EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS118-09321 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Liver 
Coordinate
chr19:39168440-39171670 
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ZNF263MA0528.1chr19:39171401-39171422CCCTCACCTTCCTCCTTCTCT-6.4
Number of super-enhancer constituents: 63             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39168564-39169764Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39168890-39170449Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39170550-39171587Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39164445-39171596Aorta
SE_04868chr19:39168734-39169885Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39164448-39170203Brain_Hippocampus_Middle
SE_07777chr19:39168707-39170257Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39164511-39180526CD14
SE_13490chr19:39168489-39169894CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39168532-39170061CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14624chr19:39170904-39172653CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39170346-39172578CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39164561-39178319CD56
SE_20865chr19:39164617-39170179CD8_Memory_7pool
SE_20865chr19:39170480-39179166CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39168508-39169910CD8_primiary
SE_22709chr19:39169957-39177919CD8_primiary
SE_23062chr19:39168629-39171558Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39168972-39169508Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39169641-39170175Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39170522-39170855Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39170961-39171539Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39168930-39170258Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39170416-39170866Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39170896-39171572Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39164448-39177989Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39168562-39171587Esophagus
SE_27614chr19:39164407-39180553Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_31384chr19:39168565-39170223Gastric
SE_31384chr19:39170454-39171474Gastric
SE_34299chr19:39169159-39170485HCT-116
SE_34681chr19:39168850-39169639HeLa
SE_34681chr19:39170836-39180506HeLa
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39168763-39172804HSMMtube
SE_38012chr19:39168814-39172845HUVEC
SE_40018chr19:39168791-39169939K562
SE_40018chr19:39171034-39171644K562
SE_40594chr19:39164568-39178326Left_Ventricle
SE_41601chr19:39169253-39169628LNCaP
SE_42097chr19:39164441-39171613Lung
SE_45660chr19:39168564-39172655Osteoblasts
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39168979-39170222Pancreas
SE_47461chr19:39170953-39171437Pancreas
SE_48075chr19:39168529-39178289Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39168554-39171607Right_Atrium
SE_49449chr19:39168880-39169517Right_Ventricle
SE_49449chr19:39170918-39171396Right_Ventricle
SE_50056chr19:39164598-39172640Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39168650-39169947Skeletal_Muscle
SE_51136chr19:39170726-39172632Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39169468-39170771Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51705chr19:39170881-39171625Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39168564-39178308Small_Intestine
SE_53291chr19:39168797-39169709Spleen
SE_53291chr19:39169852-39171576Spleen
SE_55638chr19:39170884-39171285Thymus
SE_56725chr19:39168926-39171553VACO_400
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39169454-39171639HSMM
SE_65266chr19:39168886-39178027Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr193917103039171442
chr193916951839170091
chr193917025139170884
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
