EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

HS128-08091

Organism

Homo sapiens

Tissue/cell

MCF-7

Coordinate

chr16:2214000-2215870

Target genes

Number: 33
Name	Ensembl ID

IFT140	ENSG00000187535
CRAMP1L	ENSG00000007545
MSRB1	ENSG00000198736
NDUFB10	ENSG00000140990
SNORA10	ENSG00000206811
SNORA64	ENSG00000207405
AC005363.9	ENSG00000255513
RPS2	ENSG00000140988
SNHG9	ENSG00000255198
TBL3	ENSG00000183751
GFER	ENSG00000127554
SYNGR3	ENSG00000127561
AC005606.14	ENSG00000261790
AC005606.15	ENSG00000260107
ZNF598	ENSG00000167962
NPW	ENSG00000183971
SLC9A3R2	ENSG00000065054
TSC2	ENSG00000103197
NTHL1	ENSG00000065057
RP11	ENSG00000259933
Y	ENSG00000200059
RAB26	ENSG00000167964
SNORD60	ENSG00000206630
TRAF7	ENSG00000131653
CASKIN1	ENSG00000167971
MLST8	ENSG00000167965
C16orf79	ENSG00000182685
PGP	ENSG00000184207
E4F1	ENSG00000167967
DNASE1L2	ENSG00000167968
ECI1	ENSG00000167969
AC009065.2	ENSG00000207715
RNPS1	ENSG00000205937

TF binding sites/motifs

Number: 3

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

RREB1	MA0073.1	chr16:2214128-2214148	GGGGGGGGTGTGGTGTGTGT	-	6.71
RREB1	MA0073.1	chr16:2214126-2214146	TGGGGGGGGGTGTGGTGTGT	-	7.1
ZNF740	MA0753.2	chr16:2214125-2214138	GTGGGGGGGGGTG	-	6.09

dbSUPER

Number of super-enhancer constituents: 2
ID	Coordinate	Tissue/cell

SE_24208	chr16:2212329-2214258	Colon_Crypt_2
SE_26937	chr16:2199546-2214313	Esophagus

Enhancer Sequence

GGGTAAGGGT GTGCCCCTCT GCAAGCCCAA CATCCCCAGG ACCCCCAGCA TGCCCCAGGG 60
ATCTGGTGTT GCCTGCAGAG CTCCCAGCGC AGTCCCGTCC CGAGCTGGGG TCTCAGGGGA 120
GCTCGGTGGG GGGGGGTGTG GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GCGCGCGCGC GCGCGCGCGC 180
GCACGCGTGC GTGTGTGGTT GGGGCGTGTT AGTGCTGTGT GGCGCGGCCT GGTTGCATGG 240
TTAAGCGTGT GAGTGCTGCG TGGCGCGGCC TGGTCGCATG GTTAAGCGTG TGAGTGCTGC 300
GTGACCTGGC CTGGTCGCAT GGTAAAGCGT GTTAGTGCTG CGTGGCGCGG CCTGGTTGCA 360
TGGTTAAGCG TGTTAGTGCT GCGTGGTGCG GCCTGGTCGC ATGGTTAAGC GTGTGAGTGC 420
TGCGTGGCCT GGCCTGGTCG CATGGTTAAG CGTGTTAGTG CTGCGTGGCC TGGCCTGGTC 480
GCATGGTTAA GCGTGTGAGT GCTACGTGGC CTGGCCTGGT CGCATGGTTA AGCGTGTGAG 540
TGCTGCGTGG CCTGGCCTGG TCGCATGGTT AAGCATGTTA GTGCTACGTG GCGCGGCCTG 600
GTCGCATGGT TAAGCGTGTT AGTGCTGCGT GGCGCGGCCT GGTCGCATGG TTAAGCGTGT 660
GAGTGCTGTG TGGCGCGGCC TGGTTGCATG GTTAAGCGTG TGAGTGCTGC GTGGCGCGGC 720
CTGGTCGCAT GGTTAAGCGT GTGAGTGCTG CGTGGCCTGG CCTGGTCGCA TGGTTAAGCG 780
TGTTAGTGCT GCGTGGCCTG GCCTGGTCGC ATGGTTAAGC GTGTGAGTGC TGTGTGGCGC 840
AGCCTGGTCG CATGGTTAAG CGTGTGAGTG CTGCGTGGCC TGGCCTGGTC GCATGGTTAA 900
GCGTGTTAGT GCTGCGTGGC CTGGCCTGGT CGCATGGTTA AGCGTGTGAG TGCTGTGTGG 960
CGCAGCCTGG TCGCATGGTT AAGCGTGTGA GTGCTGCGTG GCCTGGCCTG GTCGCATGGT 1020
TAAGCGTGTG AGTGCTGCAT GGCCTGGCCT GGTCGCATGC TGAAGCGTGT GAGTGCTGCA 1080
TGGCCTGGCC TGGTCGCATG GTTAAGCGTG TGAGTGCTGC GTGGCCTGGC CTGGTCGCAT 1140
GCTGAAGCGT GTGAGTGCTG CGTGGCCTGG CCTGGTCGCA TGGTTAAGCG TGTGAGTGCT 1200
GCATGGCCTG GCCTGGTCGC ATGGTTAAGC GTGTTAGTGC TACGTGGCGC GGCCTGGTCG 1260
CATGGTTAAG CGTGTTAGTG CTGCGTGGCG CGGCCTGGTC GCATGGTTAA GTGTGTGAGT 1320
GCTGTGTGGC GCGGCCTGGT CGCATGGTTA AGCGTGTGAG TGCTGCGTGG CGCGGCCTGG 1380
TCGCATGGTT AAGCGTGTGA GTGCTGCGTG GCCTGGCCTG GTCGCATGGT TAAGCGTGTT 1440
AGTGCTGCGT GGCCTGGCCT GGTCGCATGG TTAAGCGTGT GAGTGCTGTG TGGCGCAGCC 1500
TGGTCGCATG GTTAAACGTG TGAGTGCTGC GTGGCCTGGC CTGGTCGCAT GGTTTAGCGT 1560
GTTAGTGCTG CGTGGCCTGG CCTGGTCGCA TGGTTAAGCG TGTGAGTGCT GTGTGGCGCA 1620
GCCTGGTCGC ATGGTTAAGC GTGTGAGTGC TGCGTGGCCT GGCCTGGTCG CATGGTTAAG 1680
CGTGTTAGCG CTGCGTGGCG CGGCCTGGTC GCATGATTAA GCGTGTGAGT GCTGCGTGGC 1740
GTGGCCTGGT CGCATGGTTA AGTGTGTGAG TGCTGCGTGG CCTGGCCTGG TCGCGTGTTA 1800
GGCATGTGAG TGGGCTCCAC ATGTGCACGT CCTCCTTGTG TCCCGGAATG AGGCCAGGTC 1860
TCCTCCGTCC 1870