EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS118-00417 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Liver 
Coordinate
chr1:39618130-39621410 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NKX2-3MA0672.1chr1:39621006-39621016TTCAAGTGGT-6.02
RARAMA0729.1chr1:39621218-39621236GAGGTCTTAAGGTCATTT+7.51
Sox3MA0514.1chr1:39620169-39620179CCTTTGTTTT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00416chr1:39618666-39621629Adipose_Nuclei
SE_02052chr1:39619377-39620924Aorta
SE_14598chr1:39620404-39621417CD4_Memory_Primary_7pool
SE_25799chr1:39619385-39621571Duodenum_Smooth_Muscle
SE_32006chr1:39618455-39620905Gastric
SE_35822chr1:39618715-39621585HMEC
SE_36947chr1:39618590-39621552HSMMtube
SE_37973chr1:39615726-39621771HUVEC
SE_42256chr1:39618473-39621095Lung
SE_45768chr1:39619273-39621651Osteoblasts
SE_47164chr1:39617974-39621415Panc1
SE_51765chr1:39619776-39621340Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53123chr1:39619602-39620989Small_Intestine
SE_54583chr1:39618652-39621626Stomach_Smooth_Muscle
SE_63563chr1:39619712-39621545HSMM
SE_64261chr1:39619201-39621429NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr13962020539621253
chr13961849739618731
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I039152chr13961853739621579
Enhancer Sequence
AAGTACAGAA AATGTATAGC AGATACATAT GTACCCACTA CTTTTTAAAC AGATGTTGAC 60
ACCCTCATTG ACGTTCTCCC TGTTAGGTGC TTTTAGCACT TCCTCAACAT TGTGATGTTC 120
TCCCACAGAA TTTTATCTTA GACGTCACAG TAAAAAAGTT CCTCAGAATT CATACACTAC 180
CATTCTGGAG GTGCCACCAT ACATTCTATC TTGGACTTTC TTTTTAAATA TAGCCTCATT 240
GTTAGCAAAA GGCAGCTTCA GAGGAAAATT CCGTTATGTT ATTTTTGGTG TCTGGAATCT 300
GACTTTTGAA AAATGTTTAT TTTGCCTTCT TCCTCTACTC AAAAGCAACA AAAGAATGCT 360
ACCAGAACTT TATCACAAAC CAAGTGACTT AAACAAATTA AAAAAAAAAA GGCAGTTGGT 420
GGCCTATGTT TCTAGAGACT TGTTTGATTT GCTGGCAGAA CAGCCCAGGT GAGTTGAGCC 480
AGTAAGCACT TTTCTTCCAC TAGGTTTTTC AGAATAACCA AATGTAGTTC TCCTAAGCAG 540
GCACTGATCT TTAGCTGACT TAGTGGTGCA GCTGTATCCT CTGGGTTTTG ATGGAGTTGA 600
TGAGAGAAAC TGTTCTTGCG GGTGGTAGGA AGCTGTTGAC CTGACCTCTG TTACACCTGA 660
CTGTTTCAAT ATGCCTTTGT GGAAATCAAT TTCCTACCCT TCCATCTCTC TGCTAGAGAT 720
CTATAACCTT GTTCCAGTGG AAGGTGACTC TTACCTCTGA TCTTTTCCTA GGTCCTCAGA 780
ATGCCTGGCA GTGAGGCTTT TAGGTTATTT TGGGATTTTA TAAACTGAGA GGGGAACCTT 840
AGTCTCAGGT GGGGCTAGAA TCTGAGGTCC TATAGGTACA GATTTATCCT AAAAGCAAGT 900
GTTTTTGCCT TCTCTCTCAG TTGCTCAGTG CTTCTTACCT CATTTGATCT CTTAGTATTA 960
CATAAGCACC TTAGGGAGGA AAGGACTCAA AGGAGCCAAC CATTTCTCCT TGGACCCACA 1020
GCCAAAAAGA AAAGGCTCAA CGAGAGTGAG CTTATTCGAG GGTCTGTAGC CTAAAGCATG 1080
