EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS120-02239 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LNCaP-abl 
Coordinate
chr15:93374260-93376600 
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr15:93375428-93375448CCCCCCACCACCCCCAATAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 86             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00699chr15:93373648-93377608Adipose_Nuclei
SE_02552chr15:93374069-93376305Astrocytes
SE_03406chr15:93374077-93376055Brain_Angular_Gyrus
SE_03406chr15:93376068-93377544Brain_Angular_Gyrus
SE_04213chr15:93372534-93377489Brain_Anterior_Caudate
SE_05294chr15:93372494-93377830Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06531chr15:93372539-93377958Brain_Hippocampus_Middle
SE_06939chr15:93372557-93377819Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08169chr15:93372554-93377827Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08934chr15:93374247-93375981Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08934chr15:93376213-93376450Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09652chr15:93373864-93377794CD14
SE_10533chr15:93373231-93377680CD19_Primary
SE_11607chr15:93372458-93378123CD20
SE_12070chr15:93373372-93377536CD3
SE_13564chr15:93373857-93377684CD34_Primary_RO01536
SE_14477chr15:93373207-93377754CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15588chr15:93373921-93376594CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16031chr15:93374073-93377568CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16747chr15:93373884-93376835CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17069chr15:93374042-93376394CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17547chr15:93373233-93377889CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18103chr15:93372931-93377425CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18547chr15:93372973-93378037CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19553chr15:93373428-93377578CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20693chr15:93373900-93377177CD56
SE_20859chr15:93373853-93377257CD8_Memory_7pool
SE_21781chr15:93373916-93376716CD8_Naive_7pool
SE_22279chr15:93373857-93376598CD8_Naive_8pool
SE_22966chr15:93373139-93377829CD8_primiary
SE_23716chr15:93374253-93375526Colon_Crypt_1
SE_23716chr15:93375600-93376068Colon_Crypt_1
SE_24264chr15:93374697-93375434Colon_Crypt_2
SE_24264chr15:93375655-93376010Colon_Crypt_2
SE_26010chr15:93373872-93377530Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26840chr15:93373886-93377550Esophagus
SE_27996chr15:93373438-93377142Fetal_Intestine
SE_28970chr15:93373388-93377254Fetal_Intestine_Large
SE_29703chr15:93372762-93377615Fetal_Muscle
SE_30995chr15:93372882-93377545Fetal_Thymus
SE_31921chr15:93373895-93377057Gastric
SE_32877chr15:93374302-93376216H1
SE_33509chr15:93372616-93378855H2171
SE_33848chr15:93374213-93376282HCC1954
SE_34564chr15:93373889-93377088HCT-116
SE_34679chr15:93373898-93376664HeLa
SE_35377chr15:93374028-93376428HepG2
SE_36003chr15:93374111-93376462HMEC
SE_37354chr15:93373641-93376710HSMMtube
SE_39112chr15:93374292-93377409IMR90
SE_39970chr15:93374350-93376292K562
SE_41310chr15:93373442-93377529Left_Ventricle
SE_42600chr15:93373747-93377540Lung
SE_43471chr15:93374160-93376166MCF-7
SE_43659chr15:93373361-93377710MM1S
SE_44673chr15:93374247-93376095NHDF-Ad
SE_45291chr15:93374300-93376339NHLF
SE_47211chr15:93372273-93377817Panc1
SE_47960chr15:93374189-93374521Pancreas
SE_47960chr15:93374672-93375403Pancreas
SE_47960chr15:93375652-93376235Pancreas
SE_47960chr15:93376304-93376771Pancreas
SE_48549chr15:93373473-93377385Psoas_Muscle
SE_49286chr15:93373883-93374631Right_Atrium
SE_49286chr15:93374713-93375566Right_Atrium
