EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS128-00192 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF-7 
Coordinate
chr1:16512560-16515000 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:16514416-16514435TGCCGCCCTCTGGTGGCTG-8.01
FOSL1MA0477.1chr1:16514795-16514806GGTGACTCATG+6.62
JUNDMA0491.1chr1:16514795-16514806GGTGACTCATG+6.02
TP63MA0525.2chr1:16514924-16514942AGCATGTTGGCACATGCC+6.01
ZfxMA0146.2chr1:16512906-16512920CCCGCCTCGGCCTG+6.62
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23091chr1:16513017-16513608Colon_Crypt_1
SE_23091chr1:16514094-16514451Colon_Crypt_1
SE_23751chr1:16513063-16513471Colon_Crypt_2
SE_23751chr1:16514119-16514463Colon_Crypt_2
SE_24743chr1:16513042-16513547Colon_Crypt_3
SE_24743chr1:16514042-16514476Colon_Crypt_3
SE_26540chr1:16512848-16513779Esophagus
SE_26540chr1:16513910-16517815Esophagus
SE_34268chr1:16514127-16516193HCT-116
SE_34628chr1:16512910-16513730HeLa
SE_34628chr1:16513819-16517068HeLa
SE_36144chr1:16514154-16516161HMEC
SE_47150chr1:16512880-16515228Panc1
SE_50427chr1:16512935-16513663Sigmoid_Colon
SE_50427chr1:16514084-16516281Sigmoid_Colon
SE_56795chr1:16512885-16513659VACO_400
SE_56795chr1:16513668-16515000VACO_400
SE_64726chr1:16514111-16515805NHEK
SE_65472chr1:16514077-16514502Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr11651310716513257
chr11651414216514842
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I016186chr11651284916513779
GH01I016187chr11651384116516098
Enhancer Sequence
ATGGCTCACT GCAGCCTCTA CCTCCCAAGC TCAAGTGATC CTCCCACCTC AGCCTCCTGA 60
GTAGCTAGGA TACAGGCACT CACCACCACA CCTGGCTAAT TAAAAAAAAA TTTTTTTTTT 120
TGAGACAGAG TCTCGCTCTG TCGCCCAGGC TGGGGGGCAA TGGCGCGATC TCGGCTCACT 180
GCAAGCTCCA CCTCCTGGGT TCACGCCGTT CTCCCACCTC AGCCTCCTGA GTAGCTGGGA 240
CTACAGGCGC CCACCACCAC GCCCAGCTAA CTTTTTGTAT TTTTAGTAGA GACAGAGTTT 300
CACCTTGTTA GCCAGGATGG TCTTGATCTC CTGACCTCAT GATCTGCCCG CCTCGGCCTG 360
CCAAAGTGCT GGGATTACAG GCATGAGCCA CCATACCCTG TCAAAAAAAA TTTTTTTAGA 420
GATGATGTCT CACTATGTTG CCCAGGCTAG TCTCAAACTC CTGAGCTCAA GTGATCCTTC 480
TGCCTCAGCC TCCCAAAGTG CTGGGATGAC AGGTGTGAGC CACTGTGCCC GGCCTGGGCA 540
GAGCTCCTCC TGAGAGCCCG TCTGAGTGGG CTCGGGTACA GCACTGGCAC ATCCTCCGTG 600
