EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS127-15497 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Macrophage 
Coordinate
chr19:39182480-39186670 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs34105297chr1939184669hg19
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39186290-39186308CTTTACTCCCTTCCTTCT-6.07
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39184056-39184074GGAAGGCAGGAAGAAAAG+6.98
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39184712-39184730ACATCCTTCCTTCCTCCC-7.11
Foxd3MA0041.1chr19:39182542-39182554AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:39182546-39182558AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr19:39184184-39184196GAATGTTTGTTT+7.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:39185118-39185133TGAACTCCTGACCTC-6.22
RUNX1MA0002.2chr19:39184668-39184679CTCTGTGGTTT+6.14
ZNF263MA0528.1chr19:39186013-39186034CTTTTTGCCTTTCCCTCCTCC-6.12
ZfxMA0146.2chr19:39185143-39185157CCCGCCTCGGCCTC+6.01
ZfxMA0146.2chr19:39185758-39185772CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 77             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39182049-39186979Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39182076-39185083Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39185510-39187918Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39181993-39190228Aorta
SE_02408chr19:39181342-39185560Astrocytes
SE_02946chr19:39182825-39183824Bladder
SE_03166chr19:39182673-39184911Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39185728-39189384Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39182386-39185093Brain_Anterior_Caudate
SE_03903chr19:39185394-39193508Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39182350-39185068Brain_Cingulate_Gyrus
SE_04868chr19:39185423-39189876Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39182078-39206004Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39182428-39185106Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39182077-39185225Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07777chr19:39185584-39193917Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39182333-39191485CD14
SE_13194chr19:39183611-39184401CD34_Primary_RO01480
SE_13490chr19:39182874-39185111CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39183423-39184854CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39182491-39185050CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39181278-39188425CD56
SE_20865chr19:39183372-39185109CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39182642-39186831CD8_primiary
SE_23062chr19:39182731-39184965Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39185726-39186655Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39183074-39184903Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39185750-39186483Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39182754-39183899Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39183955-39185064Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39185730-39186728Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39180965-39189795Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39180697-39193852Esophagus
SE_27614chr19:39180632-39201469Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39181947-39185064Fetal_Muscle
SE_29583chr19:39185825-39186549Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39182626-39185071Gastric
SE_31384chr19:39185422-39186593Gastric
