EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS118-00418 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Liver 
Coordinate
chr1:39622180-39627330 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs67758468chr139622588hg19
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB1MA0018.3chr1:39624486-39624498GGTGACGTCACT+6.22
CREB1MA0018.3chr1:39624486-39624498GGTGACGTCACT-6.22
Foxq1MA0040.1chr1:39624109-39624120TATTGTTTATT+6.62
Hnf4aMA0114.3chr1:39624505-39624521GTGGTCAAAGTCCAGT+6.51
IRF1MA0050.2chr1:39622615-39622636TATTACTTTCCCTTTCCATTA+6.36
IRF2MA0051.1chr1:39622614-39622632TTATTACTTTCCCTTTCC-6.46
KLF4MA0039.3chr1:39625567-39625578ACAGGGTGTGG-6.14
Nkx3-2MA0122.3chr1:39625399-39625412AATAAGTGGTTTT-6.14
ZNF263MA0528.1chr1:39625134-39625155TGGGGAGGAGGGTGGAGGGAG+6.03
ZNF263MA0528.1chr1:39625137-39625158GGAGGAGGGTGGAGGGAGGAA+7.19
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02052chr1:39623700-39625273Aorta
SE_06399chr1:39623194-39625443Brain_Hippocampus_Middle
SE_08441chr1:39623554-39625364Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_14598chr1:39623413-39625353CD4_Memory_Primary_7pool
SE_25799chr1:39623252-39625649Duodenum_Smooth_Muscle
SE_30410chr1:39623509-39626362Fetal_Muscle
SE_32006chr1:39623632-39626196Gastric
SE_35822chr1:39623459-39627010HMEC
SE_36947chr1:39622990-39632657HSMMtube
SE_37973chr1:39623508-39626483HUVEC
SE_42256chr1:39623665-39625283Lung
SE_42256chr1:39625384-39626180Lung
SE_45768chr1:39623568-39627263Osteoblasts
SE_47164chr1:39622875-39627546Panc1
SE_51765chr1:39623560-39625373Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53123chr1:39623552-39625824Small_Intestine
SE_54583chr1:39623552-39625585Stomach_Smooth_Muscle
SE_63563chr1:39623442-39625404HSMM
SE_64261chr1:39623623-39625416NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr13962394539625358
chr13962649939626706
chr13962634439626656
chr13962377339626200
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I039157chr13962297839627255
Enhancer Sequence
CTTGGGGGGC TGAGGTGGGA GTATCGCTTG AGCCTGGGAG GTCAAGGCTA TGGTGAGCCA 60
AGATTGTGCC ACTGCACTCC AGCCTGGGTG ACAGAACAAG ACCCTGTCTC AAAAACAACA 120
AAAAAAGAAT TTGGGGCTCC TGCCTCATAT AACTAGTTAG TGGCAAAGTT GAGATAGACT 180
CTGAAATCCT GGGATTGACT CTACAAGAAT CTATATTTGT GTTTTTTACT ATATCCTACT 240
GTCTAATTTA CGGTCTTTAA GCACTAAACT CCTTTTTAAC CTGTTAATCT TGCCTATCAA 300
GTTGCATTTT GAGAAAAATG AACCATGTAT TTGTGTTTCT CCATAACTCC TAATACTCAC 360
ATCTGCACAA AGTAGTACCT TGCTGGTTCT GTTGACTGAC TAGTAGCATT GGAAGGCACA 420
AAAGCTTGGG TTGGTTATTA CTTTCCCTTT CCATTATCTT TTTTTTTTTT TTTTCCTCTA 480
AGTTGGGGTC TTGCTCTGTC ACCCAGGCTG GAGTGCAGTG GCGCAATCAC AGCTCACTGT 540
AGCCTCAACT TCCTGGGCTC AAGTGATCCT CCCACCTTAG CCTCCCCAGT AGCCAGGACT 600