TCTTCACTTC CAGCCTCTCA AGCTGTTGTG AGAATCCTGG GGGCTGGGGA ACATGCTTAC 660
ACTTTGAGCT GGAATCGCTG CAGAGCTAGG GTCGGGGAAG TTGTGATAGT CAAGGGCTTC 720
GGGGAGTAGG CCTAGGTCTG GTGGGTCTGG TTTCAAAGAA GCTCTGCCTT TTACTTGCTG 780
TGTGACTTCA GGCAAGTCAC TTCTCCTCTC TGAGCTTCCC TTTCCTTCTT AGTAAAGTTT 840
GGCTGAGTTG AACAGAACCT GCTCCTAGCA GAGTTACAAG GATTAAAGGG CATAATTGGT 900
GCCAATGGAG TGGTAAACAA CACTCAGTGC ACAGTGGCGG TGATTTTTAT TGTCCCCTTA 960
TTCAGTCAAG AACTTGGCAT ATCCGGGGCA GTGGCTCACG CCTGTAATCC CAGCACTTTG 1020
GAATGCCGAG GTGGGTAGAT CACCTGAGGT CAGGAGTACG AGACCAGCCT GGCCAACATG 1080
GCAAAAACCC ATCTCTGCTA AAAATACAAA AATTAGCCTG GCATGGTGGT GCATGCCTGT 1140
AATCCCAGCT ACTCAGGAGG CTGAGGAAAG AGAATCGCTT GAGCCTGGGA GGCGGAAGTT 1200
GCAGTGAGCT GAGATTGTGC CACTGCACTC CAGCCTGGGT GACAGAGCGA GACTCTTAAA 1260
AAAAAAAAAA AAAAAAGGGA GGCATGGGGG GCTAGGGAAG GGATAGCATT AGGAGAAATA 1320
CCTAATGTAA ATAGCGGGTT GATGGGTGCA GCAAACCACC ATGGCACGTG TATACCTATG 1380
TAACAAACCT CCATGTTCAA CACATGTATC CCAGAAATTA AAGTATAAAA AAAATTACAC 1440
CAATATAAAG AATGGATACA TTATGTGAGT TACTGTGCCA TGTGATAATG AAGTTCAAAT 1500
TGTAAATACA ACCACTAACT ATTTCTGTGA TTCATATTTT TATATAAGAA AAATAAAAAG 1560
AAGAAGAAGA ACTTGACATG AAGGACTGGG ACATCATAGG ACCAAGGGGG TGGTCTCTGG 1620
AGCCTCTGAG CATGTTTCAG ACTTAGGAAC CCTCACAGCT GAGGCCAGGA CTGGCCATGT 1680
GCTCCTGTCT CCAGGGCTCT ATGCCCTCCC TTCCCTCTAC CCAGCCCACT GCCCCTGCCC 1740
CTACTCCCTA CCCCTGCCCC ACAGACACAG CCAAGCCTCA GGAGGACTCA ACCCACAGGA 1800
ATGTGGGCAA TGAGCAGGCT GCGCTCGGAG GACCCCGCTA TCCCAGCCCT GGGCTCTGCC 1860
GCCCTCTGGT GGCTGGGCTG GGAAGGATGC TGCTCCCATT ACTGCCGTTG TAGAACCGCA 1920
ATTGCCCTAA AAAAATAAAA TGCTGTTGCT GCTACTCATG ATGATGACGA TGATGGCGAT 1980
GACGATGATG ATGATATTCA TTGCTTTATG GTTTGCCAAG TACCTTCTCC GTCAATCATA 2040
GGCTGCACCA AACAGAGTGC AGGGTTCTGG ACTGAAATCA GATGGGAATG TAAGTCCCTA 2100
GTCAAGTTCC AACTGATTAT GTGACCTTGG GCAAGTCATG TCACTTCCTT GAGCCTCAGA 2160
CTCCTCATCT GTGGAACGGG GTGACAAAAA TAGGGTTGTT ATAAGGATTA AAAGACCTAA 2220
CACCTGGCCG GGCGTGGTGA CTCATGCCTG TAACACCAGC ACTTTGGGAG GCCGAGGTAG 2280
GAGGACTGCT TGAGCTCAGG AGTTTGAGAC CAGCCCGGGC AAATGGTGAA ACCCCACCTC 2340
CACTAAAAAT ACAAAAAATA GCCAAGCATG TTGGCACATG CCTGTAATTC CAGCTACTCA 2400
GGAGGCCGAG ACTTGAGAAT CGCTTGAACC CAGGAGGTGG 2440