SE_49286chr15:93375611-93377542Right_Atrium
SE_50492chr15:93374140-93377562Sigmoid_Colon
SE_51268chr15:93372587-93377959Skeletal_Muscle
SE_52184chr15:93374616-93375547Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52822chr15:93374087-93377536Small_Intestine
SE_53626chr15:93374061-93377491Spleen
SE_55179chr15:93374012-93377537Thymus
SE_56153chr15:93374270-93376736u87
SE_57089chr15:93374920-93375484VACO_400
SE_58414chr15:93350819-93397613Ly1
SE_59292chr15:93350909-93397284Ly3
SE_59816chr15:93351073-93397403Ly4
SE_60705chr15:93340495-93393151DHL6
SE_61142chr15:93340330-93400291HBL1
SE_61602chr15:93347024-93408751Toledo
SE_62387chr15:93344538-93393491Tonsil
SE_63974chr15:93374541-93375645HSMM
SE_64371chr15:93374179-93376102NHEK
SE_65898chr15:93373593-93375744Pancreatic_islets
SE_67338chr15:93373361-93377710MM1S
SE_68639chr15:93350938-93376211TC71
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH15I092829chr159337289693378030
Enhancer Sequence
TTTGAATTTT TTTAAAAAAA CACCTAAAGT TTAGGAAAGT ATAAGAGGCC AAAGAAACAA 60
GAGTTCAAAG AAACAAGAGT GTTATACACG CACACTTGCA GAAAGGTAGT AAAATATCTG 120
TATAGTTCTG GCTGTCAAGC TTTTGGACTG AGATATGCGT AAGCAAGGCA AAAAGATCCC 180
ATAGTCCAGG AATATCAACC AGTCCAGTTT CCCAAGGAAA CTAAAAGTAA CTGAAAATGA 240
GAAGGGTGCC ATATAGGAAA ATTGAAGGTG GGGCATAATT ATTAATACAC TGCTTTGGAA 300
ATGCTGGTAT GGAAGATTCA TATATGGACT TCAAAGCATA CATGTCTTAT ACTTAGCTAT 360
GGGAAAATTA TCATCAAAAT CTTCATTTAT ACAAATCACG GGTATTAGAA ATAAAATCAG 420
GTATTGTGTA CAGTCAGATC CCAGGTTTAC ACAAACTAGA GGTTTCAATT AAGTTTCCTT 480
CATTTTATAA AACCATGACA CAAGCTGTAA ATAAAGGAGC TCTGGCTTTA GGCCTTCTTC 540
TGTTTATAGA CAGTAAATTT TAATCCTCTG TCCCTGCAGA CCAACTCAAA GCAGTAACCT 600
TGGCTACCGT TGCCGCAGAA GAAACACACC CTGCAGATTT CCAGTTCTAT ATTCAGTCTT 660
AGAAAATTGG TCATGTTGAA AGGGAAAAAA CAATTTTACT TTGCCTCAGT TATTGACACC 720
AAGAAGCACT CCTCAGCCTG TTCAGAGGGG AAACAATGAG TCATTCATGC TGTCAGCCCA 780
GGTGGTGCAT GAATTCCAGA CAGAGGCCGC TGAATTAACC CGTGGAGGCG TCTCTCTGAG 840
CAGAGCCCGC AATGCGCCTG CTTGGGGCTC CCTGCAGCCT CTGGGGGAGG CAGGGCGGCC 900
CAGAGCAGGC CTGTGCTGGA AAGGAACGCG AAGCCCTGTA ACCAAGCCTG TACCTCTGCA 960
GTGCTAGTCC CAAGGGGCCT CCGAGCTGTT TGTCACCATG TGATTGGCTC AGGAGAGGGG 1020
TGGAGAAATG AAAACACTCT GCCCAGGATA TATTTAGTTG AAGTGCAGCT GGGGAAGTGC 1080
TTAAACAAGG GAGCTTTTGT CCTTATGTTG AAGTGTTTTT CTTAACTCCT CAAGGGTGAA 1140
AAACTTGAGC CACGTACTGA TCCCATTCCC CCCCACCACC CCCAATATAT TTTCTCTTCT 1200
TTAGGAAATG CTCTTATTCT GAAACTTTAG AATTTTCTAG GGTTTGTTGC ATAAGAGGAA 1260
ACTGAATAAT TCTGATGCAG AACTGACACA AAATTTAAAG CACAAACTTT TAGTGGGAGA 1320
CACAGTTAAG AAATTCAAAT AATTTCTTAA CACATTAGAA GTTTGCATTC TTGCCATTAA 1380
TTTTCTGTAA GTTCAAACTG GAAATTGGCT ATTTTCAAAC GGCTTTACTT GAACTAATTT 1440
ATGGAGTTAA AAACATAATT AAGTGTTATA AGCTGACAGA GCCCTGTTTC ACTCGAGCTG 1500
ATTCACGGTT TCCAGTAATG AAAGATATCC TTCTGCGCTG CTGAGCACAG CTTCTTTGCA 1560
ACAGATGACT GATGAGCCGT GTAACGGCTC CTGTTCACAT CCTCCTCAAA AAATGGCTGA 1620
AAACTGCCAC CTTGCTGCAA GGCTTTATGT AAATACTGTA TATTAGGGCA CATTATCTAT 1680
TATTAAGAAG TAATGTGGCT GGGCACTGTG GCTCATGCCT GTAATCCCAG CACTTTGGGA 1740
GGCCGAAGCA GGCAGATCAC CTGAGGTCAG TTCAAGACCA GCCTGGCCAA TGTGGTGAAA 1800
CACCTCTCTA TGAAAAATAC AAAAATCAGC CAGGCGTGGT GGCGCATACC TGGAGTCCCA 1860
GCTACTCAGG AGGCTGAGGC ATGAGAATCG CTTGAACCCA GAGGGGAGGT TGCAGTAAGC 1920
TGAGGTTGCA CCACTGAACT CCAGCCTGGA TGACAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAATAGC 1980
AACACAGGAA ATATTTTCCA TGAAAATTCC ATTTGCAGTT ATGAAGCAGG GGCAAAAACT 2040
TCTGGACAAG AAGCCCGTGG TTTTGTTGAT ACTAGCAAAG CAGGCTGTAA TAGTGCTCTC 2100
CAGAGAAACA GAACCAGTAG GATGTGCATA TTTATAGACA AAGATTTCTC TCTCTCTCTT 2160
TTTTTTTGAG ACAGGTCCTT GCTCTGTCAC TCAGGCTGGA GTGCACTGGC GTAATCTTGG 2220
CTTCCTGCAG CCTCAACCTC TCCTAGCTCA AGCAATCCTC CTGCCTCAGT CTCACGAGAA 2280
GCTGAGACTA CAGGTGCATG CCACCATGCC CAGGTAATTT TTAATTTTTT GTAGAGATGG 2340