EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-01001 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr1:115641410-115644800 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF8MA0652.1chr1:115641759-115641773TCGAAACCGAAACC+7.73
IRF9MA0653.1chr1:115641758-115641773GTCGAAACCGAAACC+6.93
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01910chr1:115641368-115642575Aorta
SE_01910chr1:115642642-115643195Aorta
SE_12264chr1:115640516-115643864CD3
SE_12941chr1:115640570-115643877CD34_Primary_RO01480
SE_13473chr1:115640089-115643878CD34_Primary_RO01536
SE_13473chr1:115643906-115644651CD34_Primary_RO01536
SE_14129chr1:115640687-115644134CD34_Primary_RO01549
SE_14940chr1:115640204-115643730CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16080chr1:115640579-115643628CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16535chr1:115640570-115643712CD4_Naive_Primary_8pool
SE_20532chr1:115640528-115643812CD56
SE_21790chr1:115640612-115643429CD8_Naive_7pool
SE_54685chr1:115640225-115643565Stomach_Smooth_Muscle
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1115642414115642600
chr1115642865115643000
chr1115641423115642360
Enhancer Sequence
AATTCTTTGA GTCCTTAGTT GAGATTTTAT TCCTCCAGAG AGGATTTTCT TTGCCTTCTG 60
CAAATCATCT CAAGGCAGTA CCATAGTGTT AATTCAGACA ACAAATCCAT TTGAAGGCTG 120
GCTTGTGGTG ACAAGGTCTC AGGGGAGATT TTCCCCACTC CAACACCAAG TCCAAAACGT 180
ATACATTTCT TTGTCGTCTT TTGCATGATG GGTTTATTTC TTGTCTACTC TTCCCTTGAG 240
GGTGTATCCT TTGGGAGGAG GTACCAGGTT TGGGTGAGGT CTCCTAATAC ACTGTCTATA 300
TTAATGGCAT TTTAGGCTTT ACTTCACAAA CCCCAAGCGG TTGCAGCTGT CGAAACCGAA 360
ACCCAGGGCA AAAGGTGGCT TTGGTGCCTG CTTACTTCGA GTTCTTGCTT TCACTTCATT 420
TTGGCCTTTG TAGATTCTCT TCCTTTTGTG CTAGCTCAAC GATGTGGTTT TATTTTTACA 480
TTCTTACATA TTTTATCCAG GGTCTTAGTT TCAGTCGAGA AGGTAGTTCA GGATATCAAA 540
TCTGCCCTAC TGCTAGAAAA GGAAGCCCGG TGTGCCTGCT ATCGTAACTT TGGTTTTGAT 600
AAGCAAACAC GAGCAGTTTT TGACTGCTGG GTTTACAGCA TAGGAACCCT GTTGCTATGC 660
AGCTGTTGTT GGAAAATAGT CTGTGGGCTC AGAGTTTCTA AACCAACCGT CTATTGGATG 720
CCCAGAGAAG GAAGGAAAGC GAGGGCCCTG GCTTGCTGAT TACAAACCAT CTCCATGGTC 780
ACAGGTTGCT GGGTGCTCCT TTTACGATGT TTTCCCAGCA GCATGCAGGC AGCAGTAGCT 840
TCCTTTGATC ATTTTTCAGT TTCTGTTATT TGCTAGTGAG AGAAAGTTTA TACCTGCTTG 900
TGGGGACATG AGTGAAGAAA GAGAGGGGAC TTTGAAACAA GAGAAGAGAG CAAACTCAAA 960
AGGTAACTGT TTGTTTTCAT AGGACCCTAT GGGAACAACT AGCCCATTTT TGTTTTCACT 1020
CGTGCAGCCA GTTGGGGGAA GGAGAGGAAC ATAACTCATC CAGGTCTGAG GTCTAAGTCT 1080
GAATATTTAT TGTGCCTCAC AGATGATCCC CATTTGAATC ATCCAAATTA GGAAAGAGTT 1140
TAAAAAATTA CTGAGTAATA GTCTGGCAGA ATTTTAATGT GACTTCTCTT GTTGACTTTA 1200