GGCTCTTTTA AAGCCTCTTG TTGGGCCGTG AAGCATAGGT CTAATCCACG TGAAGTAATT 1140
ACCCAGGCCT GGGGTGGCCA CAGGGTGAGC AGAGCTCTTC GTACCCTTTT TGCCAGACCT 1200
ACACTTAATT TCCTTTAAAG CCTCACTTGG TCTTGCCATT TCAGCCCTTT CCTTCGAAGT 1260
ATGAAGCCTG ACTTTTTTTG TCTTCCTTTC TTCAGCCCTG CAGAGGCAGC TGTGGCCCTG 1320
GGGACAGCCC TTTCTTCAAA TGGCAAACTC ATTTTCTGTC CAGCAGACCA GAAGGACAAG 1380
GTGTAATTCA ACGCTTCTCT CCACCAGACA CTGCTGCCAG GGGGAGACAA TGAAGAAAGT 1440
GATCTTTGTT GCTCCCTGAA TAGGTCCCTG AACCTGGCAC CTGCTTTTGT TACTGGCTCC 1500
TTAAGTCACT GGAGACATTT TTGCTGTTTC CTGGGTTAGC AGCTGCTTTG GGATAATAGT 1560
AGCAACTGGT TGTCAGGATG TCAGTTCTGC CTCAAAGAAA ATCAGTGTAT TTATATGAGG 1620
AGAGTTACCT TTTCTGTTCT TAAATTTCTT CAGGGTTTGT CTGAAGAGTG AGCAGTTGGA 1680
AGTCAGCTGT GCCCTTAGTT TGATGACCCC ATGACCCTCA TCTTTGAATC TGAGGAGACA 1740
CTGCCATTTC TACTATCCAA GTACTAACCA GGCCTGGCCC TGCTCAGCTT CCAAAATCAG 1800
ACGAGATCAG GCGTGTTCAG GGTGGTATGG CCGTGGACGA GACACTGCCA TATTTTTTTC 1860
GTCCTGCTCT CCCTCTGGTG AGACTCTGAG TTCTGGGTTC TAGCATGTAG GTCAGTGCCT 1920
CCTACCTGGT AAGCATTCAA CAGATATATG TGGGATGAAT GATTGAATGA ATTCCTTGAT 1980
CTTGCTGTCC AGGTTCAGTT TCTCTGACAC TGATACGTGG GTGCTCTATG GGAGGGGGAC 2040
CTTTGTTTTT AGGAGAAAGA TTGCTTCAAA GGAATTATGG AAGGTGTTGA TTTCTAGGGG 2100
GCTTTGGGGG AACTATGGGA ACTCTAAGAT ATGATTCGTT CTCGCCTCAT TGGTCTAGAT 2160
CTTTCTCCTC GATAGTAACT GTCTGCTGAC AGACTTGCCC TGTTTCAGGA GCAGTATCCT 2220
GAACCTGACT CATCTGGGCT CTGTCCTTGA GCAGGGTAAG GGATTTTTTT TTTTTAACAG 2280
CCATCCTGTC ACTGTAGATT CAGAAGCCCT CAGGACCACA TCTCAGGCAC TGTAGTCTTG 2340
GACTTCCTGA TCTGGCTGCA TTCAGTCAAG TTCCACTCAG CTCTTAGGTG TCTGTGCCTT 2400
TGTAAGGGCT GTTGGAGACA GAAGGGCTTT TTTTCCGCTT TGTCAGCAGC TGGCCAGAGA 2460
ATGCCTATTA GTCTGCCAGA TCCTAAGTCT TTCACGTTTC CCTGTCTGTG TCTGGAACTT 2520
AGGGCAGAAT CTCTTACCAC CTGAGGTTAC ATCTCACTAT TTGCCTTTGT GGGACCCATT 2580
GGAGGATAAA AGATGAATAG CCATGAAAGG CATGCAGAGT TATTGAACTA TGGTTCTTTG 2640
AAATGCTGTG ACTCTGAGGA AAGATCCCTG GTCTCCAAGA ATACAACTGG AGCCAGACCA 2700
TTGCACCACC ACCCTCCTTT CCCAAGAGCC TCTTTGGAAC CATCACTCAT TCCATAGTTC 2760
CAAACATCCT TGTTTTTGTT TAATTTTTAT CTGATAAATG TTATGAAACA ATTTTAATGG 2820
TGAAACACAC AGAGGAAATG ACAAACTAGC ATGTGTTGTC TTTTAAATGC ACTTAGTTCA 2880
AGTGGTTAAG TCAGTTGTTC CTGTTGTTAG ATTGCTGTTG TGTAGTCGAC TTTCCTTCTT 2940
TAGGTGGGAA GAGTCTCTGA ATAGACTTTA AAAAAGCAAA AGGAACCAGC TCTTCTTTAG 3000
CTGATTGATC ATTCCTTTAC ATCTGACTCT TTTCAGCACT TAAATTCAGA TTGTACTATG 3060
CTGATTGCTT TCAGATCATG ACACAGAAGA GGTCTTAAGG TCATTTCAGG AGTTCTTTAG 3120
CTGAGGTCCA TGTGATACTT CTCCACTTGT AAACAAAAGT TTGTATGTAG GTAAATATGT 3180
ATATTTTTAT AGGGAAAAGT ATCCTTAGTT TTCATCAGAT TCTCACTGGA GTTTATGACC 3240
TAAAAATAGT TAAGACTTAG TATTTTATTT ATTTATTTAA 3280