EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS118-09319 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Liver 
Coordinate
chr19:39147990-39152040 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HES2MA0616.2chr19:39151177-39151187GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr19:39151177-39151187GGCACGTGCC-6.02
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:39149919-39149934TGAACCCTTGACCTC-6.07
Nr5a2MA0505.1chr19:39151246-39151261GCTGGCCTTGAACTC-8.25
TCF3MA0522.2chr19:39151362-39151372AGCAGGTGTT-6.02
ZNF263MA0528.1chr19:39148845-39148866GAGGGAGAAGAAAAAGGAGAG+6.03
Number of super-enhancer constituents: 101             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39138153-39152329Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39148092-39149078Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39149526-39151135Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39151209-39152062Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39148036-39152396Aorta
SE_02393chr19:39145095-39151185Astrocytes
SE_02946chr19:39148347-39148983Bladder
SE_02946chr19:39149781-39150197Bladder
SE_03166chr19:39148042-39149717Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39151248-39151982Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39142528-39150950Brain_Anterior_Caudate
SE_03903chr19:39151098-39152311Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39138188-39150664Brain_Cingulate_Gyrus
SE_04868chr19:39151145-39152446Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39137791-39163220Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39142593-39150737Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_06803chr19:39151039-39152377Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39138293-39150177Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07777chr19:39150990-39152302Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39145164-39150661CD14
SE_09404chr19:39150878-39152059CD14
SE_13194chr19:39148036-39149296CD34_Primary_RO01480
SE_13490chr19:39147965-39149621CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39147864-39149886CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39145153-39150715CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39148933-39150874CD56
SE_20865chr19:39147003-39149092CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39148116-39149221CD8_primiary
SE_22709chr19:39149249-39150729CD8_primiary
SE_22709chr19:39151153-39152066CD8_primiary
SE_23062chr19:39148152-39149702Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39149763-39150897Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39151201-39152363Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39148201-39148967Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39151536-39152021Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39148159-39150480Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39151239-39152366Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39138146-39159498Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39147926-39151143Esophagus
SE_26525chr19:39151219-39159772Esophagus
SE_27614chr19:39137681-39163004Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39147858-39163235Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39148014-39150736Fetal_Muscle
SE_29583chr19:39151289-39152312Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39148129-39151115Gastric
SE_31384chr19:39151193-39152368Gastric
SE_34299chr19:39147843-39150429HCT-116
SE_34681chr19:39145644-39150909HeLa
SE_35812chr19:39145150-39151216HMEC
SE_35812chr19:39151229-39162882HMEC
