EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS127-15496 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Macrophage 
Coordinate
chr19:39164560-39167580 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:39164640-39164655TGAACTCCTGACCTT-6.04
ZfxMA0146.2chr19:39164663-39164677CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 72             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39165147-39167595Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39164613-39166814Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39166901-39167874Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39164445-39171596Aorta
SE_02946chr19:39166206-39167906Bladder
SE_03166chr19:39164661-39165957Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39166126-39167588Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39164983-39168193Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39164489-39168342Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39164448-39170203Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39164765-39168166Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39164796-39167643Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08790chr19:39167007-39167327Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09404chr19:39164511-39180526CD14
SE_13490chr19:39164569-39168138CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39164572-39168378CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20249chr19:39164561-39178319CD56
SE_20865chr19:39164617-39170179CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39165018-39168386CD8_primiary
SE_23062chr19:39165306-39165967Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39166087-39166803Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39166892-39167972Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39166141-39166668Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39166954-39167795Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39166028-39167370Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39164448-39177989Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39164610-39168530Esophagus
SE_27614chr19:39164407-39180553Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39164574-39167863Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39164629-39166814Gastric
SE_31384chr19:39166841-39168068Gastric
SE_35812chr19:39164437-39168549HMEC
SE_36926chr19:39164423-39168326HSMMtube
SE_38012chr19:39166134-39168129HUVEC
SE_38896chr19:39166079-39167996IMR90
SE_40018chr19:39164614-39168462K562
SE_40594chr19:39164568-39178326Left_Ventricle
SE_41601chr19:39166914-39167674LNCaP
SE_42097chr19:39164441-39171613Lung
SE_44161chr19:39164690-39165914NHDF-Ad
SE_44161chr19:39165948-39168436NHDF-Ad
SE_44797chr19:39165055-39165813NHLF
SE_44797chr19:39165893-39167853NHLF
SE_45660chr19:39164558-39165979Osteoblasts
SE_45660chr19:39166130-39167979Osteoblasts
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39166251-39166741Pancreas
SE_48075chr19:39164445-39168285Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39164445-39168503Right_Atrium
SE_49449chr19:39164658-39165488Right_Ventricle
SE_49449chr19:39165542-39166833Right_Ventricle
SE_49449chr19:39166954-39168021Right_Ventricle
SE_50056chr19:39164598-39172640Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39164476-39168293Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39164591-39167784Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39164439-39168563Small_Intestine
SE_53291chr19:39164439-39168017Spleen
SE_54534chr19:39164447-39168169Stomach_Smooth_Muscle
SE_55638chr19:39164641-39165676Thymus
SE_55638chr19:39165817-39166888Thymus
SE_55638chr19:39167040-39167924Thymus
SE_56725chr19:39164643-39166779VACO_400
SE_56725chr19:39166876-39167993VACO_400
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39164405-39167784HSMM
SE_64225chr19:39164570-39167858NHEK
SE_65266chr19:39164394-39165412Pancreatic_islets
