EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS120-01181 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
LNCaP-abl 
Coordinate
chr11:65194000-65198400 
Target genes
Number: 42             
NameEnsembl ID
ARL2ENSG00000213465
SNX15ENSG00000110025
SAC3D1ENSG00000168061
NAALADL1ENSG00000168060
CDCA5ENSG00000146670
ZFPL1ENSG00000162300
C11orf2ENSG00000149823
AP003068.9ENSG00000254501
TM7SF2ENSG00000149809
AP003068.12ENSG00000255173
ZNHIT2ENSG00000174276
MRPL49ENSG00000149792
FAUENSG00000149806
SYVN1ENSG00000162298
HIGD1AP10ENSG00000254455
AP003068.17ENSG00000255058
AP003068.18ENSG00000255200
CAPN1ENSG00000014216
AP003068.23ENSG00000254614
SLC22A20ENSG00000197847
POLA2ENSG00000014138
CDC42EP2ENSG00000149798
DPF2ENSG00000133884
SLC25A45ENSG00000162241
FRMD8ENSG00000126391
NEAT1ENSG00000245532
MIR612ENSG00000207727
AP000769.1ENSG00000173727
MALAT1ENSG00000251562
SCYL1ENSG00000142186
LTBP3ENSG00000168056
RP11ENSG00000260233
SSSCA1ENSG00000173465
FAM89BENSG00000176973
EHBP1L1ENSG00000173442
KCNK7ENSG00000173338
RELAENSG00000173039
KAT5ENSG00000172977
RNASEH2CENSG00000172922
AP001266.1ENSG00000175827
AP5B1ENSG00000254470
OVOL1ENSG00000172818
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr11:65194246-65194257AACCACTCAAG+6.32
Stat6MA0520.1chr11:65196813-65196828CTCTTCCTCAGAACC+6.21
ZNF263MA0528.1chr11:65197685-65197706CCCTCCTTCCCCGCCTCCCCT-7.03
Number of super-enhancer constituents: 113             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00061chr11:65182163-65214870Adipose_Nuclei
SE_00899chr11:65194390-65196336Adrenal_Gland
SE_00899chr11:65197196-65198024Adrenal_Gland
SE_01675chr11:65193981-65196346Aorta
SE_01675chr11:65197108-65197984Aorta
SE_02333chr11:65185865-65196097Astrocytes
SE_02333chr11:65196411-65197158Astrocytes
SE_02333chr11:65197175-65198420Astrocytes
SE_02930chr11:65194353-65195210Bladder
SE_03219chr11:65182855-65195660Brain_Angular_Gyrus
SE_03219chr11:65195714-65196251Brain_Angular_Gyrus
SE_03219chr11:65196508-65197099Brain_Angular_Gyrus
SE_03219chr11:65197581-65198295Brain_Angular_Gyrus
SE_03924chr11:65182069-65198724Brain_Anterior_Caudate
SE_04949chr11:65178995-65198789Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05878chr11:65178245-65198645Brain_Hippocampus_Middle
SE_06798chr11:65182161-65199076Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07925chr11:65178950-65198640Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08807chr11:65193581-65195402Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09254chr11:65183563-65199556CD14
SE_10174chr11:65183728-65196377CD19_Primary
SE_10174chr11:65196401-65200031CD19_Primary
SE_10943chr11:65183347-65200649CD20
SE_11863chr11:65183886-65199275CD3
SE_12863chr11:65183995-65198109CD34_Primary_RO01480
SE_13329chr11:65183533-65198664CD34_Primary_RO01536
SE_14055chr11:65184014-65198287CD34_Primary_RO01549
SE_14385chr11:65183052-65198998CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15391chr11:65183660-65199965CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15806chr11:65183609-65195105CD4_Naive_Primary_7pool
