EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-01307 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr1:156456060-156459220 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3790455chr1156456301hg19
rs1171563chr1156456529hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
POU2F2MA0507.1chr1:156458371-156458384ACATGCAAATGAG-6.54
ZNF740MA0753.2chr1:156456961-156456974CCGCCCCCCCCAC+7.82
Number of super-enhancer constituents: 66             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156457065-156458145Adipose_Nuclei
SE_00337chr1:156458785-156462158Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156456670-156457855Adrenal_Gland
SE_00902chr1:156457886-156465033Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156458406-156465126Aorta
SE_03183chr1:156456043-156465384Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156457206-156457660Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156457996-156458566Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156458577-156459023Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156456452-156464992CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156456935-156461868CD3
SE_13485chr1:156456265-156458192CD34_Primary_RO01536
SE_13485chr1:156458238-156464737CD34_Primary_RO01536
SE_15064chr1:156456690-156463250CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156457379-156459814CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156457977-156460457CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156457236-156458338CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156458341-156459309CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156455796-156465002CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156455595-156466497CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156456364-156463048CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156455831-156464221CD56
SE_21124chr1:156457099-156461742CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156458726-156460216CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156457256-156460201CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_23670chr1:156458712-156461319Colon_Crypt_1
SE_24009chr1:156457788-156458281Colon_Crypt_2
SE_24009chr1:156458815-156460139Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156458742-156460751Colon_Crypt_3
SE_26648chr1:156457546-156463758Esophagus
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156457385-156464605Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156457284-156462277Gastric
SE_32703chr1:156456813-156464850GM12878
SE_33523chr1:156455889-156465173H2171
SE_37054chr1:156457835-156464275HSMMtube
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156458508-156459348LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_46671chr1:156458747-156461587Ovary
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_49466chr1:156457509-156462281Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_52473chr1:156456590-156465184Small_Intestine
SE_53429chr1:156457271-156464857Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156458029-156461282Thymus
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_65297chr1:156456555-156461791Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1156456600156457200
chr1156456267156456663
chr1156458442156458923
Enhancer Sequence
TCCAGCCCAG GGATTTCAGC TCCCCTGCTT CCCAGTGCAA TCCAAAGACT GTGCTTTCTA 60
GAGCTACAGT GGTGTGGGCT TTGGCAGGGA AGGTAGGGGA GGGCACACAG AGGGCAAGGG 120
GAGGGGGCTA CAAATAGTTG GCTTTTTAAA TGGGATTCTC TGGCCTAGTC TTGAAAACCC 180