SE_36926chr19:39137778-39163235HSMMtube
SE_38012chr19:39147692-39151398HUVEC
SE_38896chr19:39147940-39151140IMR90
SE_40594chr19:39137778-39152373Left_Ventricle
SE_41601chr19:39148332-39148962LNCaP
SE_41601chr19:39149759-39150533LNCaP
SE_41601chr19:39151326-39152007LNCaP
SE_42097chr19:39147994-39152419Lung
SE_44161chr19:39138251-39151170NHDF-Ad
SE_44161chr19:39151200-39152423NHDF-Ad
SE_44797chr19:39145079-39151181NHLF
SE_44797chr19:39151295-39151818NHLF
SE_45660chr19:39138201-39152333Osteoblasts
SE_46686chr19:39148242-39148950Ovary
SE_46686chr19:39149799-39150424Ovary
SE_47108chr19:39136358-39164169Panc1
SE_47461chr19:39149789-39150618Pancreas
SE_47461chr19:39151488-39151960Pancreas
SE_48075chr19:39146532-39151189Psoas_Muscle
SE_48075chr19:39151218-39152334Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39148061-39148983Right_Atrium
SE_48555chr19:39149099-39151161Right_Atrium
SE_48555chr19:39151170-39152407Right_Atrium
SE_49449chr19:39148223-39148947Right_Ventricle
SE_49449chr19:39151227-39152097Right_Ventricle
SE_50056chr19:39148052-39151172Sigmoid_Colon
SE_50056chr19:39151209-39152408Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39137722-39163232Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39138189-39151169Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39147924-39151151Small_Intestine
SE_52339chr19:39151229-39152378Small_Intestine
SE_53291chr19:39147912-39151142Spleen
SE_53291chr19:39151158-39152388Spleen
SE_54534chr19:39138178-39150778Stomach_Smooth_Muscle
SE_55638chr19:39149771-39150233Thymus
SE_56336chr19:39145089-39150693u87
SE_56725chr19:39147957-39149761VACO_400
SE_56725chr19:39149768-39151132VACO_400
SE_56725chr19:39151236-39152349VACO_400
SE_57359chr19:39148169-39150430VACO_503
SE_57359chr19:39151257-39152297VACO_503
SE_58002chr19:39148223-39148973VACO_9m
SE_58002chr19:39149062-39149753VACO_9m
SE_58002chr19:39149779-39151104VACO_9m
SE_58002chr19:39151269-39152290VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39145110-39152245HSMM
SE_64225chr19:39145110-39151003NHEK
SE_64225chr19:39151203-39153683NHEK
SE_65266chr19:39149035-39150482Pancreatic_islets
SE_65266chr19:39150728-39152038Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr193914975839150541
chr193914799639148107
chr193914925339149575
chr193914853339148920
chr193915093739151053
chr193914815639149750
Enhancer Sequence
CAGGCTGGTC TTGAGCTCCT GACCTTAAGC GATCCACCCA CCTTGGCCCA ACAAAGTGCT 60
GGGGTTACAG GCATGAGCCA CTGTGCCCGA ACTAATTTTT AAATTTTTTG TAAAGACTGG 120
GTCTCACTAT GTTGCCCAGG CTTTTAATCT GCAAAAAGCC CAAGATAAAG AGTTTTAATA 180
TCTTACCTCC TGAGTAGTAA TGACTGATTC CAGTTCTAAT AATGTCTTAA TTACAGCTAT 240
ACAGATTGAG GGGACTGCAG GAAGTGAAAT AGATGCATTT CTTTTTTCTT TCTTTCTTTT 300
CCTTTTTTAA ATACACACTT CGTTTCGGTG GTGAAGGCCA GTTTGAGGTT AGGAGAGGCA 360
TCTTGGAAGG AAGCTCGCAG GTGGTTCGGC ATCTGGACAT GCTGGGAAGT TGCCTGAGGG 420
GGACGTCACA ATAAGAGGAC TGTGGGTCTA CAGCCTGCCT TAGCAAAATG ACAGGCCTTC 480
TTTTACCAAG GCCAAGGGCA GTGGTGGAAG CTGACTTCAG TTGGTGTCAT CAAGGCCTCA 540
GTATGTGTAA CGGTTAACAA ATTACTATTC TATGATCAAT CTCCATCTGG GTGTGAGTAA 600
AAGGTATTTA GTTGCTATCA CCATGGAAAC CAAGTTGCTT ACTTACTGTT TTGGGGAGTG 660
CCCTCATACC AGAGGCAGTG CTAATGGTGG AGTGTTAGGC CCCGGGCAGA AAAAAAGATC 720
CTGCCACTTG GTATCACAGG AAAATACCTA CAGGCACAGC AGCCTTGCCA GGTAGGGGAT 780
GAAGGCCCTC TGTCCTCGGG GCAGGAGTTG GGCCAGTTGA TTGTGTTGAT GAGGAGTGTG 840
CATTTGTGCA TGAGAGAGGG AGAAGAAAAA GGAGAGCACT CCATGAAATC CGCTGCTGGC 900
TTTGTAGCCT AGAAGAGTGC TTTTTTTCTC TAGGAGTTTG GAACTGGAAT CTCAGCTATG 960
TGACTTCTTA ATAATAGGAC AAAATATGCC TGTATCTTTT GCCTACTTCC ACAAACACTG 1020
ATAAATTAAA AAGAACTCTA AATTTCCCAC AAATCCCAAG CACAAGTAAC TTTTTTTTTA 1080
