Tag | Content |
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EnhancerAtlas ID | HS121-04205 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | LNCaP |
Coordinate | chr1:243437960-243449570 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
DMRT3 | MA0610.1 | chr1:243439695-243439706 | TTTGATACATT | - | 6.02 | FOXA1 | MA0148.4 | chr1:243446472-243446488 | GTTTGTTTACTTTGGC | - | 6.97 | FOXP2 | MA0593.1 | chr1:243446473-243446484 | TTTGTTTACTT | - | 6.62 | Foxa2 | MA0047.2 | chr1:243446475-243446487 | TGTTTACTTTGG | + | 6.74 | Foxd3 | MA0041.1 | chr1:243446468-243446480 | GTTTGTTTGTTT | + | 6.32 | Foxq1 | MA0040.1 | chr1:243441070-243441081 | AATTGTTTATT | + | 6.02 | LMX1B | MA0703.2 | chr1:243442084-243442095 | ATTTTAATTAA | + | 6.62 | MEF2C | MA0497.1 | chr1:243443718-243443733 | TTCTATTTTTAATTT | - | 6.12 | Nkx3-2 | MA0122.3 | chr1:243439737-243439750 | TTTAAGTGGTTTA | - | 7.04 | Nr2f6(var.2) | MA0728.1 | chr1:243439384-243439399 | CGATCTCTTGACCTC | - | 6 | ZNF263 | MA0528.1 | chr1:243438589-243438610 | CTTTCTTTCTTTCCCTCCCTC | - | 6.3 |
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| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 3 | Chromosome | Start | End |
chr1 | 243447429 | 243448209 | chr1 | 243447462 | 243448200 | chr1 | 243447752 | 243447803 |
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| Number: 1 | ID | Chromosome | Start | End |
GH01I243283 | chr1 | 243447104 | 243452694 |
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Enhancer Sequence | AAGTTTCTCA TTAAGAATTT AAAACTAAAT AAATGAAAGC TTATATTAAC TATAGATTGT 60 ATTAAAATTT GCTGCTATAA ATCTTCATGT TTGTAGCAAT ACATTGACAA TTGCTATTCT 120 TACGTGATTG AGAGACTGAT GTGTCACAAG AGCTTGTCAG ACTTGGGAAT GATGCTCTTG 180 ACCATACCAT TTCTGATTGC TTGATTTCCC AGTAGTTCAT TACTATGTCT AATGATTTCA 240 TAATATGCTT TCATATTTCA GAAGTTTTCC TTCTCACCCC GCTTGCTGTA GCCCAGCAAA 300 TGGCAAATGC TTTGGAATAC AAATACCAAT CATTCTCCCA TACTTGTCAA CCTACTGGAG 360 CAGTGGTACA GCAATCAGGG ATTCTAAACT GGTAGACCAA TTCTTCTCCG CTGTCAGTAT 420 TAAGGCTCTT ACTTTGACTT TGAATGAGAA TGGTTCATAG GGTACTGACA GTAATGATCA 480 AGAAACCAAA CACATCATAT ATAGCTTATG ACACTAGAAG GTTATATGCT CAACTGCGTG 540 CAGTTTGCTA ATGTCATTAA TGCTAATAGA GCCTTTTCAT CTTCCCGAAG TATGTCGTGT 600 TTTACTTTTT TTTTTCTGTT TCTTTCTCTC TTTCTTTCTT TCCCTCCCTC TTTCTTTCTT 660 TCTAGTATCA GTGTATTCGA TTGTATGATA TTTTTATAGG AATCACTGAT ATCTCTTGTA 720 TCATGTTTTT ATATATAGTA TATGATATTA TGTATTATAT TGTTGACATT TTAAGATGCA 780 AGGCCAGTAT GTAACTTAAG GAGGCTTTAG ATGTTTCACT GTCCTGATTT TACCGGGGAG 840 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