EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS118-00062 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Liver 
Coordinate
chr1:8475180-8479700 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs159960chr18476428hg19
rs115109046chr18477866hg19
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:8477190-8477206AATTGTTTATTTAAGG-6.15
Foxq1MA0040.1chr1:8477190-8477201AATTGTTTATT+6.02
NFAT5MA0606.1chr1:8475955-8475965AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr1:8475955-8475965AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr1:8475955-8475965AATGGAAAAT-6.02
Pou2f3MA0627.1chr1:8477353-8477369GTCTATGCAAATGACA+6.09
Number of super-enhancer constituents: 43             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00045chr1:8465614-8485937Adipose_Nuclei
SE_02022chr1:8475504-8476010Aorta
SE_02022chr1:8477510-8478261Aorta
SE_03407chr1:8475506-8475959Brain_Angular_Gyrus
SE_04978chr1:8478743-8481068Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06073chr1:8479138-8485793Brain_Hippocampus_Middle
SE_07042chr1:8475647-8476823Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07042chr1:8478805-8485534Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07921chr1:8475174-8476586Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07921chr1:8477474-8483841Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11329chr1:8474464-8493359CD20
SE_18764chr1:8477368-8486022CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_23717chr1:8479176-8479684Colon_Crypt_1
SE_25808chr1:8474774-8476557Duodenum_Smooth_Muscle
SE_25808chr1:8476636-8485754Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27457chr1:8477725-8478732Esophagus
SE_28078chr1:8478132-8486070Fetal_Intestine
SE_29095chr1:8478033-8485919Fetal_Intestine_Large
SE_31622chr1:8477645-8478284Gastric
SE_40658chr1:8475260-8476338Left_Ventricle
SE_40658chr1:8476604-8477230Left_Ventricle
SE_40658chr1:8477420-8481421Left_Ventricle
SE_41679chr1:8477672-8478706LNCaP
SE_42166chr1:8475469-8476137Lung
SE_42166chr1:8477479-8478781Lung
SE_42166chr1:8478827-8481118Lung
SE_45677chr1:8474559-8476463Osteoblasts
SE_45677chr1:8477327-8485510Osteoblasts
SE_47251chr1:8465934-8485673Panc1
SE_48103chr1:8475492-8476245Psoas_Muscle
SE_48103chr1:8477498-8481110Psoas_Muscle
SE_48600chr1:8475364-8475962Right_Atrium
SE_48600chr1:8477483-8479198Right_Atrium
SE_50481chr1:8479223-8481104Sigmoid_Colon
SE_51176chr1:8473915-8486131Skeletal_Muscle
SE_52725chr1:8477578-8478762Small_Intestine
SE_52725chr1:8479134-8481145Small_Intestine
SE_53408chr1:8475430-8476079Spleen
SE_53408chr1:8477393-8478777Spleen
SE_54752chr1:8475052-8485774Stomach_Smooth_Muscle
SE_58576chr1:8455425-8501956Ly1
SE_60758chr1:8454848-8500160DHL6
SE_62661chr1:8450826-8509851Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr184776378478703
