EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-00523 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr1:39573270-39577130 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs2036465chr139575982hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxo1MA0480.1chr1:39573846-39573857AGTAAACAGGA-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:39575167-39575182TGAACTCCTGACCTT-6.04
Number of super-enhancer constituents: 22             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00416chr1:39568050-39577502Adipose_Nuclei
SE_03735chr1:39571776-39573697Brain_Angular_Gyrus
SE_03735chr1:39573746-39574178Brain_Angular_Gyrus
SE_03735chr1:39576281-39576673Brain_Angular_Gyrus
SE_04510chr1:39567727-39574980Brain_Anterior_Caudate
SE_04510chr1:39575870-39577000Brain_Anterior_Caudate
SE_08603chr1:39567660-39575003Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09028chr1:39573127-39573664Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_25799chr1:39570930-39577062Duodenum_Smooth_Muscle
SE_35822chr1:39568103-39574478HMEC
SE_35822chr1:39575702-39577050HMEC
SE_36947chr1:39568058-39574856HSMMtube
SE_36947chr1:39575573-39577214HSMMtube
SE_37973chr1:39568032-39575091HUVEC
SE_37973chr1:39575247-39577139HUVEC
SE_42256chr1:39569314-39574179Lung
SE_42256chr1:39575804-39577057Lung
SE_45768chr1:39568098-39577151Osteoblasts
SE_47164chr1:39571117-39577180Panc1
SE_54583chr1:39568298-39577059Stomach_Smooth_Muscle
SE_64261chr1:39568162-39574871NHEK
SE_64261chr1:39575092-39577047NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr13957596939576116
chr13957612839576627
chr13957546139575560
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I039109chr13957507039577046
Enhancer Sequence
CTTATGGAAT TCCTGCATTT TCCAGACTTA GAAATCCCCG TACTACCTTA ATAGGAGAAC 60
AGTTTGTCTA AGCAGAGGAG TGAGCTGGAA TCTATAGAGT GACCAGGGGA AGGAGTTTGT 120
GAGGATCATG CCACGTATTG GTTTTGGAAA GAGATGGGAA AATAGATATT GATGATGGTG 180
GGGTGTTCTA GACCCTTATT GGCTGGTCAC CACATTACTT GGATCTCTCT CTGCTGCTAT 240
TAATTTGTAG TCACCTCATT ATACAGGCTG AAGCAGGATT TTTATATGCA GAAGGAGAGC 300
TAAAATTTTC AGCTGCCTAA ACTGCCCCTA GGGCCAATGG GAGAAGGGCA GTAATGTATT 360
TGGAGTGTGA GGGAAGCAGA GCTGTGTGTA GTGCAGCTGT ATTAGGAATG GTAGTCAAGT 420
ATGGGTTTTC CAGAACTGTG CTTGGCAACC ATTTTTTTTT TTTTTTCTGT GTGGTGGCAG 480
TGAGCATGGT CTTGGCAGGA TTAGATGATT CAGCATGGAA ATAAATGCTC TCCCTTATTT 540
CCTAAATGTC CCAAAGGTTC TTTCAGATAG CTGGCCAGTA AACAGGAGGC ATTAGATAAT 600
AACACTGGAT TCTAACAGTT CAGAGTGGGC AGCAGCCAAG AGAACCAGGG TATATCCTTC 660
ATTTCCCCAA TTCTCTGACA GTCATTAAAG TCTCTCTTGG AGGTGCCACA ATGTTAGATG 720
CCAGAATTCT GAATGAGATC TGGTTCCTGC CCTTGGTTAT TCCATCTAGT AAGGGAAAGA 780
TACTTGCAAA CAAGTAGTTG TCATACTGTG ATAAGTGCTA GAACAGAGAT AGTATGGAAG 840
CCAGAGGAAG GCTGAAACCC TATTTGGATT TACCTGGGAG ATTTGACAAA GGAGGTGACA 900
TGAGAGGGTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT GAGACGGAGT CTCACTCTGC TGCCCAGGCT 960
GGAGTGCAGT GGCACGATCT CCACTCACTG CAAGCTCTGC CTCGCGGTTC ACGCCGGAGG 1020
AAATTAAGAA GGAATAGTCA GGGAGGTAGG AGAACCAGGA TTTTATTCCT CTCCTAGGAT 1080
AGAGACCAAC TCTACTGAAG AAGCAGGTCA CATATGAGCA TAGTTTTAGG TTTTAAAGAG 1140
GTGGTTAAAA ACCAGCACAC TTGGTTGATG GTGGTTGGTT AAGACAGAAT TAGACTTTTG 1200
