EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS118-12601 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Liver 
Coordinate
chr3:38002720-38005900 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr3:38003155-38003165TCTAATTAAA+6.02
CDX2MA0465.1chr3:38003013-38003024GAGCCATAAAA+6.14
Lhx3MA0135.1chr3:38005060-38005073AAATTAATTAGTT+6.29
mix-aMA0621.1chr3:38005061-38005072AATTAATTAGT+6.62
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
SE_07845chr3:38002607-38003832Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_23776chr3:38002644-38003690Colon_Crypt_2
SE_23776chr3:38004514-38004882Colon_Crypt_2
SE_27673chr3:38002691-38003987Fetal_Intestine
SE_27673chr3:38004441-38007028Fetal_Intestine
SE_28599chr3:38002586-38004011Fetal_Intestine_Large
SE_28599chr3:38004309-38007270Fetal_Intestine_Large
SE_31470chr3:38002679-38003756Gastric
SE_31470chr3:38004463-38004932Gastric
SE_37000chr3:38002384-38006054HSMMtube
SE_41818chr3:38002579-38003096LNCaP
SE_41818chr3:38003131-38003757LNCaP
SE_41818chr3:38004489-38004841LNCaP
SE_51018chr3:38002511-38004060Sigmoid_Colon
SE_51018chr3:38004318-38004943Sigmoid_Colon
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr33800311038004000
chr33800297138003941
chr33800455238004679
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I037961chr33800266838007383
Enhancer Sequence
TTAGTATCGT TCATCTCCCA ACTATGAGCC AGGATTTAGG GCCTTCCTTA GTGGGAAGCT 60
TCATGGGCTG TTTGGTGAAC GTCGGGTATT GAAGTATTAG GAAAAGATGC AGAGGGAACG 120
AAAGTTTGAA ACTGCTGAAG TATGGGTGGT CATGAATTGA GGTGAGCACT CGAATGCCTT 180
GGCCCCAGTG AGGAACGCCA CTGAGGCTGT GTCCTGAGTC CTACCGATCC CATACTTTTG 240
CTTAAATTAC ACAGCACACA GATGCTCACA AACATGAGGC TGGCAGTGTA ACCGAGCCAT 300
AAAAATGCTG AAAGGGGAGA GGATTTGTTT TCTAACAGCT ATGTTTCTAT GCTATTTGCC 360
TAAGGCTTTT AATACAGCAA TAGTACACTT CTTTCCACGA AAACATTATG AAGAACATAC 420
AAGCAGGACA GCTATTCTAA TTAAAAGCAG TCTAGAGTTC CTCTTGCTCC CCTCCTGCGT 480
TAGGCCCTGA CATCCACCTG GAGCTCTGAG GGCTTGAGGA GCACAGCGTG CAGACCTTAA 540
GCCTGAGAAA TCTTAAGTAA GGAAACAATA ATCCAATGTA CCAGGAAGAG GTACTACATC 600
TGTAAGATTT ATGAGAGTTT GTGGGATGGG CACTCCAAGA GGAAATAAGC TTAGTGTTAA 660
CTATTCATGG CTGCCAGTTC TCTGCCAAGG ACAGGAAATT TCAGATTTAC TCCCAGGAAA 720
GGAACAGGAA TGAATACCAT TCCCAAACCG TGGATGGCAA GCCGTGGTCC CTTCCTCCTC 780
CACCCACCCC CCGGCAATGC TCTTTGTGTA CATTTGAGCA AGTCATTTTG TATAAGAAAG 840
ACCTTTCTTG ATGTGACTGG TATTTCTCTT GTTCTTCAGC TTTATGAAGA CTTCAGAGAA 900
AACTTGGTGC AGGACATTTC TTAGTTAATG ATTCAAGCAT CACCTGAACA GATCAATTGA 960
AGTAACAAAG CACTGTGTAT TGTCATTATA TAGCATCCTT ACATTTCCAA GGATGCAGCT 1020