SE_15806chr11:65195144-65196725CD4_Naive_Primary_7pool
SE_15806chr11:65196792-65198376CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16287chr11:65183450-65199116CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16878chr11:65183760-65199009CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17315chr11:65183311-65200746CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17800chr11:65182980-65200056CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18291chr11:65183371-65202410CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19134chr11:65183450-65198813CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19987chr11:65183666-65200669CD56
SE_20737chr11:65183321-65199979CD8_Memory_7pool
SE_21449chr11:65183726-65199286CD8_Naive_7pool
SE_21916chr11:65183565-65199389CD8_Naive_8pool
SE_22294chr11:65183376-65201794CD8_primiary
SE_23063chr11:65183639-65196319Colon_Crypt_1
SE_23730chr11:65193982-65195263Colon_Crypt_2
SE_23730chr11:65195698-65196333Colon_Crypt_2
SE_23730chr11:65197211-65197955Colon_Crypt_2
SE_24740chr11:65183693-65195503Colon_Crypt_3
SE_25606chr11:65183310-65198526DND41
SE_25780chr11:65183301-65200057Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27682chr11:65182702-65198983Fetal_Intestine
SE_28592chr11:65183217-65199095Fetal_Intestine_Large
SE_29609chr11:65183800-65195231Fetal_Muscle
SE_29609chr11:65195512-65198662Fetal_Muscle
SE_30977chr11:65183975-65199000Fetal_Thymus
SE_32521chr11:65183686-65196252GM12878
SE_32521chr11:65196287-65199977GM12878
SE_33858chr11:65184005-65198635HCC1954
SE_34335chr11:65193736-65196214HCT-116
SE_34335chr11:65196500-65198325HCT-116
SE_34625chr11:65183091-65198780HeLa
SE_35930chr11:65185034-65198304HMEC
SE_36987chr11:65181765-65200419HSMMtube
SE_38110chr11:65183656-65198948HUVEC
SE_38985chr11:65183445-65196407IMR90
SE_39677chr11:65194472-65195332Jurkat
SE_39677chr11:65197097-65198385Jurkat
SE_39868chr11:65183327-65196343K562
SE_39868chr11:65196610-65198139K562
SE_40661chr11:65182998-65196371Left_Ventricle
SE_41607chr11:65194344-65195652LNCaP
SE_41607chr11:65195726-65196394LNCaP
SE_41607chr11:65197193-65197925LNCaP
SE_42143chr11:65182856-65196355Lung
SE_43609chr11:65183236-65199733MM1S
SE_44142chr11:65182207-65204701NHDF-Ad
SE_44763chr11:65184033-65199082NHLF
SE_45691chr11:65183413-65204702Osteoblasts
SE_47173chr11:65182160-65217345Panc1
SE_47493chr11:65194423-65195218Pancreas
SE_47493chr11:65197214-65197887Pancreas
SE_50067chr11:65182129-65196444Sigmoid_Colon
SE_51083chr11:65182107-65198857Skeletal_Muscle
SE_51809chr11:65183997-65196206Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51809chr11:65196451-65198222Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52351chr11:65183325-65196432Small_Intestine
SE_53289chr11:65183170-65199235Spleen
SE_54628chr11:65183355-65198735Stomach_Smooth_Muscle
SE_55118chr11:65183763-65196356Thymus
SE_55118chr11:65197213-65198766Thymus
SE_56200chr11:65183426-65198946u87
SE_57393chr11:65194403-65195619VACO_503
SE_57393chr11:65197137-65197851VACO_503
