EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS121-08299 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LNCaP 
Coordinate
chr12:12619840-12626210 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr12:12624182-12624193TGCTGTGATTT-6.62
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Lhx3MA0135.1chr12:12620037-12620050AATTAATTAATTT-6.92
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MAFGMA0659.1chr12:12624118-12624139ATATTGCTGTCTCTGCAAATA+6.64
MAFKMA0496.2chr12:12624119-12624138TATTGCTGTCTCTGCAAAT+6.28
MAFKMA0496.2chr12:12624119-12624138TATTGCTGTCTCTGCAAAT-6.49
MyogMA0500.1chr12:12620339-12620350CTGCAGCTGTT-6.02
NFIL3MA0025.1chr12:12622465-12622476AGGTTACATAA-6.14
POU6F1MA0628.1chr12:12620038-12620048ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:12620038-12620048ATTAATTAAT-6.02
RESTMA0138.2chr12:12625551-12625572GCTGCTGGCCCGGGTGCTAAA-6.72
Tcf12MA0521.1chr12:12620339-12620350CTGCAGCTGTT-6.62
Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04317chr12:12620051-12621453Brain_Anterior_Caudate
SE_05127chr12:12619149-12621735Brain_Cingulate_Gyrus
SE_08012chr12:12619085-12621701Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11901chr12:12617903-12622122CD3
SE_14546chr12:12617013-12622712CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15462chr12:12618022-12621965CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16691chr12:12618003-12622008CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17031chr12:12617911-12622177CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17891chr12:12616021-12623274CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18383chr12:12617999-12622211CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19167chr12:12615913-12622619CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19167chr12:12623369-12624413CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_30974chr12:12617545-12622101Fetal_Thymus
SE_30974chr12:12623541-12624536Fetal_Thymus
SE_53068chr12:12619087-12621882Small_Intestine
SE_55503chr12:12619036-12621635Thymus
SE_62687chr12:12592722-12660146Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr121262138612621591
chr121262222912622985
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH12I012464chr121261733012623616
Enhancer Sequence
TGTATCTTGG CTAAACTTGA TCTGATTCTA ATCTTGGTTT GAGACAGGGT CTTGTGCTGT 60
TGCTCAGGCT GGAGTGCAGT GGCGCAATCA TAGCACACTG ACTCCTCAAA CTCCCGGGCT 120
CCGGGGATCC TCACGCCTCA GACTCCTGAG TAGCTGGGAT TACAGGTGTG TGCCACCAAA 180
