EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS126-00046 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LY1 
Coordinate
chr1:23899400-23906100 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:23902982-23902993ACAGATAAGGA-6.14
HOXA13MA0650.2chr1:23905153-23905164GTTTTATTGGT-6.32
Nkx3-2MA0122.3chr1:23905146-23905159ATTAAGTGTTTTA-6.16
POU6F1MA0628.1chr1:23905444-23905454ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:23905444-23905454ATTAATTAAT-6.02
SREBF1MA0595.1chr1:23905859-23905869ATCACCCCAC+6.02
Number of super-enhancer constituents: 45             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01721chr1:23900657-23905229Aorta
SE_01721chr1:23905312-23906115Aorta
SE_02313chr1:23901876-23905526Astrocytes
SE_04396chr1:23902891-23904726Brain_Anterior_Caudate
SE_05716chr1:23903816-23905335Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06239chr1:23900696-23905116Brain_Hippocampus_Middle
SE_07293chr1:23902637-23904795Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08579chr1:23902794-23905344Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_10300chr1:23899372-23906111CD19_Primary
SE_11050chr1:23898822-23908436CD20
SE_18996chr1:23902922-23905455CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_26335chr1:23902515-23905797Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27258chr1:23902880-23904675Esophagus
SE_27884chr1:23903017-23904621Fetal_Intestine
SE_28880chr1:23903194-23904813Fetal_Intestine_Large
SE_29676chr1:23901788-23905238Fetal_Muscle
SE_31953chr1:23902060-23902911Gastric
SE_31953chr1:23902935-23903813Gastric
SE_31953chr1:23903835-23904596Gastric
SE_34689chr1:23902272-23905407HeLa
SE_37153chr1:23901250-23906299HSMMtube
SE_38016chr1:23903113-23904896HUVEC
SE_38999chr1:23901867-23905446IMR90
SE_41075chr1:23901556-23905295Left_Ventricle
SE_41075chr1:23905308-23906073Left_Ventricle
SE_42328chr1:23901634-23904721Lung
SE_42328chr1:23905280-23906072Lung
SE_44435chr1:23902863-23905477NHDF-Ad
SE_45797chr1:23901058-23906146Osteoblasts
SE_48755chr1:23901793-23902643Right_Atrium
SE_48755chr1:23902917-23904674Right_Atrium
SE_50077chr1:23902728-23906171Sigmoid_Colon
