EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS118-06846 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Liver 
Coordinate
chr15:93346390-93349120 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOSMA0476.1chr15:93347181-93347192AATGAGTCACA-6.62
FOXC1MA0032.2chr15:93349054-93349065ATATTTACATA-6.62
FOXP2MA0593.1chr15:93348549-93348560TTTGTTTACTT-6.62
JUNMA0488.1chr15:93347658-93347671AACATGATGTCAT+6.07
Number of super-enhancer constituents: 56             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00699chr15:93346313-93349694Adipose_Nuclei
SE_02552chr15:93346515-93348585Astrocytes
SE_03406chr15:93347275-93347952Brain_Angular_Gyrus
SE_04213chr15:93347004-93348272Brain_Anterior_Caudate
SE_06939chr15:93346372-93348290Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_09652chr15:93344405-93349641CD14
SE_13564chr15:93346405-93349099CD34_Primary_RO01536
SE_14477chr15:93346295-93349611CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18547chr15:93346435-93348385CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19553chr15:93346527-93348035CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20693chr15:93347111-93348231CD56
SE_20859chr15:93346358-93349017CD8_Memory_7pool
SE_23716chr15:93346629-93347958Colon_Crypt_1
SE_24264chr15:93347078-93347935Colon_Crypt_2
SE_26010chr15:93346287-93348981Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26840chr15:93346453-93349029Esophagus
SE_27996chr15:93346609-93348262Fetal_Intestine
SE_28970chr15:93346580-93348392Fetal_Intestine_Large
SE_29703chr15:93347101-93348008Fetal_Muscle
SE_30995chr15:93346524-93347997Fetal_Thymus
SE_31921chr15:93346702-93348063Gastric
SE_33848chr15:93346499-93348990HCC1954
SE_34564chr15:93346403-93349127HCT-116
SE_34679chr15:93343662-93356193HeLa
SE_36003chr15:93346288-93348853HMEC
SE_37354chr15:93343418-93348955HSMMtube
SE_39112chr15:93346453-93349151IMR90
SE_39970chr15:93346445-93349356K562
SE_41310chr15:93346604-93348678Left_Ventricle
SE_42600chr15:93346482-93349148Lung
SE_43471chr15:93346491-93347125MCF-7
SE_43471chr15:93347221-93347981MCF-7
SE_43471chr15:93348076-93349366MCF-7
SE_43659chr15:93346441-93348220MM1S
SE_44673chr15:93346443-93349092NHDF-Ad
SE_45291chr15:93346458-93348738NHLF
SE_47211chr15:93346289-93355941Panc1
SE_48549chr15:93346443-93349091Psoas_Muscle
SE_49286chr15:93346537-93348190Right_Atrium
SE_50492chr15:93346504-93348621Sigmoid_Colon
SE_51268chr15:93346353-93349466Skeletal_Muscle
SE_52184chr15:93346456-93348299Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52822chr15:93346497-93348061Small_Intestine
SE_53626chr15:93346470-93348701Spleen
SE_55179chr15:93346705-93347124Thymus
SE_55179chr15:93347228-93348035Thymus
SE_56153chr15:93346333-93348696u87
SE_57089chr15:93347273-93347954VACO_400
SE_58215chr15:93347082-93347928VACO_9m
SE_60705chr15:93340495-93393151DHL6
SE_61142chr15:93340330-93400291HBL1
SE_61602chr15:93347024-93408751Toledo
SE_62387chr15:93344538-93393491Tonsil
SE_63974chr15:93346442-93348299HSMM
SE_64371chr15:93346470-93348707NHEK
SE_67338chr15:93346441-93348220MM1S
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr159334705693347810
Enhancer Sequence
CCTCCTGGGT TCTAGTGATT CTCCTGCCTC AGCCTTCCAA GTAGCTGGGA TTACAGGCAT 60