TCCAGCTAAT TAAAAAAAAT TAATTAATTT TACATTTTCA AATTCAAAAG AATAATACAA 240
TGAATATTCA TATTTCTTTC ACCTAGATTG ACAAAAAGTG GTATATTTAA GACATCACCA 300
TCATTGTCTT TCTTCTGGAG TATACAGAAC CTGGTTCTGA ACACAGGGAT ATGTTTGTAG 360
CTTCGAGGAA TGAAGGGCTG TTTACAGAGC TACAAAAATA GCTTAGGTGC CATTATCCTC 420
ACTGCACTTA ATACAGGTGA CACATGAAAG CACAGAGTGG GTGGCAGTTC AAGCCTGCGA 480
GGGCCGAGCC TTTCCACTGC TGCAGCTGTT AGTGGCTGGC ACAGGGCAGG ATGGCAGACC 540
TAGTGCAGCA CAAACAAACC ACGCAGTCAG CCAGCTCTCC AGCCAACTGT GTCTACTTCT 600
AAAGTAGAAG TTAGACAAAA CATGGGGTTC ACTTAGACTG GGGTCCTGAG TAGGTGATAG 660
GCTACTTATT ACTGGGTGGA AGCGGAGAAG TATGGCAGAA GAACAATAGG CAAATTCAAT 720
ACTCCCGGAA AGAATTCTAG TTAGTTTAAT ATTTTGATGG CATGTTGTGG TTTCTGCAGT 780
GTCGTGAACT TGGCTAAACT GAACTGTGTT CCCAGAATTC CCTTCCTTGT TTGTTTCTCT 840
GGTGAGGGTT GGCCACGAGA GAGATTTGCA TGAGGTTTGG AAGTGGAAGT AGAGCAACAG 900
CCATGTGTAT TCACTGGAAG TGGATGTAGG TCAGGCCCTG TTCCATCACG TGCACGTTAC 960
CATGGATCTC CTGCACTTGT GGTGTGGGCA GCCGCTGGGC CCACGGCTCC TCCCACTCCC 1020
GCAGAACTCT GCCTTTGGCT TTTCCAGACC CTGGGCCGGG TATGAGAACC AGCTTCTTGG 1080
TCTGCAGCCA CAAGGATGAA GGTTTGGGGA TGAGAGACCA GCACGGGCTC TGATGAGAGA 1140
CAGGTGCAGG TCCCAGCTTG TGGCTTGCAG GTCTCAGTCG TACTTGCTCT CCCTCACCAT 1200
CCTTTCCAAC CGCCTGGCCT GTGGTCTGGT GAAGAAGAAA CAGCCGAACC GAGACTTTCA 1260
CCAGCCCCTC TAATTGCTCA AACCGCTTTC ACAATCCTCT CTTTCTACAT CATTCCTAGT 1320
GGTTCTTTTC TGATGGAACC TCTGACTGGT AACATGGCAT TACCAGTCCT TTCCCTCTCA 1380
TGTTTTGCTA TTTCCTGATG GAACCTGGGA GTCTGAGTGA TTTGTATTTC AAGAAGCAGT 1440
TATGCTGGAT CTCTTTGTTG GTTAATACCC CATGACCTAT CTGGCCGTTA TGGGATATTT 1500
CAGGGATAGG AGTTGTGAAA GAGCCCTTGG CTGGACGTTT CTAGCCTTAA TCTTTGGCAA 1560
GCCATTTCAT TTCCCTGAGC CTCAGTTTCC GCCTTCCTAC AGCGTGAGCA GGTCTGGGTG 1620
GGCTCTCAAG CCCCTTTCAG CTCTAAGATT CCAAGTCTGT GATTCCGATA CATCTTGACT 1680
ACAATGAGCG TGTTTACCTT TTGTCTCTGA GCAGTGGCCC TGGGTCTTGG TAGTGACTAA 1740
ATTCCGAGCT CCCAAGGTGC AGCTGCTTTT CTTCCTTTTA ATTATAAATT AGCTGTTCAT 1800
TGGCTGCTTC TTTCTAGAGC CTGTTTTGCT TATCTTGCAA TCTGTTCATT TCTGTTGATG 1860
AACACAGTCA AATAGGCCTC TATGTGCAGT CTCCTGGTTT CCCTGGTCAA AGTGGAAGGT 1920
TGGTAGAAAC TGGCCTTCAT GTCTTTGTTT CCCTCAAAGT TTTATTCTTA GTAACGCTAT 1980
ATATGGTTTT ATAGACCACA CATATATAGT TTCCTGTGTC TTAGATGATA ACATCCTTAA 2040
AATATGAAAT ATATTTTGAA CCTAGATACC TACCCAGTAT TCTCTGCACA GAGTAAACAT 2100
TTCATTAAAT GAGTTTCAAG GACTCCATAC CCTGATATAG GAGTACATTC AAGAAATGAG 2160
TTTAGGCCGG GCGCGGTGGC TCACACCTGT AATCCCAGCA CTTTGGGAGG CCGAGACGAG 2220
