EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-00400 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr1:28572720-28576650 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:28575155-28575174TGGCCTGCAGGGGGCGTTG+6.36
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:28576301-28576319TGAAAAAAGGAAGGAAGG+6.84
Gfi1bMA0483.1chr1:28575846-28575857AAATCACAGCC+6.02
Nfe2l2MA0150.2chr1:28575358-28575373CATAATGACTCTGCA+6.15
PHOX2AMA0713.1chr1:28575669-28575680TAATTGAATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr1:28575669-28575680TAATTGAATTA-6.14
RUNX1MA0002.2chr1:28573301-28573312AAACCACAGAG-6.14
SNAI2MA0745.2chr1:28572942-28572952AACAGGTGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr1:28575393-28575404TTCTTTGTTTT-6.62
Sox6MA0515.1chr1:28574936-28574946AAAACAATGG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
SE_15081chr1:28571965-28577001CD4_Memory_Primary_7pool
SE_21005chr1:28572183-28576988CD8_Memory_7pool
SE_29182chr1:28569155-28576849Fetal_Intestine_Large
SE_40167chr1:28572835-28576978K562
SE_64750chr1:28572499-28577008NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr12857601228576248
chr12857355328576556
Enhancer Sequence
CGGTATATAA ACTTATATGC TATAAAAATA ACCAACATGT TGGTTTCTCT TTGTAGTGCA 60
ATTGGGATTT GAGGGAGTTC TCCCTTCTCT GTTTAAAAGG ATCTCTTTAA AAAACAACAA 120
ATGTAATACA ACTTAGCACA TAGATAGATA TTAAATAAGT GTATTATATA AAGAATCTTA 180
AAACTTCTCC CTTCTCCGTC CACCCCAGAG CTAACCAATG GTAACAGGTG CAAACTACAC 240
ATCTTTCCAG ATCTTTGTTT CCTCTGTGTA ACTATGTATA CAACTATGAG ACTGTTCTAT 300
ATGTATCATT GCGCAACCTC GGTTTTTGCT TCGTTCTGTT TTAACCTAAC AGGAAATCCT 360
GCATACCTTT CCATTTCAGA GCACTTGGAG CTACCTTCTG TTTCTTTGCT GTAGAAGCCG 420
TTGTGTGAAC AAATCCGTTT ATTTCTCTCA TCAGTCTCCT TTGATAGACA TTTGGGTCAC 480
GTCCGGTTTT ACGCTTTTAC AATACATCAG TGAACAGCAG TAATACGAGC TCAAGACAGA 540
AGGCCTGAAA AACATTGAAA AACACAGAGA CGGAAAAAAA AAAACCACAG AGGGGGAAAT 600
ATAATTTCGG GTTATTTCAG TTTCACCTTT ACACTTTGTT ATATTCCACA TTTTTTGCAA 660
TAAATATAAA TTTGGAAGTA AAAGCATAAA ACGAAAATCA AACGATTGAT TGATTGATTG 720
ATTGACTGAG ACGGAGTATC ACTCTCGTCG TCCAGGCTGG AGTGTAGTGG CGCGTTCTCG 780
GCTCACTGCA ACCTCCGTCT CCCGGATTCA AGCGATTCTC CTGCCTCAGC CTCCCGAGTA 840
GCTGGGATTA CAGGCGCCCG CCACCACGCC CGGCAAATTT CCAAACGTAT ATTTAAAAGA 900
AGAAAAGGAA AAGAGGGGAA AAAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAAAGAAAT TAGAAGCAGA 960
TGGGGCAGTT CAGCCTCTTC TCGCGGAGCG GGGCTAGACG GAGTCAGGGG CGGACCGCCA 1020
CAGCCTGCAC CAATCAGGAC CCGGTTGATA GGCAGAGCCT GGCGACTTCG AAGACTCGCC 1080
CCCAGTCAAA GAGCCCCGGG GATTCGTTTC CGTACGCAGC CTGGAAACCA GCCTGGGCCT 1140
ATCCTGCGCG CCGCTGCGGG CTACTATTGG CTGCCAAGAA ACCCCGCCCA TCTTCCTGCT 1200
CATTGGCCGG TGCGGTTTAC GTAAGAGGAG CCTGTTGCTG AGCGAAAAGT CTGTTCTGCA 1260
ATTTTCGCTA AGGAGTTGTT AACGCTGAAA CCGCACTGGG CGTCCTGGGG TCAAAAAAAC 1320
AATACTAGCC ACAGTTTATT AAACTGCAAC TAAATGCCAG GCTATGTGCG CCAAACTTTT 1380
AATATTAATG GTTGTAGGCA CCTTTCTTGA ACACCCACCA CTATCAGCCA GTCACTGAGC 1440