AGGTTTAACA GAGGCCCCAA AGGCTGAGAG CAAAATTGTA GGTACTTAAG TACCTTTACA 1260
TTCTAAAGCA AGGTGCAAGA TTGTCTATAT TAGTCAGACA TTATATATTC ATATAAGAGA 1320
TTTATTATAA GGAGTTGGCT CATGTGATTA TGGAGGCTGA CAGTCCTGAG GTCTGCAGTC 1380
AGCAAGCTGG AGACCCAGGA GAGCTAATAG TGGGGTTCTA GTCTGAATGC TGTCAGACTC 1440
CAGACCCAAG GAGAGCTGAT GTTTCAGTTC AAGTCCAAAA ACAGGAAAAG ATCTATGTCC 1500
CAGGTCAAGC ACTCAGGAAG GAGTTCCTTT TTACTTGCAA AAGGGTCAAC CCTTTTGTCC 1560
TATTCAGGCC TTCAGCTGAG CAGATGAGAG CTGCCCTTTA AGAATGGTAA TCTATTTTAC 1620
TTGGTCTACC AATTTACACC CTCACAGGCA TACCCAGAAT AATGTTTGAC CAAATATTTG 1680
GGGCCCCCCT GGCCTAGTCA AGTTGACATG TAAAATTAAC CATCACAGAG AACAAAAGAA 1740
ATGTAAAACA GGTAGACTAA ATTGAAAACA TACAATGAGA TGGTAAATTT ATACCTAAAT 1800
ATATCAGTAA CTTCTGTTGA AAATAATCAA GAAAAAGAGA GATTGCACAA ATAACCAATG 1860
TCAGGAAAAA AAAAAGATTA ATAACTCCAG ATCTGCAGAG ATTTAGATAA TAATAGGATA 1920
ATATAAACAA CTGCAAATAA ATTTGAAAGG TAGGTAAAAT GGACTGATTC CTTTGAAAAG 1980
TAACATCAGA ATGCACTCAA TGAAAATTAG AAGTTTGAAT AGCCTTGTAA GCATTAAAAA 2040
ATTGTATATG ATCTTTTCAC AAAAACAAAA AAGTCCAGCC CAGATTGTCC TTCAGTGGTG 2100
TGTTCTGCCA AACGTTTAGG TATGAAGTAA TTCCAATCTT ATGCAAACTC TACCAGAGAG 2160
TAGAAAAAGA GGGAGCATTT AAAAAATACT AAAATTATGA GACTTGTAGC AAGATCTCGA 2220
AACCTAAACC TGAAAAAGAC AGGACAGTAA TGAAAAGGAA AATTATAGGT CAATTTCACT 2280
TATGAACATA GATGCAAAAA TCTTCAGCAA AATAATAGTC AACAAAATAG TAATATCTCA 2340
CTTATTTGTG GGATCTAAAA ATGAAAACAA TTGAACTCAT GGACCTATAG AGTAGGAGGA 2400
TAGTTACCAG AGGCTGGGAA AGGGAGTGGG GAGTTGGAGG GGAAGGTAGG AATAGTTAAT 2460
AAGTACAAAA AAATATAGAA AGAATGAAGA AGACCTACTA TTTGATAGTA CAATAGGGTG 2520
ACTATAGTCA ATAATAACTT AATTGTACAT TTTAAAATAA AGAGTGTAAC TGGATCGTTT 2580
CTAACTCAAA GAACAAATGC TTGAGGGGAT GGACACCCCC TTCTCCATGA TGTGCTTATT 2640
TCACATTGCA TGCCTGTATC AAAACATCTC ATGTACACCA TAAATATATA CACCTACTAT 2700
ATACTCTCCC AAATTTAAAA AGGTATGCAT TAATACATAG AAAGCCTAAT ACATCATGAC 2760
TGTATAGGGC AGGAATACAA TGTTGATTTA CATTTCAATC AGTATAACCT ACCACATTAA 2820
TAAAGGAGAA AAATCTGTGG TCATCTCAGT AGATACAGAA AAATCTTTTG ATAATTCAAC 2880
ATCGATTTGT TGTAAAGATT CTAGGCAACT AGGTATAGAT GGGAATTCAT TGCTACAAGA 2940
TAACATTTTG GTGACAAGAC ACATTCCTGC TATCACTACT TCTACTCATC ACTGTACCAG 3000
AGAGCTCAAT AAGAGAAATT AAATGTATAA GGCTTAGAAA GAAAGAAAGA AAGTTGTCAT 3060
TATTTGCAGA TGATCTAATT GTGTGTTTAT TTTGATTTTC TACATAAAAT AATAGGTTAC 3120
TAGAATTAAT AAGAGCGCTT ATTAAATTTT CTGATGATAA AAATAAATGT GAGAATATCT 3180
TTTCATTAGA TCAGTAATGA ATCAGAAACT AAAATTTAAA AGAACATAGC TTAAAATAGC 3240
ATAAGAAGTA TCTATTCTCT AGAAAAGACA TGTAAGAACT TTACAGGGAA AAATTAAAGT 3300
CTTTGTTGGG TAATGTTAAG GAAGCTGTTA ATGAATGGAG AGATATGCTA AGTTTGAATT 3360
AGCAAAACCG ACATTTAAAA AATGTCAATT 3390