EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS118-03004 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Liver 
Coordinate
chr10:126423970-126427260 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4962691chr10126424137hg19
rs2629540chr10126426148hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF4MA0039.3chr10:126425523-126425534GCAGGGTGTGG-6.62
RUNX1MA0002.2chr10:126424969-126424980AAACCACAGAC-6.62
SP8MA0747.1chr10:126425396-126425408CCCACGCCCCCT+6.04
Number of super-enhancer constituents: 54             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00122chr10:126420286-126432669Adipose_Nuclei
SE_00867chr10:126424063-126427366Adrenal_Gland
SE_03136chr10:126423754-126427611Brain_Angular_Gyrus
SE_03854chr10:126421348-126432824Brain_Anterior_Caudate
SE_04762chr10:126400883-126432892Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05766chr10:126349634-126432936Brain_Hippocampus_Middle
SE_06675chr10:126400903-126434597Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07833chr10:126400866-126432679Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_10231chr10:126419608-126424708CD19_Primary
SE_10231chr10:126424873-126426627CD19_Primary
SE_10231chr10:126426870-126432554CD19_Primary
SE_14406chr10:126425568-126426857CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17772chr10:126419368-126434629CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18306chr10:126419113-126424667CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18306chr10:126425550-126432664CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19113chr10:126419661-126425107CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19980chr10:126425658-126432773CD56
SE_22300chr10:126415836-126427028CD8_primiary
SE_23226chr10:126424013-126427351Colon_Crypt_1
SE_23768chr10:126424497-126426801Colon_Crypt_2
SE_25345chr10:126421297-126434389DND41
SE_25897chr10:126419527-126426939Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26558chr10:126419833-126433784Esophagus
SE_27648chr10:126424196-126432913Fetal_Intestine
SE_28609chr10:126424146-126438041Fetal_Intestine_Large
SE_29582chr10:126423805-126426722Fetal_Muscle
SE_29582chr10:126426895-126432848Fetal_Muscle
SE_30910chr10:126421304-126432559Fetal_Thymus
SE_31435chr10:126424492-126426684Gastric
SE_31435chr10:126426860-126427293Gastric
SE_36797chr10:126424496-126425388HMEC
SE_36994chr10:126423751-126426639HSMMtube