TGGATCACCT GAGGTCAGGA GTTCCAGACC AGCCTGACCA ACATGGTGAA ACCCCATCTC 2280
TACTAAAAAA AATACAGAAA TTACCCGGGC ATGGTGGCTG GTGCCTGTAA TCCCCGCTAC 2340
TTGGGAGGCC AAGGTGGGAG AATCGCTTGA ACCTGGGAGG CGGAGGTTGC AGTGAGCCAA 2400
GTTCGTGCCA TTGCACTCTG GCCTGGGTAA CAAGAGTGAA ACTCCGTTTA GAAATGAGTT 2460
TAGTCTGGGA GAATCTGCTT TTTGAGTAAA AAAGTTTGAT TTTATGTATG TGTGCGTCTG 2520
TATATATGTT TCTGTATCCT GAGTATTTCT TTGCGGCTTC TTCAGTTATG AAAGAGGTTG 2580
GTACTGTTAC CCTTACGTTA TAGGTATTAC AAACTCGGTT TTACAAGGTT ACATAAACTA 2640
ATGGCCCTGG GGCGAATGAC GTATGCCACT TTTGTGTTGA TTTGTAGAAC TTACTTAGCT 2700
TTGGCATTTC CCCTAGTAAT TCCCAAGGCA AAACCAGGAA TTGTCAGAGA CGTGACCAGA 2760
CATGTATTAA AATTCTAGTG CAATTGGGAA ACTTGGTCTT CCTGATTTGT TTATACTTCA 2820
GCCAAACCCA GATATATAGT GCTCAGCAGA AATTATTCAA AATGTTGATA CTCAAGATTG 2880
AAGGATGGAT TAGGGAGAAA TGAAAACTTT TCTTCTTGTG GACTTTTTAG GTATGAAATT 2940
TAATCACGAG AGTAGTTTTG CTTTTCTTTC CCTGACCTTT CGCTTCATTC CTTTGTTAAG 3000
AACTATATAG TGCCTCTGAG GAGGTGGCAT TATTGTTCAC TAACTTACCA TAAATCAGGG 3060
GTCTCCAAAC CCCAGGCCAC AGACTGGTAC CCATCTGTGG CGTGTGAGGA AGTGTGCTGC 3120
ACAGCAGGAG GTGAGCGGCG GATGAGCAGG TGAAGCTTCA CGTGTTGTTG TTGTTGTTTA 3180
TTGAGATGGA GTCTCGCTCT GTTGCCCAGG CTGGAGTGCA GTGGCACGAT CTCGGCTCAC 3240
TGCAACCTCC GCCTCCCGGG TTCAAGCAGT TATACTGTCT CAGCCTCCCG AGTAGCTGGG 3300
ACTACAGGTG CCCGCCACCA CACCCGGCTA ATTTTTTATT TTTAGTAGAG ATGGGGTTTC 3360
ACCATGTTGG CCAGGCAGGT CTCAAACTCC TGACCTCGTG ATCTGCCCGA CTTGGCCTCC 3420
CAAAGTACTG GGATTACAGG CGTGAGCCAC TGCACCTGGC CAGCTTCGTG TGTATTTATA 3480
GCTGCTCCCC ATCACTCACA TCACTGCCTG AGCTCCACCT CCTGTCAGAA CAGACCCAGC 3540
ATTAGACTCC CCTAAGAGCG TGAACCCTAT TGTGAACTGC GCACGTGAAG GATCTAGGTT 3600
TTGCGCTCCT TATGAGAATC TAATGCCTGA TGATCTGAGA TGGAACGGTT TCATCCAGAA 3660
ACCATCCCCC TGCTTCCCTG TCTGTAGAAA AATTGTCTTC TATGAAATGG GTCCCTGGTG 3720
CCAGAAAGGT TGGGGACTGC TGTCATAAAT AACATTGAAT TTCATGTGGG TTTTTTTTTT 3780
TTGACACACC AGGCATGTCT CTTCCATTCA AATGCTATGG CTACAGAGGG AAAGGGTAGC 3840
CAGATAATTA TCCACATGCT TCAAACCAAA AAGATAAAAA AGTTGGCAAC TAGATCTAGT 3900
TGCCTGCCAG GATGACCAGC GTTATGCTGG TGTGTGCGTG TCCATGCCTC CGGGATTTTT 3960
CCAGGGTTAT CAATGTCAGT GTAAGATCTG ATGGAATTTA CCGTTGACTC AATTTTCTTC 4020
ACCAATCAAG GCTCATTCCT TGAGGCATGA GTTATGCGAA AAGCTTTTCT GCACCAAGTA 4080
CTTTCATTCT GGTCTTTGGA ATTGTCATAA TTCTGACAGA GAACACAGAC CATTACTGAA 4140
TGCTCTTCAG GTTACCCTAT TTGCCTGTCA CATTGCTTCT ACCGGCCACA TCCTGCATTT 4200
CCTGTGGGAC AGCATTTTCA AACGGATTCT AGTGTTTGAG CTGGAACCAA AAGAATGAAA 4260
CTGTTTTTAC ATAAGTGCAT ATTGCTGTCT CTGCAAATAA AGTACAACAA TATGACTGAC 4320
