EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS127-02056 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Macrophage 
Coordinate
chr1:159890630-159893220 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6427499chr1159891917hg19
rs2789422chr1159892088hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Myod1MA0499.1chr1:159892832-159892845AGCAGCTGTTTCT+6.28
Tcf12MA0521.1chr1:159892831-159892842CAGCAGCTGTT-6.32
YY1MA0095.2chr1:159892039-159892051CAACATGGCTGC+6.14
Number of super-enhancer constituents: 46             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02009chr1:159887204-159896462Aorta
SE_02391chr1:159891163-159896016Astrocytes
SE_09609chr1:159888811-159896163CD14
SE_10233chr1:159889294-159896142CD19_Primary
SE_10984chr1:159884833-159896640CD20
SE_11910chr1:159890466-159896330CD3
SE_12862chr1:159890202-159896191CD34_Primary_RO01480
SE_13325chr1:159887045-159896510CD34_Primary_RO01536
SE_14052chr1:159890274-159896187CD34_Primary_RO01549
SE_14513chr1:159890132-159896515CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15769chr1:159891344-159896220CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15949chr1:159891339-159896140CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16460chr1:159890826-159896099CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16913chr1:159890317-159896307CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17500chr1:159889525-159896840CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17880chr1:159889025-159896700CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_19597chr1:159888663-159896506CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20057chr1:159890184-159896627CD56
SE_20849chr1:159889345-159896337CD8_Memory_7pool
SE_21561chr1:159891197-159896204CD8_Naive_7pool
SE_22506chr1:159889745-159896593CD8_primiary
SE_23567chr1:159891451-159896346Colon_Crypt_1
SE_23939chr1:159892115-159896031Colon_Crypt_2
SE_25013chr1:159890918-159896336Colon_Crypt_3
SE_30108chr1:159891067-159896091Fetal_Muscle
SE_31985chr1:159891083-159896707Gastric
SE_34858chr1:159890807-159896516HeLa
SE_36438chr1:159891272-159896570HMEC
SE_38165chr1:159890321-159896029HUVEC
SE_40207chr1:159890880-159896228K562
SE_41182chr1:159890906-159896421Left_Ventricle
SE_42315chr1:159887173-159896572Lung
SE_44957chr1:159891221-159895990NHLF
SE_47692chr1:159891560-159896059Pancreas
SE_48986chr1:159891201-159896458Right_Atrium
SE_49778chr1:159891574-159893172Right_Ventricle
SE_50509chr1:159888888-159896553Sigmoid_Colon
SE_52604chr1:159889149-159896485Small_Intestine
SE_53483chr1:159887801-159896526Spleen
SE_55434chr1:159890662-159896015Thymus
SE_58180chr1:159892507-159896090VACO_9m
SE_59359chr1:159879583-159907614Ly3
SE_63031chr1:159879414-159896447Tonsil
SE_63399chr1:159883649-159916570NCI-H69
SE_64771chr1:159890244-159896649NHEK
SE_65431chr1:159891110-159896368Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1159892447159892988
chr1159891200159891400
Enhancer Sequence
TGAGCACCTA CTATCTGTGC TAGGGATTGT GAAAGAGATA GTAGAAGTCC TTGGTCCTCA 60