SE_58461chr11:65170809-65225246Ly1
SE_58925chr11:65170783-65198465Ly3
SE_59648chr11:65169738-65223378Ly4
SE_60421chr11:65157742-65225276DHL6
SE_61166chr11:65170820-65199975HBL1
SE_61489chr11:65182225-65202320Toledo
SE_62214chr11:65170357-65224596Tonsil
SE_63599chr11:65183859-65196362HSMM
SE_63599chr11:65196451-65198282HSMM
SE_64274chr11:65185872-65198415NHEK
SE_66506chr11:65194472-65195332Jurkat
SE_66506chr11:65197097-65198385Jurkat
SE_67147chr11:65183236-65199733MM1S
SE_67461chr11:65183426-65198946u87
SE_68250chr11:65184198-65198490TC32
SE_68251chr11:65184198-65198490TC32
SE_68252chr11:65184198-65198490TC32
SE_68574chr11:65184357-65198079TC71
SE_68575chr11:65184357-65198079TC71
SE_68576chr11:65184357-65198079TC71
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr116519723165198400
Enhancer Sequence
GAATTGTTGT ATTGCTATGT TACATTTCTC GACCCCTATC ACATTGCCTT CATAACGACT 60
TTGGATGTAT CTTCATATTG TAGATTTAGG TCTAGATTTG CTAGCTCCAA GTAATTAAGG 120
CCATGTAGGA GAGCATGGTA ACCACAGATA GAACTGGTAT TATCCCAAGT GGTCTGCAGA 180
CTGCTGAGTG GGGATGGGAT CTGCTCTCTG TTGAGAGTTG GTAATCATTG GTTTGAAATG 240
TGATGAAACC ACTCAAGCCA ATGAAGGTGG GTGTGTAGGT GGGGAGTACT TTGCCATAAT 300
ATTTTAAAAC ATTACCTGGT TAGAGTTCTA AGTGGTACTT ATTTTTGTTT GGTTAGGGGA 360
AAGCCTGAAT AAAAACAGAA ATGGACACAT AATATGCATA TTCCATAGTC TTTGGGAGGC 420
TGGAATGTGC CTGGGATTTG GGTCTAAGTG TATGCGTAAT TCTTACCTCA CTAAAGAATT 480
TGCCTTGTTT TTTTCCTTTT GGTGAGTGAC TAAAACGTCT GGGCTTCCCT GTGTGCGTGC 540
TACAGTAAGC AAGCAGAGGC TGTGCAAAGG TGTGAGCAGG ATCACGTGGA ATCTGGAGGA 600
TACATCTTGG CTTGCAAACT GCCTCTGTCT CCTGGGTGGG ACTGTTCTGT CCTTGCACTG 660
CTGTTCTGTG TTACCTCTTG GGGTGTAAGG TTTTGCTTAC AGGAGACAAA CTTTGGGCGT 720
AGAATGGAAG CCACTGCCAG CCTCTGTGCT GAGAAGGAAG GTGCTTGTTT CAAAGGGAGC 780
AGCAAGGGAG GCTTGTTCTA CTCACCTGGG CCTGTTTGCC TGAGAAGGGG AGATAAGGGC 840
TGAACTGGGA CTAGCCAGGG GGACCAACAC AAATGGTGGG GGATCATGAC CTGAAGGATT 900
CTTTCCTTCC CATGAGCTGC AGGGCTGGTT GCCGTCCTTG CAACTGTGTC TTATTTGCCT 960
GTGCCGTTAT ATCTTGGTGA CCCCTCCACG TGTACACTAC TGACAAACGG GTGGAGTGCT 1020
GGGGAGAAGT CACTGTGCCG CCCACCTAGT AAACCTTCTG TCTGTGCTCA TGGCATCTCC 1080
AAGATGGGGC ACTGCTGTGT GCAGAATCCA GGGTCCTCTT TCTGCTTGCA ACTCCTTTCC 1140
CTGGATGCCC CAGAAACAAT CCAGGCCTCC TTTCCTATCT TACCCCTTTG CTTTGCTTTT 1200
TACCCCAGCA CCTCTATAAC CGCCTTCTCT TCTTTTCAGA ACTCCTTGTT TCTCGTCCTG 1260
TTTTTTATGA TTACAAAACT CTTGCTTCCA CCCTGGAAGA TAACTGCTAT AGATGCCTGT 1320
ATGTAAATGG TGCTGTCTCC AGCAACTGGC ATGCTGAAGA AGAATTGATT CACGGGGTAT 1380
AAATGTTGGG GATTGGAAGT GGGGATGAAA TGGCACTTGT TGATACAGGA GCAGAGAGGT 1440
GAGGCCGACT GCTGAAGACA GCTCGCCACC CTCCTTGCCT CCACTCCAAT CCAGGGGCTG 1500
GGGCCACATT CTTTGCCTTC ATTTATCCTC AGATCAGGTG AGATCGACAG GAGGTGTTGA 1560
TGGCAGTGCC AGCAATTATT GCTAATCCGT TTGCATCCTT ATGCATAGAT CTGAATTCAG 1620
ACTTTGTGAA TTTCCAGAGG TGTGGGTAAT ATAATAGAAT TCAGTGAGTG GGCATGGCTG 1680
ATCTTGTGCA AATTAAAAGT TATGGGGCAT AAGAATAGCA AAAGTTGAAC TTCTTTTAAA 1740
AAGGAAAGTA CCCTGAGAGC CAGTATTGGT TGAGGCTCTT CAGTATGCCC AGGTTGGCAG 1800
CACTGAGAAC CGCAGGAACG GCCTGTTGTT ACAAAAAGGA GATTGACTCA GCTGCCCTTG 1860