GAGCCACCAC ACCCGGCTAA CTTTGTTGTA TTTTTAGTAG AGACAAGGTT TCTCCATGCT 120
GGTCAGGCTG GTCTCGAACT CCCAGCCTCA GGTGATCTGC CCACCTCGGC CTCTCAAAGT 180
GCTGGGATTA CAGGTGTGAG CCACCACACC CTAAAATAAA ATTGTTTTAA AAGTAAGATC 240
TTTAACTTAC ACACCTGCAC ATTTGCAAAG CCCTAGTTGT TGGGGTTTTG TTTTTTTGTT 300
TTTTTTTTTC TTTGAGACAG AGTCTCACTG GGATTGCAGG TGTGAGCCAC CTTGCCCTGC 360
CTGTGTTTTG GTTTTTGTTG TTTTTGCCAG ATAAAGTAAC ATTCAGTTTC CACATATTGG 420
GATATCACTG GGAGACCATT ATTCAGCCCA CCACACACAT CCCCAAATCT ACCAGGTTAA 480
ATGGAGGTAG ATTTTTAAGC TTCCCAAGTA GCTGGGACTA CAGGCATGCA CCACTATGTC 540
TGGCTAATTA TTTTTATTTT TTATACAGTT GGGGTCTTGC TACATTGCCC AGGCTGGTCT 600
TGAACTTCTA GGCTCAAGCA AACCTCCTGC CTCTGCCTTC CAAAGTGCTG GGATTACCGG 660
TATGAGTCAC CACACTGAGC AAGGGAGAAG AATTTTAAGA GTCCCTATAA TAACTCCACA 720
CCTCTCTAAA AACCGCACTG CTCGCCCCTC CCCACTCCCA CAGGTTTTGG AGTTTCTGAC 780
TCCTGAAAGA GAATGAGTCA CAGACAGTTC CCGTCAGAAA AGACTATGTC CCTCCCACCT 840
CTCATTTAGT TCCCGTTTGT TTAGGATTCA AGTGTCTTGG GCAGTTAGAT AGCTCCCCAG 900
CCTACCCAGT TTCCCTCTTG CCTCCCCTCT ACTACCCCCA GAAATGCTTG TGCAATATTG 960
GACTGACTCA CCCAGAAATA ACTCATGACT CTCCTTTGTT TACAGTTTAA GAGACTAGGG 1020
TGTTGAAATA TCTCAGCAAA GGCCACTGAG GGACTCTTCA GTCCAGGGAC AATGAAACAC 1080
TGGACAACCT GGGAGGAGTT AGGTACATTC TCTGGCCTTC TCTCAGAGGG GCTTTTGCTG 1140
TGTTGTAACA GGCAGTGGAG TGTTGGTAAA TATTTAACAA GGCATCTCCA AGGGGAAAAG 1200
CCTTAATATG TAGTGTTTAC CTATTCCTGT GGTGTAAATA CCCCTGCTAT GGCCAGTTTC 1260
AAGCTACCAA CATGATGTCA TTGAAACCAA AGTTGGAAAG AAAAGTGCAT CATCATTCTG 1320
AGCAGCTGAC TCCAACACGC CACTGTAGCT CCACTGACCT AAGGGAAAAC TGTCAGTCTT 1380
CACTCCATAA GGATGTACAG GCCCAGGGGC TGGACAATGT AGCTCTTGGA AGATCACAAT 1440
AGAGTCAGTT TCCTAATTTC AGGGACCAAC TGTTACTGCT AAGAATAAAT GGGAGGCCAG 1500
GTGCAGTGGC TCACACCTGT AATCCAAGCA CTTTGGGAGG CCGAGGCAGG TAGATCACCT 1560
GAGGTCAGAG TTCGAGACCA GCCTGACCAA CAGAGTGAAA CCTCGTCTCT ACTAAAAATA 1620
CAAAAATTAG CCAGGCTTGG TGGCGTGCAC CTGTAATCCC AGCTACTCAG GAGGCTGAGG 1680
CAGGAGAATC ACTTGAACCC AGGAGGCAGA GGTTGCAGTG AGCCGAAATC ACACCACTGC 1740
ACTCCAGCAT GGGCAACAGA CCAAGACTCT GTCTCAAAAA AAAAAAAAAA AGAACAAATG 1800
TGTAAAATAG TCACAGATCT TTACAATCCC ATCCAGCGAT GAGGTTCTAG GTACAAAACA 1860
AACATTAACA TCTTTCTCCT CTGGAATCGC TTGAACCAAG GAGACAGAGG TTGCAGTGAG 1920
CCAAGATCGT GCCACTGCAC TCCAGCCTGG GAATCAGAGT AAGACTCCGC CTCAGGAAAA 1980
AAAGAAAAAG AAATCTTTTT CCTCTGAACT CTCATCAAAC TTCTATTTCT ACATCTCTTT 2040
TGATTTTTTT TATTTATCTA ACAATGACTG TGCCAAGCAA TATTCCAAAT AAGGTATATA 2100
CCGTGACACA ATCCAACCTC ACAACAAGCC TACAGGCAAG TACTTTATGT ATTTATTTAT 2160
TTGTTTACTT ATATATTTGT TGACACTGGG TCTCACTCTG TTGCCGAGGC TGGAGTGCAA 2220
TGGCACCATC TGGGCTCACT GAAGCCTCGA CCTCCTGGGC TCAAGCGATC CTCCCACCTC 2280
AGCACCCCCA GAGTAGCTGG GATTACAGGC ACACGCTACC ACACCCAGCT AATTTTTGTA 2340
ATTTTAGTAG AGAGGGCATT TCACCTTGTT GCCCAGGCTG GTCTCGAACT CCTGGACTCA 2400
GGCGATCCAC TGCTTCAGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGAGTGAGC CACCAAGCCC 2460
AGCCTGGAAC AAGCACTTTT TACAAATCTG TTTTACAAAG GAGCAAACTG AAGCGCTGAG 2520
AGGTTAAGTT ACATGTCCAA AGTCACAAAG CCCTGAATTG CCTTTGCAAT GCCCCTTAAA 2580
AAGTGGCAGA ATAAATGCCC AACCCAAGAA GCTCTTCACA TATTTGATTT AGATTCCACA 2640
TAAAAATAAA AGCACTATGT ATACATATTT ACATATGGCA TATTTATGAT CTACTTTATA 2700
GTTATTTTGT AGCTGTTAGT AATGAAAATA 2730