TTGTAAATAT CTTCCAGGAC AATGCTGTGA TTTTCCAGTT GATTCTGCAA CTTTAAAGAT 4380
ATAACCAAGT ATAATTAGGC CGTTCAAGGA TGAATGGGTC CCACAGAAGC TAGAAATAGT 4440
TTACTTCCTG CTTCCATTTC TAGATGCAGA AGACTAATAT TCACAGAAAA ATTACGTAGA 4500
CAAATTTTGT TTACTAGATC TAAAACATTC CTGCTTCTCA GAAAAACAAA ACCAAAGGAG 4560
TATTTAAGAT AAAGTAACAG TGAACGTGTT GAGACTAAAA AGTTTCCATC AACTAGTCCC 4620
ATATGCACCC TCTACCCTTC ACATAATCTC TTTGGACACT CGGCTCCAAT TTTGTCTTAT 4680
TTTTCTTCAC ATCTCAATCT ACACCTTCCT AATATGTCCG GAATTGGTGG ATTCTTGGTT 4740
TCACTGACTT CAAGAATGAA GTCGCGGACC CTCACAGTGA GTGTTACAGT TCTTAAAGGC 4800
AGCGTGTCCG GAGTTTGTTC CTTCTGATGT TCGGATGTGT TTGGAGTTTC TTCCTTCTGG 4860
TGGGTTCGTG GTGTCGCTGG CTCAGGAGTG AAGCTGCAGA CCTTCGCGGT GAGTGTTACA 4920
GCTCTTAAGG CAGCGCGTCC AGAGTTGTTC ATTCCTCCCA GTGGGCTCGT GGTCTCGCTG 4980
GCTTCAGGAG TAAAGCTGCA GACCTTTGCG GTGAGTGTTA CAGCTCATAA AAGCAGTGTG 5040
GACCCAAAGA GTGAGCAGTA GCAAGATTTA TTGCAAAGAG CGAAAGAACA AAGCTTCCAC 5100
AGTGTGGAAG GGGACCCGAG CGGGTTGCCA CCGCTGGCTC GGGCAGCCTG CTTTTATTCT 5160
CTTATCTGGC CCCACCCACA TCCTGCTGAT TGGTAGAGCC GAGTGGTCTG TTTTGACAGG 5220
GCACTGATTT GTGTGTTTAC AATCCCTGAG CTAGACACAA ATGTTCTCCA AGGCCCCACC 5280
AGAGTAGCTA GATACAGAGG GTTGATTGGT GCATTCACGA ACCTTGAGCT AGACACAGGG 5340
TGCTGATTGG TGTGTTTACA AACCTTGAGC TAGATACAGA GTGCCGATTG GTGTATTTAC 5400
AATCCCTGAG CTAGACATAA AGGTTCTCCA AGTCCCCACC AGACTCAGGA GCCCAGCTGG 5460
CTTCACCCAG TGGATCCTGC ACCAGAGCTG CAGGTGGAGC TACCTGCCAG TCCCACGCCC 5520
TGTGCCCACA CTCCTCAGCC CTTGGCTGGT TGATGGGACT GGGCGCTGTG GAGCAGGGGG 5580
CGGCGCTCGG GGAGGCTCAG GCCGCACAGG AGCCCACGGA GTTCGGGGAG GCTCAGGCAT 5640
GGCGGGCTGC AGGTCCTGAG CCCTGCCCTG TGGGAAGGCA GCTAAGGCCC TGTGAGAAAT 5700
TGAGCACAGC AGCTGCTGGC CCGGGTGCTA AAAGCCCCTC ACTGCTCGGG CGGTGGGGCC 5760
AGCTGGCTGC TCCGAGCGCA GGGTCCGCTG AGCCCACGCC CACCTGGAAC TCGCACTGGC 5820
CTGCAAGCAC CGTGCGCAGC CCCGGTTCCC GCCCATGCCT CTCCCTCCAC ACCTCTCCCT 5880
CCACACCTCC CGGCAAGCTG AGGGAGCCGG CTCCGCCTTG GCCAGCCGAG AAAGGGGCTC 5940
CCACAGTGCA GCGGCGGGCT GAAGGGCTCC TCAAGTGCCG CCAAAGTGGA AGCCCAGGCA 6000
GAGGAGGTGC TGAGAGTGAG TGAGGGGTGT GAGGGCTGCC AGTGCGCTGT CACCTCTCAC 6060
TAATTTCCCC TTAGTTTATT TTTTGTTTAA AATGGAGTTT CGCTCTTGTT GCCCAGGCTG 6120
GAGTGCAATG GCGAAATCTT GGCTCACTGT AACCTCCACC TCCTAGGTTC AAGCAATTCT 6180
CGTGCCTCAG CCTCCCAAGT AGCTGGGATG ACAGGCACCC ACACCTGGCT AATTTTTGTA 6240
TTTTTAGTAG AGAAGGGATT TCACCAGGTA GGCCCGGTTG GTCTCAAACT CCTGACCTCA 6300
GGTAATCCAC CTGCCTTGGC CTCCCAAAGT GCTGGGATTA CAAGCGTGAG CCACCGCCCC 6360
CAGCCTCCCC 6370