SE_34299chr19:39180509-39186508HCT-116
SE_34681chr19:39184216-39184943HeLa
SE_35430chr19:39183365-39184979HepG2
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39172838-39186932HSMMtube
SE_38012chr19:39181151-39186650HUVEC
SE_38896chr19:39182466-39184917IMR90
SE_40594chr19:39180727-39193965Left_Ventricle
SE_42097chr19:39180674-39193834Lung
SE_44161chr19:39181143-39185634NHDF-Ad
SE_44797chr19:39181919-39184905NHLF
SE_45660chr19:39180876-39186673Osteoblasts
SE_46686chr19:39182759-39183893Ovary
SE_46686chr19:39184055-39184894Ovary
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39182677-39185005Pancreas
SE_47461chr19:39185655-39186661Pancreas
SE_48075chr19:39180646-39186770Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39182415-39185026Right_Atrium
SE_48555chr19:39185073-39190229Right_Atrium
SE_49449chr19:39182454-39184953Right_Ventricle
SE_50056chr19:39182445-39193963Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39181521-39186773Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39182066-39185548Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39180899-39193971Small_Intestine
SE_53291chr19:39181227-39190272Spleen
SE_54534chr19:39180651-39189737Stomach_Smooth_Muscle
SE_56725chr19:39182441-39185071VACO_400
SE_56725chr19:39185122-39189741VACO_400
SE_57359chr19:39183289-39184322VACO_503
SE_57359chr19:39184333-39185048VACO_503
SE_58038chr19:39182547-39184962VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39182024-39185548HSMM
SE_64225chr19:39182411-39185099NHEK
SE_64225chr19:39185744-39186682NHEK
SE_65266chr19:39181937-39187543Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39182386-39185068H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr193918259439182977
chr193918414839184440
chr193918563039186442
chr193918249139184907
chr193918557039186200
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
TGCAGTGAGC CGAGATCATG CCACCGCACT CCAACCTGGC GACACAGCGA GACTCTGTCT 60
CAAAACAAAC AAACAAACAA AATCCGTCCT TTGCAGCAGC AACACGCACG CTTTCTGGCA 120
CCTCAAAGGG GATTGTCCAA GACTGGAACA CTGGCTGCAG GGAGGGGGCC GGGTGCAAAG 180
AGCTGGTTTC TGGGTGGACA CGCAGGACCT TTGGAATGCT CGCTACCCCA CTCAGCAGTA 240
TTTATACCTC TTCTCCAACT GCGAAGTCAG AGCTTTTTCA TGCAGGCTGA GAAAACTCCG 300
AATAAGGCAA CTTCAGGCCA GGACATAAGA CGCATTCCAT ATTTCACTGT AATTGCTTTC 360
AAATTAGGTT ATGTCGTCAT GTAACAGGCA CACACAGTGC ACTTGCTTTG CCCCTGGCTG 420
GGGTTGGGTC CTGGACAGGC TGCCCCGTGT GTCGCTGAAC TGCCGCAGTG CTAGCCCTGA 480
TTGCCTGGGC AGTAGGGCTG TCTGCGTCCC ACGTTGCTGC ACCCATCTAA TTTGTGGCTG 540
TGTTATTGTG ACCTGCTCGT TTTCTGTTCT TTCAACCTGC TTCCTGGCTT TTATCTCCTT 600
CAGAATCTGG TGGCAGTGGA TCTTCAAAAA GTGCTCAGGT GTGCAGTCTC ACAGGCCAGA 660
GGCTCCACGG GCCCCCTTGC CAGGGCGAGC ATCTCTGCCT GTGCCGCTGG TAACCCAGAT 720
TCCAGAAGGC TTAGCCGTCT GGCCCTGAAA GCGCCTTTAT AGTTGGTGAT GAAGCCCATG 780
GGCTGGGGAG CCGTTTCTGC TTTCAGGAAC TGAAAAGATG CCCCAGTGGG GCTAGGCCTT 840
GCCTGAGGTC TGGCAATAGC CTGCCAGATG GGTGATAAGA AGGCCTACCC AGGTGATAAG 900
CCTACCCAGG AATAAATAGC TGTACCTCCC CTGTGTCCAA GCCCTGGACA CCCTTCCCTA 960
GGACCCATGG AAGCAGGAAC CATGGGCAGC GTCAGAGGCC ACAGCAGGCA AGGTGGAAGT 1020
TCAGGAGGTG GGACGGCGCC CTCCCCCTCA AAGCAACTGA TGCCCCAGCG GAGCGACAAA 1080
CCCTACACGG TATTTCAGAG CCAAGGTTTG AAAACTCCCA GGGTGCTAGG GAGCTCCGTC 1140
TGGCCTCCGG GTACCTGGGG TTGGGGCTGG CTGTGGCCAG TTGCAGTCAA CCCTGAGCCT 1200
GGGCAAAATG CATGCAGGCT GGTCCTCCTG GGTGATATCC TGCTAGGCGG GTGGGCAGTG 1260
TACACGGCAG AAGAGGGTTG CGGCATGAGG CAGCAAACGT TTTTTTCTAA AATCTTGTCA 1320