CAGATCCTTC AAAATAACAG TAAAAATATA GATAATCTAC AGTTTATTGA GCACTTCATC 1500
TGCATCAAGC CTTGTTAAGG GGTTTCCATG CATAAGCTCT CATTCTCACA ATAGAACGGT 1560
GGAGGTAAAC TATTGCCCCA TTTAACATTT AACATGCAGT CCTGTAGACC CAGCTACTCG 1620
GAAGGCTGAG GTGAGAGGAC CCAGGAGCTC CAAACTTAAG TGAGCTATGA TCGCGCCACT 1680
GCACTCCAGC CTGGGCAACA GAACGAGACC TGTCTCAGAA AAACAAAAAC GTAATAAAAG 1740
AAAAACAAAA ACAAAAAAAC AGGAAACGGG TTCAGAGAAG TGAAGTGTTT TGCTGAGGTT 1800
CACAAAGAAA GGGTTGGAAC TGGAACCTTC AACTCCGATA TCCTGATTCC AAGTGTGGCC 1860
TTTTTAGGGA GGGGGTCGGG GTACAGAATT CCGCTGGGGA TAGGGAAAGG TAGGACAGGA 1920
TGGTGGGAGG CCAGAGGCGT TGCTCCAGGG ACAAGCCTCA GGGTGGTTCT CTGAGAATAG 1980
GATGTATAGA GCCTCTAGGA GTGGAGGGTT GGGGAAGGAA GGGAGACCAG AGGAAAGGGA 2040
GAAGTTGTTC TTTCTGAAAA TGTGAGGCTT CTCTCCTGGG GCAGCCTATT AAGGTGTAGG 2100
TAGCCCTGGA CCTCGAGATT CTAGTCTCCA CTCTGTGGCC AACTTCCTAG GGAACCTTGG 2160
GCAAATTCCT CTCTCTCGAC CTGAGGCTTC CTGCCTTGTA AGAGAGGTAG TAAGCCAAAA 2220
CAATGGAAAG TGCATTCGGG CTGTGAAGTA TTTTAGGACT CTGGTCCTTG CTGGCAGCAG 2280
GGGGAATCTT CAGCAACCAC AGACCTTTAC TTAGCTGTTG CCTGGCCTCT TTTCAAGACC 2340
TTCAGGCGGT GACATGGACC CTAACAATCC TATAAACTCA AAACGGTTTG GGCCAGCCCT 2400
TTCCTACTCC ATTCTGACTT AGCTATAGCA GGATCTGGCC TGCAGGGGGC GTTGAGGAAC 2460
CACTCAGCCG ACAAAACTAA ACTAAATCAA CCAAGCAATT TGCCCAAAAG CACCCAGTGC 2520
GTTAGTTTTT GCATTTAAGA AGGGTAAACG TTTCCAAACC TGAAGATTTC TGTCCTCAGT 2580
ATGCAATCGA GAAGACGAAT TATATACACT GCCAGTTCTT TATGGCACCA GTTCTCTCCA 2640
TAATGACTCT GCAAGTTTAG AGCTAATTTC TATTTCTTTG TTTTACAGAT AGGGAAACAG 2700
ATTCAAAGAG CTGGAAAAAA AAAATTCAGT TTGGGTTACT TGGCTAAAAG CTGGCACCCG 2760
AATTGCCTGA CTCCTGGGAA GTGCTCTTAG GAGATAGTTG GCTTTGTTTC TGGGAGTCTG 2820
TGGTTGTACT GCCTGCTAAT GCACAACTCC AAAGGACAAT TTTGGTTGTG TAGCTTGACA 2880
GCTCGGCACC TGTCAGCTCT GTGCAGGAAG GACCTCCCTC CCCACCTAGC ACAATGCCTG 2940
CTTCATGAGT AATTGAATTA ATGTGTGACT AAGCCTTGAA GGATGGGTCT TCTTTGGCTT 3000
TATCAAACCA ATTGGAGTGG AACTTCTTTC CTGAAAGTTC CCCCTGGGCA GGAATTGTAT 3060
CTGAGATTAG TGGGTGGGGA GGGGGGAAAC AATAAGAAGA GCTCAGAAAA TGACATCTGG 3120
GGTGATAAAT CACAGCCCCC CGAATGGTCC CATTACAAGG TCATTATAGT AAAGTGATCT 3180
CAGAATTTGA GACTAGAAAA CTAATTCAGG AAGAATGAAT ACAGAACAGA TGACAATCAT 3240
ATTAGGGTCA TAATCTGAAA TGGATCTAAG GCTGAAGACA TCTCAAAAAC ATTTCAAATC 3300
CAGTCTAGGT AGGTGTATCT TTGGGACTGG AAGGTGATTG AGGAATATAA ATAGCTGGCC 3360
AATCAGTGGC CTCAACATAG CTGATGCAAG AGTTGAGAGT GTGGCAACAG AAGAAGGAGA 3420
TCTTTACCCA ACCAAAAATA CAAGGCAGTG GGGAGGGGAG GAATGTGCCC AGCCAGTGGC 3480
ACCCTGCCAT GCCCTGCTAG GCTGCTAGCT TCACCACTGG ATTTCCCAGA GCCAGGCACA 3540
GTGCCTGGTA CACACAAGAT GGTAAATAAA TATTTATTGA ATGAAAAAAG GAAGGAAGGA 3600
ACTGGAGCCC TGACCAGCAG ATAGTTGCTG AGTAGAGCAG TTCAATAATT CGTCCTTTCA 3660
CTTGCTCAGA TTCCAGCTGC CTTAGCCACC TTCAGATGAT AAATTTGCCT TTCAGTAAAG 3720
GCTCTCCTAC AAAGAGGAAT GCCCTGGCCT CTCAATTACA GGTCGCTTGA CAGTTATGTT 3780
TCTCACTTCC AATTAATATA TCTGCTTTAA GCATCAGTTC CTTTTGCCAG CCGGCTTCTT 3840
ACATATTCAT GTGTTTGTCT CATCAATGGA GTGGTGGAGT TTCTGCATAG GAGTCATTCC 3900
TGCCTGGGTT GGAATCCTTA CTCAGCATAT 3930