SE_51741chr1:23901781-23905632Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52549chr1:23902842-23905170Small_Intestine
SE_52549chr1:23905280-23906163Small_Intestine
SE_53706chr1:23901906-23902658Spleen
SE_53706chr1:23902697-23905306Spleen
SE_54840chr1:23900793-23905744Stomach_Smooth_Muscle
SE_56054chr1:23901526-23905401u87
SE_58372chr1:23873313-23964782Ly1
SE_63528chr1:23901642-23905713HSMM
SE_68324chr1:23879596-23905390TC32
SE_68325chr1:23879596-23905390TC32
SE_68477chr1:23874949-23904689TC71
SE_68478chr1:23874949-23904689TC71
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr12390460023905142
chr12390371423904323
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I023572chr12389942723906089
Enhancer Sequence
AGTTTGCTAG CAGCCATGTT TTCAAGCTGC AACAACTACT TCTTGGATGG TGAGAATTGG 60
GAGAGATGGC AGAAGGCCTG GGGAAGAGTG GGGATGCTGG GAAAGCCTCC TGGTGAGAAA 120
GCTCAGGCCA CAGCTGGGCC AGGGACATCC ACAGCAGTCT CCAGGCTCTG ACACCCCCTC 180
CCCAACCCTG ACTCCCTCCC AGGGGAGAGA ATAACTTGGC TCCAAAGCTG AGGCCAGAAT 240
ATAAGCCAGA GACCTGCTGA CCTGACCCCC CCACCCTGGA ATCTACTGAA TCTGGGGCCA 300
GGAGCAAGGA AGGGCTGACC CCAAACTGAA CAAATCAAAA AGCCAAGTTC CCCTCTGAGC 360
CCTGCAATTT TTTTTTCTTT TGGACCAAAT AAGGAAGGAG CACCTGTTAC TTTATAATCA 420
TACTGTAGGA CAGCCTCGAG TTGAAAGCCA TGGGATCTGG AGTCTTGAAA ACGCGGTTCA 480
AGCTCCTATC TTTTCTATTT CCAAACTCAG TGTCCTAGAG CAACTCACTC ACTTTCCCCA 540
AGCTTCAGTT TTTCTATCTA TGAAATAGAC AATGATACTC CTGTTAAGAG GGCGCTTGTA 600
AGGATTTGGG GGACCAGAGG TTAAATTCGC TTCATTTTAG TTCACCTACG TTACTTATGT 660
TTTGTTACAT GTCTTAAGTT ATGGTTTTAA TAATCCCCCC ACTCAAAAAT AAACAAGATT 720
AAAAGAATAA TGAAAATAGT TAATAATAAG TGTCAACATT TATGGGCACT GATTTTGTGC 780
TGTTTCAAGT GCTTTATACA CATTAACTCA TTTATCTTCA TAAAAAGCCT ATGAAGCCAT 840
TATACAGATG AGGAAACAGG CTCAGAGAGG CTAAGCATGT TGTTCAAGGT CACACAGCAT 900
GGAAGAGGCA AGCCGACTGA CTCCAGAGCC TTAGCTTTGT GCCAGTCAGA ATGGAAAAGA 960
ACTCCAAAAG ACACCAACCT GGTTTATTCA AGTGCTGGCA TGTAAGGATA AGGAAAAGCA 1020
GCCATCAGTT TGAATGACAG GCGATGGGTC CGGAGTAATT AGCCAAATGT ATGAAGATTT 1080
CACCATTTCT AAACCATCCT GTTATATGAC CACACATACC ATCTTCATGG AAGTGCAGTA 1140
GCATCACCAT GACAACTACT TTTGTGTTTT TACCTCTAAT GTAATCGATT GTATTTTAAA 1200
ATATTTTTAA ATGAATAAAA GCTTTTGAAT TTAATGTTTT AAGTAGGTAA TACTTTCACC 1260
