EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-11019 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr19:39531850-39533300 
Target genes
Number: 10             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr19:39532432-39532448TTTTATTTACATAAGT-6.23
LMX1BMA0703.2chr19:39532537-39532548ATTTTAATTAA+6.62
Lhx3MA0135.1chr19:39532541-39532554TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:39532545-39532558TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:39532549-39532562TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:39532542-39532555AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:39532546-39532559AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:39532550-39532563AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr19:39532543-39532553ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:39532547-39532557ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:39532551-39532561ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:39532543-39532553ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:39532547-39532557ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:39532551-39532561ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
ATGAATAAAT ACCCAAGACT GGATAATTTA TAAAGGAAAG AGGTTTAATT GACTCACAGT 60
TCTTCAGCAT GGCTGGGCAG GCCTCAAGAA ACTTACAATC ATGGCAAAAG GGGAATCAAC 120
ATGCCCCTCT TCACAGGGCA GCAGGAGAGA GAAGTGCTGA GCAAAAGGGG AAAAGCCCCT 180
TATAAAACCA TCAGGTCTTG GCCAGGCGTG GTGGCTCATG GCTGTAATCC CAGCACTTTG 240
GGAGGCCGAG GCAGGCAGAT CACTTGAGGT CAGGAGTTCG AGACCAACCT GGCCAACATG 300
GTGAAACCCT GTCCCTATTA AAAATACAAA AATGAGCCAG GCATGGTGGG ACACACCTGT 360
AATCCCAGCT ACTTGGGAGG CTGAGGCAGG AGAATTGCTT GAACCCAGGA GACAGAGGTT 420
GCAGTGAGCC AAGACTTTGC CATTGCACTA CAGCCTGGGT AACAGGTGAT AGAGCCAGAC 480
TCCTCCAAAA ACAACAGCAA CAACAACAAA AGGTGAAAGC ATTTGCTTTT TCTCCTCACT 540
TGATTCCTCC AAAATCTGGA AACTCTTCGT GAGTATTCTT ATTTTTATTT ACATAAGTTC 600
AGAAAAAGTC TGCCCTTTCT TTATAAGCAA GATATAATAG AAAACACTGG CTATATCACC 660
AAGGCTTTGA CTGAAGTGTC ATATTTTATT TTAATTAATT AATTAATTAA TTTATTTATT 720
GAGACCAAGT TTCACTCTGT TGCCCAGGCT GGAGTGCAGT GGCACGATCT CAGCTCACTG 780
CAACCTCTGC CTCCCAGGTT CAAGTGATTG TCCTGCCTTA GCCTCCCGAG TGCTGGGATC 840
ACTGGTGTGC ACCACCATGC CCAGCTAATT TTTTTTTTTT TTTGTATTTT TAGTAGAGAC 900
AGGGTTTCAC CATGTTGGCC AGGCTGGTCT CGAGCTCCTG ACCTCAGATG ATCCACTCAC 960
CTTGGCCTCC CAGAGTGCTG TGGTTACAGG TGTGAGCCAC CATGCCTGGC CTGAAGTATT 1020
ATATTTTAAA ATATACATAA ATGCCTGGCT TCAAGAGTTC CCAGTCTTAC AATGAATGAG 1080
TAAAAATGGC CCCTTTCTGG CAGGCCCAAG AACCTTAAGA ACCTGTTGGT AAAATCTAAA 1140
GTCTGCCTTG GTTTGGCTTC TGAGCCTCAA GAGGTTTCTA AATCTGAGAT TCCTATATGA 1200
TAAATGTGGA GAGAAAAAGT TACATTTCTA AAGAAAAACT ATAATATACC TATTAATAGA 1260
TTGCAGCCCT GTGCACTGTT TTTAAGTTCT TGTTATCTAC CTATAGACTG GACGAGTTCC 1320
TGAATTCTCC TGACTTCCTC CAATATATTG CTACAACTCT CTGACTAAAA GCAACGGCTG 1380
GATGGGCGAG GTGGCTCACG CCTGTAATCC CAGCGTTTTG GGAGGCCGAG GTGGGCAGAT 1440
CACTTGATAT 1450