCTGAATAG CTGGGACTAC AGGCATGAGC 720
CACCATGTCC AGCTCTGAGT GATTTTTACT TGCTTCTCTG ATTTTCTGTA GTTTCCGGAA 780
TTTCTAATCA GTATTCTTCC TACACAGAAA CAACCAACGA AGTACTCAAA AACATAAAGA 840
GGAAACAGGC AGAGGGGCCA TAAGGCAGCA GAAGACTGTG GCAGGGTTCT GAGTCAGGCA 900
GCACCAGCAC CTCAGCTCTG CTGGTGGCCA GTCTCTGTGG CTTAGGGCCA GGCTGTCCCC 960
TAGCCAAAGG GAAGCAGAGA CCAAGCCATG CTTTTTTGGG GCTTTCTGCC CCCAGAGTCT 1020
ATGGGAAGGA GGGCAGCCCA GAAAGCCCAA TGGCTTCTAA GACACTATCC TTTGCACCAA 1080
ATGCCCTAGG CCACCCAAAG TCCACCCTAT ACCGGCAGCC AGTGTCTGGG TGGAGCTTTG 1140
CTGTCTCTCC ACAGGAGCAG ACACATCAGC CACCTCAGTG CCTCCACTGG CCCTCCCTCT 1200
GACTCAGGGA CCCCAGTGTC CCCAAAACAA GTCTAAGCTT CTTCACGTGG TCCTGGCCCC 1260
ACAGCCTGCT CACCCCCTCA GCTACACACT TCCCCGTCCA TCACGCTTAA AGAGCCAGCT 1320
CCAGGAGGTG GCCCTGTGGG CCCCTCCCAG TGTCCCTACT CACCCTGAGG CACAGTAACC 1380
GCCCTTCTCC TGGGCCCCCT TTGCCCCACT TGCCTCTCTA CCCTCTCCAC AGCAGGCCCC 1440
ACTCCATGCA CGTGGCCCTG TGTCGGCTGC ATGTCTGTCT TTCACAGCCT GCCCTAAATG 1500
CACCAGGCAG CTCCAGGAGG GGCTCAGCAT ACATTGCCTC AAGCTGGATA AAGGAATTCA 1560
GAAGGCACTC AAGAAAGAGC TTTATGGGTA GCCTGGGGCT CTCTGAGCCT TTCAATGACT 1620
TGAGAAGACA TTTGGAAGCA AAGAAGTTGT GCCCAGCAGA GAGGGCAGGA ATGTGGCTGG 1680
GCCGGGGCAG CCAACCCCTA AGCAACTTCT TTGTGGCAAA GCAACAGGGA ATGCCAAGTT 1740
TGCATTCCAT AGAGTTTCCT TCTAAAATGG GTAGCTGACC TTTTCTATTT ACTTTACTCT 1800
GCTTCAGGCC AGCTGCAGGA GCCCGGGACA TGGGCTGGCC AGGGAGGTTC AGGGGAAATC 1860
ACCCCTAGGG TGCTTTTTCA CATGTGCCAA TGAGAGGAAG CAGGTGGAGA AAGTTGATGT 1920
TCTCTGTCAA GTATAGAACC AGAGTAGAGT TCTAGAATGG CGAAATGAAA GGAAGCTTTG 1980
AGATTATGAA TCTGATCCAA CCCCATCACT GGCAAACTGG CCTCAAAGCC TACACTGCTC 2040
ATGGGGGTTT CATGGCCCCT GGTCCACTTC ACTCACTCAT GCTACCAGGC TTATCCTTTG 2100
GGGCGCTAGC CTCCCTTCTC ATCCCTTATA TCTTGAGGCT ACTCCACATT CACCTGCTGC 2160
CCTGGGCCCC TGGAGGGAGG CAGAGAGGAT AAGGACAGGA CAGTCCCACA TGGCCTGTTC 2220
CCTGAGAACA AGGTCCTCCA CCTGGCCACC CTGGTCCCTC CTGGCCATAC AGGCCCCATC 2280