ACAGTCATGG GACAGCACAC CTAGTTAACA TTTTTAGTTT TTGTAGAGAT GAGGTCTCAC 660
TATATTGCCC AGGCAGGTCT CAAACTTCTG AGCTCAAGCA GTCCGCCCAC CTTACCCTCC 720
CAAAGTATTG GGATTACAGG TGTGAGCCAC CACACCCAGC CCCTTTCCAT TATCTTAGCA 780
GCTGTCACAA TTATTTAGCC TGATCTTTTT AGGTGGGCAT ACTCCCTTTT CTCTCTGTTT 840
TTACAATGCT ACTTACACAG TTTCTCCACC TGCATCCAAT CTGTAATTGG GAGTTTTGCA 900
GAGCAGTGTA TTTGGTATGC TGTGAACTCT TCCCTAGGTC ACCCAATGGC ATCTTGTGAG 960
CCAGGTTGTC TGAAAAACTT CAAATCTTGG TGGCAGTGTG GTGGGTGTAT CTCCCATATG 1020
AGGGATTGTT CCAGGGATCT GACTCAATTG ACAGCTCCTG AATTTCTAAT ATGCCAAGGC 1080
TTTTGTGGTA AGATGAGCAA GAATTTTTCA AGCTCAGATT TGGGGAACAT AGCTTCTTGC 1140
CATGCTATCT CATTGGCATG ATGTGTGACT TTTGGGCAGA TTACTTAACC TCTGTCTATT 1200
TACTTTTTCT TTTTTTGAGA CAGGGCCTCA CTTTGTCACC AAGGCTAGAG TGCAGTGGTG 1260
TGATCTTGGC TCACTGCAGC CTCAACTTCC CAGGTTCAAG CGATCCTTCA TCCTCAGCTC 1320
CCCAAGTAGC TGGGACTGCA GGAACGTACC ACCACACCCA GCTAATTTTT TGGAGTTTTT 1380
GTAGAGACGG GGTTTTGCCA TGTTGCTCAG GCTGGACTTC TGTCTGTTTT CTCATCTGAT 1440
AATGAAAAGT TGCAATTATT TTCACAAGAT ACTTTCAAAG ATGAGTCTAA TAATGCAGAT 1500
GAGCCATTTT GAGTTCCTTA CAACAAAGAT GCTGTGGAAA TTTCAGGATT TTCCCCCTTT 1560
AGTTATAATA TGGGTAGCTT ATCCTAAGAA CCTGTGACTA TTGGGATGGT CATCTTTTTG 1620
AGGCCAGCAG TAGAAAGAAA TTTGCAGTAG TGACTGACAC ATTAAAGCAA CCCCGAAACA 1680
AATCAGAGTG AAATAGTGTC CTGGAGTTGG GGATATGTGG GTGATATCTG GGCTGCATTT 1740
TCTCTCTAGG TATCCATGGA GAGGGTCCTG TCTCCCTGAA TGGTTGTGCT TTCAACAGTT 1800
AGGGAATGAG CTTGACAGTT TCTGCTTCTT CCCTCCCCTT GCCTTGAACT GCCTTGATAT 1860
GCAGTGCCTC CTCTGTTGTG TGGCTGTATT CCAGTCCGTA AACATGACTG CTGTAAGGAG 1920
AGTACAGAGT ATTGTTTATT TTGTAAAACT TGTCTCATTG CCATGTAATA TTTGCTCAAG 1980
AGCTCCTGTT GTGGTGATAT TCTTGTGGTG AGCATGGCCC TTTAAAGATT TTGTTCTCAA 2040
ATGTTAAATG AGCCCCTGAC TGGTGTCCTG AAAAGCATTT AAGCTTCTCT CCCTAGAGTT 2100
TAAGCAAGAG GAGCAGTAAT CCCAGTGGAG CCTGGGCTGG GGTCTAGAGA GAAGGTGGCA 2160
GATGAGGTGG CAGATGACAG GCAGGGGCGG TTGTGGTCCC GTAGCTCATT TGCACAAAGG 2220
AGGGGCTGGC CTCTCCTGGG GAGGTATTTC CGCTCACTGG AACAAATGAG GGCGCTCAAA 2280
AGGCTGTAAT GTAATGAGGC TTCTCTGGTG ACGTCACTTG TAAATGTGGT CAAAGTCCAG 2340
TTCTTGGGGG CTAGTAGAAG CGGGAGTAGA GATCATTCGG TTTGCATGCT TTCACTTCTC 2400
AGCTGTCACT GTGCCATGGT GCCTACTTTC AGCCAGTGAA CCAACTCAAC TGGGCCGGGC 2460
ATGAACGCTT ACAAGTATCA GAAGTTCCTG GAGGGACTCA ACAACCTTAG AGGTATTACA 2520
AGGCTTCAGG CTCCCTACCC TTTGTCCTTG CTGATCGTGT GAGCACTTAT TATGGTGTGT 2580
ATTGTATAGG GTCTGTAAAA CCCTCCTGCT CTGAGCTGGC CCTATTTTTT ATGCGTTTAG 2640
GCAATTAAAC AGAAGGGATA GAGTTTGTAA ATGCAATCCT AAGTGAGTAG GAGAGAATCT 2700
CCTTAGGTAC TTCAGCAACA GCCTGTTGTC TTGCTTGAAC GGACAAGTAA GAAATGTCCC 2760
CTGTATTCTT GAGCTCAGAG GGCTCAGGGC ACTCCCTGTT TTCTTTGAGG TGGCCAGACA 2820
GTGTGGGTGG AGGGCTCTTG CCATAGGGCC CTGCAGCCTC ACCTAGGTGT AGTTATGTTT 2880