TTTTCACAAA GCTTTAAGGA CTAAATAGTC TTTACTTGCT GGGCTGGGCT AGGAATAAAA 1260
GAGAACATTC ACATTTCAAC ATTGGTAACA TCTATCTGGT ACTTATGAAA TTCAGAATTG 1320
TCACTAAGTG TTGTGGGTTA TACGAAGCTA GTTAGGACCA ATTTTCATTT ATCCTAGTGC 1380
AGAAAATAAC TTATAAAACT TACTGCACAG AGGGTTACAA GTGAAGAGTC TGCATATTAC 1440
TTAATGTACA AAATTGATAT CGTAGAAAGA CTATGCTTTG GATTTCTTCT GTTGTGGGCT 1500
CCAGTCCTAG TTTTTGCCAG TTAATTTCTA CTGTGTGACC TTGGAAAAGA TTTCTCTCAT 1560
CTTTTGGGTT TCTCATCTGT TAAAATAGGG ATGATAATAC TAATTTCTTG GGATTCATGA 1620
GAATATAAAT GAGCTCTGGG CATATATTTG TCCTTTAATG TTCCATTTTA TTTTACTTTA 1680
CTTTATTTTG AGGTGGAATC TTGCTCTGTT GCTCAGGCTG GGATGCAGTG GCACGATCTC 1740
ACCTCACTGC AACCTCTGCC TCCCAGGTTC AAGCAATTCT CCTGCCTCAG CCTCCTGAAT 1800
AGCTGGGATT ACAGGTGCAC GCCACCATGC CTGGCTAATT TTTTCTATAT TTTTTTTTAG 1860
TAGAGATGGG GTTTCACCAT GTTGGCCAGG CTGGTCTTGA ACTCCTGACC TTGTGGTCTG 1920
CCTGCCTCAG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT ACAGGCGTGA GCCATTGCAC CTGGCCTATT 1980
TTATTTTTTA ACTCTTTTCT CTCCTTTTTT TTTTTTCTAT CTCCTACCAG AAGGAACCTT 2040
TAATGTTTAG AAAAACGTTG ATTTATATCT TATTTAAGCT TTATAATATC CTGAAGGATA 2100
GTATTACACA GATGAATAAA TTTAGGCACA GAGACTTAAA ATTACTGTCT AAGAGCCAGG 2160
CTCCAGATTT CTGGGTGAAG GTTTCACATT GTATCACAGA AGGGAGTTTT AAAATCACAG 2220
TAGATGACTT GGGCTAAGTG AGAAATTGTG AAAATGCTTT AATTGTTAGT ATCATTATTG 2280
TTGTTAGTTT TAGTTTCTGA AGTATAGTCA CACACTTTAA GTGACATACA TTTCCAGATC 2340
TCTGAACTGT GGAGAATTTC TTTTCCCCTT ATTATGGGAG AAGTTTTACG ATATATAAAT 2400
CACATTGAAA TTTTCATACA AAAATAATAC AAAATAAAAT AAAATACAAA AAATACAAGA 2460
AATAAATACA AAAATAATTT TTAAAATAGT ACAAAATGAT GAAATTTTGT TAACACAGTG 2520
ATTGGAAAAT ATGGGTTGAG GATTTGGGAT TGTTTACCTA AGTGACGCTC TGAAGCAACC 2580
TTTTGGTTAT ATGTAGATTC AGCTTATTTA TCCTTTTTAG TGGATGTTGT TCTTTTTTTT 2640
TTTTTTTTTT TTTTGAGACA GGGTCTTGCT TTGTTGCCCA GGCTAGAGTG CAGTGTGGTG 2700
AGATCAGGGC TAACTGCAGC CTTCACCTCT CAGGCTCAAG TGATCTTCCT ACCTCAGCCT 2760
CCCAAGTAGC TGGGACTAAC AGGCATGTGC CACCATGCCT GGCTAATTTT TAAGTATTTT 2820
GAAGAGAAAA GGTCTCACTA TGTTGCCCAG GCTGGTCTCA ACCCCCTGGC CTCAAGTGAT 2880
CATCCTGCCT TGGCCTCACA AACTGCTGAG ATTACAGGCT TGAGCCACCG TGCCTGGCCT 2940
ACACTCAGTT TTTAAGTTCC TTTTTAGATC AAAGTCCTAG AGTTGGAGTG GATAGTTTTT 3000
AGCCAGAACA AAAGAGTAAG TGCTACTTCT GGACATGAAC ACTGTTAATT CAGAAAGTGA 3060
GTCAAGTCAG TCTGCTGGGA AATCACAAGT TTTGGCCACA TTCATGCTGT TGAAATAATA 3120
AAATGTGTCC ATGTGCTAAC AGTGCTTATG GGAGCTACTG CCTTGTCTTG GGCTTGTTGG 3180
CAAATGACGT AATACAAACC AGGGAAATGC ACCAGCGTAA GCCTATTATA CTGGTATTTT 3240
TCAGTGCCAA TTCCAGGTTT AAGAGATCAT GGTGGAAAGA ATACTTCAGA GTGCATATCT 3300
GAGAACAGAA ACATCCCAAG ATCAAAAGTC ACAAATGAAC AATTATAGAT TGTAAGGAGT 3360
CTGTTGTGTT TTCTCAGTGT TCTTGAAAAC ACCCAGTCTT TACTCCTTTT TCTAAGTAAG 3420
GTTGGCCCTT TCAGCTTCTG ATAATTATAT ATTGAGCCAT GTTGTGACTA GGTTGTATGG 3480
AATGCTAGAG CTCCTGTTTT TACTCTCATG GTTTTGATTG GAGTTGAAGC CTCTCTCGTC 3540
TGGCTTCTAT TGGTGGCATT TACTAATTTT CTGGCCTGGT AAATGGCTTG TGGTAGCTAA 3600
GAATGTTTAT TCCAGTTTTT TGGAGACAGG GTCACCCATG TCAGAGTGCA GTTGATACCA 3660
TTGTGTAGCT CACTCTAACC TCAAACCCCC GGGCTCACAT GATCCTCCCA TCTCAGCCTC 3720
CGGAGTAGCT AGGATTAAAG GTGCATGCCA CCATGCCCAG CTAATTATTT TATTTATTTA 3780
TTTATTTATT TATTTATTTT TGGAGACGGA GTCTCACTCT GTCACCCAGG CTGGAGTGCA 3840
GTGGTGCGAA CTCGGCTCAC 3860