AGTGCCCACA GTGCCATCAG GGAGACAAAG TGAGTACATA TGAACAGGTA AGGATTGCAC 120
ACAAAGAATA CTAAAGTGCA CAGTTCAGAT CACATGTTGT AGGAGTTAAA AGAAGCAGAC 180
GGGCAGAAGC AGCCTGGGAA GGCTTTCTGG AAGAGGTAGG CTTGAATAGG TCCTTGAGGG 240
ATTTCAGCAA ACAAATCGAA TTTCCTATGA AAAACCAGGC AATAAAAACA AATTCTACTT 300
TCCCCTCTAG GAGCTATGAC AGGCAGAATC ATGCCCCCGC AAAAGGTGTC CATGTCCTAA 360
TTCCCAGAAC CTGTGGATAT TGTTATCTTA TATGACAAAA AGGGACTTCG TAGATGTGAT 420
TAAGATCTCG AAATGGGGAG ATTATCCTGC ATCATCTAAA TGAGCCCAGT GTAATCACAA 480
GGGCCTTACT AACTGAAAGT GGGAGATAGG TGAGTCAGAG TGGGAGAAGT AACAACAACA 540
ACAACAAAAT GGAAGTAGAA GTCAGAGTCA CACAGGGCCA TGAACCAAGC AATGCAGGTG 600
GCCTCCAGAA GCCAGAAAAG GGAAGGAAAT AGATTCACCC AAAAACCCCA GAAGGAACAC 660
AGCTCTGCCA ACACCTGTAT TTTAGCCAGT GAGACCCCTG TTGAGTCTGT AGAACTGTAA 720
GATGCTGTAT TTGTGTTGCT TTAAATCACT AAGCTTGTAG CAATTTGTTA CAGCAGAAAT 780
AGGAAACTAA TACAGGAGCC CTGGGTGATA TTTTTGGGGA AACCTGGAGA AGAGAAGGCA 840
AGACGGGGAA ATACACAGGA GGGTTTCTTT AACTTCGTTG GAGGAGCTTG ATTAGCAAGA 900
ACTGGGTGGT TTCCCGACCA ATGGCCTGAG TTGGCGGACC TCACTGTGGC AGTGTGTTCC 960
CACCACACTC ACCACCTGGG TCTGACACTC AGGGGCTGAG CAAGACCCGG GCATGGTATG 1020
GATGCCAAGG GGAGCCAAGA ACCAAGAATG GGCCACAGTC CCCATTTTCT GTCCCATCCC 1080
CACCCTGGTT TGGCTTTTCT CTCTTCTCCA AAACAGAGCT AGCTGTCAGG CTGCTCACGA 1140
AAGGGGACCC CCAGGACAGG CATCTGCGTT CAAGGGGAAG AAAGAGAGCC ACCCCTTCTA 1200
ACCACATCTG GCTCCAGGCC AGGTTGGCCT TCAGGGATGA AGTCACTCCA GCTCCCCCTC 1260
TCCCACACAC CCAGGTTAAA CAATCCCGTC ACCCCCTCTC AATGGACCTT GGGGCTCTGC 1320
GAAATACAAG GGGACCAGCC TGCCTCAAAC CCTCAACACC TCTCGGCCGC AGAGGCTGTG 1380
TCTTGGGCCA GTCCCTCCCG TCCCGACTCC AACATGGCTG CTCCTTTTTA CCCCAGCTTA 1440
TCAAGCTGCA CATTTCCGGC AGATCCTCCC CTAAATCAGT TATTTTTAAA CCTCATTAAG 1500
AGCAACCCGC CCCCTCCACT TCCCCCAGCC CGAAAGCTGG GCCAGATAAA TGTCAGTCTG 1560
GGCCCCGACC CACAGCGCCA GGCACACACA CCATCAGCTT GGGGAAGGCA GGCGGGGTGG 1620
GGTGGCTGAG TTCTGAGGAG AAACCAAGAG AAGCATCCCT GCCCTTCCCA GAGGCCACTC 1680
CACCATAGAA ACCTCTAACC TCTGATGCAC AGGGGAATGG CTGGAAGACA GGTAGGAAGA 1740
GGAAGGGGCT AAGAGCTACT ACCACCAGTA AGCCCCCTTT CCGCAGCCCA GTTCCAGACC 1800
TCTCTCCTGG GAGTGGCTGT GCTCAGGGCT GTTTCCAGGG ACCAAGTGGC CTGAGGCTCG 1860
GGGATCACCA TGGCACAGGT AAAGAAAGGG CAGGAGAATG ATTAACCTAG ACACTGGGGT 1920
TAAGAGCAGA GAGAAAGGCC TGAAGCCAGA CACTTCCAGT GCCCCCCAAC CCCCCAAGGC 1980
AGGACAAACT TGGCCTCCCA GACCCACCAC TGGGTGGAAA GTGGATGCTG AGGAACCCCC 2040
TCCACCGCCC AACGCTGGGG CCTGGACACA GCTGGCAGGG TCACGGCCTC CAGCTGCAGT 2100
GTATCTGCTC CACTCTGGGG CCATTGCCCT CAAGCTCTGA GGTGCCAGAG CCATAGGGCG 2160
GGGTCCTGAG AAGGGGCAGT TCCAACCAGG CCAGGCCTGG TCAGCAGCTG TTTCTCTTCC 2220
CCACCCCCAC GGGCAGGCAG AAGCTGATGG GCTGCGGCTG CTGGAGCTGG GAAGGCCCAC 2280
CCTAGGGACA CCCAGGGGAC CTGCCCCTGC CTTCCCTCAA ACATAAAGAA AACAGTAAGC 2340
AAGTTGCCTA CCAGGGTGAG AAGAGATATG CCCAGCTGGA AGACAGGTGT GGGGGACCCC 2400
CAGAGCTGGG GACCCCAAAG GAAGGTGACA GCTGAACAAC CTGGGGGATG GACTGGCAGG 2460
GAGCAACCTA AACCCTAGCG CTACTGCAGC TGTGAGAACA ACCCTCACCC TCACCCTGGA 2520
GTTACAATAG GCGGGAAACG GGGAGGGGCC ACGCAAGGCA CTCGGCCCCA CCCAGACCCT 2580
GGGCTGGAAG 2590