TGGTTAAAAA CTCAAAAAGC TCGAGAGGCA TAAAGTGAAA GGCCTCCTTC TCACCCCGGC 1320
CCCTGCCATC CTCTTCTCAC AGTCAGCCAA TGTTGCTAGT TTTGTGGGGA GGGGAAGAAC 1380
TGATACTTTT TGAAAGTAGA AAGAGTGTGC TTGATTTGTT CTGAGGTCAC AAGCCATAAA 1440
GCCCACCTTA CTCTGGTTGA TTTCTTCAGG TCGGCCTCAG CCTGATTTCC TGTACCCTTT 1500
GAGGCACTGC TGCTTCCTGC AGGTGATGGT TAGTCCCTTA GGGAGATGGT CAGTCCCTTC 1560
TCCCTCTGAA CTTTCCCCTG AGGCACCCCC TTCAGTACCC GCTATGCTCC TGACCACATT 1620
CTCTCTGGCC TCTAGGCCTG ACTGGTTCTC CATCCCCCAG AACCTGCAGA GCCTGTAAAT 1680
GCCAGAGAAA TCTCATCATC TCACACAGCT GATGTGGTAG AGGTGGACCC AGAGGTCACA 1740
CCTGGGTGGC TTCAGGCTAT ATCTAGCCTA TGAGATTTTT TGTTCTTTTT TGGTCTGCAC 1800
AGTGATGTCA GAATTGGAAA TCTTCACCTG AAAGTCCAAT TTTCTGATTT CACTTGAAAT 1860
ATTGGCAGAC TCAGCCACAC TGAACCCATA CTGATGCATG ATGATGACAG CTGGAGCTGA 1920
GCAGCAGTTG CTCCCTTGAG AAGGAGCACA AGCTCTCTGG GTTGTATGGT CCCCGCCACT 1980
CTGGGTTGGT TAACATGGTA GGCAGGATCA TAGTCACCTC CAAAGATGTC TGTGTCCTAA 2040
TCCCTATAAT TTGTGAATGT ACTGTTACAC GGCAAGTGGG AATTAAGTTT GCAGATGGAA 2100
TGAAGGTTGC TATGCAGGAT TATCTAGGTG GGTCCAATGG AATCAGAAGG GTCCTTAAAA 2160
GTGGGAGAGG GCAGCAGAAA AGAGTCAGAG AAAGAGAGGC AACCACGAAA ACAGGGTCAG 2220
AGAGATGCCA TGTTGCTGGC TTTGAAAATG AAGGAAGGGG TCACAACCCA AGGAATGTTG 2280
GCAGCCTCCA GAAGCTGGAA AAGGCAAGGA AATCAATTAT CTTCCAGATT CTCCGAAAGG 2340
GAAGTCCCTG CAAACACCCT GATTTTAGCC CAGTGAGATC AGGTTGGTTT GAGAGCATAA 2400
ACTTAAGTTG TTTTAAGTGA CTAAGTTTGT AGTCATTTTG TTATAGCAGC AATAGAGAAG 2460
TAATACAGTT AATATGGGCC CTTGTAGGTC TCCAGGGATG GGGGAGTGGG GCACAGCTGT 2520
GAGAGCTGTT GTAAGTGTGC AAGACTCATA GCTTAAAGAG CTCGGTAAAT GGCCATGAAT 2580
GTTCTAATGA ATAGGCGTAG CAGGCGGGTT CTGGGCAGAG TAGAGATATG GGTGACCCTT 2640
GCTTTGGTTT TTTCTCCCTC CACTCTTGTG ACACCCTCTG CCCAGTTTCC TTCACAGCCC 2700
TGGGGCTTGC TGAGAGAGCC GGGCTGATAT GTCAGGCCTT CAGCATTGAG TAGGGCAATC 2760
ACTTAGCAAG TTGGCAGGTC TCAGCAGCTG GTGGAGGAAT CTGGGCTCTG ACTGAGGACA 2820
GGATTAGAGG TCAAAGTGGG AAAGTAGGGA ATAGGCCCCA GACTGAGTAA AAAGACCAGG 2880
AGAGCTGAAG GTGGGGGAGG GTCAGGAGCA GGTTCTGAAA GGGGGTGCAA AGCTAGGCAG 2940
GGCCCAGACT TGAGGCCTGT TCTAGGTGGT GCTGGCTGGT AGGGGAATGA CTGATGGTCT 3000
AGGATTGCTG AGGACAACTG TGCACCTGCC AGCACTGTCC TAAGCCTGCC TCTGAACACT 3060