AATCTAGACT GTTAAATGCA GGAACTGCTG AGCTCCTCTG GCTTACAGCA TCTACCCTCC 240
CTCTCTCCCC TTTACTATCT CCCTCTCACC ACCTTTAGTT CATAACCGAA TTCTTGCAGA 300
GATGTAACCT CTGTCAGCTG ATGACCAATA CTGCCTCTTC CTCCAAACTG GAAGAGAAGC 360
CTCTCTTTGT TCTCATGACC CTCAGAAAAG TCATTCTTGC AGTCTTTCTA GCATTTATCA 420
CAATTGTGAA TAACTATGAT TCTGTGCTTC TATTTAACGC CTGGCTCCTC TATGAGACTA 480
AAGTTTCATG AGGGCAGGAA TCACATCTGT CTTTTTCACT ACTCTATCTC CTATAAGAAG 540
GGAGCTGAGA AAATGTCTGT TGAAAAGAAG AAAATACTAT TTCATTGTTG TGGTGCTGTG 600
AGAAGTCCTT CTTGCAGTCT AACCTCCAAC AGTCTTGCTG CAGTACCAGT TCCTCTCACT 660
CTATCCTCTA TGGAGCTAGA ACCCTTGCTC TCCCAACTGC CCCTGAAGAT TTGGACACCA 720
CCTACCCTCC AACCACCCCT GGTATCCCAG TCCTCAACCC TCCCCACCCT CAGGTTGGTT 780
GGTGCAGAGG GTGAGACTCT AAAGTCTTCT AAGGAGCAGC CCTGAGCACA TGGAGATGGA 840
GAGGATGGGG TTGCTTAGGC AACTGTCGCC TGGCAACCAG CTCCCTGGCT GATCTCCTAC 900
ACCGCCCCCC CCACCCCCGC CTCATGCTGG GGGAGCTGGG ACGAGAGAGG GATCAGGGCT 960
GAGAAGGCAG GGAAGCAACA GAGATTCACT GAGCATCGTC TGACAGAGAG AAGTCAGGGT 1020
TAAAAAGACT AGGCCCCATC TATCCCCACT CCCTACCAAG GTAGCCCAAA GCACTTTTTA 1080
TAATTCCATG CTTCCCAGGC CCCTTTCCCC ACTGCTGCTC CCACTTCTGT GCCAACACTG 1140
CCAGAGGAGG AGATGCCCCT GTCTTAGGCA GTCCTTCCTC CCATCTAACC ACAAACCCCT 1200
CTACAAAGCA GATGCAGTCT ATACTGACCT TTTTTCCTTC TGCTATCCAT TCCACATTGC 1260
TGCAGGGTCT TTGAAAGCCC TGAGGCAAGA ACATGAACTC AACCCTGATT TTGGAAGAAG 1320
GGGTAGCTGG GGCCTAGGCA GGCACAAAAT ACCCTAACCT GACCCTATCC AAGGTTTGGA 1380
GGCCTATCCT AGCTAAACTT CCCTCCTACC CAATTAGGGA GGTTTTAATG AACACCTGGA 1440
CCTCCTTAAT TAGCCCTCTG CCTAATTACC TAACCAACTG GCAGGAGCCA GAGGCCTGGG 1500
CATCTGTTCT CCAGATGTGA GTCTCTCCTC TCCAGCCTCA CCTGGCCCCA TTCTTCTCCT 1560
GTCTGGTCTA CTCCTCCTCT AGGAAGCCCT CGCAGATGAT CCGGCCCTTG GCTGCTTCTC 1620
TTCTAACCAT CTCTCCTTCA CCCTGCCTAG TATCTGGAGC CCAGGGCTTG GGAGGACTTG 1680
GGCTACCAAA GAGACAGGGG GTTGGCCAGG ATGGCCTTCC TGTTCTGATG GCCCCAGGGC 1740
CTGCCCAATC CTGACCTCAG GCCACAACTA TGACTCCTCG GGCTGACAGT ATCTATGTCA 1800
CCAAAAGTTC CCCTTCAAAG GCTCTCAAGG CTCTGGCTGA TTGACTCTGA TTCACCTGAC 1860
TCCGTGGACA GGACAAGGGT GGGGCGGAGT GAACCTTGTG GGTGGCAGGG GGTTGGGACA 1920
GGCAGAGGCA GGGCCTTCCT GGTGGACATG GGAGAAGCAA AGATGGGCAG GACATTTGGC 1980
AATGCCCACC CATATCTGTT CCCATCCTAG TGGTCCCAAG GCTCAAAGAA ACTACAGGGC 2040
ATCTGCTTTC AAAGCTCCCA TACCAGCACA GGTCAAAAGG GAGCAGATGC CCAGAGAGGG 2100
AAACAGGCAC AAACTCACCA ACTGTGGAGA AGGGTGGCTG AGGAGAAGCC TTCACAAATG 2160
GACAGCAGGG AGGATGCAGG GCAGGAGGCC CCTCTGACAA CACCCTTGAC AAAGAGAGCT 2220
GAGGGGACCA GGGGGAATCA AGAAGGACCC CACTGATAGC CATTTTTCCA ATCCCAGGTA 2280
CCGACCCAAT TAGAACTTGT GGGTTGTGTT TACATGCAAA TGAGCTACAC ATGATGTGCA 2340
AAATGTACCG TAAAGGAGGA CTGGTTTGGA GGGGGCATGG GAGAAGAAAC AGGTCCCTGC 2400
CTCCCCCAAT GCAACACCTC TGGGTACCTG AGCAATATTC AAACCATTCT CGGGTTTCAG 2460
AATGATGCTA TCTCAGTTCC TGTGTGAAGG TGGCCTGGGG CCAGTGGGGA GAGCGGTGAA 2520
GGGGAGAGGT CAGGGTAGCC TCCTTGCAGC TGCAGCAGGG CTGAGCAGGG CTGTCCTTCC 2580
CATGGAGCTG CAGGGGAATT CCTTTCCGAT AGCCAGCCTC TATCCTCTCT TTCTTGCTCT 2640
TGGCAGGGGA GTACCTACCT GTCCTTCTCC CCTACACCCT TCCACCCATA TCTGTTCCCA 2700
TCCTAGTGGT CCCAAGGCTC AAAGAAACTA CAGGGCATCT GCTTCCAGAG CTCCCATACC 2760
AGCACAGGTC AAAAGGGAGC AGATGCCCAG AGAAGCTGAG TGAGCAGCCT CGCATCACAG 2820
AGCAGTGGGC CTCAACCTGC TCTTCCTCAT GGTGAGAAAG GGAGCTCTCA TTAGGCAGGC 2880
CCTTCATCTC TTCCTCCCAG GCTGCTCCGG GCTGCAGGCT GAGGACTGGA GGGGAAGGCA 2940
GGAGGCGCTG GAGACAGCTG TCATCCCTCC TCCCGCCCCT TCCCTGTGGC TGGGCTGCAG 3000
GGCATGAAAT AAGCAGCAGG CGCTGGGGGA GGGGGTGACA ATCCAATCCA CCTGTCACCC 3060
CCACAGTCAG GCAGCCTCAA GCAGCCTGCT CACTAACGAG GGAGGAGGCG TGGGTGAGGC 3120
AGACACAGAA GAGGGTGGCA GAGGGGGGAC AGACACACAG 3160