CTTGGGCCAG GTTTTCCAGT TGCTTGTGTC TACAGTGAGT CAGAGTCCCA TTTGGAGAGA 2940
ACTGGAGTTG GGAGTGGGGA GGAGGGTGGA GGGAGGAATG CAGGTTGATG GGCTATTTGT 3000
AAGCCCATTG TAAAGTAAGC CTTTGTAAAG AGTAAAACAA TGACTTTGAA AGAGGAAGCT 3060
TTTTATTAAA GTTTTAAAGG AAATAGTGTT TTCTTTGCAT CATGGGCAAA TTCTTCACTG 3120
ACCAGACATG AGAAGAATGT ACTCAGATGT GATGTAGGAC TCTTTTTGGA TATTAAAGAG 3180
AAAAATGAAT GAAATCTTTT TACTTTCCCT TCTCTAATTA ATAAGTGGTT TTATTTCCAT 3240
TTGCAGAGGA GGGTGCTTAA ACCATTTTTC TTTCATCAGT AGTTAGGATT CTGGACCCAG 3300
AGCAACCATG GGGTGTGGAG AGAGTGGGAG GGGGTAGAGG GAGGAAAGGA GTAAACTGGG 3360
TTTTTTCAGG GATGAGGAAA GTGGCAGACA GGGTGTGGGC AGGAGATCTG TACTCCCTTC 3420
TTGCCAGGGT ATGTAGATGT TTTACTTTCT TTCACTATCT GTTGAAGAAC TCTGGTTCTA 3480
AGAAATATAT ATGGAGAGCT TTGTATGCTA TAAAGGGATA TACAGGTCGG GCATGGTGGC 3540
TCGCACTCGT AATCCCAACA CTTTGGGAGG CTGAGATGGG AGGATCGCTT GAACCCAGGA 3600
GTTCTAGACC AGCCTGGGCA ACATAATGAG ACCCCCATCT CTACAGAAAT GTTAAAAAAT 3660
TAGCTGGGCA TGGTGATATG CACCTGTACC CTTAACTACT TGGGAAGCTG AGGTGGAAGG 3720
ATCACTCTGA GTTCATCTTA GAGGTACAGA ACCCAAATAA CACAGCAAAG AGCCCCAGAG 3780
TCTGGAGTGA GAAGAGTGCT GCTCTCTGGT GCTAGAGACC ATGTGAAGAA GGGAAGAATA 3840
CCCACATCTG ACTAAGCATA TGTGTAAATG CACCTTCCTC TCTGAGACAA AGAGCTGTAG 3900
TATGGGGCTT TAGAGTGAAG GTAATAGATC TTTTCTCTCC ACACTACTAC TCACCTTGAA 3960
TGGAGTTCTG TTTTCTAATC TTTCATTCAC TATTGTTTGC TTCATTCACT TATATACACT 4020
GTATAATAGT CTTTATAGCA TAAAACATAC AATATATAGC AGTTTCTCTT GTTGACCCAA 4080
AGAAAGGATC AGATTTAAAC TCTTCTTTGC TCCTGCAACC TGAGTCTTTT TCAGGTGGGA 4140
GAAGTTCCTG GAAAGAGGAC ATGTAGTTTT TTTGGTTTAG TCCTTATCAT TTTTTGGAAT 4200
GTTGCTATAG GTCTTAGACA ACTATTCCCC CAATTCTGGG CTGCCAGGCA GAGAGTTAGA 4260
TACAAACCAT TGCCTTTGTC AAATCCTCCT GTGGGTTGAG TTTCACCCAC TGTGCCCCCT 4320
GATTAAGGTG AATGGTTACT TCCCTTCTTC TTTTCACTTA ATATCTTTGT GTATTCCAGA 4380
AGGGCTGATG GAAAGAGGTA ATTGGCTCCC CTCTTCATTT AGTTACTGAC TGTTGCTTTT 4440
CTTGGCATGG TTCAGCTTGT AGACATTCCT CCATCTAGTG GGTAACTGTT GAAGGGAATC 4500
CAGTGGGAGA ATAGAGACAT TGTACAAGTT TTTGAAGTTC TGATCCCCAA ATTCCTATGA 4560
ATTTTTGGTG TTTTGATCCA GAATTGGGGT GCAATATTTT CCACTGCTCG TGCTTTTTCT 4620
GGAGGGCTTT AACTTATATT TCTCAAGCCT GTCAAAAACC TTAGTTATTG GGGTGATTTC 4680
TGGCCAGATG GACCTCTCTC ATGGGTATGA CAGGCTGAAC TATTGGCCCG AGTCCTGATT 4740
TTTGGCAGAG TCCAGACCTG TGCCATGACT GGGATAAGTA GGTAATTAGG GATTAATTAG 4800
GGAAGCAGAG AGGTAGGTGA AGTAGAGTGG TGAGAAAGTG GTTCACTAGC CTTTACTAAG 4860
AAAAATTTAT GATAGGACTA TGAGATAACT GACTTTTAAA ACAGAAATAT AATGGCCAGG 4920
TGCAGTGTCT CATGACTGTA ATCCCAGTGC TTTGGGAAGC TGAGGCAGGA GGATCAGTTG 4980
AGGCTAGGAG TTTGAGACCA TCCTGGGCAA CAGTAGCAAA ACCCTGTCTC TAAAAACAAG 5040
CAAACAAACA AAAAAACAAT ACAAAAACTA GCCGGTGGCT GGGCACGGTG GCTCACACCT 5100
GTAATCCTAG CACTTCAGGA GGCTGAGGCG GGCGGATCAC AACGTCAGGA 5150