GTGCATCTGA CTGACTATGA CTGCTGAGAG ATTCCAAGGA CCCTTAATGC CAGGGCTAAC 1920
CTCTCCATGT GCAGTGAGAC CTCTGGAGGA AGTGTCATCC TCTGGCTTTG TGTGGTACTC 1980
ATTATGGTGC AGTGCGGGCA TGAAATGAAG ACACCCAAAT AGGCTTACAG ATACGATATG 2040
TTTTAAATGT TCGTATTTAA CAAAAACATA CTGACACTGT TTGGAAATGG CAACAGGAAG 2100
ATAGCAAAAT GAATACTAAC ATTACGAAAA GATGAACAGG TACATGTTCC AAGGCAGGTG 2160
GCTGTGAACT TCCTCTGAGT GAAGGCATCC CCTCCAGCAC CTTTCAGCCT GCTAGTTAGG 2220
ACGACCCGCC GCCACCCTCC AGGACCTCCA GCCCTGCACT GCCTTTCCTC TCTTTTAAAT 2280
AATTCTTCAT TGAGTTCTAA TATGTAAAAA AAAAAAGTTT ACTGTAAAGT TTGCAAATAA 2340
GGAAATTTTT TTTAAAAGTC CTCAGTAATC TTACCAGTAA CAATTGTTAT GGGCACATTT 2400
GCTTTTGGAA GATTTCTTTT GTATGCATGG GATAAGTACA TTTTTAAACA AAAATGGGAT 2460
TATGCCATAA ATTCTATTTT GTGACTTTAA TATATAGTGA ACACCTTTTT TAATGATGAC 2520
AGGATGTTCC CTTGCATGGC TGTATCAATT TAAACAATCT TGTTTCAATG GGCATACAGG 2580
GTATTTTCTA GTTTTTTTTT CCTCTTAGAA AATAATACTT GCGATGACTT TCCTTGTAGC 2640
TCAGACTTTT TCACGTCTGT TGTTATCTCT TTGGGAATGC TGAATACATA CATTTCGAGA 2700
AGGAAATGAC TGTTAAACTC TTAAGACTTC AGGTTCATAT TGCTAAACTG CCCAGCAGGG 2760
AGGGATTTTT TCAATTAGTG TTCTCACTGG TGAGGCAAAC CTGATGCCTT CCCCTCTTCC 2820
TCAGAACCGG CTTTATCACA TTGAAAACCT TTGCTCCTCC GACGGATCGA GTCTGCTTTC 2880
CCTCTGGATG TGAGCATTGC TTTGTCTGCT GGTGACTGAA CATCTCTACC TTGTGTCAAT 2940
TGGCCATTTG TGGTGTGTGT GTGTGTGCGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT ATGATTTTCT 3000
AATTCCTAGT CATTTTTCTA TTGATTGTTT TGCAAAAGCC ATTTACATCT TAAGGATATT 3060
GATAATCTTT TGTTATATTT GATGCAAATA TTTTTTTCCA GTTTATAGGT TGCCTTTTAA 3120
TTTTGTGTTT CAGGTAGATA AAAGTTAAAC GATTTTCTTA GGTTAGTTTA TCACTGTGGT 3180
TTCTGAACTT GTTATGTGTA GATCTTTTCC ACCCCAAGAG TACATAAATA TTAATCCATA 3240
CTTTCTTATG GAACTTGTAT GGTTTCGTTT TTTACATTTA AACCTTCTTC CCCGTGGTGT 3300
GTGTTGTGGA ATCTGTGTTT GTGTGAGGAG GGGCATGGTG CTCTCAGAAC CCACCTCCTG 3360
TGGCCAGAGA GCCCTGTCCT GTGAGGGTGG TTGTCACAGT GGCAGGGTTC AATTCAGAAG 3420
ACCTTGAGGG CAGGCTGATG TTTCCTGAAT GGGCCCCTGG TTGTTGCTTG TCCCTGACTC 3480
TCCATTTCCC CATCTGAGTG GATTTGGACC TAATAGGGCA CTGGAGCTGG TTCGAATCCT 3540
GACTGGACTA CTTGGCAACT TTATGTCTGG GAGCAAGTTA CTTAACCTCC CCAAGCCTGT 3600
GTCTGTGAAA TGCGGGTAAA TGAATGTAGA TGTTTGGCAG CAGCTACTCC TTGTTGAGCT 3660
CTCACAGTGA ACTCTCCTGC CTCTGCCCTC CTTCCCCGCC TCCCCTGGTG CCTAGCGTCA 3720
GGTCTAGCCA CTTCCTCCTG GGCCCCTCTC CCTTTTCTGT GGCTGGCTGC CTGCCCGCCT 3780
GGCGCTGGAC CTTTCATGTA ACGGGAATCA GCATGTATAT TCTGGTCTGG TCTGTTTCTA 3840
CACTTAATTT TGTTTCCAGT AGTATTTCCC TGTACCGGCA GAGTTCACAA ACACATTTGA 3900
AGAGGCTTTT TCTCAGGATT CTTAACCTTC CCAAAGGAAG TCCCATGGAT GGGTTTCTAG 3960
AAGTCTATAA ATGCTCTGAA ATTGTATTTT TCTGTGGAAA GCATAACTTT CATCTGCTTG 4020
TTCGTGCTCA AAAAAGATCA TGAATGAATG ATTGCATGAT TTTATGCCAT TGTGCTTATA 4080
CTAAAGGATA TGTAGCCCAT CTCTTGAGCT GTTAAACTGT TTTGACTACT TTAAATCGTG 4140
CAGCTGTGAG CATCTCTGTA AATTTAGTGT ACACATGTAT CCCCTGGAGT GGCATTGCCT 4200
CGGCAGTGAG CACTTATGGT TTTATAACTC TCTTCACAGA CTCAAATGAC TCCAGAAAGC 4260
TACACTTCCT GTTGTGAGTA TATGATATCC ATTTCCCTAC ATAGCCACTA ACATCAGGTT 4320
TTTACAATTT TATTTATTTC TTGCTACTTT AAGAAATTTT TGTGGTGAAA TACATATAAT 4380
AGAAGTTGAC TATCTGAATC 4400