AAGGGCCAGA GAGAGAACTG CTGTGAGGCA CTCCTCCTAG TAACAGACCA CAGGGAAGGC 2340
CACGCCCAGG ATGCGCCTGC AGGCCTTGCA GAGGCCACCA CTGACCAGAG AGACTGGCAA 2400
CTTTGATCAA AGAACACTTT CATTTTTAAT ATTCAGAGTA CAGAGACACT GGAGCTCTGC 2460
CAGGAAAACA CACTCATGAC ACTCAGACAT GCCCCTAATA ATCCTCTGTT TGCTTTAGGC 2520
TCTGCACATA GAGACCTACC CCTTGTCCCC AATATAAATA ACAAGGCTTC AGTTGCTGCT 2580
GCCAGAGGCC AGACTCGACA GAAGCATGAA AATGAGGGGA GAGGCAACTA CCCCAAATGA 2640
GGTACACAAC TGCTCTAGAG GCTGATCTGG TCTTTCTTTC AAGGGCCATT AAAATGTTCA 2700
AACTCCCTGA CCCGGTAACC CTGCTCTGGG GAAATTATTC CATAGAAATA GTAACAAGAC 2760
AGGAGCAAGC AAAACAAAGC ATTCTATATA CGCACGATCC TGGCAGCATA ATTCATAATA 2820
GCTACAACAC CTCTGGGATC TCTTCTGGCA GAGTGCCCTA GAGTGGCCTA AAGTACCACC 2880
AGGCTATGAG GGCAAAGGAC AATTTAGTAC AGGGATGTTT TTGTTTGGTG GTTGATATTT 2940
TTCTTTAGAA CACTCAATGG CTGGCTTTGC AGCAAATGAG ACTTTTAAAG AGCCCAGTGG 3000
CTTCCCCACT CGTGGGCAGA GGAGACTGTC CTCCAGCTGT CACCCAGCAA GGCAACTGTG 3060
GCCCCAGCCT GAAGAACGGG TACAGTGTAA GGCAATAAAA CCTCCCTTCC CTTCTCTTAT 3120
CCAGCCCACC CCAAGCCTCC TGTCCTTCTG GCCACACAAA GAGGACAAGG TCTATTGGAG 3180
CACATGACAC AAGAAGTGAC CATGGGCAGG ACAGGGCCAC ATCACAGCCT CAGGGGGTGG 3240
ACAGGCCTCC AAGCAAGTCC TGGCAAATGC GTCCTCAGCG GGTTTCAGAA AAAGGAGTGG 3300
GAGCGCCTTT GTGCCCCCAC CTGAAACCAC AGGCCAGAAA GCATGAGATA ATGCACCCTC 3360
CCCAGTAGGG GCAGCCTCCA CACATGGCCT CTCAGAGGCC ACCTCTCGAG ACCACCCTTC 3420
CACAGAGGAA GAGGGTGTCA CTGACATTTT CTCAATGTGG AAAACAGTCC AGAAAGACTA 3480
TCCAAGGTGC CAGAGTTGAA GGAAGAGCCG GAGGCAGAAT CCACACCCTG CTCTCTGGCC 3540
TAGGGGTGGA CCCCACACCA GCTTCCTGCA TCTGGCTCCT CAGGGACCAG CAACTGCAGT 3600
AGAGAAGCTA CCTGACACAG TGACTGGGGC CTGGCCAGGG CTGCAGGTGG CTGTGCCAGG 3660
GCTCTGAGTG CTCAAGTGTT CCTCAAAGGA AAAACTCCTG CAGCCTACCC CACAGTGGAG 3720
TTCAGCCTAC AGCATTATCC TGGAAACTCC CTCCCTCAAC GGGAGCCCAG CCTCTCAGCT 3780
CTCCCCACTG CCAGGAGAAG CCTTCCTCAG CCCTAAAAAT TACAATTTTA GGTCACAGGT 3840
CTTAGAGGCA GAAGGAGCTT CAGAAGTAGT ACAGTCAAGC CCTTGCCTTA AAAACAAGGA 3900