GGTGCAACCC CTACCTCCCG GGTTGAAGTG ATTCTCCTGC CTCAGCCTCC CAAGTAGCTG 60
GGATTACAGG TGCACACCAC CATACCCGGC TAATTTTTGT ATTTTTGGTA GAGACAATGT 120
TTCACCATGT TGGCCAGGCT GGTCTCAAAC TCCTGGCCTC AAGTCATCTG CCTGTCTCAG 180
CCTCCCAAAG TGCTGGGATT ACAGGTGTGA GCCACCGCGC CTGGCCAAAC AGGATGCTTT 240
GCAAGTAGGC AGAAGAGGGA GACATCACTG TCCCATGGAG AGGTGGGAAA ATCATCGTTA 300
GCACAGGATA ATTCATCCTA TTTTGTGCTC ATGTTTACTG AGCTAGGATT GACCTGTGTC 360
CGGGCAGCAG GGACACAGAG GTGAGTAAGA CAAAGAGAAG GCCCTTGCCC TTAAAAATGA 420
TACGTGTGGC TAAAACGCTG TAGACCTTTT TGTTTTTTCC TTTTTGAGAC TTCCTTTTTA 480
TACAGAAATT GCTACCTGCA GGTAAAATTA ACTTACATCG TGAAAGCGAC AGTAAAGTGT 540
TTCTAGGGAT AGCTAAAGAC CTAAGAACAC AGCCCTGTGG TTTGACTGGC TGGCCACCTT 600
CCTGCAGCTG GGTTTACTAT GGTGCTGTGT TCTGGGACAG CCCACTCGTC TCCATTTATT 660
GGGCTGAGCC TCGAGACCTG CAATACCAGG GAAGGAAGGG AAGTCTAGGC TGTCTTTGGT 720
GGCCATTGTT ATTTATGGGG CATCGGCAGA GAAGTCAGTA CCATGGAAAA TCTAGAGAAA 780
GATAGAGGAT ACGCAGTGTG GTTGAGCAGA ATCTGATAGC TCCCTGGCTC TCTCCGGGCC 840
ATGGGACCCA GGGCGACACA GCCACCCTTT TTCTCTCTGC TGTCTGGCTT GGGCTTGGGC 900
TTTGTCTCCT GTGTCCCTCC ACACCTTCTT CGCTGTCAGT GGTGACCAAT CCCGTGGAAT 960
CAGCCACTGT GTGTTACCCC AAGTCCTTGC CCCTGGGACC TCGCTCTGTT CGGAGACAAA 1020
ACCCGGGACT GTTTCTCCTT TTAAATGCAA CCTTGTTCCA CAGGAGAGGA GAAAAGCAAG 1080
AAAGAGGTGG CTTGTTTATC TGATGGTAGT GGGGTGTGCT CTGATATGCC TTTGAAAGGG 1140
GCCCAGCTTT GCTTTGCCCA GCGGCCTTTG CAGGATAATG AGAGAAGGAA AACACAGGGA 1200
ACTTAGTGGG AATTTGAAAC TGGAGTGTGG GAGTGGGAAA GTTCAGCTTT TACCTTGGAG 1260
CAATCCAGTC TTTCTCCTGT AGGAAAACAG AATGGTGCTG TATGGCCTCC AAGCTGGGTT 1320
ACATCCTGGG AAAAAGACAC GTGCTTGGCT ATTGGCCTGG GCGCAGTTTA TGTGTAAGCC 1380
TTTCCTTGTG GATTCCATTT TCTTATTTCC CGAATACTTC TCAGCCCCAC AAGTCCACTG 1440
AGTCTTCTGT CTCCAGAGAC TGCCTGGTTT CCATCCCCGA GGGCATCTGC GCATCACTTA 1500
CCATGGTGTA CCATGCACCT CCAGTGTGCC CGGCACTGTG TCAGGAGCTG GGGATACAGG 1560
TGCTGGTCCC CACCTCACTC CCCTCAACCT CTGCAATATA TGATACATAA CCCACACACA 1620
CAGACCATAT GCAAAAGTGG TGGGACTCCT TTGTACCTGT CACCTGCATC AGTGATTATC 1680
AGCATTTTGC CAGACTTGTT TCATCAGTGT CTCCCAACAC ACTCCCCCCA GACATTACCC 1740
ATACGTGCTC AAATAGATTT GGGTGTGCGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1800
ATTTTTTTAG AGACAGGGTC TCGCCCTGTC ACCCAGGCTG GAGTACAGTG GTGAGATCAT 1860
AGCTCACTGC GGCCTCTGAA CTCCTGGGCT TGCTTTGTTG CCCAGGCTGG TCTCAGAACT 1920
CCTGGCCTCA AGCGATTCTG CCACCTTAGC CTCCCAAAAT GCTGGGATTA CAAGTGTGAG 1980
CCACCGCACC CGGCCAATGT ATGTATTTTT AAACATAACC ACATACTGTT ATATTTAATG 2040
CTTCTGACCA TGTCTTAAGA AAAAAACAAA AACTCCCTTT GGCTTCCTTG ACATCACAGT 2100
CTCTCTGTTT CTCTGACTCT TCTTCCTCAT CTCCTATGGC TAAATTCTCT CCCTCTGTCC 2160
ACTGCTTACA CATGGGCATT TCACAATGTC CTTTTTCCCT GAAGGAACTT ACCCCCTCCC 2220
CTCAGCCTTA AGTACCCCAT CTGTGGGGAT GATGCCCATG CCTGTAGTCC TGACTCACTC 2280
ACCACGCTCT ATCGCAGTTA TTTACTGATG CATCTCTCTC CCCTATCAGA CGCTGAGGTC 2340
TTTGATGGAG CAACCTTGTA TTTGTCCGTG TATCCCCAGC ACCACACCTG TCCATAGCTG 2400
GAGCTCAGGA AGTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTAAAGT CAGAGTCTCA 2460
CTCAGTCGCC CAGGCTAGAG TGCAGTGGCA CAATCTTGGC TCACTGCAAC CTCCACCTCC 2520
TGGGTTCAAG CAAGCACGTC TGGGTAATTT TTGTATTTTT AGTAGAGATG GGGTTTCACC 2580
ATTTGGCCAG GCTGGTCTCG AAGTCCTGAC TGCAAGTGAT CTGGCCGCCT TTGGCTCCCA 2640
GATTGCTGGG ATTACAGACA GGCATGAGCC ACTGCGCCCG GCCTCAGGAA GTAGTTGAAT 2700
GAGTGACTGA ATGAATGCCC ACGTGAGCAA ATGACCTGTT TGCTGAACTT TAGACTGACG 2760
TTGCCTGATG CCCACTGCTT GTGCAGTACG TACTTCAGTC TCAGCGTGTC TGAGACCAAA 2820
CTCATTTTCA AGTCCCACTT CTTGGGCTTG GCATTGCCCA TTTGTCAGCC ATCCGAGTCA 2880
GAAACCTTGG AGTCAGCTTT TGACTTCTCA TCCTGTAACA GGCACCAAGT TTGATTTCTT 2940
TCCCTTGAAT ATCTCTTAGA ACCCTCACCT TCCTCCTTCT CTTTATTCCT ACCATTGTCC 3000
TTACTCAGGA CCATATAGTG AGGGTTTAAA AGTGCAGAGT CTTGGCCGGG TGCGGTGGCT 3060
CACACCTGTA ATCCCAGCAC TTTGGGAGGC CAAGGCGGGT AGATCACCTG AGGTCAGGAG 3120
TTCGAGACCA GCCTGGCCAA CATGGTGAAA CCCCGTCTCT ACTAAAAATA CAAAACTTAG 3180
CTGGATGTGG TGGTATGTGC CTGTAATCCC AGCTACTCAG GAGGCTGAGG 3230