EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-00240 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr1:19250560-19253550 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:19251175-19251193GGAAGGAAGGCTGGAGTG+6.37
ZNF263MA0528.1chr1:19251733-19251754CCTCTTCCTCTCTCCTCCTCA-6.18
ZNF263MA0528.1chr1:19252859-19252880GAAGCAGGCAGGAGAAGGAGA+6.1
ZNF263MA0528.1chr1:19251739-19251760CCTCTCTCCTCCTCAGCCTCC-6.23
ZNF263MA0528.1chr1:19251730-19251751TCCCCTCTTCCTCTCTCCTCC-7
Number of super-enhancer constituents: 32             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01018chr1:19248092-19251465Adrenal_Gland
SE_01018chr1:19252579-19254307Adrenal_Gland
SE_01970chr1:19247032-19252407Aorta
SE_01970chr1:19252523-19257157Aorta
SE_05988chr1:19246801-19251768Brain_Hippocampus_Middle
SE_05988chr1:19252374-19255926Brain_Hippocampus_Middle
SE_08107chr1:19247233-19251717Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_12029chr1:19252618-19255373CD3
SE_14542chr1:19249621-19251996CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14542chr1:19252384-19255629CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17874chr1:19248896-19256964CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18508chr1:19248071-19257402CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19155chr1:19249074-19251617CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19155chr1:19252273-19256975CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_26830chr1:19247945-19251474Esophagus
SE_26830chr1:19252560-19255286Esophagus
SE_30281chr1:19249947-19251083Fetal_Muscle
SE_30281chr1:19252489-19254534Fetal_Muscle
SE_33643chr1:19248059-19252156H2171
SE_35893chr1:19247868-19251482HMEC
SE_35893chr1:19252381-19255666HMEC
SE_38219chr1:19247806-19251800HUVEC
SE_38219chr1:19252084-19255853HUVEC
SE_42513chr1:19247474-19252218Lung
SE_42513chr1:19252368-19257164Lung
SE_47330chr1:19252465-19257219Panc1
SE_47564chr1:19252625-19253241Pancreas
SE_53460chr1:19247615-19251818Spleen
SE_53460chr1:19252387-19255462Spleen
SE_64648chr1:19252638-19255298NHEK
SE_65885chr1:19248222-19251293Pancreatic_islets
SE_65885chr1:19252418-19256447Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr11925322019253400
chr11925303419253391
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I018925chr11925209619256859
GH01I018921chr11924790119251893
Enhancer Sequence
ATGTGGACAG CAGCTGGCTT GACTGAAGAG CCTGTCGCCC GCCCTGACAT CCCTCCCGGC 60
GGTGGTGGAG AAAACCTGGC TCCGCCAGCT CCAGTGTTGA CAATGCAGAA AAGCTCTGTC 120
CTTGGATCGT TCTGAGGACT GGCATGAAGG GCCAGGTGGG CGATGTGTTT CTTACGGCAC 180
TCCAGACACC TGTATTCCCT GCCCACCCAC CCAGAGCCAG GGAGCACTCA GCTTAACTGA 240
GAACTGGTGA ACCAAGTTGC TGGCACAGAG ATTTCAACAC CAGCTTCCCA AGCACAACCC 300
TCCCTCTTCC CTGGGTCTGC CCACAAGAGT AAGGTTTCAG TGGGGAGGGT GTTTCAGGCA 360
GAGGGACCAA CAGAAACAAA GAGGGCAGCA GGAAGGGACA GGCCAGGCGC TGTCTGCCAC 420
CAAGAGGCGG GTGCACCTAC TTTGGATCAG CGGTTTGCAG ACATCGTTTC CTTTCAGCCT 480
GCACCATCCC CTCTCCCAGC CCCAGCCCAT GGCTGAGCAA ACGACTTGCC CAAAGACTGC 540
