EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS122-00130 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LoVo 
Coordinate
chr1:20802010-20804150 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:20803829-20803840GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr1:20803837-20803850TAATTAATTAGTT+6.22
Lhx3MA0135.1chr1:20803833-20803846TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:20803834-20803847AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:20803830-20803843ATTTAATTAATTA-6
POU6F1MA0628.1chr1:20803835-20803845ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:20803835-20803845ATTAATTAAT-6.02
RFX2MA0600.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC+6.02
RFX2MA0600.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC-6.29
RFX5MA0510.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC+6.07
RFX5MA0510.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC-6
mix-aMA0621.1chr1:20803838-20803849AATTAATTAGT+6.62
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03446chr1:20803030-20803671Brain_Angular_Gyrus
SE_03446chr1:20803754-20804585Brain_Angular_Gyrus
SE_05163chr1:20802127-20814849Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06168chr1:20800960-20809454Brain_Hippocampus_Middle
SE_06941chr1:20801073-20814394Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08044chr1:20802020-20815753Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_23263chr1:20802154-20804475Colon_Crypt_1
SE_24162chr1:20802438-20803173Colon_Crypt_2
SE_24162chr1:20803198-20804404Colon_Crypt_2
SE_24976chr1:20802327-20803850Colon_Crypt_3
SE_24976chr1:20803865-20804568Colon_Crypt_3
SE_27987chr1:20800622-20814579Fetal_Intestine
SE_28809chr1:20799528-20814863Fetal_Intestine_Large
SE_41848chr1:20802447-20804302LNCaP
SE_65794chr1:20802035-20804918Pancreatic_islets
Enhancer Sequence
ATACAAAAAT TAGTCAGGCA TGGTGGCAGT CGCCTGTAAT CCCAGCTACT CGGGAGGCTG 60
AGGCAGGAGA ATCACTTGAA CTCGTGAGGC GGAGGTTGCA GTGAGCCAAG ATCGTGCCAT 120
TGCGCTCCAG CCTGGGGCAC AAGAGCGAGA CTTCGTCTCA AAAAAAAAAA AAAAAAAGAG 180
TTCAGAGTGG AAGCCAGACT CAGACTCAGT TTCCACTCCT GGCTCCTTCC TGACTGAGGA 240
CAGGTTACTC AGAACCTCTG GGCCTCGGTT TCTTTGTATG TGAAATGGGC ATGATATATA 300
GTTGTAACTG GCACACACCA TAAACATGAT TCCTAGGGCT GCTGTGAGAA TTAAATAAGA 360
AAATGTACAC GGAACACTTA GCACTGTGGC ACATGACAAG AAGGCTATTA AGAAAATTTA 420
AATAATGGAA AAAAAATAGA ATACCGATAG TGATAACTGC GCACTCATAC AATGCCTTGG 480
TTGCAGAGGT CATTCCCCCA CATTACCTTG TGGGGTTTGA TCAGCAGTTC TGGAAGCACC 540
TAGGGCAGGA ATCACCACCC CAGGGTCACA GATGAGACTG CTGAGGTTCC CAGAGGACCC 600
AAGCAGGGCT GCAGGTGCCC TGGCTCCCAA CTCAGTCAGT GCTCTCTGGT TCCGGAAAAG 660
AATTCTGGGT GAAAGCGGGA GGGGGTGGGA AGCTCCTTCC CCCCAGGTAC CCCTGAGGTC 720
TAACTCTGGA ACTCCTTGGA TAATGAGAAA AGGGGGGCTT CGGAACCCAG GACGTGGGTT 780
CCACATCCTG CGGGGGCAGG GAGGCCGCGC GGGAGGCCGC CAGACGCAGT AAATAATTCA 840
CACAGATGAA CTGGAGATAA GGGCGGCTTC GTGGAGGATC GAGTTCAGGT CGGAGGAGGC 900
TCAGACGGCT GGGGGGACTT GTGGTCTCCC CGGTCTGAGA GGGGAAAATT CCTGGGACTC 960
TGGCTGCCAG GAAAACACAG TCCCCAGGTG CCGGCTTGGT GCCACTCCCT GCCATTGGCG 1020
GGAGGGAGCT CCCCGGAACT GCCCCGCGGG GCAACAGGCC TGGCCAGCCG CCTCCGCCCA 1080
GCCGTCCCCA TGGCAACCGG CTGGCCTGGT CCAGGGTTCA CGGACAACCG GATCCTCTGT 1140
CTCCCCTCCC CCACGGGAGG CTGGGCGTCT TAGACTCCCA ACTGTGTTCT CTGGGAGCTT 1200
CCAGCTGCAG GAACCTACAG AATCATCCTG TCTGACCCCC TCGTTTTATG GGAGTAGTTG 1260
AGACCACGGA CTCTGGGGAC CTGCCCGTCC TGGTTGCAAG CCCCGCTCCA CCATTTCCTG 1320
CTGTAGGATC CTAGGCAGGG GACTTGGCCA CCCTGTGCCT CGGTGTTCAT TATCTGTAAA 1380
ATGGGGATGA TAATAAGTGA CTGTCTTATA GGGTTGTGAA AATTGAATGG ACTAAATGCA 1440
AAGAGGGCAG AGTGGTTACT GGTCTGTAGC CAGCACTGAG GAAGCATTAT TTTCCATGTT 1500
GGGAAGGTGA CGGTCACACA GCATGCTATT AGCAGATTTG GGATTGGAAT GCAGTTGCCA 1560
ATTCTTCCTA AAACACCCAG GGTGGCCACA TTGGGATTCT CCAAGGGTTA CCTGTGCTTC 1620
CTGCGGGCCC ACCCAACCCC CCTCTCTAAC CTCTTGACAG TCACAGTCAT TGAATTGTCT 1680
TTGACCAGGC AGTAAAATCC CTGAACCAGA AAAGGTCTTG CTCTAGCCAG CCCGGTCTCC 1740
CCAGTGCCAA GCACAAACCC GTTTCCTGCA CCTCCACTTT CCACCCCATG CCTGGTAGAG 1800
GAGTTGTTGA ATGAATATAG ATTTAATTAA TTAATTAGTT CATCTCCTCT ACCCAAACAC 1860
CCTCCCAGAG CAAGCTCCTG AAGCCCCTGG CCACCCAGCT CTCTCTCTTA CAGGACACCC 1920
CTTACGCTGA CCACTTCCTG CCATCAGCCC CCACCCCACC CCACTGCCAT CACCATGCTG 1980
TTCACAGTTC CCATGGCACA TTGCCTGGGT CCTCCTCCTC CCTTCAGCCT GCCCTCCCTC 2040
ACTTCCCTCC CCGGTTAGTG ACCCTTTGTC CTCAAAATGG CTGTTTTGGG GTCAAGGACC 2100
CTCCTCCAGG TCCAGAGGTG TACATTTCCC CTGGGTTAAG 2140