AATCCACATC CTCCCTAATC CAAATCTAAC AGCAAATCCT TTTCTCTCTG TCACTCCCTG 1140
CTTTTCTTTA AGAAAATGAG TACCTTGCCT TAAACTATAT ATTGGATGAA AATATTAAAC 1200
ACTTTCACAA AGTGCTTCTT TGGCTGTTAC TGGTATGCCT TGCATTTGGA AGGGTCAGAG 1260
ATTTGAAGAC TTCTGTGATC TTCCAGTTCT GGCCTATGAA ATACAGTCAG TTTCAAAATT 1320
CAAAATGTCT GGAAGAGCCA ACTTGCCAGG CCGGTTCAAG GGCAGTCAGA TGAATCGACC 1380
CTTCTTACAG GCTGTCTACG AACCAGTCAT GATTCAGATA TTCAAGTCCT GGAAGGTATC 1440
CAGACGGTAA ACATCACCAG GATTGTGAGG CAGTTACTTT TTTTTTTGGA TCGTTTGAGC 1500
TACACTGCCA AGACTGTGGT AGGACTTGTC TGTGTAAAAC AGAAAGGGCT GTCTCTAAAT 1560
GTCTTTTTCA AGAATGTCGG CTATAATCAC CCGACACTGT GTCTCATGGT GGGGTGAGAT 1620
GAAATACCTA GACCGGTTAG GGGAGGGCCT TCTTGGCCAT TTTTTGAACT AATTTTCCCT 1680
TTCCCTTTGT AACTTTTTTT TCTTCTTTTC TTTTCTTTTT TTTTTTTTGA GACGGAGTCT 1740
TACTCTGTCA CCCAGGCTGG AGTGTAGTGG TGCAATCTCG GCTCATTGCA ACCTCCGCAT 1800
CCTGGGTTCA AGTGATTCTC CTGCCTTAGG CTCCCGAGTA GCTGGGACTA CAGGCATGCA 1860
TTCCACGCCC AGCTAGTTTT GGTATTTTTT AGGAGAGACG GAGTTTCACC ATGTTGGCCA 1920
GGCTGGTCTT GAACCCTTGA CCTCGTAATG CCCACCTAGG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT 1980
ACAGGTATGA GCCACCGCGC CCAGCCCCTT TGTAACTTTC ATTAACACTG ATGAGGCACA 2040
AGCCATAGGA TAGAATTGAA TCCATTGAGA GCTGTGAGCC AATTGAGGGA TGATTGGTTA 2100
ATAGATTGTG GCTTGAAGCT GTGGAAGGTA AGGGGTGACA CTTGACTCCT ATTAGCCTTG 2160
TAGAAACACC TCAGAGATTC ACAGGAAGCA AACTTTGACC ATAAAAATAT AAGACTCACA 2220
GCGCACCGAG TTCTCTTAGC AGCTACCTTA GAGTTGAGAA AGTTTTGGGC CTCTTTAATA 2280
AACAAGCACA AAGCAGTTCT TGCCAAATAC GGCCTGCTCT GGGGCCACAG GGTTAGCTTA 2340
GGAGACAACT TTCTTGCCTA AAAATAAATG CATGTTCCTA TCAGACATTC CAAGCATAGT 2400
TTAAACATGA GACTTCTGAG CAGCAGCTCA AGCTCTGTGG GTTCAATTAT GTCAGAGTAT 2460
GGGCAGTGAG GGTCTTTGGG GAGTGTGCCC CCTTATTTGG GATTGGTTGT GGCTACCAAG 2520
GAAATCAGAT GATCAAATGC AAAACTTCCT CCATCTTATT TCTATATGAT CTTTTTTTTT 2580
TTTTTTTGAG TTGGAGTCTT GCTCTGTTGC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC AGGATCTCAG 2640
CTCACTGCAG CCTCTGTCTC CCAGATTCAA GCTATTATTC TCCTGCCTCA GCCTTCCAAA 2700
TAGCTGGGAC TACAGGCGTG GCCATCATGT CCGGCTAATT TTTGTATTTT TAGTAGAGAC 2760
AGGGTTTTGC CATGTTGGCC AGGCTGGTCT CCAACTCCTG ACCTCAGGTC ATCCACCCGC 2820
TTTGGCCTCC CAGAGTGCTG GGATTACAGG CATGGGCCAC CGCCCCCAGC CTTATTTCTA 2880
CACGTTCTTG ATCTATCACA GGCTGGTGGG GGAGACAGCA TGCATATAGA TAATGAACAA 2940
GGTAACTTCA GATAGGATTA TGTGCAATAA ATTAAATAAC AGCTAGCATT TTACCTTGTG 3000
CTAGACACTA TTCTAAGTGC TTCCCATGGA CTGACTGGTT TTTGTTTTTT TTTCTTTCCT 3060
TTGAGACTGA GTTTCGCTCT TGTTGCCCAG GCTGGAGTGC AATGGCGTGT TCTTGGCTCA 3120
CTGCAACCTC CGTCTCCTGG GTTCAAGCAA TTCTCCTGCC TCAGCCTCCC GAGTAGCTGG 3180
GATTACAGGC ACGTGCCACC ATGCCTGGCT AATTTTTGTA TTTTTAGTAG AGACGGGGTT 3240
TCTCCTTGTT GGTCAGGCTG GCCTTGAACT CCCAACCTCA GGTGACCCAC CCGCCTCAGC 3300
CACCCCAAGT GCTGGGATTA CAGGCGCGAG CCACCATGCC CGACCCATGG ACTCACTTGT 3360
ATAATCTTGT GAAGCAGGTG TTGTTACCCT TACATGCAGA AATGGATCCA TGGGCCTTTA 3420
AGCCACTTGC CCCTGTGACA GTGCCAGGAT TTGAATGTAG AAGTTGAGGC TTTCAAGTTT 3480
ATGCTGTTAT TTCTACACTA CACTGAAGTC TAGTGATTGG GAATGGCTTT GCGAGCGGGT 3540
GGTGAGGGGA GGAGTGTGCA GTGCAGGTAC TTCAGATGGA GAGGAAGGTC TCAAAGAGGT 3600
GGCATTTCAG CTGTTCCTTA ACGGATGAGA AAGAGAGAAC CAAGAGAGCA CCAGAGGAAC 3660
GCGCTTCCAA CAGAGAAAAC CAAGCAAGGG GGCCCCCGAG GAGCAGAAAG GCCCGAGTGG 3720
TCAGAGCGGA GCCCGTGGAA GAGATGGGCA CAGCCAGATT GCTTAGAGCT GTGTTGTTAG 3780
AAGTGCTGAT GAGTCTACAT TCAACTTGCG CCTGCAAACT CAGTCCCTCT TAGATGCCAG 3840
TAGGTCAGGA ACCTCATGCT TCCAGGACTC TGGCGCTCCT ACCCTTTCCT CCCAGGCCTC 3900
CTGGACAGGC CAAACCAGAA CTGACTTCTA AAGTGGGAAC CCCAAGACGG CAGAACATGA 3960
ATCAGCCAAA CAAAAGCTGC AGTTATCTCT GTGATGATTT CGGCAGTCGG CACGTGTATT 4020
TGATTAAAGC GTTGGTAACT TTGAATCTGG 4050