SE_65266chr19:39165862-39166710Pancreatic_islets
SE_65266chr19:39166857-39167918Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39165582-39166750H9
SE_68725chr19:39166945-39167695H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr193916472439166067
chr193916630239166492
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
ACAGGTGCCT GCCACCACGT CCGGCTAATT TTTGTATTTT TAGTAGAGAT GGGATTTCAC 60
CATCTTGGCC AGGCTGGTCT TGAACTCCTG ACCTTGTGAT CTACCCGCCT CGGCCTCCCA 120
AAGTGCTGGG ATTACAGGCG TGAGCCACTG CGCCCGGTGT GATTATTTTT ATGAAGGAAA 180
AGACCAGAGT CCTTTAAGAG GGGACAGTGG GGGACTTGCA ATAGATTGTG TGGGAGCTGT 240
CAGGGGAGAC TTTCCAAGAT GATGACAGTG AAGTGAGGCC TGGAGGGAGA GTTAGAGCCA 300
ACCTCAGAGA AGGGAACACT GTTCTAGGCA GGAGGACCCA GGGTTGTGGG AAGAGAGAAA 360
TAAAATGAGA CCAAGACAGT GGGGAGAGCA GTGTGAGTTG AAGTCAGAGG GGTGACAGCA 420
GCCAGAATGT GCCGGTAGCG AGGATCTTGG ATTTTATTCT AGCTGCAATG AGAGCTTTGA 480
TTCTACAAAT ATTTATTGCG TGCTAGTCAC TGTTTTAGGT ACTGGGTGTA CAACAGTGAA 540
AAAAGAACTT CCCAGCCGAG TGGAATGCCG TGGAGCATAT CTGTTTCGAT GCTGGGACAG 600
ATCCCTAACA CAGCTCATTA AAGCAGATAG CACCATTCCG TCTCTTTCTT CAGCTTCACT 660
TTACGTCAGT CCCAGCATTT TTATCCCTAC CCTTACAGAT GAGAGAACTA AAGTTCAGAG 720
AGGTGACGTG ACTTGCCCCA GGCCCCTCAG TCAGTAAAAG ACAGAACTGA GAATCCAACC 780
AGACTCTTCC CTTTTTAGGT TATTTCTCTA ACATTAGGGC CGAGTATCGA TTCTCTTTAC 840
CTCTGACTTC GTGTCCCTGG TATTAAGACT CAGGGCCCAC AGTGCCTCTT GGAATTCAGG 900
CATATGGTGA CATCAGTGTG CCTACCATTC AGGTCTTGGA GAATAGGGTA TGGCGAAAGG 960
AGAGAACTCG TGATATCGCT GATTCAGTAG CCCAGAGTTG TACGAGTCCT TGGGTGTTTC 1020
ACCTTCATCC AGGCATCTGA GATTGGAGAC AAGCATGTGG CTGAATGACG TATCTGGGGG 1080
AAGCTGTCTA AACAGCCGTG TGGAGTTGGA GAGTTGAATT AGCTCTGTGG CCAAACCTCT 1140
GGGCTCAGTC TGCCTATATA TGGCTTGATC TCAAAGAACA GGTGATAGCA GTAGGAGTTG 1200
TTTTCTGTGT TGCTGGTGGG AGATGCCCAG GCACATTCCT TTGTAGACAA GCACAAACTA 1260
GATATTTTTG AAATCGGAGG TCTGAAACCA GCCGAAGAAT TAATCCTGGC CTGGAAAGCA 1320
TATGGGAGAG TACAGCCAAC CTGGCTTGGG TGTTGCTTTC TTGGTTTTGT TGCATTTTTG 1380
AGGCAGGGTC TTGCTCTGTC ACCCAAGTGG GATCACAGTG GTACAATCAT GGCTCATTGC 1440
AGCCTTAACC TCCTGGGCTC AAGTGATTCT CCTGCCTTAT TTTTTGATTT TTTTTGTAGA 1500
GGTGAGGTCT CACCATGTTG CCCAGGCTGG TCTTGAGCTC CTGGGCTCAA GTGATCCTCC 1560
ACCTTGGTCT CCCAAAGTGT TAGGATTACA GGCGTGAGCC GCTGCCCCTG GTGACTTTGT 1620
TGCTTTTTAA TAAGCCCAGA AATTTCTTTC AAGAGGGAGG ATCTTTGTGA ACATCTTGAG 1680
CCGCGTTCTT GATCGCTGGC TGTGGAAGCC TCCACCTATC AGGCTCAAGT CCATGTTGCT 1740
ATCATGTGCA CTTTGGCTGG TGAGGTGCTG AGCAGAGGTT TCAGCCTCTA CCACAAGGTT 1800
TCCTGATGAA AGGTCAGCTG GGTGGGCCCA GCTTCTCCTT ACCCAACTGA GAGGCCTCAT 1860
AGAGCACAAG GCCTGGGTAC GGAGGTTCCT GGGGCTCCTG CCATACCCAG CCAGGCCAAG 1920
CAGAGGGCCC CAGTGTGTTG TTGGGTGCTG AGAGGCTGCC CGCAGCTCTC GCCTGTGTTG 1980
GAAGGCTGTA GACTTGGCTT CTCCCAAACG TAAGCTGTGA AGCCATGGAC TCAGATTCTC 2040
AGCCTGGCCC TGCTACTTAC TGTGGGACCT TGGGCAAGGA AGTCTCCATT TTCTCTTTTA 2100
CAAAATGGGG CCAATAATCT GACTACCACA GGGCTGTCAG GATGCAGCGG GATGGAGCCT 2160
TTATAGGGTC TTGTTCTGTG GGATCTGGAG TCCCATATGG GAGTTATTAG TTGAGGGACG 2220
AGGCATCTGG GAATCTTTAT TCAACTAGGA AACTTCAGCC AAAGAACTAA TGCCATAGAG 2280
ATGTCTTATG GTGTCTGCAT TTGAAGCCAG CGGTTCTTTG AAAATTTATC CTGAGTTCCA 2340
GAAAGCCAAC TGCTAGATAA GTAAGCATTG AGCATTTAAG GGGTCCTGGA AGTAAGATTC 2400
CTGGAAAGAA GCAGCAATCT CTTACTCATC CCCGATTATC TCAGACACAG AGTGGTGGAT 2460
GGAACCTTTG TGGTTTAGGG GCTGACTCTT GGTATTGCTG GATAAGGAAT ATGAGCCAGT 2520
AGAGACGAGT GTGTTGTATA GCAGTGTCCT GCGACTGGGC TGGAGACGTG GCTGAGGGAG 2580
GCCAGGGGGC CTCAGAGTGC ACGGGAGGAG GCTTACAGAG GTCTTTTGCA TCCTGCAGAA 2640
CACCACATGT GTCCTTCCCT CTGGGAAACC TCCCACCCGG GCAGGGCCTC TGGGGCCGGA 2700
TGTGGAAGGT AAACAGGCTG CCTTTCTGCT CTCTACCACA GACAGGCCCG GAAAGGCCTG 2760
AGTAGGAGCT TTTCATCTCA GGAAGCCCTG AGGTCCCACA GCTTCTCCTG AAGCAGCCTC 2820
ATTGTCCCTT TGTAAGAGCA TGACCAGGTG CTCTAGCTCC TGGAGCACCA GTGGAGAACT 2880
AGAGTGGCCC AGGTGCTGAT GCCAAGTTCG AGCAACAGCT CCTGGCGGGT TTCCCTGCAT 2940
CCCCCCACTC ACTCCCATCT ATTCTTCACA TAGGGGCCAA AGAACATCCT GCTTGACATC 3000
TTGATCAGTG TCCCTTGCCC 3020