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008414chr184746158476360
GH01I008416chr184766058477230
GH01I008417chr184773948478781
Enhancer Sequence
TAGTTTTCAA AGTCAGAATA GATCTTACAA GGCTAAAAAA GAATCTATGA TATAAAATAT 60
AAGCTCCAAG TGGATAAATC CATTGACTGT TAACCACAGC AACCACAACT TGTAAGTCTT 120
TCTAAAGACC AATTCAAACC TTCCATTTGT TTTACTAGCT AATAAAATGG TGCAGACTAT 180
TTAGGCTTCA AAGTCATAAA TGTCTCCATC TAAAAGTCAT CCAGGTAACC AAGACACAGC 240
CAAATCATAA GAAATATAGG TTAGCAAATA CCAACAGCAA ATAAATCCCT GCAAGCAACA 300
TTTTGTTCAA TAACACTTTA AAAGCCCCAA GCATACTTCA TTTGAGTGCA GTTTCTATAA 360
GTAATACATT TCAAATAATT AAAGCATTCT CATGCCATCC CCACTAGTTT TCATATGTAG 420
GATAACGCCA AGGTCAGGCT GTTTACACTG AGAACGGCAA CTGTCCAAGG CCCTTGGTTT 480
AAAAAGTCAC CCAATTTTTT AATACCTCCT TTTCTTTCCA ACACCAGCAC CAAAAGTCTC 540
TTACGTACTT CACTTACACA AGGGAATATC AGCCAGTCTC TCATAGATTA CCCTCACGAA 600
AACTGGACCA CTGCCCAGGC AAATATCCCT ATAGTTCAGA CTATCACAAT TAATAGATTC 660
GAGCCTCGGC TCCATTTTAA TGGGAACAAA CTCTCAGCAC AGGAATAGCT ATAGGATCAC 720
AGTACTTACT GCCAAAATGC AGTGCCTGTT TCTACTGGCA ATCACTTTGG CCTCAAATGG 780
AAAATTCCAA CTGTTTATAT CTATGTGAGC ACAAATTATT AAGAAAAACA GTATGGCACA 840
TAAATGTCTT TCCTCTTACC CATCTTGCCA GCCCCTCAAA TAACTTATAT TTCTTTTTCA 900
TACATAAGGA ATGCCAATAA AAGAAAGCAA TGCCCGAAAA CACTGTGGTA TTAAACCTTT 960
ATGACTATGT AAACTTCAGT TAACAAGAGA AGGCCATCCT TCCACATAAA AAGGCTTATT 1020
AAAAACTGAA ATAGAATCTG GCAAGGTCTA ACTAGACTGC ATGCCACAAG GTAAAGAGAA 1080
CAAGAGCTTT TGTATCAAGT AAGACAGGAG TTACAATCAT GTTTCTAGAA AAACATGGGA 1140
GTGGGAATTG AGAAGAAAAC TATATTGAGA AGTCCTGGCT CACGGTCAGG CGCGGTGGCT 1200
CACACCTGTA ATCCCAGCAC TTTGGGAGGC CAAGGCGGGC GGATCACAAG GTCAGGAGAT 1260
CGAGACCATC CTGGTTAACA TGGTGAAAAC CCCGTCTCTA CTAAAAACAC AAAAAATTAG 1320
CCAGGCGTGG TGGCGGGCGC CTGTAGTCCC AGCTACTCGG GAGGCTGAGG CAGGAGAATG 1380
GCGTGAACCT GGGAGGCGGA GCTTGCAGTG AGCCGAGACT GCATAACTGC ACTCCAGCCT 1440
GGGCGACAGA GCGAGACTCC ATCTCCAAAA AAAAAAAAAA AAGAAAAGAA AAGAAAAGAA 1500
AAGAAATCCT ATTATTGACA ATGGAAATAA GCCCTGATAC TTTTCTGTTT GAAATATTTT 1560
GCAATAATTA GAAAAACAAA ATCAAGCCCT AATAGTGAAA CTTTACAATT TTAACAGAAT 1620
AAAGACAGTA TCATTTTAAG AATGATATAC TATGCAGGCT CAGAATTCTG CAAGTCTGCA 1680
TTACTGTAAA TAGCGGTGCT TCCTAAACTT TACAGTACTT TGGAATCCTC TGGGGGGTCC 1740
GTTAAAATGC AGATTCTGGC TCAAGAGACA AGGACAGGGC CTGAGAATCT TCCATTTTAA 1800
CCAGTGATGA GAGTGCTGGC CTGAGGAGCA CACTGTGAGC AGTGAGGATA GACAACGTTT 1860
GTAGAAGAGG GACAAGGTTT AAAAACAGAG ATCTTCTAAT GTACTGGTAT GTGGCCGTGA 1920
CACATTTGCA CATTCTCAGT AGCATCAACC GACTAAGGAA GTCCATACTT TGTTATGCAA 1980
CATTAGATTA AGCATTAATG AGGCTAGGAA AATTGTTTAT TTAAGGTTAT AACCTGAAAT 2040
TAAATAAAAC TTCAGGCTGG AAGCTCATAT TGAATACTAG AATCATTTTT AACCTCTTAA 2100
TATTAACAGA AACCTGATTA CTCAGTCTTA AAGCCCTTTC TCAATAGCAT TTATTCTCTG 2160