AAGCTGTCAG CCTCTGTTTA CCTTCCACTC TCAGTATAAC CTGCATTCGG CCTATTTGTT 3120
GGGAGGCAAC TGAAAAACTA ATTTATCCTG AATTATTCTT AGTGACTGAT AGTGGCTTAC 3180
TGTGTCAGAT ACTTGCCAAG GAGATTCATG TTGAAGTGCA TATCATTTTA ACCTAAAAAG 3240
ATGAAGTGCA TTTAAGGTAG CAGTGTCTGA GAAGGAAAAC CTCATGGCTA CTGGTGGTGG 3300
GGGGTGGCAG GGAACATAGG ATGTCACACG GTGGACAGCC TTACCTGCTC ACAGGGCTGT 3360
ACACCCCCAG GAGGTCTCTC ATATTCCAGC CCCCATGTCC TTAAGTCTCT TTAGATTTTT 3420
TTCACCTGGG CTTTCATTAC AATTCTTTTA CTTTCCGTGT TTCCTGGGTA AGCTTGTTTA 3480
TATATTTTTA GCAAACATTC ATGTAACACT ATGTGCCAGG CACCATTCTA AGTGCTTTAC 3540
AAATGTTTAT TTAGGTAACA GAGGTACTGT TGCCTCCATT TTACAGATAA GGAAACTGAG 3600
ACACAGAGAG GCTAATTTGC CCAAGACCAC GTGGCTAGCG AGTGGCTACA CTTTCTGAGC 3660
CTCGGCTTTC TTGGCTGTTA AATTGATATG TATATACAAG CGCCCTCTGC ATAGCAGGGC 3720
TTCTCAGACC CAACACTATT GACATTTTGG GCTGGATAAT TCTTTGTTGT GAGGCTGTCC 3780
TGTGCATTGC AGGATGTTTA GCGGTATCCC TGGCCTCTAC CACATAGGGT ATTCACTGCC 3840
AAGAGATGCC AGTAGCAACT CCCACTCAAG CTGTGACAAA CCTAAAATGT CCCCTGATCT 3900
TGCCAAATGT CCTCTGGGGG CAAAATCAAC CCTAGTTTAG AACCACTGCC TAATAGGATC 3960
CTGGGGAGGA TTAAATGAGC TATTTCATAT AAAATACCTT CCGGCAATCC CTTCCCCATT 4020
CCTTCCATAA CTCTATGGTG AGTTCTAACT CCTCAGAACC CTCTTGTTCT TTCTGTTCCT 4080
CTACTGTTTG GAAAATGTGC CCACCTATGG AGACTGGGTG CTTGAGAGCT TCTTGCAAAT 4140
CCAAAGCTGT TCCAGGAGCT AGACCTGATT CCAGTCCTGT CATTTCCACA GACATGCTGT 4200
GGGACCTTGG CTGAAGTCCT TCCCCTCCTT GAGCCTCGGT TTCCCCATGT GTACGAGGGG 4260
GCTGACCCAG AAGCTTTCCG AAAGGTCTTC TCACTGCAGG AATCAGTGAC TGGGTGATTC 4320
ATACCAAGTG CAAATTCCCC TCACAAAGTC CAAATTCTTC CAGCGACTTA GTCATTCCAG 4380
GGTTTGAACT TTCTCGCAAA AACCATTTGA AAAATTCTTC CAGCTTAAAA AAAAAAAAAA 4440
AAAGCTATTA AAAGAAAGTA AAAGTTTCAA AACCAAATCC TAGGCAAACA ACCCTGAAAA 4500
CAATACACAC ACATACATAT ACATACAGCA CCCAAGGTAG CTCTGAGAAC AGGATATGAA 4560
ACCTTGCAGG CCGGCACTAA GAAATGATTC ACAGGCCTTT GAGATGCTTC TATTTCAAGA 4620
CACAGTCCAC CCACTGGATC TGGTGGCTCC AAAAACAAAC TTTCAGCTGC TGTTTCTTAT 4680
CGCAGTGTGG TTCGCCTGGC CAGTATCCTT GGGTCTCAAG AGCTCCAGAC AGAAGACAAG 4740
GTTGAGTCCT GTGAATTCCC TTTCTGTTCT ATTTCAAGCC TCAAGCTGCT GGCTTGTTTA 4800
AAGAAAGTCT TTTGCATCCA CCTTTTGGTT GGCTGACCCG AGTTTAAAGC AACATAGCCT 4860
AATGGGTTCG TAGCACAGCC TGCGAATTCA TAATTTTAGT TTAGCAAGGC CTCTGTGTGG 4920
