Tag | Content |
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EnhancerAtlas ID | HS121-01740 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | LNCaP |
Coordinate | chr1:53559230-53569010 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
DMRT3 | MA0610.1 | chr1:53562407-53562418 | CTTGATACATT | - | 6.02 | KLF4 | MA0039.3 | chr1:53561067-53561078 | CCACACCCTGC | + | 6.62 | Klf1 | MA0493.1 | chr1:53561065-53561076 | AGCCACACCCT | + | 6.02 | RREB1 | MA0073.1 | chr1:53567137-53567157 | CCTCGAAACACCCACACACA | + | 6.01 | ZEB1 | MA0103.3 | chr1:53568996-53569007 | GGGCAGGTGGG | - | 6.14 | ZNF263 | MA0528.1 | chr1:53559360-53559381 | CTCCCTCTCTCCTCCTCCACT | - | 6.33 | ZNF263 | MA0528.1 | chr1:53559410-53559431 | CCTCCTCTCTCACCTTCCTCC | - | 6.4 | ZNF263 | MA0528.1 | chr1:53559354-53559375 | CTCTCTCTCCCTCTCTCCTCC | - | 7.02 | ZNF263 | MA0528.1 | chr1:53559357-53559378 | TCTCTCCCTCTCTCCTCCTCC | - | 7.88 | Zfx | MA0146.2 | chr1:53567842-53567856 | GAGGCCCCGGCCCC | - | 6.33 |
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| Number of super-enhancer constituents: 1 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_50019 | chr1:53555211-53561312 | RPMI-8402 |
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| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 4 | Chromosome | Start | End |
chr1 | 53559805 | 53560009 | chr1 | 53560013 | 53560187 | chr1 | 53560346 | 53560499 | chr1 | 53563025 | 53563079 |
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| Number: 1 | ID | Chromosome | Start | End |
GH01I053094 | chr1 | 53559901 | 53560045 |
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Enhancer Sequence | GCCTGCGGGT CAGGGACACA GTGCTGTGGT AAAGCAGGGA CAGACCCACA GGCCCACATG 60 GGTCTCAGCA TGGCTGGCTT CCCAGCAGCC TTGATGCTCC AGCACTCCCC CCACTCCCCC 120 CACTCTCTCT CTCCCTCTCT CCTCCTCCAC TCTACTACCG ATCCCACAGT GCTCTCACGT 180 CCTCCTCTCT CACCTTCCTC CACGCAGCAG CCAATGTCAC CTCCTCAGGA TAAAAGTGCT 240 CCCTGCCAAG TGCACCCCTG GCTTCGCTGT GCGCTTAGGC CATGACAAGC TCCCCGCTGC 300 CTCACCCAGC TCGATGCCTC AGCCCCACTC GAGTGGGCCC TGCCTGCCTC TCCCTCCTGC 360 TCCTGCCCAT CTCACTGTGC CCTGGCACCA CTGGCCTTCT TTAAGTTTCT GGAAGGAGGG 420 AGTCCAGCTC TTCACTGCCT CAGGGCCTTT GCGCAAGCCG TTTACACAGT GCCCCAGGCA 480 CTGGCTGCCC GCTCTCCAAA CAGCTTGGAA GCCATCCCCG ATCCCCTTTG CAAACTCCCA 540 TTTATTCTTC AATATCTCAC CTCTTAGGGC CTATTACAAC ATAACTGTCT GGGTTTTTTC 600 CCGTCTCCTC TGCGAGGTTA GCTCAGCGAG AGCAAGAACT GCATCTCCTT AGCTGGAGCA 660 TGTTAGACGC ACAGTGGTCA ATGGTGAGTG AGGACTAGGG CCTTTCCTGA TGCTCCTGGC 720 GCCTCCCCCG GCATTCTAGG CCTTCCTCCC CAGCTCGCAC ACACCAGGAA AGGGTGGTGT 780 GGGAACGGCT CCGTGGGGTG AGCTCTGTCA GGCCAGTCCT GAAACAGGGA CTGAGTGGCT 840 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