GTCCCAAAGA ATTCTTACCC ATGGGCTGAA GAATTTGCAT TAATCTAAAG CCAAGCTCTC 1080
AGGGAAGCTG TGTGCATTTA GGAAACAGCA GAGGATTAAT GGAACCTCCT AGCCTGTTGC 1140
CTCCCAACTT GGCCTTGTTC CCTGCAGCAC AAATTAAAAT CAATTGCTTG CTTAATATGA 1200
GTCTCACCCT TCTCCATCTT TTCTCTCTTA GATCGTACCA TGAGGGGTTT TACTTACTGT 1260
TAACTTTTCT CTCTTAGATT GCACCATGAG GGGTTTTACT TACTGTTAAA GAATGCTTGT 1320
AAAGTGTGGG TTAACTGTGC TAAGAAAGTA ATCTTTATTC TTGGGTTTGG AAAATGAACC 1380
ACTTTTGGCA GATCTTTGAT GTTTTCAGAG ATGCTAGGGT TAGAATTTCT AGATCCTTAT 1440
TTTCCAGGCT AACAATTAAA TTAATAAGTT AAAACATTTT AGTAGTTTAT AAACGCATAG 1500
GAAAAGGACT GGATAGACAC TAATGTCAAA AGGGAGACAT AGAAAAGAGA ATGATTGTGT 1560
TTTACTCTCA TAGGTCTATA ATCTTTACAA TGAGAATGTG TTTTATATTA AATAGTTGTG 1620
TAATAAAAAT TCAAACAAAT TTTATTCTGG TCACAAGCAT GCTTTCTGCT CTGTCCCAGA 1680
CAACAAAAAT GACCCACATT CTCTCTACTA TGTTCACTTA GCTCATCACA CTCTGCCTTT 1740
TTAAAAACAC CTTTTGATAG AAAACTTTTT GCAAATTTAA TTTTTTAAAA ATAACCTGCT 1800
GACTCACTGG TTTGTAATGG AGGACAGAGT CCTTTCTAGA TCCTCGAATT TCGTGCCTGT 1860
CTCCAAGGCA CATCCCCACA TCCCGTCACA GTGCTGCAGG ATTAGGGAGG ATTGCTTCCA 1920
GCTGAAAGAG ATGGGAGGCC ATAAAGGCTC TTTCTTCTGG ATGACGTTGG AAAGGAAGAA 1980
ACATGGAGTT AGAAATGCTT ATGTCTCCAC ACGTAGCCTC TTCCTGGGCA ACCCTGGACA 2040
GTCTCTGTCT GCCAAGGTGA TCATTGTACT TGCAAATTTA CCTAACCTGT TGACTGCCTG 2100
TGTTACATTT ACTATTGAAC CAGCTAGAGT TCAAAATTAA CTTTTGATCA CTGACTTTCA 2160
GTTTGAACCA AAAAAATAAA AAGAGGAAAG AGCCACGTAA AAGGAAATAC AGCTTGATTT 2220
CATTTTTTTC TTGTTTTATT TGATGAACTA AATTGTCCAT TCTTCAGGGG CTCAGAATAG 2280
ATATTTCCTT TTGTTTTGTA TCAAATATTA AAGAGAGTTT GACCTTCTTT GCAGGTCAGA 2340
AAATTAATTA GTTAACTCTG GATATTGAAT ATGCCACAAA GTAGACTAAA ATACTTCAGA 2400
TCATTTCTAG AATGAGGCAA GGCCTAAAGA AATAAATCCT CTAAATCGAG TGAGGTTGGC 2460
CAGAGATACC TAGCATTTTA TGGTTGGCTG AAGATACCCA GCATTTTATT AACTCTTTAT 2520
GACTTCTTTA TCACGAGATT TGAGTCACCT GCTACTAAGA CACATAAATA GATTGTTTGG 2580
TCAACACACA ACATGTGGAT TAAAGTATAA CTTTCAGAGG CAGAGAATCC AAGGGGTAAA 2640
AATACCACAT TTGCTCAGTA TTCTACCACA GTGCGGTGGC ACAAGGTGGC ACTGTACCTG 2700
GATTGGTCTT ATTTCTGTTT CCTAGTGTTG GGGGTAACTC TGGACTGCAT TATGCTGGTG 2760
GGCCTATAGT TTGTCTTCAA GTTTTTTAAA AATCTCAGTC ACTAAAAAAA AAAAAAAAAA 2820
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA TCTGTAGTTC CAACATAGCT CTAATATCTA CTTATGTGCC 2880
ACAGTGAATT TCAGGCAAAA TATGACCCCA CGAAACAGAC CTCCATTGTG ACAGTACCTA 2940
TTATAATTAA ATACTCATTC TTGTGTAATC CATTTTAATA ATAACTGTAG CCACCAATAT 3000
ATGTGTGAGG CAAAATGCTG GGCATTTTAT TGCCATTATA ACTGATAACA ACAACCTTTC 3060
ATGGTAGGTA TTACTATCCC AATTTACAAC CAAGAAAGTG ACAGAGCTGA TGATTGAAAC 3120
CAGGTTTGTC TGGTTCCAAA GCCTAGGACT TCATAGCAGT CATTCAGATC GTGGCACCGT 3180