SE_39370chr10:126423665-126424686Jurkat
SE_40602chr10:126415564-126427340Left_Ventricle
SE_42109chr10:126419696-126427334Lung
SE_44061chr10:126420402-126424678MM1S
SE_46776chr10:126424026-126425009Ovary
SE_46776chr10:126425043-126425766Ovary
SE_46776chr10:126425769-126427302Ovary
SE_48059chr10:126415530-126433768Psoas_Muscle
SE_48558chr10:126421296-126427182Right_Atrium
SE_49774chr10:126424043-126426118Right_Ventricle
SE_50103chr10:126423987-126434728Sigmoid_Colon
SE_51170chr10:126420625-126427185Skeletal_Muscle
SE_52350chr10:126423936-126435317Small_Intestine
SE_53300chr10:126419634-126433753Spleen
SE_55093chr10:126425250-126426701Thymus
SE_55093chr10:126426878-126427333Thymus
SE_58522chr10:126367014-126434794Ly1
SE_60556chr10:126404074-126434649DHL6
SE_61270chr10:126405484-126433849HBL1
SE_62212chr10:126285528-126438541Tonsil
SE_65502chr10:126424008-126427194Pancreatic_islets
SE_66255chr10:126423665-126424686Jurkat
Enhancer Sequence
GATTTCACCA GTCTCAACTC TTGGTAACAG ACACACTGCA AACTAAACTG TAATGCATAC 60
TTTCAACTTT TCCTCCCGAA AAAAACCCTA CGCTATCTGA GAGAGGAAGA TGCTGGAGGA 120
GAAAAGGCTC TATCCGCCCC AGCCTGACCC GTCCAGCCAA GCCCAACTCC AGTTGAAGTC 180
CCCTCTGCTC TGTCCTGTAT CTTGTCATCA CTGACTGACC TCCTCAGGGC AACCTGCCTG 240
ACTCATGTCC TTCCAGCCTC CCTTCAGTCC TCGCAACAGC ACGCGCTTGC CACAGGCTGC 300
GTGAGATACT CACTAATGTC TGGTGGGCTC TAAGTGTCCT CAGGTGTGGT CTCACTCAGG 360
GCCCCGAACC TATGGGCTGG CTGGGGGTGC TGTCAGCACT GCCATACTCC AGAAGAAGGA 420
ATGGGGGCCA GAGAGACAGT CGCCTGCTCA AAGGCACATG GCATGGCGGG CAAAGGGCAG 480
ACCTAGGATT TGAACCCAGG CTTCTGATTC CAAAGCTGAA TGCTACTTTT GCCCTCGATG 540
ATACAGAATT GGGTTTCACC TAGACTCTGC CCAAAGTTCC TCTGTGACGC CAAACAGTCC 600
CATTCTTCCT GCAGCCACAA GAAGCACCTA GGTGGCATGC AGCCGACCAT GGGCTTTGCA 660
GCAGAACCCC TGCCTGCCCA GTCACACTCA TCTCCTACCT GGCACTGCTC TGCAAGGCAC 720
TACGCCCATT GCAAGGGGCT TCTCAAACAA GCTCTAAACT GATCTTCCTA AAAACGCTGG 780
GTGGCAGGAC CAGCAAGGTG AGAAATCAGA GGCCCAGTGA GGGTTACAGG GCAAATTAGG 840
TCCAGCAAGT AGGCAGTCTG TGCCCACTAC CTTCCAGCCA GGAAACTGAA TCGTTTGACT 900
GCCAAAGGGA TTACAGGGGA GAGCGGTTCC TACGGCCCGG TCCCCAGGAT CATGCCACAG 960
AGGGGCTTCC CCGCATCCTG CACTCCTTCT GGAGACTCAA AACCACAGAC CTCTTTTCCC 1020
CCGGGCTCAG GAGCCAGGCT CCTTCTCCTC ACCCAGATCA TGGAGACACC CAGCTGCAGA 1080
GAACTTAGTC TTTCCACTTC CAAACATGCA GAGAAGCTGC TCCCAGCCAG CGGACAGAAC 1140
CTCCCTCTGC TCCCAGGCCC ATGGCCAAGG CCAATGCCAG AGCAAGGGGA ATTCCAGGCA 1200
GGGCCGAGGC CTCTCCCAGC TGGGCTTTGT CTGTCAGGGT GCTTCAGGCT TCAGCCAGAG 1260