CTGCAGGAAT ATGGTCTATG CAAATGACAT TTTGCCTGAA GAAAAAAGTA CAGTTAATGG 2220
CCAGTAGTTA CGTACGTATT TAATAGAATT CATTCCCAGA AATGTGGCTA AGAAAGGTGG 2280
TTGATTTTCA TGTTATTTAT TAAATTAAAA ATTTAAATCT CTAATACCTT TCATCCCATT 2340
ACTTAAAGTT AAAAACGTCA AAACTGGCTG CCCTTTCACT GGGCCCTTGG TGCCAAACAG 2400
TGACACATTT CCAATAGAGA AAATGAAGAT AGAAGGCAGG CTTCCCTTCC CATTAACTTT 2460
GAACTTTCAA GTCCCTATCT GTCTTCCTAC AAGACTAAAT TATAAGAAGA GCCTCCTCTT 2520
TGGTCCCATC CTATACATAC TTCGGTAGCA CAGCCCTCAC TTCTCTTCTT AAAAGCCTTA 2580
AATGGGTCCC ATCCCCACAC TCACCCATAC ACATTCTTTG GAGGGAATTC AAGGTCCCCC 2640
AAAATCTACC CTGCAGCTAT AATTTGGGCC CAAGTTCTAC TGCATCCGCT TATGCAACCT 2700
CCTTTCCAAC CATGCTCATG TACTTGCTGG GCACGTTTTA CAATTTCCTG TCTCCGTGCC 2760
TTTGTTCATA GTATTTCCTA TGGCTGGAAA GTTGCTTTTC CTCTACCCTC CCAACCTGGG 2820
CCTGTCAAAA ATGAATCCTT CCTTCAAAGC CCAGTTCAAA CACCGCCCCT CCAATTAGCT 2880
TTCCAGGAGC CTCTGTGCTC ACTTTGTGGG GCCTGAACCT CCACCCACCA GGGCCCTCAG 2940
CACATTCTAC CAAGTATGGC AGGTATGTAA ATGTCGTGCT GGCTCCCTGC AGGGCAGGGA 3000
TGGCACCTTG CTTCTCTTTA TAGATACCCT ACCCATTGCA GTGCTCAGTG GGCACCCAGA 3060
ACTTTAAAAA ATTGAACTAT ACACAAAATT TAGTTCTGAT AATGGGAAGT GAATGAAAAT 3120
GAGTTTCCAG TGTAGTAAGT GTCAATGCAC CACCAACTGG GATTACAAAT GACACAAGCT 3180
TAATCTTCAC TGGGCTAGGT GCTCAAAAAT AAAAAGAAAG AGACGAGAAA GACAGCCAAA 3240
GCATGTCCCC TTTCACCTTC CATCTCCCTC CAGGGGCTAA CACTTTGGGA ACACCTCTTG 3300
GCTACCAAGC TGGGGTAGAT CACATTGTCT TCTCACCAAT CTTAGTTGCA CCAGAGACAA 3360
GCAACGGCAG GTCACTGAGG AAGCGCTCCT GGACTACGAC CCAGTGCCAG CTGAATTTGT 3420
CTAAGTAATA GGAGACACAG CTATAAACAA AGGCCAGGAT TCAAGGGACA ATCATCCAGG 3480
TGCCAGACAC AAAAAGTCTT TGGTTCAAAT AACTGATATG TCCTCAGAGA AGAGATATGT 3540
CACCACTGCT TGAATAATTA TCTCATGATT TTGAAGAAAA CTGCAATGTA TAGACAAATC 3600
AAACAAAAAA TTATTTTTGG ATCATCCACG ATTTTGTGTT ATTCCTAACA TGGATTCACC 3660
TTTAGGTAAT TAAGATTCTC TATTAGGCCT CCTACTTTTT CAGGCATTAC CTTAACATCA 3720
AAGCTCATGT ACCATCCATC TACCCAACAA TAAGTGGCAG GGCTCAAAGC AGAATCAAGA 3780
GGCCTAGTTC TCCACTGTCC TCCCAAAAGT TCAGACACCG GGCGCTCTGT GACTTATACA 3840
AATATACTAA CACTTAAGAC TCTGATGTGG TTTATGACAA ACAGTGGCTT GACAGAGAAG 3900
AGGTATACAG CCAAGGTGAA TCTAAAATGC TCCACCCGTA TTCCTGACTA CATTTCACCT 3960
ACTAATTATA TACTTTATAA GCATATTGAG GGGAGGTAAA TGGTTATAGA GAAACAGAGA 4020
ATGGGAAAAA GTATAATAAA CTACAGGATA TTTGCACAAC CATGACACTA AAAGATTTGA 4080
CTTGTAGTTA TTCTCTTGGG TACCCTGAGG TTAACACGTA ATACCCATTC AACTAAGCCT 4140
CTATAAACAG TTGGGTTTTC CGCAATCACA GCCACTATTC CCACTTCAGT GGGCAGCAGT 4200
GTTCAGAGAA AAGCCAGATT TAGCTCTTGT GCAATAAACA CCAGAAACCA AAAGAGCTAG 4260
GAAAGCTGTT TACGTCTATG CCCACCAGGA ACCCTTCTCT GCTATAACCG CATGAATGAA 4320
CTGGTAAGAA TGAGGTCTCA ACAAAGCTTC AAGACGGACG TTGTTAACTA GTTGCTGCCC 4380
TCCAAGTTTT TGGCAAGACA GATTAATGAA AAACAGGTAA CTTATTTTTA TACAGGCTCA 4440
GTATATTTAC AAGCAGAAAG GAATTCTGTA CTTTTCAAAG CATTTAGCTA CCACCTTATG 4500
TAGTATTTAA GGTAGACAGG 4520