EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS121-09989 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LNCaP 
Coordinate
chr13:28015220-28019220 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs9581854chr1328017782hg19
rs12016871chr1328017782hg19
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP2MA0593.1chr13:28019000-28019011TTTGTTTACAT-6.14
KLF4MA0039.3chr13:28016637-28016648CCACACCCTCC+6.32
MEOX2MA0706.1chr13:28015648-28015658GTTAATTACT-6.02
ONECUT1MA0679.1chr13:28019162-28019176TATATTGATTTTTT-6.62
ONECUT2MA0756.1chr13:28019162-28019176TATATTGATTTTTT-6.91
ONECUT3MA0757.1chr13:28019162-28019176TATATTGATTTTTT-7.19
POU2F2MA0507.1chr13:28016995-28017008TTTATTTGCATAT+6.98
ZNF263MA0528.1chr13:28015221-28015242GGAGGAGCAAGAGGAGGGGTT+6.28
Number of super-enhancer constituents: 23             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10692chr13:28016182-28017029CD19_Primary
SE_11680chr13:28013917-28017900CD20
SE_11680chr13:28018577-28026786CD20
SE_12042chr13:28015436-28017081CD3
SE_13592chr13:28015655-28017340CD34_Primary_RO01536
SE_13592chr13:28018257-28026305CD34_Primary_RO01536
SE_17560chr13:28015165-28017701CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17995chr13:28014967-28017653CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18655chr13:28015265-28017613CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18655chr13:28018742-28022277CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19517chr13:28016145-28017082CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20353chr13:28015355-28017232CD56
SE_22112chr13:28015723-28017022CD8_Naive_8pool
SE_22591chr13:28014274-28017458CD8_primiary
SE_25456chr13:28013485-28017845DND41
SE_25456chr13:28018398-28026664DND41
SE_28157chr13:28014355-28017802Fetal_Intestine
SE_29360chr13:28015219-28017972Fetal_Intestine_Large
SE_30949chr13:28014151-28017687Fetal_Thymus
SE_53141chr13:28015452-28017646Small_Intestine
SE_54432chr13:28015896-28016978Spleen
SE_55388chr13:28015775-28017017Thymus
SE_66707chr13:28015583-28016071Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr132801596128016044
chr132801605628017406
chr132801605128017000
chr132801800928018132
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH13I027440chr132801437028017834
Enhancer Sequence
AGGAGGAGCA AGAGGAGGGG TTGGTCTTCT CTCAGGGGTG GCAAAGGTGG AGGAAAATCC 60