GGCAGCCTGG GAGGGAGGGT GGCCTCCACG GGGTGGGGGC AGGCAGCAGC AACTGGAACC 1320
TGCATAAGCC GCCTCTCCTG CACAAGGCAC AGTCCAGCTG CCAGGACACA CAGCGGCCCC 1380
AGACAGGACC TGTACAAACC CAGCTATCCA GGAGCTCGAG GGCCCACCCA CGCCCCCTCC 1440
TAGAAGCTGC AGCATGGCAC CCAGGCAGGA GTTGCCAGGG AACGCCCACT GGGCAATGCA 1500
CGTGTCTTAC AGCAGGAACT CTCCTCCCCT GGTGAGCACT GGATGGAAAA GCAGCAGGGT 1560
GTGGTAGAAA GAATACAGGG CTGAGGTCAG CTGGGCCAAG TTCAAATCCC AACCTGGGGT 1620
GAGTGATTTC TGCAGGCAGC ATGTCTTCAG CAATGAAATC GGGCTAGTCC CTGAGCCACA 1680
GGTTGTGCTG AGGATTAAAT GAACTAATGA AGCAAAGTGC CCGGCTCCAC ACTGGACACC 1740
CAGCAGATGT CCAATCAATG TCTGCTAAAT GAATGTGGAA ATTGCAGCCC TGAGAAAAAT 1800
AGCAATTCTC CTCTTCTCCC TTCACTCGGC CCAAACCCAA CTCCCCACAG GGGGAAGAGC 1860
CCTTATTCAC TACTCACCAC CACCACAACA CAGCCGGGCA GACTGACACA CTTTTGGCAA 1920
AGAGGCCAAA ACCTTTTTCA GCAAGCTCAC CTTTACAAGG TTTCAGCACC TTCCATTGGG 1980
ACTGGGGGGT GGGGACGGGG GATGGGTAGC ATGTTTCACT TGGCTAATGA ACTCTGTGAG 2040
CAATGATCAA GTTCACCTGC TGGTCTACGC TAAAGCAGGC TGTCTTGCAA GCAGGAATTA 2100
AGGTTCCACG TCATGAGAAC ACAGCAGTAG GGCAGGGACT CAGGAGACAG AGTCTGCACC 2160
TTTGACAACT GGCTACGGGA CCCTGGGAGA GTCACCTCAC CTCTTAAGGA TCGGACTTCT 2220
CTTCCAGAAG GTTACATCAG CAGGCCCAAG AAGCTCTCAC TCTCCAAGCC CCCTGGCCAT 2280
TCTAAACACA ATTCTATGAA ATGTAATCCT GAGTATGTTC ACAGGAAGAC AGGCTCTGAG 2340
CTGACAGAGT GACATTCACT GCAAACCTGG GTGAAAAAGA CTCACCACTC ACTGGGAGTT 2400
GCCAGGATAT GCCCTGGAAC CTAACTGCAT CTTTCCTCCC CTGAGCCCCA GGGGCACACG 2460
GTATGCCAAA TCCCCAGAAA GAACAAGACC ACTAGGACTG TGGGGAGGCA GGGCCTGCAT 2520
GAGAACTGCC CTGAAACCAC AGCCTGAGTA AAATCTGCCC CCTTCAATCT GGAAAGAAGG 2580
TGGTTCAAAG GGACTGTGCT GAATCTTGGC CCAGCAGAAA CAGAAATGAC CTCGATGATG 2640
CCCACAGCAG ACACTTCCCC TAGGGATGGG TGCCCTTCAG ATGCCACTTC ACCAAGACAG 2700
AGCAGCAGCA GCAGCAGCAG CAAATGCCAA TAGGTTTGCT CCGCTCCCGA ATACGAAAGC 2760
CCCCAATCTC CTGCTAAGGA ATAGGGAAAC TAAGGAACCG ACCCGTAGGT ATGCATGGGG 2820
TCTATTACAG CCCTCACTCC TCAGTCTTGG ATGCACAAGA GAATCGACTC AGGAACTTTA 2880
AAGATACCAA TGCTGGGTTG CTGCCCCCCT CTCCAAGATT GTGATGTAAT TGGGCCTGAA 2940
TGCAGCCTGG GCATCTGGAT TTTTTTTTTT TTCCAACCTT CCCAGGTGAC TCTAATGTGC 3000
AGCCAATATT CAGAACCATT ACTTTACTCT AGCTTCTAGA AGTTCAGAGC ACAGGGGCCC 3060
CAGCACGCTC CTACAAACTC TTCAGGGGCA GAAAGGACAG CATGCCTGGC CAGGCAGGCC 3120
TTGCTAGAGA TGGGTCTCCT TATTCTTCCT TCAAAACACA CGCACACTCA CACCCCCCCG 3180
AGAAGCAACC TGCAAAGAAC CATCTGTCTG AGACAGAATG CAGGGCCGCT GCCCAGCCCT 3240
GGCTGGGGCG TACCAAGTTC AGTCACACTG GAGGATATAC AATTGTGTTC 3290