CTAGGAAGTG GCAGCGCCTG GATTCGAACC CAGGTCTGAC AGAATCCTAC GCCCGGGCCC 600
TTTAAGGCTG AAAGGGGAAG GAAGGCTGGA GTGAACATAA AGAGATCACT TTTGGGGCAC 660
AAAGGCCATT TTCCTCGAGT CTCCCTCAGC AGTCCAGGAG CTGTTCTGTT GGCTGGGGAG 720
GGGTCCTTTC TGGTCTTTTG AAGACTCCAG AATATTGACA GGCCTGCCAC TGGCAGAAAA 780
TGAGGTGACA AACACATCCC AGTGCTCTCT GCAGGGCCTT TCCATAGATC CCCTCCATCA 840
TACTGCACAT GCACTGGGCT GGAAAGCTAC CCTGTCCCCA CTTTACAAGT GGGAAAATGA 900
AGACCCAGGG CCTATGGACA ACTCCAGCCA CGGCTGACAC GGCCTGAATC ACTGAGAGCC 960
GCCCCTGCCC ACCCTGACCC AACAGCTCAT AAAACTTCCA AATCCTTCTC TTTTCTAGCG 1020
CTGGATGAGA GAAGGGACAT TTATTGATTA CCTTCTCGGT GGTATCCACC ACATTAGGCA 1080
CTCATACTTC CCTCTATAAA ATCCCGCTGA GCCCTCCCCT GGGGATCATC CCCATGTTGC 1140
AGATGAGGCT CAGAGGTCAG GTAACTCATT TCCCCTCTTC CTCTCTCCTC CTCAGCCTCC 1200
TGAAACCCTA GCCATTCTCC CAGGCTTGTC TCAAATGTCA TCTCTTCCCC AAGCCTCACA 1260
TCCACTTCCA TTGTTTGCCC CACAGCTTAA AGCAGTGGAG GCCCCAGGAT CTCCTCTTCC 1320
CCAGTGGCAT GGTTGTGGGA TCCCACGGCA CACAGCTCTT GCCCAAAGGA GCCAGTCCCG 1380
TGACGCCAGG GCCAGTGATG GCTCCATTGT GTGGTCACCG CCACTTCCAC CTTCCCCACC 1440
GCCACCGGGG GCTGGCACTC ATCTCGGGAG GTCTCAGGCA CAGAGATGGG GCAAAGAGGA 1500
AGCAAGAGGC AAGTTCCCTG GTCTAGGTGG GAAAACAGGC ACAGGAGCCG GGTCTCAGGT 1560
CGGGGGTCCA GTCCTTCTGC AGGCCCAGAG AGCTGGTTAT GATGATCATT CCTGTGCTTG 1620
CTACTGTATT CCCTGCACCT CAAACTGGCT GGGCACTTGC TAAGGAGTCA GACATTTATC 1680
GAATGGATTG GTTGGATGGA TGGATGGATG GATGGATTGG TTGGATGGAT GGATGGATTG 1740
GTTGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATTGG TTGGATGGAT 1800
GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGGATTG GATGGATTGG TTGGATGGAT GGATGGATGG 1860
ATGGATGGTT GGATGGATGG ATGGATGGAT TGGTTGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG 1920
GATGGATGGA TGGATTGGTT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT 1980
GGATGGATTG GTTGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATTGG 2040
TTGGATGGAT AGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATCCAA AGCTGCACTT 2100
ACTCCTCAGT GCCCTGATGG CCCTCGCCTC CAGACAGAAC TCCTTTCCCC CAGAGCATCC 2160
TTAGACTGAA CATCCCAGCC CAGGGGCTCA CAGGAGGCAA ATTCCCAGCA TAGCCCCTGC 2220
ACTCAGCTTC ATCCATTCGG CTCCAGAGCC TCTCCTGGGA GAGGCCAGGC CAGGCCAGGG 2280
GGAGGGATGG CCAGGGCAGG AAGCAGGCAG GAGAAGGAGA AACCTTCCCT TTCCCACTTC 2340
CCACAGCCCT GGGCCAGGGA GGGGAGGCAG GGATGTCAGA ACAAAGAGTG CAGGGAGAGG 2400
AAATGACTCC ACAAAAGCAC AAAGCAGCTG AGATCAGGGG CCTCGGCCAC CATCTTAGCA 2460
GAACAAGCAC TCTCTGAGGC TGGTGGCCAG GAGGGAGAGG TGGCAGCACC ACCCCAGCCA 2520
GATGTGGTCT CTCCGCATTC CTGAGGAGCC ACCACTGGAA CCACGTGAGG GACGAGAAGT 2580
CTCTGCTGGC CTCTGGGGAA AAGGGGTGGG CAGATTCTAT GCCAGTCCCC ACCCCCACCC 2640
CACTCAGGGC CAGTGCCTCC CCCTCTCCCG TCAGCTCAAG ATGACACACA GACCCGCAGG 2700
AAAGGGACCG ACAAGCCTGC CCTACAGAGG GGCGGAAACC CAAGCTGAAG TCACCAGCAG 2760
AGGGGCTGAC TCACAGATTT TTCACTTCCT GTGCAGTCAG AAAAAGAGGC TCGAGGCTCC 2820
CGCTCAGGAG GAAAGTAGGT GCAGGCCCAG CAAAACAATG AAGCCCTCCA GGGACGAACC 2880
TGGGGCTCCT GGAGTGAGCA TCCCAAGACA CCAGGGCAGC AAGAGACGGG TTCAAATCCT 2940
GCCCCATCAC TTCCCAGTTG CGTGATCTTG AGCAAGTCAG TTACCCTCTC 2990