ACATATATGT GGACCCCATG CAGTTCAAAC CTGTGTTGTT CTAGGATCAA CTGTATTTCT 120
CATGCATCTT GTAGTGCCAA CTCCAAAAGC GAGTGTCATC TTAGGGCTTT ATTTATGAGG 180
ATGCAGTACA TAAAATGCTT GGTGATTCAT AAACACCAAT TGATAAACTT CTAATATAAT 240
TAACTGTTAA CAATTTTTCA ATACATCTGA TGGTATATAG CAGATAGGAA CACACTATGG 300
GAAAGGGACC TCTCCAGGAA GGAAGCCAGC CCACTGCAAG AATAACTGAG CCTGTCAGAA 360
AACACTGTGA CATAAATCAA AGTGCTAACC TCATAAACTA TAAAGATCAT TCTCAAGGTA 420
AGGCAGGTGT TAATTACTAC CAAATGTTAA CAGAGGCATG TATGGTGACA GTGGTTTTAC 480
TTCATGGTTA TGAGACTGAA TTTGAAGCAC TTACAAATGG CACATTGATT TTTTAATTGC 540
TTTTCTGTCC TTCCATTCAT GTATTTGGTA AATCTTAGAA GTACAGGCTG AAAGAGTGCT 600
GAGAGGACCC ATTCATCTCA TCTAGGGCAT GCTAGGAATC ATTAGAGAAT CACAAACTTG 660
GAGAGGTGTG ACTTGTCAAA GATGAAAGAG GAAAACAGAA GGTGTCTTCA GGGTGCTTCT 720
CAAAGAATGG TCCCAGAATC TCCTGGGGTG TTTAAAACTG GAAGTTCCCT CTGGTCCCTG 780
GCTTTGAGCC CACTGGGCTG TACAACCCAC TTATCTCTCA CCTGTCATGT TCAAGAGTGA 840
TATGCAAAAA AATATGGTAA ATTCAACAGA AAGTGATGGA CATGCATATT CTCAACACCC 900
TCCTTACCTA GTTTGGTAAC ACCCAACACT CTAATTTATA GCTCTGGTGC CAGTCTCTTC 960
TCTTGAGTTC CACACCTGTA GGGTTAACCG CCTACCCAAC CTCTCCACTT AGATATGTAA 1020
TAGTCATTGA GGATTAACGT GTTCAAAGTT CAATGCTTTG CCTTCCATGC AAAACTTGCT 1080
CCTCCCTCAG TCTTCCCTGT CTCATGTAAT TGCAACACAT TCTTCTGGTT GCTCAGGCCA 1140
AAAATACCAA CGTTATCCTT GACTCTTTAT TTTCTCTCAG CAACCCATCC GCAAAACCTA 1200
CCGTTCAACC AGTATAACCA CTTCTCACCT TCTCTACTGC TATCATCCCA CTCCCAAACC 1260
GCCGCGCCGC TCAACTGCAT CACAGTAAAA CCGCATCACA GTAACAGCTT CCCGACTGCT 1320
CTTCCTGCCT CTGCCCTCAC AGCCTGGAGT TTATTACTGC TAGGGCACAC AGAGCAATCC 1380
TTAAAAATGC GTAAGTCAGA TCACGTTCCT CCTCTGCCCA CACCCTCCCC TGGCTAGTAT 1440
CTCACTCCAA GTAAAAGCTA AGCTCTCTAC CATGCCCACT GGCCTGTGCC GACCGTACTT 1500
CTTCTGGCTC ACTCTGTTCC AGCCTCCTTG CTGTTCCTTG TGAACAGTGA ACACACCCCT 1560
CCTCTGGGTC CTGGCACCCA GAAGTTCTCT CTCCCTGCAA CACTCTTCCC TCAGATAGCC 1620
TCATGGTTCA TTTACCTCGT CTCTGCTCAA ACGCTACCTA CTCAGCGAGC CCTTCCCTGA 1680
CCCTTCCATA AAAGAGCACA CCCCAACACT CTCAAACCCA TTACCTTGCC TTTTAAAAAC 1740
TTTACTGCAT TCATCACTGC TGGACACATT CTATATTTAT TTGCATATAT GTTCATAATC 1800
TTTCCTCACT GGAATGAAAG CTTCATGAGA ACATGGACTT TGTCCATTTT GTTCACTGCT 1860
GTGTTCCCCG GCACTACAGC TCAGAGCCTG GCTCAGCATG CACATGTCGA ATGAATGCAC 1920
GGGCCGAAGG AAACAGCCAA GGAGCTATGG CAGGGCTGCT GGCATTTAAC CTCTACACCT 1980
TCGGATGTGT CACGAATGCC TACAAACTAC ACCCTTCACA TTTCTAGCTG GCATTTCAGA 2040