GGCCGGAGAA GCCAGAGCTG GCTGGGGATG AGATCTGTAT GGGAGCCCCC ACCAAGACAG 3960
ATCAACAGCT ATGGCCACGT GTTGGCACCA AGGCCTACCC AAAGGCCCCT GAGGGATGGC 4020
TTATAAGCAG CCAACGGCTG TTCCAGGCAA TGACCAGGGC TGAGTGTTAG TTAAATGAGG 4080
CCCCTGCCCT GCTGGAGCTG CCATCGCATC TGCATCATGC GGTCTGCACC CACTCTCATC 4140
CCAGACGCTG CAGAACCTAA CCAAGGTGCT CTACACTGAC AAGTTTGAAC TTTGCACCCA 4200
TCCCACCTGA AAGCCCATAG CTAGTGGGTA CTTAAGGCGT TAGAAAAAAC TGGTCTGCCA 4260
AAAGCAAAAC AAAAAACCCC AAGACTGAAA AATAAATCAT GGTACTCTCA AAGAAATATT 4320
AAGCTGCCAT AATTTCATGA AAGTGTATTT ACCAAAAGAT AGTCATGACA CGGCTCATGA 4380
AAAAATGTTA CAAAACAGCA TGATATGCAC AGATACATGT TGATCTGTAG TTTCTAAGTT 4440
TTCTACAATA AAAAAATCTA TAATTTATGT AAATATCAAT TGAAAATTTT TTTTTTTTTG 4500
AGATGGAGTC TCGCTCTGTC GTCCACTGGA GTGCAGTGGA GCAATCTCGG CTCACTACAA 4560
GCTCCGCCTC CCGGGTTCAC TCCATTCTCC TGCCTCAGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC 4620
AGGCGTGAGC CACAGCACCC GGTTGTAAAT ATCAATTTAA ATTTTAAAAC AGGAGAGGAG 4680
TAAACGTTTA TGGCAGATGA GCTAAGCCCC AAAGGGCCCA TAAGGTGAGA ACTGGATTGG 4740
TCACACTGGC CATGTGGGAC CCAGATGTTG GGGGACAGGG GCCTGCATAG CCCACTGCCC 4800
CTCACCCTCC CAGGGCCCAA TCTAGCCCAC AGACCACTCT GGGAAAGTGG ATGGTGCTCA 4860
ACCCCATAAG GCTGCCCTGA GTGGCAAACT GCCAGCAGCT GCTGCACTCT GCCAAAGACT 4920
CTTTTCCCCA CACAGGGAGG GGTCTCAGTG CCAGCTCCAC TCCCTTTCAA AAGTTGGAGG 4980
ATTTTAGCCA AGGAAATTTT AGCCAAGTCA CTTCACCTGC CTGGACTGTA GTTTCTTCAC 5040
CTATAAATGC AGATCACATT AGTCCCAGAA CAGAGGTGAA GACTTCATAA GAGGGGCTTT 5100
GGAAGCTGAG ATCAGGACAT ACAAGATATC AAGACTTAAT GCACACAGAA AGGATTCAGC 5160
TGTGCTCCTA CCCCACCCTA CCCAGAAGGG AGGTGCCCGG TGCCAGCACA TGGTGAGTCG 5220
GCTTCACCAT CTTCCTTAAA CCAGTTCTCT CTTGATTCAT TCTCCCACAT TCCCAGGCCT 5280
ATTCCCAAGA AACAGGGTCA GGAAAAACGA GGCAGTCGTG GGTCCCTGTG CTGCTGCTTC 5340
AGCAGGAGAT CTCCACTGCC CATGACTGGG ACATCACCAG ATGTAGACAT CCTCTACAGT 5400
GGGACTGAAA GAACTCAGGA GGCGTGATGG GAGCCGCCCT GGTCGGTACC ACTACGGTGG 5460