AGCGTGGGGT CCGTGGAATC CACATGTGAG CATCAGCCTG GTGGGTGGGG AGAGTGAAGC 1380
CTGCGATCCA GTCTGGATCA TGTGCTACAC AGTGCAGAGC CGGCATGCTC ACCCCTCCTG 1440
AGGGATCGCT CGAGCCTATT TCTAGGCCCA AAGCGACTTT GCAAGAGACT CCCTTTATTC 1500
TGGGCTTAGT GGAATTCCAG CTTCCAACAG CCATTTCCCT CCACCCCCTT CAGTTCTGAG 1560
AACATGTTTT GTAACAGGAA GGCAGGAAGA AAAGAGAAGG CGAGTTTGTT CAGCTGGGTC 1620
AGCCGCATCC CACCAAGGCC CTTTCTTCCC TCCAGCTCAC CATCGCTCTG CCCACTGGAA 1680
CCACTCGGTT GCCCTGTGTC TGCCGAATGT TTGTTTCTTA ATCAGCGCCC CAGAGTAGAG 1740
AGGGCTTTGC CTCTTCGGGT TGAGGGAGGG AATCATTGAT GAATGGCTCA TTAAAGCCCA 1800
CTGCTGCCAC ATTCCTGGGT GCTTAGGTCA CCTCCTGAAC AATATCCATC ATTCATTCAC 1860
CTACCGCCCC ACATCCTGGC GGCTGGGAGG GGTCCCTGTG ACGCAGGAAG GACTTTATGA 1920
CCAGAGATGC TAGGTCTCCG TCTCCCTCCT GCAGCCCACA GTGACAAAGC AGAAACTGCT 1980
CTTGGGGCCC CCTGAAGCCC GCCTTAGCTG GGTCACCATG GGCCTTGGCA CACGGAGGGG 2040
TGACAGTGGA TCCCAACTCA ACTGACAAGC TTGCCTTTCT CTGTTCTTCC ACCCCCCTTC 2100
CCCGCACTCA CACCCTGTGC TATTTTAGCA ACCAGAGAAG CCTCTTTAAT AGGCTGCCCG 2160
TGTGCAGGGG CAAGCTCTGA AGCCTCCTCT CTGTGGTTTG GTTCACATGT GTTCTCAAAG 2220
ACAGATGAGT CCACATCCTT CCTTCCTCCC TAGATAGGTC AAGGGCTGGG TGCAGGCTGC 2280
CTTCACAGGA GGGCCAGGGA CAGGCTGGGA GGAGCGGGGC CACCTTTTGC GAAGCGGGTG 2340
ATCTGCTGGG GCGTTGCTCT GCCTGCCTGC CTTGTTCTCT GAGTTTACCT CTAGCTTGGG 2400
GACCAAGGGT GGGCTGGGGC CTTCTTTTTT TTTTTTTGAA ACCGAGTCTT ACTCTGTCTC 2460
CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC GCGATCTTGG CTCACTGCAA CCTCTACCTC CCAGGTTCAA 2520
GCGATTCTCC TGTCTCAGCT TCCCGAGTAG CTGGGTTTAT AGGAGCCCGC CACCACGCCC 2580
AGGTAATTTT TGTATTTTTA GTAGAGACGA GGTTTCACCA TGTTGGCCAG GCTGGTCTTG 2640
AACTCCTGAC CTCAAGTGAT CCGCCCGCCT CGGCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGTG 2700
CGAGCCACTG CGCCCGGCCC TGGCTGGGGG CTTCTTGACC TGACTCTGCT GTCTCTCCCT 2760
CACTGGCCAG CACCTCCCAT TCTACTCAGA CATCGTGGAA TGAATGCCCA CCCCGTGTTT 2820
GTATGTATCA TCTGTGTCTG TGTGACATTA AGCAAGTCAC TGAACCTCTC CCTGCCTCAG 2880
TTTCCTCATC AAATGGAGAT ATATCGCATG TGATCATGGG GTTGGAGGTT TTAAAGAGTT 2940
GCTAATGTGT AAATAGTAAG AACTAGCAAT TAGCCGTTAT AGCATAATTA CCTTTAATAT 3000
GTCATGCCCC CCGCACCCCC GTGCTGAATG TAATTTTGCG GGGGGGCGGG TTGAGACAGG 3060
GTCTGGCTCT GTCACCGAGG CTGGAGTGCA CTAACACAAT CTCAGCTTAC TGCAACCTCT 3120
GCCTCTCAGG CACAAGCTGT CTTCCCACCT CAGCCTCTCG AGTAGCTGGG ACTACAGGCG 3180
CTCAGTACCA CGCCTGGCTA ATTTTTGTAG TTTTTGTAGA GATGGGGTTT TGCCATGTTG 3240
CCTAGGCTGA TCTCAAACTC CTGTGCTAAA GCAATCCTCC CGCCTCGGCC TCCTAAAGTG 3300
CTGGGATTAC ATGGTGTGTG CCACCATGCC TGGCTGGCCA GAATGTAAAT GATAACTGTT 3360
TTGCTTCCTC CTGTGTCCAG TACATAATAG GGCTCCAAGT CAGTATTTGT GAGGCAGGTG 3420
CATGCCTCTT AGTTGCGGTC CTGAGGGCAT GGCCACTGCC ACGTTCTGGA CAGTCAGAGT 3480
CGCTGCTGCC CCTGGAAGAT GACCGCGATC ATGAAGCCCA GGAGAGCTCG ATGCTTTTTG 3540
CCTTTCCCTC CTCCCACAGA GGGCTGGCAG CTCTGGTTCC TCCCAAATGA AATAGAAACC 3600
TTGAGTTTGC ATTTCTTCTT TGGCGTGCCG GCAGGGCACC TCTGCCTTCC TCTTCCTGCC 3660
AGGGGGAGGA AGTTTCTCTC AGGGGCTCTT CACCCTGCTT TATTCCTGGC CATCACACAT 3720
TGACCCTTGT CCCCTTCGGC TCTTTCCCTG CATGGCAGGG ACAGCATGAC CGTTTAATGG 3780
CTTTGTGAGG CCAGCATGCC AGCCTCACTT CTTTACTCCC TTCCTTCTCG GAGTGGGCTC 3840
TGTCCCTTCT GCAGGAGGGC TTTGGCACAT GCTCTTCCCA GTATCTGGAA GGTCTCCCTC 3900
ATTTTTATCT TATTAACTCC TCATCCTTCA GCTCAGAGTT TGAGAATGAC TTCTTCAAGG 3960
ACACCTTTCT GTGTCTGCCT CACCAGTCGC TTGGTGCCCC CCCACCCCGC CACCATGCTG 4020
ACCGCACTCT TCAGCTCCCA TCCCAGGGGA GGTGACACAA ACTCGGCCCC AGGAGCCCAG 4080
CACCTGGCTT TAAACCCAGC TCTGTAACTT TCTAGGTGTG TGACTGATGG GAGCAAGCCA 4140
CTTCACCTCT CAGGCCCTCC GTTTCCTCAT CTGCAAAATG GAGGCAGTAC 4190