TGCCCGTCAG TAATGGTGAG TATCTGTGGC CAGATGCTCC ATCCACAGTG TATGACATGC 2100
ATTGATTTAT GGTTATTACC CAGCTGGTGG CTCCAGCTGT AGATGCTGTA AAGGCTCTAA 2160
GGTGGGAGCA AAGTGATTTT AAATCACTGA CATACTGTTT AATAAAAAGT CAGATCTTTT 2220
GTGAATGGAG GAAGCCCCCA AACCAAAAAA GAAGAAAAAT CTGAAAAGAT CACAGAAGAT 2280
TTTTTTTTCA CTTATCAGAA AACTAGCAGC AGCATCCAGT CCCAAATGTC ACTAGGTATT 2340
CTGCTAGGGG ACTCTTAAGT TCCTGCTCAC AAGCCTGCTC TATAAACTTT ATGTCTAAAA 2400
TCAGTGTTGT TTCTTTCCAA AGTCTGTATT AGCGACAATG ATGTAGAAGT TATCACATGT 2460
AAAATCATGT TACTAAATAG ATAGATATAA ATTCTAATAT TCTTGATATA TACAGTAGAC 2520
AAAACAGTTC ACTGCAATTA AGCTTTAATA CTAACTCAGT ACTGGCTATC TTTTTCCCTT 2580
AGTAGTTATG AATAAGAGCT AAAGTGCCTT GTTTAATAAA TTATCAACAT ATTAAAATAT 2640
AAAAAATTTC AAAATTTGAT TTTTTTCAAA CAAGCAAACA AAATAACTAG ATATAGGAAA 2700
AGATGAAAAA AATTTATAAA AATGTTGAAG ACAAAAGCAA TTCATTCCCC TATTTTTCCT 2760
AATTGCCAGT ATTTCTCAAG TTTTTTTATA AGTGTTATTT TTATACTTGA AAATAAATTT 2820
TATTTACAAA ATAAAGACTA TTTCAGAAAA ATGACGTAGG TTTTTTAAAA AAGCTTTAAA 2880
AACACTTTCC AAGAAGGAAA CAAAGGAAAG GGAAAGAATA GAAAAACACT GGAAGTAGGG 2940
CCGGGTGCAG TGGCTCACGC CTGTAACCCC AGCACTTTGG GAGGCTGAGG TGGGCGGATC 3000
ACAAGGTCAG GAGATCGAGA CCATCCTGGC TAACACAGTG AAACCCTGTC TCTACTAAAA 3060
AATAAAATAA AAATTAGCTG GGCGTGGTGG CGGGCGCCTG TAGTCCCGGC TACTCGGGAG 3120
GCTGAGGCAG GAGAATGGCG TGAACCCGGG AGGCGGAGCT AGCAGTGAGC GAGATTGCGC 3180
CACTGCACTC CAGCCTGGGC GACAGAGCGA GACTCTGTCT CAAAAAAAAC GAAAAAAAAA 3240
AGAAAAACAC TGGAAGTATA TAACTTTTAA AGTTCTTTGC CACTAGTTTA AATTTTTAAG 3300
AAACTTCAAT TTTTATTGAT GTATACAGCA AACAATGCAA TTCATTGCAA TTAAGCTTTA 3360
ATACTAACTC AATACTGGCT TTAAATCAGC AAAATTGAAA ATATACGTTT CTTCAAAACA 3420
GGCCCTTATA GATAAAAATA TAAATACAAA GTTAAAACAA CCTGTAATAT TACATTTAAA 3480
TTGCAGCTAT CAACATAAAT TCATAATTTA AAAACTTTTT ATTAGGGAAC TTTTTAACCT 3540
TGTACAGAAA GAACTGGATA ATAAACAGCA GCTGGGTTTC ATCTTTACCC CTCAACTATC 3600
TCCCCCCAAC CATCCAGGAA TGCTTTCAAA GTAAATCCTA CTTTTTCAGG AAATAGTATG 3660
TATCTCTAAG AGGTACTCCT TAATCTTTTT AGTATTCACA ATATTATCCC AATTAAAAAA 3720
CGTTCCTTTA TTTCATCAAA TATTTAGCTT TCAGATTTCC ATGATGGTAT TATGATTTTG 3780
TTTGTTTACA TGTCATTTAC AGTTTGGCAG CATGAAGAGA CTCCCACTGG TCAATTTTGG 3840
TGTAATTTAA ACAGTAAGGC ATAATCACTG TCATTCATTT CAATATACTG AATATACAAA 3900
AATCTATGAA AATGATAATT TGCCACAACT GCATGGGACT ATTATATTGA TTTTTTACTT 3960
TGAAAATTGC TAATTAAATA AAAAGAACTG AGCATTTATC 4000