AACAATGCAT GCCAAATCAA GCTGATGTCA TGGATCAAAC AACCATGATC TGTGATACAC 5520
CCTGGTGTGT GGAAACCATC AGTGGGGCCC AGCACACAGA GCAGAGAGGC CTGGCATTGG 5580
CTGGACTCAA GGGTTTGGGC ACTGGGCCAG GGCTGGGCCT TAGCTGGGGT GGGAAGTCTC 5640
TCCACAAGAG GGTCATGCAC ACATTGAGCT GGGGAACAGA TTTTCCATCT CTGAAGAAGG 5700
AAGGCTAGTG GCCTCATTGC TTTTGCAATA TGTGACACCC AGCACCGGTC AAACAACTAT 5760
CTCTGATGGT GACCGACTTT TCCAGCTGTG TGCAGACCTC CATACAAAGC CACAGGGAGG 5820
TGGTGGCTGT GGAGGTTGGG AGGTCGGGAC TTGCTTGTTC AGGCACTTTC TGGCATAGGA 5880
GGAGGCGAGT GCTCCTGGTT AAGTGCCTCC TCCCTTCTCC TCCCACCTGT CAGCCCCAAC 5940
CCAACAGTCC ATCCATCCCA CAAGGCAGGG TGGCAATGGC TGTCAGCCAC AAACGCTGCC 6000
CTAGACATGC CTCCATGGCA CATATCAGCC AACCTCCCAT CAGGAAGAAG TGACGGAGAG 6060
CTTTTTAAAA AAAAAAAAAG CAGCTAAGCA GCTGACACTG ACATGAACGC CCCTGAATGC 6120
CCTCTTCCAT GGGCCAGCTT TCCAGGGCAC ATCTTATCTG GGCAGTACAC AGGGGGCTGG 6180
GGGAAGGGAG CTGCCTTAGG GATGAGTCAT CCATGCCTCT ACAGAGTTAG CTACAAGAGG 6240
GCTGGCAGAG ACAGGGAAGA GTCAGCCCAG AGAAGTAGGG CCCATCTAGG GGTAGGAATG 6300
CATCCTTTCT TCCCACAGAG CCTGGGCTGG TGGAGCTGCT GGAGCTCACT CCCACCCAAT 6360
GGGGATTTGG TTGTATGGGG ATAGGACAGG ATTTATCCTA GGAGAATAAT ACAAATTTTA 6420
AAAAGGAATC TGGATCTATA GATTCAATGC AATTCTATCA AAATCCCAGC AAGCTTTTTC 6480
TAATAGATAT TAACAAGCTA ACTATAAAAT GCATAAGGAA AGGCAAAGGA ACTGTTAGAA 6540
TAGCTAACAT AATTCTGAAA AGGTCTCCTC AGGCAGTGGG GCAGGAACAC AGGCAGGCAG 6600
GCGAGTGGCT CTTCAAGATG GCTGGTGAGG GGCAAGGTCC TGGGGTGGCT CCCTCCAATC 6660
CTGCTGGATT TTCATTTACT TAGCCACAAA CCCTGGCCCT ACAGTGTATC TGGTTAGACA 6720
AATGAATCTG CAAAATGAGA CCACTCAGCT TATTTCCAAG GACTATCTAA TGCAGCAAAT 6780
AAGCGAGGCT CTACAAAGTG GTTCCTAATC ACAAACTTCT AAGTCACATT TCCTTATTTC 6840
TACTCCCATC CATTGCCTCA CATTTCCCCC AACTGTTGCC TTATTTGCAA AGCTGGCACA 6900
TGCTTTATGT AAAAGTTACT TCTGCCTTTT CGAGGTGTGT CCAGAGTCCT TTCACTCTCT 6960
CGGGAGGACC TCACGGTGCC TTCCTTCTGC CCAGAGCCCC AGCACTAGCT GGGCAAACAG 7020
GTATGGCATT TGCTCTGTTC GTCAGGTGAA 7050