CTCCAGCAAG TCCTACTGGA TCCTGGGCTG GTCATTCTAG AAGCTGTCTC CAGCTAAACA 4980
ATCCTGCCTG GCTTTCCTTA TACATATCAA TATTATACTT GCCCTAGGCC AGGATTAAGA 5040
ATTTTAGCAC AAATTCAAAA TTTCATGCTT TTATGTAAAA TAGAAATATA AAAGTAATTC 5100
ATTCGATGAA ATGCTTACTG AGTGCTCACT ATATGCCAAG CACCAGCAAT GTACTGGCGA 5160
TAAAATACAG CCCCTGCCTT CAGGAGCCAC ATTGAACAGG AAAAGCAGAC AATCTAAATA 5220
TACATAGTAG AAACACATGG AACTATTCCC TATGGGAAAT GCCCTGCATA AAAAGTGATA 5280
CCAAAGTTGG AGCAAAATTG AAAGAAATGC AAATGCTTGT GATACGGTTA AGTACATTTT 5340
CATCTGTACT TACCCTTGAT TTTGTTTTAG ATTTAGAAAA TCTTGAACTT TCACTGTTGC 5400
TTCATTTGCC CTCCAAAAAT CCAGAATCTT ACAGAAAGGG TCAGTGTCTG GATCAAACAT 5460
GTTTCTTATC TAATTTCCTT GCCCCAGTTT TTGTTTATGC CATCATTGCT GCATGGAGTC 5520
CTCCCTCCTC TCCTTGTGTA TCCTCCAAGT TCTGATGCAA AGCCCACTTC CTCCAGGAAG 5580
CATTCGCAGA CCCATCTGGC CACATCCTCG CTGTTCTCTA AACACACATA TCTCATGCTC 5640
TTGACTTGGC CTTTAGCCTG TCCTGCCTTA TGATCTCTCT TGTACTTCTG TCCTGAAGTT 5700
TTATCTAACT TATGAATTGG GGGAAAGAGG ACAGGCACTG ACATTTATTA AGTGTTTTAT 5760
TGGTGACGGG CATTTTGCTA GCTCTTTACT GTATATAATG TGCCTGGTAT GTAGAAGATG 5820
TTCAATAAAT ATTTGTTCAA CGAATGCTTC AGTGATTTGG CTTAAACCTA ACAATAACCC 5880
TATGAGACCA ATTCTATTAG TATTCCCATT TTACAGATAA GAGAACTGAG GCACAGACAG 5940
GTAAAGTCTG CATTTGAGGG CTTTCTGTCT TAAAAGTTGA AGTTCAGACT TTCTCTTCTT 6000
CTCTGTTGCT TTTTTCTGCA AATAGATTTC CCTGAAGTGT CTTGATTAAT TAATAGGACA 6060
TATACTGTGC TCCCTGCTTT ATCCCATCTC AGGCAATATT ACCTGTTCTC TCCGTTGTGA 6120
GCCCATATTT GTATTTCTAC AGTTAGTTTA GAAACCACTC TGCATCAGGC GTGGTGACTC 6180
ACGCCTATAG TCCCAACACT TTGGGGAGGC TGAGGCGGGT AGATTGCTTG AACTCAGGAG 6240
TTCGACATCA GCCTGAGCAA CATGGCAAAA CCCCATCTCT ACAAAAAAAT GAAAAATTAG 6300
CCAGGCCTGG TAGTGCACAT CTGTGGTCTC AGCTACTGGG GAGGCTGAGG TGGGAGGATC 6360
ATTTGAGCCC AAAAGGTGGA GGCTGCATTG AGCGAAGATT GTGCCACTGT ACTCCAGCCT 6420
GGGTGACAGA GTGAGACCCC ATCTCAAATA AAAAAAATCA TCACCCCACC ATTACCTGTG 6480
CCTTGTCTAC CTTTCCCACT AGACCATAGG CAGCACTAAT GTAGTATGAC TGCTGTGCCC 6540
CTGGCTGGCA CACTGCTCAT GCTCAGTGAA GATTTGCTGA GCCAGGGTGG TAGTGGTGGT 6600
GGTGGTGGTG ATAACAATAG GTTGAGTAGT GATGTTCCCC AAAAGATATG TGTTAATTTT 6660
TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTAGATA GAGTCTTGCT 6700